Report on the effects of fragment size, indexing, and read length on HLA sequencing on the Illumina MiSeq.

Profaizer, T; Coonrod, E M; Delgado, J C; Kumánovics, A

Profaizer, T; Coonrod, E M; Delgado, J C; Kumánovics, A.

Afiliación

Profaizer T; ARUP Institute for Clinical and Experimental Pathology, Department of Pathology, University of Utah School of Medicine, Salt Lake City, UT 84132, United States. Electronic address: tracie.profaizer@aruplab.com.
Coonrod EM; ARUP Institute for Clinical and Experimental Pathology, Department of Pathology, University of Utah School of Medicine, Salt Lake City, UT 84132, United States.
Delgado JC; ARUP Institute for Clinical and Experimental Pathology, Department of Pathology, University of Utah School of Medicine, Salt Lake City, UT 84132, United States.
Kumánovics A; ARUP Institute for Clinical and Experimental Pathology, Department of Pathology, University of Utah School of Medicine, Salt Lake City, UT 84132, United States.

Hum Immunol ; 76(12): 897-902, 2015 Dec.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-26303189

Asunto(s)

Antígenos HLA/genética; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Alelos; Biología Computacional/métodos; Biblioteca de Genes; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/normas; Prueba de Histocompatibilidad; Humanos; Reacción en Cadena de la Polimerasa; Análisis de Secuencia de ADN

Palabras clave

HLA typing; Illumina MiSeq; Next-generation sequencing

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento / Antígenos HLA Límite: Humans Idioma: En Revista: Hum Immunol Año: 2015 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Estados Unidos

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