From RNA-seq to Biological Inference: Using Compositional Data Analysis in Meta-Transcriptomics.

Macklaim, Jean M; Gloor, Gregory B

Macklaim, Jean M; Gloor, Gregory B.

Afiliación

Macklaim JM; Department of Biochemistry, Schulich School of Medicine and Dentistry, The University of Western Ontario, London, ON, Canada.
Gloor GB; Canadian Centre for Human Microbiome and Probiotic Research, Lawson Health Sciences Centre, London, ON, Canada.

Methods Mol Biol ; 1849: 193-213, 2018.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30298256

Asunto(s)

Bacterias/genética; Biología Computacional/métodos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Metagenoma; Microbiota; Transcriptoma; Bacterias/clasificación; Bacterias/aislamiento & purificación; Humanos

Palabras clave

Bayesian inference; Compositional data; Meta-transcriptome; Microbiome; Probability distribution; Standardized effect; Transcriptomics

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Bacterias / Biología Computacional / Perfilación de la Expresión Génica / Metagenoma / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento / Transcriptoma / Microbiota Límite: Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Canadá Pais de publicación: Estados Unidos

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