iPPBS-Opt: A Sequence-Based Ensemble Classifier for Identifying Protein-Protein Binding Sites by Optimizing Imbalanced Training Datasets.

Jia, Jianhua; Liu, Zi; Xiao, Xuan; Liu, Bingxiang; Chou, Kuo-Chen

Jia, Jianhua; Liu, Zi; Xiao, Xuan; Liu, Bingxiang; Chou, Kuo-Chen.

Afiliación

Jia J; Computer Department, Jing-De-Zhen Ceramic Institute, Jing-De-Zhen 333403, China. jjia@gordonlifescience.org.
Liu Z; Gordon Life Science Institute, Boston, MA 02478, USA. jjia@gordonlifescience.org.
Xiao X; Computer Department, Jing-De-Zhen Ceramic Institute, Jing-De-Zhen 333403, China. liuzi189836@163.com.
Liu B; Computer Department, Jing-De-Zhen Ceramic Institute, Jing-De-Zhen 333403, China. xxiao@gordonlifescience.org.
Chou KC; Gordon Life Science Institute, Boston, MA 02478, USA. xxiao@gordonlifescience.org.

Molecules ; 21(1): E95, 2016 Jan 19.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-26797600

Asunto(s)

Sitios de Unión; Proteínas Portadoras/química; Biología Computacional/métodos; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; Proteínas/química; Programas Informáticos; Algoritmos; Proteínas Portadoras/metabolismo; Conjuntos de Datos como Asunto; Proteínas/metabolismo

Palabras clave

IHTS; KNNC; Optimize training dataset; PseAAC; physicochemical property; protein-protein binding sites; stationary wavelet transform; target cross-validation

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Sitios de Unión / Programas Informáticos / Proteínas / Proteínas Portadoras / Biología Computacional / Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Molecules Asunto de la revista: BIOLOGIA Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: China Pais de publicación: Suiza

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