BrownieAligner: accurate alignment of Illumina sequencing data to de Bruijn graphs.

Heydari, Mahdi; Miclotte, Giles; Van de Peer, Yves; Fostier, Jan

Heydari, Mahdi; Miclotte, Giles; Van de Peer, Yves; Fostier, Jan.

Afiliación

Heydari M; Department of Information Technology, Ghent University-imec, IDLab, Ghent, B-9052, Belgium.
Miclotte G; Bioinformatics Institute Ghent, Ghent, B-9052, Belgium.
Van de Peer Y; Department of Information Technology, Ghent University-imec, IDLab, Ghent, B-9052, Belgium.
Fostier J; Bioinformatics Institute Ghent, Ghent, B-9052, Belgium.

BMC Bioinformatics ; 19(1): 311, 2018 Sep 04.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30180801

Asunto(s)

Algoritmos; Biología Computacional/métodos; Gráficos por Computador; Genoma Humano; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Humanos; Lenguajes de Programación

Palabras clave

Graph alignment; Illumina; Markov Model; Next-generation sequencing; de Bruijn Graph

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / Gráficos por Computador / Genoma Humano / Análisis de Secuencia de ADN / Biología Computacional / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Bélgica Pais de publicación: Reino Unido

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