A comparison of three programming languages for a full-fledged next-generation sequencing tool.

Costanza, Pascal; Herzeel, Charlotte; Verachtert, Wilfried

Costanza, Pascal; Herzeel, Charlotte; Verachtert, Wilfried.

Afiliación

Costanza P; imec, ExaScience Lab, Kapeldreef 75, Leuven, 3001, Belgium.
Herzeel C; imec, ExaScience Lab, Kapeldreef 75, Leuven, 3001, Belgium.
Verachtert W; imec, ExaScience Lab, Kapeldreef 75, Leuven, 3001, Belgium.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 301, 2019 Jun 03.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31159721

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Lenguajes de Programación; Benchmarking; Humanos; Programas Informáticos; Factores de Tiempo

Palabras clave

C++; Garbage collection; Go; Java; Memory usage; Next-generation sequencing; Reference counting; Runtime performance; SAM/BAM files; Sequence analysis

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Lenguajes de Programación / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Bélgica Pais de publicación: Reino Unido

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