Molecular characterization of a Korean porcine epidemic diarrhea virus strain NB1.
Can J Vet Res
; 83(2): 97-103, 2019 Apr.
Article
en En
| MEDLINE
| ID: mdl-31097871
En Corée, pour les 30 dernières années (1987 à ce jour), la diarrhée épidémique porcine (DEP) s'est établie comme une situation endémique dans laquelle de multiples génogroupes des classiques G1 et G2b, ainsi que le G2a pandémique récemment introduit, ont coexisté. Étant donné la nature dynamique du virus, un suivi continu sur le terrain des souches de DEP est requis. La présente étude est la première à révéler la prévalence de DEP dans neuf provinces échantillonnées, avec un taux de détection global de 6,70 %. Le virus de la DEP (VDEP) était présent chez les porcs de tout âge, spécialement dans les groupes d'animaux non-vaccinés contre la DEP. Les animaux dans le groupe en finition avaient taux de détection le plus élevé (2,34 %), suivi par ceux du groupe des nouveau-nés (1,56 %). Deuxièmement, en utilisant le séquençage de Sanger, nous avons récupéré un génome complet (28 005 nucléotides de long) de la souche NB1 sur une ferme sévèrement affectée par la DEP. L'analyse des nucléotides et des séquences d'acides aminés déduites a montré que NB1 différaient de 18 autres VDEP coréens principalement dans quatre gènes codant pour protéines: ORF1a, ORF1b, S, et N. Deux substitutions d'acides aminés (V635E et Y681Q) dans les épitopes neutralisants COE et S1D de NB1 ont résulté en une altération de l'index antigénique des sites adjacents, dont l'un contribuait à une mutation qui échappait aux anticorps neutralisants.(Traduit par Docteur Serge Messier).
Texto completo:
1
Colección:
01-internacional
Base de datos:
MEDLINE
Asunto principal:
Enfermedades de los Porcinos
/
Infecciones por Coronavirus
/
Virus de la Diarrea Epidémica Porcina
Tipo de estudio:
Risk_factors_studies
Límite:
Animals
País/Región como asunto:
Asia
Idioma:
En
Revista:
Can J Vet Res
Asunto de la revista:
MEDICINA VETERINARIA
Año:
2019
Tipo del documento:
Article
Pais de publicación:
Canadá