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PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents
Fileto, R; Kuser, P. R; Yamagishi, M. E; Ribeiro, A. A; Quinalia, T. G; Franco, E. H; Mancini, A. L; Higa, R. H; Oliveira, S. R; Santos, E. H; Vieira, F. D; Mazoni, I; Cruz, S. A; Neshich, G.
Afiliación
  • Fileto, R; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Kuser, P. R; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Yamagishi, M. E; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Ribeiro, A. A; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Quinalia, T. G; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Franco, E. H; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Mancini, A. L; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Higa, R. H; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Oliveira, S. R; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Santos, E. H; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Vieira, F. D; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Mazoni, I; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Cruz, S. A; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
  • Neshich, G; Embrapa Information Technology. Campinas. BR
Genet. mol. res. (Online) ; 5(2): 333-341, 2006. ilus, tab
Article en En | LILACS | ID: lil-442565
Biblioteca responsable: BR1.1
ABSTRACT
PDB-Metrics (http//sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function. It summarizes the characteristics of the collection of protein structure descriptions deposited in the Protein Data Bank (PDB) and provides a Web interface to search and browse the PDB, using a variety of alternative criteria. PDB-Metrics is a powerful tool for bioinformaticians to examine the data span in the PDB from several perspectives. Although other Web sites offer some similar resources to explore the PDB contents, PDB-Metrics is among those with the most complete set of such facilities, integrated into a single Web site. This program has been developed using SQLite, a C library that provides all the query facilities of a database management system
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: LILACS Asunto principal: Programas Informáticos / Proteínas / Bases de Datos Factuales / Internet / Análisis de Secuencia de Proteína / Bases de Datos de Proteínas Idioma: En Revista: Genet. mol. res. (Online) Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2006 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Brasil
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