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Complete genome sequence of a putative new secovirus infecting yam (Dioscorea) plants.
Hayashi, Evelyn Anly Ishikawa; Blawid, Rosana; de Melo, Fernando Lucas; Andrade, Miguel Souza; Pio-Ribeiro, Gilvan; de Andrade, Genira Pereira; Nagata, Tatsuya.
Afiliación
  • Hayashi EAI; Laboratório de Fitovirologia, Departamento de Agronomia, Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, PE, CEP 52171-900, Brazil.
  • Blawid R; Laboratório de Microscopia Eletrônica, Departamento de Biologia Celular, Universidade de Brasília, Brasília, DF, CEP 70910-900, Brazil.
  • de Melo FL; Laboratório de Microscopia Eletrônica, Departamento de Biologia Celular, Universidade de Brasília, Brasília, DF, CEP 70910-900, Brazil.
  • Andrade MS; Laboratório de Microscopia Eletrônica, Departamento de Biologia Celular, Universidade de Brasília, Brasília, DF, CEP 70910-900, Brazil.
  • Pio-Ribeiro G; Laboratório de Fitovirologia, Departamento de Agronomia, Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, PE, CEP 52171-900, Brazil.
  • de Andrade GP; Laboratório de Fitovirologia, Departamento de Agronomia, Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, PE, CEP 52171-900, Brazil.
  • Nagata T; Laboratório de Microscopia Eletrônica, Departamento de Biologia Celular, Universidade de Brasília, Brasília, DF, CEP 70910-900, Brazil. tatsuya@unb.br.
Arch Virol ; 162(1): 317-319, 2017 Jan.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27730382
The complete genome sequence of a new virus infecting yam plants exhibiting mosaic symptom in Brazil was determined. The genome of this virus is composed of two molecules of positive-sense RNAs of 5979 and 3809 nucleotides in length, excluding the poly(A) tails. One large open reading frame (ORF) in each genomic segment (RNA1-ORF1 and RNA2-ORF2) was predicted. The highest amino acid sequence similarity in the Pro-Pol core region of RNA1 and the CP region of RNA2 was observed with chocolate lily virus A (a putative member of the family Secoviridae), with 54.6 and 27.7 % identity, respectively. This virus is thus likely to be a new member of the family Secoviridae, and we propose the tentative name "dioscorea mosaic-associated virus" (DMaV) for this virus.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Virus de Plantas / Virus ARN / ARN Viral / Genoma Viral / Análisis de Secuencia de ADN / Dioscorea País/Región como asunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Arch Virol Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Austria
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