Hot-spot analysis to dissect the functional protein-protein interface of a tRNA-modifying enzyme.

Jakobi, Stephan; Nguyen, Tran Xuan Phong; Debaene, François; Metz, Alexander; Sanglier-Cianférani, Sarah; Reuter, Klaus; Klebe, Gerhard

Jakobi, Stephan; Nguyen, Tran Xuan Phong; Debaene, François; Metz, Alexander; Sanglier-Cianférani, Sarah; Reuter, Klaus; Klebe, Gerhard.

Afiliación

Jakobi S; Institut für Pharmazeutische Chemie, Philipps-Universität Marburg, Marbacher Weg 6, D-35032, Marburg, Germany.

Proteins ; 82(10): 2713-32, 2014 Oct.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-24975703

Asunto(s)

Modelos Moleculares; Proteínas Mutantes/química; Pentosiltransferasa/química; ARN de Transferencia/metabolismo; Sustitución de Aminoácidos; Proteínas Arqueales/química; Proteínas Arqueales/genética; Proteínas Arqueales/metabolismo; Proteínas Bacterianas/química; Proteínas Bacterianas/genética; Proteínas Bacterianas/metabolismo; Biología Computacional; Bases de Datos de Proteínas; Dimerización; Estabilidad de Enzimas; Proteínas de Escherichia coli/química; Proteínas de Escherichia coli/genética; Proteínas de Escherichia coli/metabolismo; Sistemas Especialistas; Isoenzimas/química; Isoenzimas/genética; Isoenzimas/metabolismo; Cinética; Simulación de Dinámica Molecular; Mutagénesis Sitio-Dirigida; Proteínas Mutantes/metabolismo; Pentosiltransferasa/genética; Pentosiltransferasa/metabolismo; Conformación Proteica; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; Proteínas Recombinantes/química; Proteínas Recombinantes/metabolismo

Palabras clave

MM-GBSA computational stability analysis; crystal structure analysis; interface binding hot spots; native nano-ESI mass spectrometry; protein-protein interaction inhibition; site-directed mutagenesis

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Pentosiltransferasa / ARN de Transferencia / Modelos Moleculares / Proteínas Mutantes Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Proteins Asunto de la revista: BIOQUIMICA Año: 2014 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania Pais de publicación: Estados Unidos

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