Exploring Configuration Space and Path Space of Biomolecules Using Enhanced Sampling Techniques-Searching for Mechanism and Kinetics of Biomolecular Functions.

Fujisaki, Hiroshi; Moritsugu, Kei; Matsunaga, Yasuhiro

Fujisaki, Hiroshi; Moritsugu, Kei; Matsunaga, Yasuhiro.

Afiliación

Fujisaki H; Department of Physics, Nippon Medical School, 1-7-1 Kyonan-cho, Musashino, Tokyo 180-0023, Japan. fujisaki@nms.ac.jp.
Moritsugu K; AMED-CREST, Japan Agency for Medical Research and Development, 1-1-5 Sendagi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8603, Japan. fujisaki@nms.ac.jp.
Matsunaga Y; Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, 1-7-29 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama 230-0045, Japan. moritugu@yokohama-cu.ac.jp.

Int J Mol Sci ; 19(10)2018 Oct 15.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30326661

Asunto(s)

Modelos Moleculares; Conformación Molecular; Algoritmos; Cinética; Conformación Proteica; Proteínas/química

Palabras clave

OnsagerMachlup action; molecular dynamics simulation; multidrug transporter; multiscale enhanced sampling; rare event; string method; weighted ensemble

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Modelos Moleculares / Conformación Molecular Idioma: En Revista: Int J Mol Sci Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Japón Pais de publicación: Suiza

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