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Detection of tuberculosis drug resistance: a comparison by Mycobacterium tuberculosis MLPA assay versus Genotype®MTBDRplus
Santos, Paula Fernanda Gonçalves dos; Costa, Elis Regina Dalla; Ramalho, Daniela M; Rossetti, Maria Lucia; Barcellos, Regina Bones; Nunes, Luciana de Souza; Esteves, Leonardo Souza; Rodenbusch, Rodrigo; Anthony, Richard M; Bergval, Indra; Sengstake, Sarah; Viveiros, Miguel; Kritski, Afrânio; Oliveira, Martha M.
Afiliación
  • Santos, Paula Fernanda Gonçalves dos; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Costa, Elis Regina Dalla; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Ramalho, Daniela M; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Rossetti, Maria Lucia; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Barcellos, Regina Bones; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Nunes, Luciana de Souza; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Esteves, Leonardo Souza; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Rodenbusch, Rodrigo; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Anthony, Richard M; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Bergval, Indra; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Sengstake, Sarah; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Viveiros, Miguel; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Kritski, Afrânio; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
  • Oliveira, Martha M; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro. BR
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 112(6): 396-403, June 2017. tab
Article en En | LILACS | ID: biblio-841801
Biblioteca responsable: BR1.1
ABSTRACT
BACKGROUND To cope with the emergence of multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB), new molecular methods that can routinely be used to screen for a wide range of drug resistance related genetic markers in the Mycobacterium tuberculosis genome are urgently needed. OBJECTIVE To evaluate the performance of multiplex ligaton-dependent probe amplification (MLPA) against Genotype® MTBDRplus to detect resistance to isoniazid (INHr) and rifampicin (RIFr). METHOD 96 culture isolates characterised for identification, drug susceptibility testing (DST) and sequencing of rpoB, katG, and inhA genes were evaluated by the MLPA and Genotype®MTBDRplus assays. RESULTS With sequencing as a reference standard, sensitivity (SE) to detect INHr was 92.8% and 85.7%, and specificity (SP) was 100% and 97.5%, for MLPA and Genotype®MTBDRplus, respectively. In relation to RIFr, SE was 87.5% and 100%, and SP was 100% and 98.8%, respectively. Kappa value was identical between Genotype®MTBDRplus and MLPA compared with the standard DST and sequencing for detection of INHr [0.83 (0.75-0.91)] and RIFr [0.93 (0.88-0.98)]. CONCLUSION Compared to Genotype®MTBDRplus, MLPA showed similar sensitivity to detect INH and RIF resistance. The results obtained by the MLPA and Genotype®MTBDRplus assays indicate that both molecular tests can be used for the rapid detection of drug-resistant TB with high accuracy. MLPA has the added value of providing information on the circulating M. tuberculosis lineages.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: LILACS Asunto principal: ADN Bacteriano / Tuberculosis Resistente a Múltiples Medicamentos / Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple / Isoniazida / Antibióticos Antituberculosos / Mycobacterium tuberculosis Tipo de estudio: Diagnostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Asunto de la revista: MEDICINA TROPICAL / PARASITOLOGIA Año: 2017 Tipo del documento: Article / Project document País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Brasil
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: LILACS Asunto principal: ADN Bacteriano / Tuberculosis Resistente a Múltiples Medicamentos / Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple / Isoniazida / Antibióticos Antituberculosos / Mycobacterium tuberculosis Tipo de estudio: Diagnostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Asunto de la revista: MEDICINA TROPICAL / PARASITOLOGIA Año: 2017 Tipo del documento: Article / Project document País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Brasil