Structural and mechanistic insights into a Bacteroides vulgatus retaining N-acetyl-ß-galactosaminidase that uses neighbouring group participation.

Roth, C; Petricevic, M; John, A; Goddard-Borger, E D; Davies, G J; Williams, S J

Roth, C; Petricevic, M; John, A; Goddard-Borger, E D; Davies, G J; Williams, S J.

Afiliación

Roth C; Department of Chemistry, University of York, Heslington, York, UK. gideon.davies@york.ac.uk.

Chem Commun (Camb) ; 52(74): 11096-9, 2016 Sep 25.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27546776

RESUMEN

Bacteroides vulgatus is a member of the human microbiota whose abundance is increased in patients with Crohn's disease. We show that a B. vulgatus glycoside hydrolase from the carbohydrate active enzyme family GH123, BvGH123, is an N-acetyl-ß-galactosaminidase that acts with retention of stereochemistry, and, through a 3-D structure in complex with Gal-thiazoline, provide evidence in support of a neighbouring group participation mechanism.

Asunto(s)

Bacteroides/enzimología; beta-N-Acetil-Galactosaminidasa/metabolismo; Acetilglucosamina/análogos & derivados; Acetilglucosamina/química; Acetilglucosamina/metabolismo; Sitios de Unión; Dominio Catalítico; Enfermedad de Crohn/etiología; Enfermedad de Crohn/microbiología; Humanos; Simulación de Dinámica Molecular; Estereoisomerismo; Especificidad por Sustrato; Tiazoles/química; Tiazoles/metabolismo; beta-N-Acetil-Galactosaminidasa/química

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Bacteroides / Beta-N-Acetil-Galactosaminidasa Tipo de estudio: Etiology_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Chem Commun (Camb) Asunto de la revista: QUIMICA Año: 2016 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Reino Unido

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google