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Indel variant analysis of short-read sequencing data with Scalpel.
Fang, Han; Bergmann, Ewa A; Arora, Kanika; Vacic, Vladimir; Zody, Michael C; Iossifov, Ivan; O'Rawe, Jason A; Wu, Yiyang; Jimenez Barron, Laura T; Rosenbaum, Julie; Ronemus, Michael; Lee, Yoon-Ha; Wang, Zihua; Dikoglu, Esra; Jobanputra, Vaidehi; Lyon, Gholson J; Wigler, Michael; Schatz, Michael C; Narzisi, Giuseppe.
Afiliación
  • Fang H; Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Bergmann EA; Stanley Institute for Cognitive Genomics, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Arora K; Stony Brook University, Stony Brook, New York, USA.
  • Vacic V; New York Genome Center, New York, New York, USA.
  • Zody MC; New York Genome Center, New York, New York, USA.
  • Iossifov I; New York Genome Center, New York, New York, USA.
  • O'Rawe JA; New York Genome Center, New York, New York, USA.
  • Wu Y; Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Jimenez Barron LT; Stanley Institute for Cognitive Genomics, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Rosenbaum J; Stony Brook University, Stony Brook, New York, USA.
  • Ronemus M; Stanley Institute for Cognitive Genomics, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Lee YH; Stony Brook University, Stony Brook, New York, USA.
  • Wang Z; Stanley Institute for Cognitive Genomics, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Dikoglu E; Centro de Ciencias Genomicas, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Cuernavaca, Mexico.
  • Jobanputra V; Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Lyon GJ; Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Wigler M; Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Schatz MC; Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
  • Narzisi G; Stanley Institute for Cognitive Genomics, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA.
Nat Protoc ; 11(12): 2529-2548, 2016 Dec.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27854363
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Análisis Mutacional de ADN / Mutación INDEL / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Límite: Humans Idioma: En Revista: Nat Protoc Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Análisis Mutacional de ADN / Mutación INDEL / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Límite: Humans Idioma: En Revista: Nat Protoc Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido