Intraresidual Correlated Motions in Peptide Chains.

Bastida, Adolfo; Carmona-García, Javier; Zúñiga, José; Requena, Alberto; Cerezo, Javier

Bastida, Adolfo; Carmona-García, Javier; Zúñiga, José; Requena, Alberto; Cerezo, Javier.

Afiliación

Bastida A; Departamento de Química Física , Universidad de Murcia , 30100 Murcia , Spain.
Carmona-García J; Departamento de Química Física , Universidad de Murcia , 30100 Murcia , Spain.
Zúñiga J; Departamento de Química Física , Universidad de Murcia , 30100 Murcia , Spain.
Requena A; Departamento de Química Física , Universidad de Murcia , 30100 Murcia , Spain.
Cerezo J; Departamento de Química , Universidad Autónoma de Madrid , 28049 Madrid , Spain.

J Chem Inf Model ; 59(11): 4524-4527, 2019 11 25.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31670959

RESUMEN

We investigate the interresidual and intraresidual correlations between dihedral displacements of adjacent residues within model polyalanine peptides by analyzing extensive molecular dynamics trajectories. Correlations are evaluated individually at different residue conformations covering the whole (Ïi,ψi)-space. From these, we draw maps that unveil an unprecedented strong intramolecular correlation displaying opposite (correlated/anticorrelated) behaviors at different conformations. Both interresidual and intraresidual correlations arise from the propensity of the peptide to minimize the overall atomic displacements.

Asunto(s)

Péptidos/química; Simulación de Dinámica Molecular; Conformación Proteica; Teoría Cuántica; Termodinámica

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Péptidos Idioma: En Revista: J Chem Inf Model Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA / QUIMICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: España Pais de publicación: Estados Unidos

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