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Flexible protein-ligand docking using the Fleksy protocol.
Wagener, Markus; Vlieg, Jacob de; Nabuurs, Sander B.
Afiliación
  • Wagener M; Department of Molecular Design and Informatics, MSD, Oss, The Netherlands.
J Comput Chem ; 33(12): 1215-7, 2012 May 05.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-22371008
Considering protein plasticity is important in accurately predicting the three-dimensional geometry of protein-ligand complexes. Here, we present the first public release of our flexible docking tool Fleksy, which is able to consider both ligand and protein flexibility in the docking process. We describe the workflow and different features of the software and present its performance on two cross-docking benchmark datasets.
Asunto(s)
Palabras clave

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Proteínas / Simulación del Acoplamiento Molecular / Ligandos Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Comput Chem Asunto de la revista: QUIMICA Año: 2012 Tipo del documento: Article País de afiliación: Países Bajos Pais de publicación: Estados Unidos

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Proteínas / Simulación del Acoplamiento Molecular / Ligandos Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Comput Chem Asunto de la revista: QUIMICA Año: 2012 Tipo del documento: Article País de afiliación: Países Bajos Pais de publicación: Estados Unidos