SparkBLAST: scalable BLAST processing using in-memory operations.

de Castro, Marcelo Rodrigo; Tostes, Catherine Dos Santos; Dávila, Alberto M R; Senger, Hermes; da Silva, Fabricio A B

de Castro, Marcelo Rodrigo; Tostes, Catherine Dos Santos; Dávila, Alberto M R; Senger, Hermes; da Silva, Fabricio A B.

Afiliación

de Castro MR; Computer Science Department, Federal University of São Carlos, Rod. Washington Luís, Km 235, São Carlos, 21040-900, Brazil.
Tostes CDS; LBCS-IOC, Oswaldo Cruz Foundation, Av Brasil 4365, Rio de Janeiro, 21040-900, Brazil.
Dávila AMR; LBCS-IOC, Oswaldo Cruz Foundation, Av Brasil 4365, Rio de Janeiro, 21040-900, Brazil.
Senger H; Computer Science Department, Federal University of São Carlos, Rod. Washington Luís, Km 235, São Carlos, 21040-900, Brazil.
da Silva FAB; PROCC, Oswaldo Cruz Foundation, Av. Brasil 4365, Rio de Janeiro, 21040-900, Brazil. fabricio.silva@fiocruz.br.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 318, 2017 Jun 27.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28655296

Asunto(s)

Programas Informáticos; Algoritmos; Nube Computacional; Hibridación Genómica Comparativa; Bases de Datos Factuales; Alineación de Secuencia

Palabras clave

Cloud computing; Comparative genomics; Scalability; Spark

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Reino Unido

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