StructureFold2: Bringing chemical probing data into the computational fold of RNA structural analysis.

Tack, David C; Tang, Yin; Ritchey, Laura E; Assmann, Sarah M; Bevilacqua, Philip C

Tack, David C; Tang, Yin; Ritchey, Laura E; Assmann, Sarah M; Bevilacqua, Philip C.

Afiliación

Tack DC; Department of Biology, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA; Department of Chemistry, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA.
Tang Y; Department of Genetics, Yale University School of Medicine, New Haven, CT 06520, USA.
Ritchey LE; Department of Chemistry, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA; Center for RNA Molecular Biology, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA.
Assmann SM; Department of Biology, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA; Center for RNA Molecular Biology, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA. Electronic address: sma3@psu.edu.
Bevilacqua PC; Department of Chemistry, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA; Center for RNA Molecular Biology, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA; Department of Biochemistry & Molecular Biology, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA.

Methods ; 143: 12-15, 2018 07 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29410279

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Conformación de Ácido Nucleico; ARN/química; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Algoritmos; Biología Computacional/instrumentación; Perfilación de la Expresión Génica/instrumentación; Genoma; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/instrumentación; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; ARN/genética; Análisis de Secuencia de ARN/instrumentación; Programas Informáticos; Transcriptoma/genética

Palabras clave

DMS; Glyoxal; RNA structure; SHAPE; Structure-seq; Structurome

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: ARN / Análisis de Secuencia de ARN / Biología Computacional / Perfilación de la Expresión Génica / Conformación de Ácido Nucleico Idioma: En Revista: Methods Asunto de la revista: BIOQUIMICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Estados Unidos

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