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1.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 74(5): 901-912, Sep.-Oct. 2022. tab, graf, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1403418

RESUMO

Genealogical data comprised 45,711 animals born between 1901 and 2016, with 48,127 animals in the pedigree file. Population structure was analyzed in terms of pedigree completeness, individual inbreeding coefficient (F), generation interval (L), rate of inbreeding (ΔF), effective population size (Ne), effective number of founders (ff), and effective number of ancestors (fa). The herd initially consisted of 13 bulls and 14 cows, and there were variations in the number of selected bulls and cows throughout the analyzed period, with 2,575 bulls, 13,691 cows, and 45,711 births recorded at the end of 2016. In total, 48.81% of the cows had only one progeny. Most dams (47.59%) were between three and seven years old, with a mean L in the population of 7.9 years. According to the results, 52.75% of the cows, 44.92% of the bulls, and 63.71% of the calves of the Guzerat breed in the northern region of Brazil showed some degree of inbreeding, with small-magnitude coefficients (0.56, 0.83, and 0.71% for cows, bulls, and calves, respectively). This fluctuation did not hinder the genetic evolution of the herd in the region. The effective population size does not seem to compromise the maintenance of genetic variability in the breed.


Os dados genealógicos compreenderam 45.711 animais nascidos entre 1901 e 2016, com 48.127 animais no arquivo de pedigree. A estrutura populacional foi analisada em termos de completude de pedigree, coeficiente de endogamia individual (F), intervalo de geração (L), taxa de endogamia (ΔF), tamanho efetivo da população (Ne), número efetivo de fundadores (ff) e número efetivo de ancestrais (fa). O rebanho consistia inicialmente de 13 touros e 14 vacas, e houve variações no número de touros e vacas selecionados ao longo do período analisado, com 2.575 touros, 13.691 vacas e 45.711 nascimentos registrados no final de 2016. No total, 48,81% das vacas tiveram apenas uma progênie. A maioria das barragens (47,59%) tinha entre três e sete anos, com média de L na população de 7,9 anos. De acordo com os resultados, 52,75% das vacas, 44,92% dos touros e 63,71% dos bezerros da raça Guzerá na região Norte do Brasil apresentaram algum grau de endogamia, com coeficientes de pequena magnitude (0,56, 0,83 e 0,71% para vacas, touros e bezerros, respectivamente). Essa flutuação não impediu a evolução genética do rebanho na região. O tamanho efetivo da população não parece comprometer a manutenção da variabilidade genética na raça.


Assuntos
Animais , Bovinos , Linhagem , Variação Genética , Endogamia/estatística & dados numéricos , Brasil
2.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 73(1): 231-238, Jan.-Feb. 2021. tab, graf, ilus
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1153040

RESUMO

The objective of this research was to study the population structure of the Cattle Conservation Nucleos Curraleiro Pé Duro of the Instituto Nacional do Semiárido (NCP_INSA) based on pedigree data. Genealogical information from 338 animals registered in the period from 1991 to 2019 was used. The number of founding animals (Nf), the effective number of founders (fe), effective number of ancestors (fa), inbreeding coefficient (F), and average relatedness coefficient (AR), in addition to Fis, Fit and Fst were estimated. It was possible to identify ancestors up to the third generation, with an increase in information over the generations. Of the total pedigree information evaluated, 90.53% had the identification of the father and mother. The effective size of the population was smaller than those proposed by FAO, suggesting the need to redefine the herd management and genetic management plan strategies, promoting gene flow and breed expansion.(AU)


O objetivo com essa pesquisa foi estudar a estrutura populacional do Núcleo de Conservação de Bovinos Curraleiro Pé-Duro (NCP) do Instituto Nacional do Semiárido (INSA), por meio de dados de pedigree. Utilizaram-se informações genealógicas de 338 animais registrados no período de 1991 a 2019. Foi estimado o número de animais fundadores (Nf), o número efetivo de fundadores (fe), o número efetivo de ancestrais (fa), o coeficiente de endogamia (F) e o coeficiente de parentesco médio (AR), além do Fis, Fit e Fst. Foi possível identificar ancestrais até a terceira geração, com aumento crescente das informações ao longo das gerações. Do total de informações avaliadas, 90,53% possuíam identificação do pai e da mãe. O tamanho efetivo da população foi inferior ao mínimo proposto pela FAO, o que sugere a necessidade de redefinir as estratégias do plano de gestão e de manejo genético do rebanho, de modo a promover fluxo gênico e expansão da raça.(AU)


Assuntos
Animais , Bovinos , Linhagem , Patrimônio Genético , Endogamia/estatística & dados numéricos , Brasil
3.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 72(2): 560-564, Mar./Apr. 2020. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-29626

RESUMO

Este estudo analisou a estrutura populacional de ovinos deslanados do núcleo de conservação do estado do Ceará, Brasil. Os parâmetros populacionais foram estimados com base nos dados genealógicos de indivíduos das raças Santa Inês (SI), Somalis (SO) e Morada Nova (MN), nascidos entre os anos de 2001 e 2014. Os parâmetros estimados foram: número de gerações completas equivalentes (GCE), intervalo entre gerações (IEG), número de fundadores (Nf), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa), coeficiente de endogamia (F) e índice de contribuição genética (ICG). O GCE médio foi de 1,82, 2,78 e 1,52 para SI, SO e MN, respectivamente. O IEG foi próximo entre as raças, 3,67 anos em média. O Nf para SI, SO e MN foi igual a 225, 194 e 153, respectivamente. As razões fe/fa foram distantes de 1 nas três populações, o que indica ocorrência de gargalo genético, principalmente para SO. Os coeficientes médios de endogamia foram de 1,81%, 0,78% e 0,78% para SI, SO e MN, respectivamente. O ICG foi de 3,32, 5,38 e 2,87 para SI, SO e MN, respectivamente. Os parâmetros populacionais estimados apontam que parte da genética original desses rebanhos foi perdida, principalmente na população da raça Somalis.(AU)


This study evaluated the population structure of sheep without wool from the conservation nucleus in Ceará State, Brazil. Population parameters were estimated on genealogical records of Santa Ines (SI), Somali (SO,) and Morada Nova (MN) breeds, that were born between 2001 and 2014. The following estimates were obtained: number of complete generation equivalents (GCE), generation intervals (IEG), number of founders (Nf), effective number of founders (fe), effective number of ancestors (fa), inbreeding coefficient (F), and genetic contribution index (ICG). Average GCE was 1.82, 2.78, and 1.52 for SI, SO, and MN respectively. Mean IEG was similar between breeds, 3.67 years. The Nf was 225, 194, and 153 for SI, SO, and MN respectively. The fe/fa ratios were different to 1, which is an indication of genetic bottleneck, mainly for SO. The average inbreeding coefficients were 1.81%, 0.78%, and 0.78% for SI, SO, and MN respectively. The ICG was 3.32, 5.38, and 2.87 for SI, SO, and MN respectively. Estimated population parameters indicate that part of the genetics of these breeds was lost, mainly in Somalis.(AU)


Assuntos
Animais , População , , Ovinos , Endogamia/estatística & dados numéricos
4.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 72(2): 560-564, Mar./Apr. 2020. tab
Artigo em Português | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1128405

RESUMO

Este estudo analisou a estrutura populacional de ovinos deslanados do núcleo de conservação do estado do Ceará, Brasil. Os parâmetros populacionais foram estimados com base nos dados genealógicos de indivíduos das raças Santa Inês (SI), Somalis (SO) e Morada Nova (MN), nascidos entre os anos de 2001 e 2014. Os parâmetros estimados foram: número de gerações completas equivalentes (GCE), intervalo entre gerações (IEG), número de fundadores (Nf), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa), coeficiente de endogamia (F) e índice de contribuição genética (ICG). O GCE médio foi de 1,82, 2,78 e 1,52 para SI, SO e MN, respectivamente. O IEG foi próximo entre as raças, 3,67 anos em média. O Nf para SI, SO e MN foi igual a 225, 194 e 153, respectivamente. As razões fe/fa foram distantes de 1 nas três populações, o que indica ocorrência de gargalo genético, principalmente para SO. Os coeficientes médios de endogamia foram de 1,81%, 0,78% e 0,78% para SI, SO e MN, respectivamente. O ICG foi de 3,32, 5,38 e 2,87 para SI, SO e MN, respectivamente. Os parâmetros populacionais estimados apontam que parte da genética original desses rebanhos foi perdida, principalmente na população da raça Somalis.(AU)


This study evaluated the population structure of sheep without wool from the conservation nucleus in Ceará State, Brazil. Population parameters were estimated on genealogical records of Santa Ines (SI), Somali (SO,) and Morada Nova (MN) breeds, that were born between 2001 and 2014. The following estimates were obtained: number of complete generation equivalents (GCE), generation intervals (IEG), number of founders (Nf), effective number of founders (fe), effective number of ancestors (fa), inbreeding coefficient (F), and genetic contribution index (ICG). Average GCE was 1.82, 2.78, and 1.52 for SI, SO, and MN respectively. Mean IEG was similar between breeds, 3.67 years. The Nf was 225, 194, and 153 for SI, SO, and MN respectively. The fe/fa ratios were different to 1, which is an indication of genetic bottleneck, mainly for SO. The average inbreeding coefficients were 1.81%, 0.78%, and 0.78% for SI, SO, and MN respectively. The ICG was 3.32, 5.38, and 2.87 for SI, SO, and MN respectively. Estimated population parameters indicate that part of the genetics of these breeds was lost, mainly in Somalis.(AU)


Assuntos
Animais , População , , Ovinos , Endogamia/estatística & dados numéricos
5.
Ci. Anim. bras. ; 18: e-38048, 2017. graf, tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-20083

RESUMO

Objetivou-se avaliar a estrutura populacional de 91.579 animais da raça Nelore criados no Semiárido Nordestino, nascidos entre 1965 e 2011. Analisaram-se o pedigree e a estimação dos parâmetros populacionais baseados na probabilidade de origem do gene. Nos primeiros anos, registraram-se nascimentos superiores de fêmeas, tendendo ao equilíbrio entre os sexos com o passar dos anos. Os números de efetivo de animais fundadores (fe) e ancestrais (fa) indicaram a utilização reduzida de animais na formação genética do rebanho. Dentre 24.676 ancestrais, 450 foram responsáveis por 50% da variabilidade genética da população. Dos 10 fundadores de maior importância, 8 se apresentam dentre os 10 ancestrais; o indivíduo com maior expressão apresentou coeficiente de relação médio (CR) de 1,31%, explicando 1,81% da variabilidade. 72% dos animais têm pais e mães identificados, observando-se perda de informação entre as gerações. 100% dos rebanhos utilizam touros externos e 61% deles vendem touros, não havendo classificação núcleo ou isolado. Endogamia variou de 0,14% na segunda geração a 0,73% na oitava, enquanto que o CR oscilou de 0,8% a 0,35% entre a primeira e a quarta geração, decrescendo a partir da quinta. Observou-se um intervalo médio de gerações de 8,3 anos. O rebanho possui número reduzido de animais na formação genética e pequena integralidade do pedigree, dificultando a estimativa de alguns parâmetros populacionais.(AU)


The objective of this study was to evaluate the population structure of 91,579 Nellore cattle reared in the Northeast semi-arid, born between 1965 and 2011. We analyzed the pedigree and the estimation of population parameters based on the probability of gene origin. In the early years, a higher number of female births occured, tending to gender balance over the years. The number of founder animals (fe) and ancestors (fa) indicated the reduced use of animals in the genetic formation of the herd. Among 2,4676 ancestors, 450 were responsible for 50% of the genetic variability of the population. Of the 10 most important founders, 8 were among the 10 ancestors. The individual with the highest expression presented a mean coefficient of relationship (CR) of 1.31%, explaining 1.81% of the variability. 72% of animals have identified fathers and mothers, revealing loss of information between generations. 100% of the herds use external bulls and 61% of them sell bulls, with no core classification or isolate. Inbreeding ranged from 0.14% in the second generation to 0.73% in the eighth, while the CR ranged from 0.8% to 0.35% between the first and fourth generations, decreasing from the fifth on. The average generation interval observed was of 8.3 years. The herd has a small number of animals in the genetic make-up, and small completeness of pedigree, making it difficult to estimate some population parameters.(AU)


Assuntos
Animais , Bovinos , Endogamia/estatística & dados numéricos , Intervalo entre Gerações , Variação Genética , Animais Endogâmicos , Relação entre Gerações , Genética Populacional
6.
Ciênc. anim. bras. (Impr.) ; 18: e, 2017. graf, tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1473559

RESUMO

Objetivou-se avaliar a estrutura populacional de 91.579 animais da raça Nelore criados no Semiárido Nordestino, nascidos entre 1965 e 2011. Analisaram-se o pedigree e a estimação dos parâmetros populacionais baseados na probabilidade de origem do gene. Nos primeiros anos, registraram-se nascimentos superiores de fêmeas, tendendo ao equilíbrio entre os sexos com o passar dos anos. Os números de efetivo de animais fundadores (fe) e ancestrais (fa) indicaram a utilização reduzida de animais na formação genética do rebanho. Dentre 24.676 ancestrais, 450 foram responsáveis por 50% da variabilidade genética da população. Dos 10 fundadores de maior importância, 8 se apresentam dentre os 10 ancestrais; o indivíduo com maior expressão apresentou coeficiente de relação médio (CR) de 1,31%, explicando 1,81% da variabilidade. 72% dos animais têm pais e mães identificados, observando-se perda de informação entre as gerações. 100% dos rebanhos utilizam touros externos e 61% deles vendem touros, não havendo classificação núcleo ou isolado. Endogamia variou de 0,14% na segunda geração a 0,73% na oitava, enquanto que o CR oscilou de 0,8% a 0,35% entre a primeira e a quarta geração, decrescendo a partir da quinta. Observou-se um intervalo médio de gerações de 8,3 anos. O rebanho possui número reduzido de animais na formação genética e pequena integralidade do pedigree, dificultando a estimativa de alguns parâmetros populacionais.


The objective of this study was to evaluate the population structure of 91,579 Nellore cattle reared in the Northeast semi-arid, born between 1965 and 2011. We analyzed the pedigree and the estimation of population parameters based on the probability of gene origin. In the early years, a higher number of female births occured, tending to gender balance over the years. The number of founder animals (fe) and ancestors (fa) indicated the reduced use of animals in the genetic formation of the herd. Among 2,4676 ancestors, 450 were responsible for 50% of the genetic variability of the population. Of the 10 most important founders, 8 were among the 10 ancestors. The individual with the highest expression presented a mean coefficient of relationship (CR) of 1.31%, explaining 1.81% of the variability. 72% of animals have identified fathers and mothers, revealing loss of information between generations. 100% of the herds use external bulls and 61% of them sell bulls, with no core classification or isolate. Inbreeding ranged from 0.14% in the second generation to 0.73% in the eighth, while the CR ranged from 0.8% to 0.35% between the first and fourth generations, decreasing from the fifth on. The average generation interval observed was of 8.3 years. The herd has a small number of animals in the genetic make-up, and small completeness of pedigree, making it difficult to estimate some population parameters.


Assuntos
Animais , Bovinos , Animais Endogâmicos , Endogamia/estatística & dados numéricos , Intervalo entre Gerações , Variação Genética , Genética Populacional , Relação entre Gerações
7.
Rev. bras. estud. popul ; 32(1): 121-137, Jan-Apr/2015. tab, graf
Artigo em Português | LILACS | ID: lil-754015

RESUMO

Esse artigo tem por objetivo analisar os padrões de seletividade marital entre os casais heterossexuais e os casais homossexuais no Brasil, investigando os níveis de escolaridade, cor/raça e grupo etário. Inicialmente foi feita uma análise descritiva dos dados com o intuito de caracterizar a população estudada e os diferenciais entre os tipos de casais. Além disso, esse artigo utiliza tabelas de contingência e modelos log-lineares para compreender as formas de associações entre os casais e quais variáveis influenciam a seletividade dos parceiros. Os resultados mostram que cor/raça e escolaridade têm maior influência na seletividade dos casais heterossexuais, enquanto cor/raça e grupo etário são mais relevantes para os casais homossexuais em relação aos seus padrões de seletividade. Portanto, é possível identificar a existência de diferenças entre as características de seletividade entre esses casais e seus padrões, o que abre margem para estudos posteriores que possam aprofundar a compreensão das distinções entre esses padrões, no sentido de encontrar formas de tentar explicá-las e suas possíveis consequências no Brasil.


El objetivo de este artículo es analizar los patrones de selectividad marital entre las parejas heterosexuales y homosexuales en Brasil, investigando para ello los niveles de escolaridad, color/raza y grupo etario. Inicialmente se realizó un análisis descriptivo de los datos con el fin de caracterizar a la población estudiada y los diferenciales entre los tipos de parejas. Además, el estudio utiliza tablas de contingencia y modelos log-lineares para entender las formas de asociación entre las parejas y las variables que influyen en la selectividad de sus miembros. En relación con los patrones de selectividad, los resultados muestran que el color/raza y la escolaridad tienen mayor influencia en las parejas heterosexuales, mientras que el color/raza y el grupo etario al que se pertenece son más relevantes para las parejas homosexuales. Por lo tanto, se pueden identificar diferencias entre las características de la selectividad de estas parejas y sus patrones, lo que abre un espacio para estudios posteriores que puedan profundizar la comprensión de las diferencias entre estos patrones, con el fin de intentar explicar estas distinciones y sus posibles consecuencias en el país.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Adulto Jovem , Pessoa de Meia-Idade , Censos , Comportamento de Escolha , Características da Família , Heterossexualidade , Homossexualidade , Parceiros Sexuais/psicologia , Fatores Etários , Brasil , Escolaridade , Endogamia/estatística & dados numéricos , Modelos Lineares , Fatores Socioeconômicos
8.
Trop Anim Health Prod ; 43(7): 1449-57, 2011 Oct.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21533896

RESUMO

The first registers of Somali sheep in Brazil are from the beginning of the 1900s. This breed, adapted to the dry climate and scarce food supply, is restricted in the northeast region of the country. Molecular marker technologies, especially those based on genotyping microsatellite and mtDNA loci, can be used in conjunction with breeding (pedigree analysis) and consequently the maintenance of genetic variation in herds. Animals from the Brazilian Somali Conservation Nuclei from Embrapa Sheep and Goats in Ceará State were used to validate genetic monitoring by traditional pedigree methods and molecular markers. Nineteen microsatellite markers and 404 base pairs from the control region of mtDNA were used. For total herd diversity, an average 5.32 alleles were found, with expected heterozygosity of 0.5896, observed heterozygosity of 0.6451, 0.4126 for molecular coancestrality, and coefficient of inbreeding (F (IS)) was -0.095. Comparing molecular coancestrality means over the years, there was a consistent increase in this parameter within the herd, increasing from 0.4157 to 0.4769 in 2 years (approx. 12% variation). Sixteen mtDNA haplotypes were identified. Inbreeding and other estimates from genealogical analyses confirm the results from molecular markers. From these results, it is possible to state that microsatellites are useful tools in genetic management of herds, especially when routine herd recording is not carried out, or there were gaps in recent generations. As well as pedigree control, genetic diversity can be optimized. Based on the results, and despite herd recording in the herd of Brazilian Somali of Embrapa Sheep and Goats, additional management measures need to be carried out in this herd to reduce inbreeding and optimize genetic variation.


Assuntos
Conservação dos Recursos Naturais/métodos , Marcadores Genéticos/genética , Variação Genética , Genética Populacional , Carneiro Doméstico/genética , Animais , Sequência de Bases , Brasil , DNA Mitocondrial/genética , Genótipo , Endogamia/estatística & dados numéricos , Repetições de Microssatélites/genética , Dados de Sequência Molecular , Linhagem , Alinhamento de Sequência
9.
Trop Anim Health Prod ; 42(7): 1427-34, 2010 Oct.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-20401534

RESUMO

Reyna Creole cattle originated from Bos taurus cattle brought to Latin America during the Spanish colonization in the fifteenth century and are the only remaining local breed in Nicaragua. However, the current genetic status of this breed is unknown. Therefore, the population structure of three recorded Reyna Creole herds in Nicaragua was studied to estimate their level of inbreeding, effective population size, and generation intervals. Data from 2,609 animals born between 1958 and 2007 were analyzed. A pedigree completeness index higher than 0.8 was required to obtain reliable estimates of the level of inbreeding, and this criterion was met for 367 animals (14%) in two herds. The average level of inbreeding was 13.0%, with values ranging from 0% to 43.8% for individual animals. One of the herds had an average inbreeding level of 21.6%, primarily due to long periods in which the same bulls were used for mating, leading to excessive frequencies of matings between closely related animals. The effective population size differed between years and ranged from 28 to 46 animals, showing that the Reyna Creole cattle breed is endangered, close to critical status. The average generation interval was 6.9 years with values as high as 19.1 years for some sires that were used for artificial insemination over a long period of time. Due to the high level of inbreeding and small population size, urgent actions are required for the development of a breeding program to protect the breed and support its sustainable utilization.


Assuntos
Bovinos , Fatores Etários , Animais , Bovinos/genética , Bovinos/fisiologia , Feminino , Endogamia/estatística & dados numéricos , Expectativa de Vida , Masculino , Nicarágua , Linhagem , Crescimento Demográfico
10.
Arq. bras. med. vet. zootec ; 55(3): 361-365, jun. 2003. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-141

RESUMO

A partir das informações de 71.991 eqüinos da raça Campolina, registrados de 1951 até 2000 pela Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Campolina, observou-se que 86,6 por cento dos animais pertenciam à região Sudeste. A média anual do número de nascimentos de 1951 a 1998 foi de 1.159 animais, sendo 5.107 o ápice em 1991. Dos 3.361 criadores e dos 4.848 proprietários de animais, respectivamente, 50,3 por cento e 60,3 por cento possuíam menos de cinco animais. Quanto ao número de filhos, 53,3 por cento das 17.680 mães produziram menos de dois filhos. Dos 2.418 pais, 51,7 por cento tiveram menos de 10 filhos. Os números médio e máximo de filhos por égua foram, respectivamente, 3,1 e 20, e por pai, 22,2 e 531, na mesma ordem. O tamanho efetivo da população considerando-se todos os anos foi de 8.509 animais e a taxa média de endogamia para toda a população foi próxima de zero. O número máximo de gerações foi 6,5, sendo o intervalo médio de gerações de 8,7 anos. O coeficiente médio de endogamia observado entre os animais endogâmicos foi de 6,1 por cento, com incremento de 1,9 por cento por geração.(AU)


Data on 71,991 animals of the Campolina horse breed studbook recorded from 1951 to 2000 were used to describe the population structure of the breed. Most of the animals (86.6%) originated from the Southeast States of Brazil. The average number of births per year was 1,159, and the maximum number of births (5,107) was observed in 1991. From the total of 3,361 Campolina breeders and 4,848 Campolina owners, respectively, 50.3% and 60.3% owned no more than five animals. Concerning progeny number, 53.3% of the 17,680 mares had less than two sibs and 51.7% of 2,418 stallions had less than 10 sibs. The average and maximum number of births for the mares were, respectively, 3.1 and 20. For the stallions, these numbers were 22.2 and 531, respectively. Considering all data structure, the effective population size was 8,509 animals, and the average inbreeding coefficient for the population was close to zero. The highest generation number was 6.5 and the average generation interval was 8.7 years. The inbred animals had an average inbreeding coefficient of 6.1%, with and increase rate of 1.9% per generation.(AU)


Assuntos
Animais , Cavalos/crescimento & desenvolvimento , Endogamia/estatística & dados numéricos , Intervalo entre Gerações , Animais Endogâmicos/classificação
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