A machine learning approach to optimizing cell-free DNA sequencing panels: with an application to prostate cancer.

Cario, Clinton L; Chen, Emmalyn; Leong, Lancelote; Emami, Nima C; Lopez, Karen; Tenggara, Imelda; Simko, Jeffry P; Friedlander, Terence W; Li, Patricia S; Paris, Pamela L; Carroll, Peter R; Witte, John S

Cario, Clinton L; Chen, Emmalyn; Leong, Lancelote; Emami, Nima C; Lopez, Karen; Tenggara, Imelda; Simko, Jeffry P; Friedlander, Terence W; Li, Patricia S; Paris, Pamela L; Carroll, Peter R; Witte, John S.

Afiliación

Cario CL; Program in Biological and Medical Informatics, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Chen E; Department of Epidemiology and Biostatistics, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Leong L; Department of Epidemiology and Biostatistics, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Emami NC; Department of Epidemiology and Biostatistics, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Lopez K; Program in Biological and Medical Informatics, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Tenggara I; Department of Epidemiology and Biostatistics, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Simko JP; Department of Urology, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Friedlander TW; Department of Urology, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Li PS; Department of Urology, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Paris PL; Department of Anatomic Pathology, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Carroll PR; Division of Hematology/Oncology, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.
Witte JS; Division of Hematology/Oncology, University of California, San Francisco, California, 94158, USA.

BMC Cancer ; 20(1): 820, 2020 Aug 28.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32859160

Asunto(s)

Secuencia de Bases/genética; ADN Tumoral Circulante/genética; Genoma Humano; Aprendizaje Automático; Neoplasias de la Próstata/genética; Adulto; Anciano; Anciano de 80 o más Años; Biomarcadores de Tumor/genética; Biomarcadores de Tumor/aislamiento & purificación; ADN Tumoral Circulante/aislamiento & purificación; Estudios de Cohortes; Humanos; Masculino; Persona de Mediana Edad; Mutación; Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Secuenciación Completa del Genoma/métodos

Palabras clave

Cell-free DNA; Machine learning; Panel design; Prostate cancer; Tumor variant detection

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Neoplasias de la Próstata / Secuencia de Bases / Genoma Humano / Aprendizaje Automático / ADN Tumoral Circulante Tipo de estudio: Etiology_studies / Incidence_studies / Observational_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Adult / Aged / Aged80 / Humans / Male / Middle aged Idioma: En Revista: BMC Cancer Asunto de la revista: NEOPLASIAS Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido

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