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Reference-free compression of high throughput sequencing data with a probabilistic de Bruijn graph.
Benoit, Gaëtan; Lemaitre, Claire; Lavenier, Dominique; Drezen, Erwan; Dayris, Thibault; Uricaru, Raluca; Rizk, Guillaume.
Afiliación
  • Benoit G; INRIA/IRISA/GenScale, Campus de Beaulieu, Rennes, 35042, France. gaetan.benoit@inria.fr.
  • Lemaitre C; INRIA/IRISA/GenScale, Campus de Beaulieu, Rennes, 35042, France. claire.lemaitre@inria.fr.
  • Lavenier D; INRIA/IRISA/GenScale, Campus de Beaulieu, Rennes, 35042, France. dominique.lavenier@irisa.fr.
  • Drezen E; INRIA/IRISA/GenScale, Campus de Beaulieu, Rennes, 35042, France. erwan.drezen@inria.fr.
  • Dayris T; University of Bordeaux, CNRS/LaBRI, Talence, F-33405, France. thibault.dayris@outlook.fr.
  • Uricaru R; University of Bordeaux, CNRS/LaBRI, Talence, F-33405, France. ruricaru@labri.fr.
  • Rizk G; University of Bordeaux, CBiB, Bordeaux, F-33000, France. ruricaru@labri.fr.
BMC Bioinformatics ; 16: 288, 2015 Sep 14.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-26370285
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / Gráficos por Computador / Programas Informáticos / Caenorhabditis elegans / Proteínas de Caenorhabditis elegans / Compresión de Datos / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2015 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia Pais de publicación: Reino Unido
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