SimuSCoP: reliably simulate Illumina sequencing data based on position and context dependent profiles.

Yu, Zhenhua; Du, Fang; Ban, Rongjun; Zhang, Yuanwei

Yu, Zhenhua; Du, Fang; Ban, Rongjun; Zhang, Yuanwei.

Afiliación

Yu Z; School of Information Engineering, Ningxia University, Yinchuan, 750021, China. zhyu@nxu.edu.cn.
Du F; School of Information Engineering, Ningxia University, Yinchuan, 750021, China.
Ban R; Hefei National Laboratory for Physical Sciences at Microscale, USTC-SJH Joint Center for Human Reproduction and Genetics, School of Life Sciences, University of Science and Technology of China, Hefei, 230027, China.
Zhang Y; Hefei National Laboratory for Physical Sciences at Microscale, USTC-SJH Joint Center for Human Reproduction and Genetics, School of Life Sciences, University of Science and Technology of China, Hefei, 230027, China. zyuanwei@ustc.edu.cn.

BMC Bioinformatics ; 21(1): 331, 2020 Jul 23.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32703148

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Programas Informáticos; Simulación por Computador; Genómica/métodos; Reproducibilidad de los Resultados

Palabras clave

Base substitution errors; Intra-tumor heterogeneity; Next-generation sequencing; Phred base quality; Simulators

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Análisis de Secuencia de ADN / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: China Pais de publicación: Reino Unido

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