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UCSF Chimera, MODELLER, and IMP: an integrated modeling system.
Yang, Zheng; Lasker, Keren; Schneidman-Duhovny, Dina; Webb, Ben; Huang, Conrad C; Pettersen, Eric F; Goddard, Thomas D; Meng, Elaine C; Sali, Andrej; Ferrin, Thomas E.
Afiliación
  • Yang Z; Resource for Biocomputing, Visualization, and Informatics, Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158, USA.
J Struct Biol ; 179(3): 269-78, 2012 Sep.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-21963794
Structural modeling of macromolecular complexes greatly benefits from interactive visualization capabilities. Here we present the integration of several modeling tools into UCSF Chimera. These include comparative modeling by MODELLER, simultaneous fitting of multiple components into electron microscopy density maps by IMP MultiFit, computing of small-angle X-ray scattering profiles and fitting of the corresponding experimental profile by IMP FoXS, and assessment of amino acid sidechain conformations based on rotamer probabilities and local interactions by Chimera.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Simulación por Computador / Programas Informáticos / Modelos Moleculares Límite: Animals Idioma: En Revista: J Struct Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2012 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Estados Unidos
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