A model of pulldown alignments from SssI-treated DNA improves DNA methylation prediction.

Moreland, Blythe S; Oman, Kenji M; Bundschuh, Ralf

Moreland, Blythe S; Oman, Kenji M; Bundschuh, Ralf.

Afiliación

Moreland BS; Department of Physics, The Ohio State University, Columbus, OH, USA.
Oman KM; Present address: Institute for Genomic Medicine, Nationwide Children's Hospital, Columbus, OH,, USA.
Bundschuh R; Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA, USA.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 431, 2019 Aug 19.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31426747

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Metilación de ADN/genética; ADN-Citosina Metilasas/metabolismo; ADN/metabolismo; Modelos Biológicos; Alineación de Secuencia; Algoritmos; Emparejamiento Base; Cromosomas Humanos Par 7/genética; Islas de CpG/genética; Genoma Humano; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Humanos; Dominio de Unión a CpG-Metil; Análisis de Secuencia de ADN/métodos

Palabras clave

DNA methylation; Methyl-CpG-binding domain proteins; Protein pulldown; SssI treatment

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: ADN / ADN-Citosina Metilasas / Alineación de Secuencia / Biología Computacional / Metilación de ADN / Modelos Biológicos Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido

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