MICRA: an automatic pipeline for fast characterization of microbial genomes from high-throughput sequencing data.

Caboche, Ségolène; Even, Gaël; Loywick, Alexandre; Audebert, Christophe; Hot, David

Caboche, Ségolène; Even, Gaël; Loywick, Alexandre; Audebert, Christophe; Hot, David.

Afiliación

Caboche S; University of Lille, CNRS, Inserm, CHU Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019-UMR 8204-CIIL-Centre d'Infection et d'Immunité de Lille, F-59000, Lille, France. segolene.caboche@pasteur-lille.fr.
Even G; PEGASE-Biosciences, Institut Pasteur de Lille, 1 Rue du Professeur Calmette, 59019, Lille, France. segolene.caboche@pasteur-lille.fr.
Loywick A; Genes Diffusion, 3595, Route de Tournai, 59501, Douai, France.
Audebert C; PEGASE-Biosciences, Institut Pasteur de Lille, 1 Rue du Professeur Calmette, 59019, Lille, France.
Hot D; Genes Diffusion, 3595, Route de Tournai, 59501, Douai, France.

Genome Biol ; 18(1): 233, 2017 12 19.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29258574

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Genoma Microbiano; Genómica/métodos; Programas Informáticos; Bases de Datos Genéticas; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Humanos; Reproducibilidad de los Resultados; Investigación; Análisis de Secuencia de ADN; Navegador Web; Flujo de Trabajo

Palabras clave

Bioinformatics pipeline; Comparative genomics; High-throughput sequencing; Microbial genome characterization

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Biología Computacional / Genómica / Genoma Microbiano Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia Pais de publicación: Reino Unido

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