ChopStitch: exon annotation and splice graph construction using transcriptome assembly and whole genome sequencing data.

Khan, Hamza; Mohamadi, Hamid; Vandervalk, Benjamin P; Warren, Rene L; Chu, Justin; Birol, Inanc

Khan, Hamza; Mohamadi, Hamid; Vandervalk, Benjamin P; Warren, Rene L; Chu, Justin; Birol, Inanc.

Afiliación

Khan H; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Mohamadi H; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Vandervalk BP; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Warren RL; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Chu J; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Birol I; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.

Bioinformatics ; 34(10): 1697-1704, 2018 05 15.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29300846

Asunto(s)

Empalme Alternativo; Exones; Transcriptoma; Secuenciación Completa del Genoma; Algoritmos; Genoma; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; ARN; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Programas Informáticos

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Exones / Empalme Alternativo / Transcriptoma / Secuenciación Completa del Genoma Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Canadá Pais de publicación: Reino Unido

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