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1.
Proteins ; 90(4): 1005-1024, 2022 04.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34890079

RESUMO

Auxin is involved in almost every aspect of plant growth and development, from embryogenesis to senescence. Indole-3-acetic acid (IAA) is the main known natural auxin that is synthesized by enzymes tryptophan aminotransferase of arabidopsis (TAA) and YUCCA (YUC) of the flavin-containing monooxygenases family (FMO) from one of the tryptophan-dependent pathways. Genome-wide identification and comprehensive analysis of the YUC-protein family have been conducted in Coffea canephora in the present study. A total of 10 members CcYUC gene family were identified in C. canephora. Phylogenetic analysis revealed that the CcYUC protein family is evolutionarily conserved, and they consist of four groups. In contrast, bioinformatic analysis predicted a hydrophobic transmembrane helix (TMH) for one CcYUC (YUC10) member only. Isoelectric point (pI), molecular mass (Ms), signal peptide, subcellular localization, and phosphorylation sites were predicted for CcYUC proteins. YUC enzymes require the prosthetic group flavin adenine dinucleotide (FAD) and the cofactor nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) for their enzymatic activity. Therefore, we include the molecular docking for CcYUC2-FAD-NADPH-IPyA and yucasin, which is a specific inhibitor for YUC activity. The docking results showed FAD and NADPH binding at the big and small domain sites, respectively, in CcYUC2. IPyA binds very close to FAD along the big domain, and yucasin competes for the same site as IPA, blocking IAA production. Furthermore, in silico point mutations affect the stability of the CcYUC2-4 proteins.


Assuntos
Proteínas de Arabidopsis , Arabidopsis , Coffea , Yucca , Arabidopsis/metabolismo , Proteínas de Arabidopsis/genética , Proteínas de Arabidopsis/metabolismo , Coffea/genética , Coffea/metabolismo , Flavina-Adenina Dinucleotídeo/metabolismo , Ácidos Indolacéticos/química , Ácidos Indolacéticos/metabolismo , Simulação de Acoplamento Molecular , NADP/metabolismo , Filogenia , Yucca/metabolismo
2.
Arq. bras. med. vet. zootec ; Arq. bras. med. vet. zootec. (Online);65(3): 918-926, June 2013. tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-679130

RESUMO

This study aimed to evaluate the effects of adding Yucca schidigera and zeolite (Clinoptilolite) to feed (super premium and standard) for adult dogs on the apparent indigestibility coefficient of minerals. In the first assessment, 21 dogs were used, with average weight of 12.5kg±1.46 in seven treatments in two periods (super premium diet referred to as control and control with the addition of 125, 250, 375ppm Yucca schidigera and 0.5%, 0.75% and 1.0% zeolite). The second assessment was conducted with standard feed, using 21 experimental plots distributed in three treatments (standard diet referred to as control and control with the addition of 375ppm of Yucca schidigera and 1.0% zeolite). The additives did not affect the acceptability of feed and fecal characteristics in both assessments (P>0.05). With the exception of calcium, no minerals were affected by the inclusion of additives (P>0.05) in the experiment with super premium feed. In the assessment with standard feed, calcium as phosphorus and magnesium presented decreased excretion (P<0.05) with the inclusion of additives. It is possible to conclude that the inclusion of additives in the tested concentrations may interfere with the excretion of some minerals in the diet.


Este trabalho teve como objetivo avaliar os efeitos da inclusão de Yucca schidigera e zeólita (Clinoptilolita) em alimentos (super premium e standard) para cães adultos sobre o coeficiente de indigestibilidade aparente de minerais. No primeiro ensaio, foram utilizados 21 cães, com peso médio de 12,5kg±1,46, distribuídos em sete tratamentos em dois períodos (dieta super premium denominada controle e controle com adição de 125, 250, 375ppm de Yucca schidigera e 0,5%, 0,75% e 1,0% de zeólita). O segundo foi realizado com um alimento standard, utilizando-se 21 parcelas experimentais distribuídas em três tratamentos (dieta standard denominada controle e controle com adição de 375ppm de Yucca schidigera e 1,0% de zeólita). Os aditivos não afetaram a aceitabilidade do alimento e as características fecais nos dois ensaios (P>0,05). Com exceção do cálcio, nenhum mineral sofreu interferência da inclusão dos aditivos (P>0,05) no experimento com alimento super premium. No ensaio com alimento standard, tanto cálcio quanto fósforo e magnésio apresentaram redução na excreção (P<0,05) com a inclusão dos aditivos. Pôde-se concluir que a inclusão dos aditivos nas concentrações testadas pode interferir na excreção de alguns minerais da dieta.


Assuntos
Animais , Cães , Minerais , Animais de Estimação , Ração Animal/análise , Yucca/metabolismo , Zeolitas/metabolismo , Cães
3.
Arq. bras. med. vet. zootec ; 65(3): 918-926, jun. 2013. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-9659

RESUMO

This study aimed to evaluate the effects of adding Yucca schidigera and zeolite (Clinoptilolite) to feed (super premium and standard) for adult dogs on the apparent indigestibility coefficient of minerals. In the first assessment, 21 dogs were used, with average weight of 12.5kg±1.46 in seven treatments in two periods (super premium diet referred to as control and control with the addition of 125, 250, 375ppm Yucca schidigera and 0.5%, 0.75% and 1.0% zeolite). The second assessment was conducted with standard feed, using 21 experimental plots distributed in three treatments (standard diet referred to as control and control with the addition of 375ppm of Yucca schidigera and 1.0% zeolite). The additives did not affect the acceptability of feed and fecal characteristics in both assessments (P>0.05). With the exception of calcium, no minerals were affected by the inclusion of additives (P>0.05) in the experiment with super premium feed. In the assessment with standard feed, calcium as phosphorus and magnesium presented decreased excretion (P<0.05) with the inclusion of additives. It is possible to conclude that the inclusion of additives in the tested concentrations may interfere with the excretion of some minerals in the diet.(AU)


Este trabalho teve como objetivo avaliar os efeitos da inclusão de Yucca schidigera e zeólita (Clinoptilolita) em alimentos (super premium e standard) para cães adultos sobre o coeficiente de indigestibilidade aparente de minerais. No primeiro ensaio, foram utilizados 21 cães, com peso médio de 12,5kg±1,46, distribuídos em sete tratamentos em dois períodos (dieta super premium denominada controle e controle com adição de 125, 250, 375ppm de Yucca schidigera e 0,5%, 0,75% e 1,0% de zeólita). O segundo foi realizado com um alimento standard, utilizando-se 21 parcelas experimentais distribuídas em três tratamentos (dieta standard denominada controle e controle com adição de 375ppm de Yucca schidigera e 1,0% de zeólita). Os aditivos não afetaram a aceitabilidade do alimento e as características fecais nos dois ensaios (P>0,05). Com exceção do cálcio, nenhum mineral sofreu interferência da inclusão dos aditivos (P>0,05) no experimento com alimento super premium. No ensaio com alimento standard, tanto cálcio quanto fósforo e magnésio apresentaram redução na excreção (P<0,05) com a inclusão dos aditivos. Pôde-se concluir que a inclusão dos aditivos nas concentrações testadas pode interferir na excreção de alguns minerais da dieta.(AU)


Assuntos
Animais , Cães , Yucca/metabolismo , Zeolitas/metabolismo , Ração Animal/análise , Minerais , Animais de Estimação , Cães
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