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Tipificación con oligonucleótidos espaciadores de Mycobacterium tuberculosis en Cuba / Spacer oligonucleotide typing of Mycobacterium tuberculosis in Cuba
Herrera Avila, Yoslany M; Díaz Rodríguez, Raúl; Marrero Figueroa, Antonio; Llanes Cordero, María Josefa; Lemus Molina, Dihadenys; Martínez Rodríguez, Ileana M; Gozé Valdés, Roxana; Fonseca Gómez, Carlos M.
Afiliación
  • Herrera Avila, Yoslany M; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
  • Díaz Rodríguez, Raúl; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
  • Marrero Figueroa, Antonio; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
  • Llanes Cordero, María Josefa; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
  • Lemus Molina, Dihadenys; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
  • Martínez Rodríguez, Ileana M; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
  • Gozé Valdés, Roxana; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
  • Fonseca Gómez, Carlos M; Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí. La Habana. Cuba
Rev. cuba. med. trop ; 67(1)ene.-abr. 2015. tab
Article en Es | CUMED | ID: cum-64891
Biblioteca responsable: CU1.1
Ubicación: CU1.1
RESUMEN
Introducción: el conocimiento de los linajes de Mycobacterium tuberculosis es importante para entender el origen, evolución y propagación de la bacteria. Objetivo: determinar los patrones genéticos de M. tuberculosis circulantes en Cuba. Métodos: estudio descriptivo de corte transversal con un componente analítico en Cuba, en el período comprendido de enero de 2009 a diciembre de 2010. Se aplicó la tipificación con oligonucleótidos espaciadores (Spoligotyping) a 308 aislamientos de M. tuberculosis del período 2009-2010. La clasificación en genotipos se realizó según la base de datos internacional SpolDB4. Los resultados se analizaron además con la herramienta web en línea MIRU-VNTRplus y se compararon con los patrones genéticos de M. tuberculosis identificados en 1993-1995 en Cuba. Resultados: se definieron 79 patrones genotípicos diferentes, de los cuales 46 (62 por ciento) fueron patrones no reportados anteriormente en SpolDB4. Los 22 agrupamientos definidos incluyeron al 75,4 por ciento de los aislamientos estudiados. Se encontraron cinco familias genéticas fundamentales: Beijing (25,6 por ciento), S (19,2 por ciento), LAM (16,9 por ciento), Haarlem (16,9 por ciento) y T (5,8 por ciento). La familia S prevaleció en la región Occidental (OR=3,4; 95 pir ciento IC:1,8-6,3; p<0,05), Beijing en el Centro de Cuba (OR=6,7; 95 por ciento IC:3,7-11,9; p<0,05) y LAM (OR=3,0; 95 por ciento IC:1,6-5,6; p<0.05) y Haarlem en la zona Oriental (OR=1,8; 95 por ciento IC:1,0-3,4; p<0,05). Conclusiones: se observó una gran diversidad genética entre los aislamientos de M. tuberculosis circulante en Cuba en 2009-2010. En el país, la estructura genética de la población de M. tuberculosis ha variado en el tiempo con una disminución de genotipos endémicos como Haarlem y T y un aumento significativo de S y Beijing. Estos datos aportan elementos importantes para la epidemiología y control de la TB en Cuba(AU)
ABSTRACT
Introduction: Knowledge about Mycobacterium tuberculosis lineages is important to understand the origin, evolution and spread of this bacterium. Objective: Determine the genetic patterns of M. tuberculosis circulating in Cuba. Methods: A descriptive cross-sectional study was conducted with an analytical component in Cuba in the period extending from January 2009 to December 2010. Spacer oligonucleotide typing (Spoligotyping) was applied to 308 M. tuberculosis isolates from the period 2009-2010. Classification into genotypes was carried out according to the international database SpolDB4. Results were additionally analyzed with the online tool MIRU-VNTRplus and compared with the M. tuberculosis genetic patterns found in Cuba in 1993-1995. Results: 79 different genotypic patterns were defined, of which 46 (62 percent) had not been previously reported in SpolDB4. The 22 clusters defined included 75.4 percent of the isolates studied. Five main genetic families were found: Beijing (25.6 percent), S (19.2 percent), LAM (16.9 percent), Haarlem (16.9 percent) and T (5.8 percent). The S family prevailed in the Western region (OR=3.4; CI 95 percent:1.8-6.3; p<0.05), Beijing in Central Cuba (OR=6.7; CI 95 percent:3.7-11.9; p<0.05), and LAM (OR=3.0; CI 95 percent:1.6-5.6; p<0.05) and Haarlem in the Eastern region (OR=1.8; CI 95 percent:1.0-3.4; p<0.05). Conclusions: Great diversity was observed among the M. tuberculosis isolates circulating in Cuba in the period 2009-2010. The genetic structure of M. tuberculosis has changed in the country with the passing of time, with a reduction in endemic genotypes like Haarlem and T, and a significant increase in S and Beijing. These data contribute important information for epidemiology and TB control in Cuba(AU)
Asunto(s)
Palabras clave
Texto completo: 1 Colección: 06-national / CU Base de datos: CUMED Asunto principal: Tuberculosis Tipo de estudio: Observational_studies / Prevalence_studies / Risk_factors_studies País/Región como asunto: Caribe / Cuba Idioma: Es Revista: Rev. cuba. med. trop Año: 2015 Tipo del documento: Article
Texto completo: 1 Colección: 06-national / CU Base de datos: CUMED Asunto principal: Tuberculosis Tipo de estudio: Observational_studies / Prevalence_studies / Risk_factors_studies País/Región como asunto: Caribe / Cuba Idioma: Es Revista: Rev. cuba. med. trop Año: 2015 Tipo del documento: Article