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Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: A candidate for meat tenderness in cattle.
de Souza, M M; Niciura, S C M; Tizioto, P C; Ibelli, A M G; Gasparin, G; Rocha, M I P; Bressani, F A; Malagó, W; Diniz, W J S; de Oliveira, P S N; Lima, A O; Mudadu, M A; Barioni Junior, W; Coutinho, L L; Regitano, L C A.
Afiliación
  • de Souza MM; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, Brasil.
  • Niciura SC; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, Brasil.
  • Tizioto PC; Laboratório de Biotecnologia Animal, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brasil.
  • Ibelli AM; Laboratório de Biotecnologia Animal, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brasil.
  • Gasparin G; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, Brasil.
  • Rocha MI; Laboratório de Genética Animal, Embrapa Suínos e Aves, Concórdia, SC, Brasil.
  • Bressani FA; Departamento de Zootecnia, Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", Universidade de São Paulo, Piracicaba, SP, Brasil.
  • Malagó W; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, Brasil.
  • Diniz WJ; Laboratório de Biotecnologia Animal, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brasil.
  • de Oliveira PS; Laboratório de Biotecnologia Animal, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brasil.
  • Lima AO; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, Brasil.
  • Mudadu MA; Laboratório de Biotecnologia Animal, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brasil.
  • Barioni Junior W; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, Brasil.
  • Coutinho LL; Laboratório de Biotecnologia Animal, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brasil.
  • Regitano LC; Laboratório de Biotecnologia Animal, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brasil.
Genet Mol Res ; 15(3)2016 08 29.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27706648
In contrast to the Mendelian inheritance model, parental alleles can contribute unequally to gene expression, which may result in phenotypic variance among individuals and bias in the predicted additive effect of molecular markers associated with production traits. Given the need to understand the effects of allelic variation and parent-of-origin effects on the expression of genes with a commercial interest in cattle, we analyzed the expression of KCNJ11 (potassium inwardly rectifying channel, subfamily J, member 11), which was previously described as a functional candidate gene for meat tenderness. Allele-specific and parent-of-origin-dependent expression of this gene were assessed in bovine muscle using the rs379610823 single nucleotide polymorphism as a reference. Biallelic expression was observed; however, the T allele was expressed at significantly higher levels than the C allele. Furthermore, increased expression of KCNJ11 was found in animals harboring the maternal T allele. This study is the first to describe the differential allelic expression of bovine KCNJ11. Our findings are important for understanding the mechanisms that underlie the pattern of KCNJ11 expression and its potential impact on the phenotypic variation of meat tenderness in Nelore beef cattle. This reinforces the need for further investigation of allelic- and parent-of-origin expression deviation in genetic markers eligible for the selection of target traits.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Marcadores Genéticos / Carácter Cuantitativo Heredable / Canales de Potasio de Rectificación Interna / Patrón de Herencia / Carne Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Genet Mol Res Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Brasil
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