TNER: a novel background error suppression method for mutation detection in circulating tumor DNA.

Deng, Shibing; Lira, Maruja; Huang, Donghui; Wang, Kai; Valdez, Crystal; Kinong, Jennifer; Rejto, Paul A; Bienkowska, Jadwiga; Hardwick, James; Xie, Tao

Deng, Shibing; Lira, Maruja; Huang, Donghui; Wang, Kai; Valdez, Crystal; Kinong, Jennifer; Rejto, Paul A; Bienkowska, Jadwiga; Hardwick, James; Xie, Tao.

Afiliación

Deng S; Pfizer Early Clinical Development Biostatistics, Cambridge, UK.
Lira M; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Huang D; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Wang K; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Valdez C; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Kinong J; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Rejto PA; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Bienkowska J; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Hardwick J; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Xie T; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA. xietao2000@gmail.com.

BMC Bioinformatics ; 19(1): 387, 2018 Oct 20.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30342468

Asunto(s)

ADN Tumoral Circulante/genética; Análisis Mutacional de ADN/métodos; Mutación/genética; Simulación por Computador; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Humanos; Neoplasias/genética; Distribución Normal; Curva ROC; Programas Informáticos

Palabras clave

Error suppression; Next-generation sequencing; Single-nucleotide variant; Variant calling; ctDNA

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Análisis Mutacional de ADN / ADN Tumoral Circulante / Mutación Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Screening_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Reino Unido Pais de publicación: Reino Unido

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