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Determination of DNA mutation load in human tissues using denaturing HPLC-based heteroduplex analysis.
Lim, Kok Seong; Naviaux, Robert K; Haas, Richard H.
Afiliación
  • Lim KS; Department of Biological Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA.
Methods Mol Biol ; 554: 287-99, 2009.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-19513681
Since its introduction more than a decade ago, denaturing HPLC has been widely used to screen nuclear and mitochondrial DNA for mutations. We recently developed a quantitative method based on denaturing HPLC to measure DNA mutation load, using tRNA Leu(UUR) region of the mitochondrial DNA as an example. The mutation load is determined based on the quadratic function that governs DNA reannealing and the formation of heteroduplex and homoduplex DNAs. We have used this assay to measure heteroplasmy level for several mitochondrial mutations in DNAs obtained from human tissue samples. This quantitative DHPLC assay is well suited for simultaneous detection and quantification of DNA mutations.
Asunto(s)

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: ADN Mitocondrial / Análisis Mutacional de ADN / Cromatografía Líquida de Alta Presión / Análisis Heterodúplex / Mitocondrias / Mutación Límite: Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2009 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Estados Unidos

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: ADN Mitocondrial / Análisis Mutacional de ADN / Cromatografía Líquida de Alta Presión / Análisis Heterodúplex / Mitocondrias / Mutación Límite: Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2009 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Estados Unidos