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High-Quality Draft Genome Sequence Resources of Eight Xylella fastidiosa Strains Isolated from Citrus, Coffee, Plum, and Hibiscus in South America.
Pierry, Paulo Marques; de Santana, Wesley Oliveira; Kitajima, João Paulo; Martins-Junior, Joaquim; Zaini, Paulo Adriano; Uceda-Campos, Guillermo; Feitosa-Junior, Oseias R; Pessoa, Patrícia Isabela Silva; Coletta-Filho, Helvécio Della; de Souza, Alessandra Alves; Machado, Marcos Antonio; Gesteira, Abelmon da Silva; Martins, Layla Farage; Amaral, Murilo Sena; Beckedorff, Felipe Cesar; de Almeida, Luiz Gonzaga Paula; de Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro; Verjovski-Almeida, Sergio; Setubal, João Carlos; da Silva, Aline Maria.
Afiliación
  • Pierry PM; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • de Santana WO; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • Kitajima JP; Mendelics Análise Genômica, São Paulo, SP, Brazil.
  • Martins-Junior J; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • Zaini PA; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • Uceda-Campos G; Department of Plant Sciences, University of California, Davis, CA, U.S.A.
  • Feitosa-Junior OR; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • Pessoa PIS; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • Coletta-Filho HD; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • de Souza AA; Centro de Citricultura Sylvio Moreira, Instituto Agronômico de Campinas, Cordeirópolis, SP, Brazil.
  • Machado MA; Centro de Citricultura Sylvio Moreira, Instituto Agronômico de Campinas, Cordeirópolis, SP, Brazil.
  • Gesteira ADS; Centro de Citricultura Sylvio Moreira, Instituto Agronômico de Campinas, Cordeirópolis, SP, Brazil.
  • Martins LF; Embrapa Mandioca e Fruticultura, Cruz Das Almas, BA, Brazil.
  • Amaral MS; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • Beckedorff FC; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • de Almeida LGP; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • de Vasconcelos ATR; Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, RJ, Brazil.
  • Verjovski-Almeida S; Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, RJ, Brazil.
  • Setubal JC; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
  • da Silva AM; Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil.
Phytopathology ; 110(11): 1751-1755, 2020 Nov.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32520631
Xylella fastidiosa subsp. pauca, once confined to South America and infecting mainly citrus and coffee plants, has been found to be associated with other hosts and in other geographic regions. We present high-quality draft genome sequences of X. fastidiosa subsp. pauca strains J1a12, B111, U24D, and XRB isolated from citrus plants in Brazil, strain Fb7 isolated from a citrus plant in Argentina and strains 3124, Pr8x, and Hib4 isolated, respectively, from coffee, plum, and hibiscus plants in Brazil. Sequencing was performed using Roche 454-GS FLX, MiSeq-Illumina or Pacific Biosciences platforms. These high-quality genome assemblies will be useful for further studies about the genomic diversity, evolution, and biology of X. fastidiosa.
Asunto(s)
Palabras clave

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Citrus / Hibiscus / Xylella / Prunus domestica País/Región como asunto: America do sul / Argentina / Brasil Idioma: En Revista: Phytopathology Asunto de la revista: BOTANICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Estados Unidos

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Citrus / Hibiscus / Xylella / Prunus domestica País/Región como asunto: America do sul / Argentina / Brasil Idioma: En Revista: Phytopathology Asunto de la revista: BOTANICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Estados Unidos