Exploiting fine-scale genetic and physiological variation of closely related microbes to reveal unknown enzyme functions.

Badur, Ahmet H; Plutz, Matthew J; Yalamanchili, Geethika; Jagtap, Sujit Sadashiv; Schweder, Thomas; Unfried, Frank; Markert, Stephanie; Polz, Martin F; Hehemann, Jan-Hendrik; Rao, Christopher V

Badur, Ahmet H; Plutz, Matthew J; Yalamanchili, Geethika; Jagtap, Sujit Sadashiv; Schweder, Thomas; Unfried, Frank; Markert, Stephanie; Polz, Martin F; Hehemann, Jan-Hendrik; Rao, Christopher V.

Afiliación

Badur AH; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, Illinois 61801.
Plutz MJ; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, Illinois 61801.
Yalamanchili G; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, Illinois 61801.
Jagtap SS; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, Illinois 61801.
Schweder T; Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst Moritz Arndt University of Greifswald, D-17489 Greifswald, Germany.
Unfried F; Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst Moritz Arndt University of Greifswald, D-17489 Greifswald, Germany.
Markert S; Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst Moritz Arndt University of Greifswald, D-17489 Greifswald, Germany.
Polz MF; Department of Civil and Environmental Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, Massachusetts 02139.
Hehemann JH; Center for Marine Environmental Sciences University of Bremen (MARUM), Bremen 28359, Germany; Max Planck-Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen 28359, Germany. Electronic address: jhhehemann@marum.de.
Rao CV; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, Illinois 61801. Electronic address: cvrao@illinois.edu.

J Biol Chem ; 292(31): 13056-13067, 2017 08 04.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28592491

Asunto(s)

Alginatos/metabolismo; Organismos Acuáticos/fisiología; Proteínas Bacterianas/metabolismo; Polisacárido Liasas/metabolismo; Vibrio/fisiología; Alginatos/química; Organismos Acuáticos/enzimología; Organismos Acuáticos/crecimiento & desarrollo; Proteínas Bacterianas/química; Proteínas Bacterianas/genética; Biomarcadores/metabolismo; Cristalografía por Rayos X; Regulación Bacteriana de la Expresión Génica; Técnicas de Inactivación de Genes; Genómica/métodos; Ácido Glucurónico/química; Ácido Glucurónico/metabolismo; Ácidos Hexurónicos/química; Ácidos Hexurónicos/metabolismo; Concentración de Iones de Hidrógeno; Hidrólisis; Isoenzimas/genética; Isoenzimas/aislamiento & purificación; Isoenzimas/metabolismo; Estructura Molecular; Peso Molecular; Filogenia; Polisacárido Liasas/química; Polisacárido Liasas/genética; Proteómica/métodos; Proteínas Recombinantes/aislamiento & purificación; Proteínas Recombinantes/metabolismo; Especificidad de la Especie; Especificidad por Sustrato; Vibrio/enzimología; Vibrio/crecimiento & desarrollo

Palabras clave

Vibrio splendidus; algae; alginate lyase; bacteria; enzyme kinetics; mass spectrometry (MS); nuclear magnetic resonance (NMR)

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Polisacárido Liasas / Proteínas Bacterianas / Vibrio / Alginatos / Organismos Acuáticos Idioma: En Revista: J Biol Chem Año: 2017 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Estados Unidos

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