Spatiotemporal Developmental Trajectories in the Arabidopsis Root Revealed Using High-Throughput Single-Cell RNA Sequencing.

Denyer, Tom; Ma, Xiaoli; Klesen, Simon; Scacchi, Emanuele; Nieselt, Kay; Timmermans, Marja C P

Denyer, Tom; Ma, Xiaoli; Klesen, Simon; Scacchi, Emanuele; Nieselt, Kay; Timmermans, Marja C P.

Afiliación

Denyer T; Center for Plant Molecular Biology, University of Tübingen, Auf der Morgenstelle 32, Tübingen 72076, Germany.
Ma X; Center for Plant Molecular Biology, University of Tübingen, Auf der Morgenstelle 32, Tübingen 72076, Germany.
Klesen S; Center for Plant Molecular Biology, University of Tübingen, Auf der Morgenstelle 32, Tübingen 72076, Germany.
Scacchi E; Center for Plant Molecular Biology, University of Tübingen, Auf der Morgenstelle 32, Tübingen 72076, Germany.
Nieselt K; Center for Bioinformatics, University of Tübingen, Sand 14, Tübingen 72076, Germany.
Timmermans MCP; Center for Plant Molecular Biology, University of Tübingen, Auf der Morgenstelle 32, Tübingen 72076, Germany. Electronic address: marja.timmermans@zmbp.uni-tuebingen.de.

Dev Cell ; 48(6): 840-852.e5, 2019 03 25.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30913408

Asunto(s)

Arabidopsis/embriología; Arabidopsis/genética; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Raíces de Plantas/embriología; Raíces de Plantas/genética; Análisis de Secuencia de ARN; Análisis de la Célula Individual; Diferenciación Celular/genética; Regulación de la Expresión Génica de las Plantas; Redes Reguladoras de Genes; Genes de Plantas; Marcadores Genéticos; Meristema/citología; Meristema/genética; Reproducibilidad de los Resultados; Factores de Tiempo; Factores de Transcripción/metabolismo; Transcripción Genética

Palabras clave

gene regulatory network; pseudotime; quiescent center; root development; scRNA-seq; single-cell RNA sequencing; spatiotemporal gene expression; stem cell; trichoblast

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Análisis de Secuencia de ARN / Arabidopsis / Raíces de Plantas / Análisis de la Célula Individual / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Dev Cell Asunto de la revista: EMBRIOLOGIA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania Pais de publicación: Estados Unidos

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