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In house reverse membrane hybridisation assay versus GenoType MTBDRplus and their performance to detect mutations in the genes rpoB, katG and inhA
Ferreira Junior, Sergio Luiz Montego; Costa, Elis Regina Dalla; Santos, Paula Gonçalves dos; Gomes, Harrison Magdinier; Silva, Marcia Susana Nunes; Esteves, Leonardo Souza; Oliveira, Martha Maria; Maschmann, Raquel de Abreu; Kritski, Afrânio Lineu; Suffys, Philip Noel; Rossetti, Maria Lucia Rosa.
Afiliación
  • Ferreira Junior, Sergio Luiz Montego; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Costa, Elis Regina Dalla; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Santos, Paula Gonçalves dos; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Gomes, Harrison Magdinier; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Silva, Marcia Susana Nunes; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Esteves, Leonardo Souza; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Oliveira, Martha Maria; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Maschmann, Raquel de Abreu; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Kritski, Afrânio Lineu; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Suffys, Philip Noel; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
  • Rossetti, Maria Lucia Rosa; Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde. Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Porto Alegre. BR
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 109(3): 307-314, 06/2014. tab
Article en En | LILACS | ID: lil-711730
Biblioteca responsable: BR1.1
ABSTRACT
Drug-resistant tuberculosis (TB) threatens global TB control and is a major public health concern in several countries. We therefore developed a multiplex assay (LINE-TB/MDR) that is able to identify the most frequent mutations related to rifampicin (RMP) and isoniazid (INH) resistance. The assay is based on multiplex polymerase chain reaction, membrane hybridisation and colorimetric detection targeting of rpoB and katG genes, as well as the inhA promoter, which are all known to carry specific mutations associated with multidrug-resistant TB (MDR-TB). The assay was validated on a reference panel of 108 M. tuberculosis isolates that were characterised by the proportion method and by DNA sequencing of the targets. When comparing the performance of LINE-TB/MDR with DNA sequencing, the sensitivity, specificity and agreement were 100%, 100% and 100%, respectively, for RMP and 77.6%, 90.6% and 88.9%, respectively, for INH. Using drug sensibility testing as a reference standard, the performance of LINE-TB/MDR regarding sensitivity, specificity and agreement was 100%, 100% and 100% (95%), respectively, for RMP and 77%, 100% and 88.7% (82.2-95.1), respectively, for INH. LINE-TB/MDR was compared with GenoType MTBDRplus for 65 isolates, resulting in an agreement of 93.6% (86.7-97.5) for RIF and 87.4% (84.3-96.2) for INH. LINE-TB/MDR warrants further clinical validation and may be an affordable alternative for MDR-TB diagnosis.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: LILACS Asunto principal: Oxidorreductasas / Proteínas Bacterianas / Catalasa / Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple / Mutación / Mycobacterium tuberculosis Idioma: En Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Asunto de la revista: MEDICINA TROPICAL / PARASITOLOGIA Año: 2014 Tipo del documento: Article / Project document País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Brasil
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: LILACS Asunto principal: Oxidorreductasas / Proteínas Bacterianas / Catalasa / Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple / Mutación / Mycobacterium tuberculosis Idioma: En Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Asunto de la revista: MEDICINA TROPICAL / PARASITOLOGIA Año: 2014 Tipo del documento: Article / Project document País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Brasil