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1.
Neotrop. ichthyol ; 20(1): e210162, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1365200

RESUMO

The ichthyofauna of the La Plata hydrographic basin is divided into Upper and Lower Paraná River systems due to the geographic isolation of the Sete Quedas waterfalls, currently flooded by the lake of the Itaipu dam. In Parodontidae, pairs of species, or groups of cryptic species were described between these systems. Although genetic isolation and speciation have already been proposed in other species in the group, Parodon nasus has been maintained as a valid species and distributed throughout the La Plata river basin. In this perspective, specimens of P. nasus from four different sampling sites in the Upper and Lower Paraná River systems were compared regarding the karyotypes, molecular analyzes of population biology and species delimitation to investigate their genetic and population isolation in the La Plata river basin. Despite a geographic barrier and the immense geographic distance separating the specimens sampled from the Lower Paraná River system compared to those from the Upper Paraná River, the data obtained showed P. nasus as a unique taxon. Thus, unlike other species of Parodontidae that showed diversification when comparing the groups residing in the Lower versus Upper Paraná River, P. nasus showed a population structure and a karyotypic homogeneity.(AU)


A ictiofauna do sistema hidrográfico La Plata é dividida em alto e baixo rio Paraná devido ao isolamento geográfico dos Saltos das Sete Quedas há 22 milhões de anos, atualmente inundado pelo lago da represa da Usina de Itaipu. Em Parodontidae, espécies pares ou grupos de espécies crípticas foram descritos entre esses sistemas. Contudo, embora o isolamento genético e especiação já tenham sido propostos em outras espécies do grupo, Parodon nasus tem sido mantido como espécie válida e distribuída em toda a bacia do rio La Plata. Nessa perspectiva, exemplares de P. nasus de quatro diferentes pontos de amostragem nos sistemas do alto e baixo rio Paraná foram comparados quanto ao arranjo dos cariótipos, análises moleculares de biologia populacional e delimitação de espécies, afim de investigar seu isolamento genético e populacional na bacia do rio La Plata. Apesar da barreira geográfica e imensa distância geográfica separando os exemplares amostrados no sistema baixo rio Paraná em comparação àqueles do alto rio Paraná, os dados obtidos demonstraram P. nasus como único táxon válido. Dessa forma, diferentemente de outras espécies de Parodontidae que demonstraram diversificação quando comparados grupos pares residentes no baixo e alto rio Paraná, P. nasus demonstrou estruturação populacional e homogeneidade cariotípica.(AU)


Assuntos
Animais , Biologia , DNA Ribossômico , Caraciformes/genética , Anotação de Sequência Molecular , Cariótipo
2.
São Paulo; 2019. 48 p.
Tese em Português | Sec. Est. Saúde SP, SESSP-IBPROD, Sec. Est. Saúde SP, SESSP-ESPECIALIZACAOSESPROD, Sec. Est. Saúde SP | ID: bud-3783

RESUMO

Bothrops insularis or the Golden lancehead is a critically endangered species endemic to Queimada Grande Island, São Paulo. Due to its vulnerability, five ex situ populations have been kept in four Research Institutes for breeding and conservation purposes. B. insularis has been studied based on natural history, evolution, ecology and venom content. However, genetic diversity approaches are still scarce, although this is a crucial parameter to the development and maintenance of conservation programs. Herein, we aimed to: (i) characterize and compare the genetic diversity of the ex situ population (housed at the Laboratório Especial de Ecologia e Evolução, Instituto Butantan) to representatives of the in situ population; and (ii) test the existence of genetic structure, and inter/intrapopulational genetic divergence. This study was carried out using twelve heterospecific microsatellite markers obtained from three species of Bothrops neuwiedi group. Our results recovered low to medium genetic diversity parameters, with the highest genetic variability detected in the ex situ population. Both populations showed low but significant values of pedigree (kinship) inbreeding coefficient, as expected for threatened species, and/or with restricted geographic distribution. Moreover, the negative values of mating systems inbreeding coefficient may be related to mechanisms that cause inbreeding avoidance in the populations. The interpopulational differences of allelic frequencies and the presence of private alleles could be related to genetic drift, demographic events, and/or absence of representatives from one region of the island. Despite these divergences, none of the population differentiation indices showed significant values and, therefore, there are no evidences of genetic differentiation between the ex situ and in situ population. Genetic distance and discriminant analysis of principal components (DAPC) approaches recovered five genetic clusters. However, these clusters do not recover any geographic relationship among representatives of the in situ population, and they are not totally explained due to consanguinity relationships as well. Based on the information herein presented, we conclude that further studies using genetic markers (new microssatelites, SNPs, for instance) are needed to achieve more information related to genetic diversity of Bothrops insularis, and to investigate its genetic structure.


Bothrops insularis é uma espécie endêmica da Ilha da Queimada Grande, São Paulo, considerada ameaçada de extinção. Em decorrência da sua vulnerabilidade, são mantidas cinco populações de B. insularis em plantéis de quatro institutos de ensino e pesquisa para fins de reprodução e conservação ex situ. Nos últimos anos, essa espécie tem sido alvo de estudos relacionados à história natural, evolução, ecologia e composição de seu veneno. Entretanto, existem poucos relatos sobre a diversidade genética das populações existentes, informação crucial para a condução e manutenção de programas de conservação. Neste contexto, o presente estudo objetivou caracterizar e comparar a diversidade da população ex situ mantida no Laboratório Especial de Ecologia e Evolução do Instituto Butantan com alguns exemplares da população in situ, por meio de 12 marcadores microssatélites heteroespecíficos dese nvolvidos para três espécies de Bothrops do grupo neuwiedi, bem como testar a hipótese de estruturação e divergência genética inter e intrapopulacional. Os resultados mostraram que as populações apresentaram baixos/médios índices de diversidade genética, sendo a maior diversidade genética observada na população ex situ. Ambas as populações apresentam baixos, porém significativos, graus de endogamia de grau de parentesco, como esperado para populações de espécies ameaçadas de extinção e com restrita distribuição geográfica. Adicionalmente, foram recuperados valores negativos de endogamia de sistema de acasalamento, possivelmente relacionado a existência de processos que evitem a endogamia nas populações. As divergências interpopulacionais das frequências alélicas e a existência de alelos privados observados podem estar relacionados a efeitos de deriva genética, eventos demográficos recentes e/ou a ausência de amostras de uma região da ilha. Apesar dessas divergências, nenhum dos índices de diferenciação populacional apresentou valores significativos e, portanto, não há indícios de diferenciação genética entre as populações. Quando as amostras são estudadas em conjunto, as análises de distância genética e de componentes discriminantes principais (DAPC) sugerem a existência de cinco agrupamentos genéticos, porém tais agrupamentos não recuperam as relações geográficas dos espécimes da população in situ, e não são totalmente explicados por relações de consanguinidade. Além das informações inéditas apresentadas no presente estudo, consideramos importante que abordagens futuras utilizem novos marcadores moleculares (como SNPs e/ou novos microssatélites) para a melhor compreensão da diversidade genética e para investigar a estrutura genética populacional de Bothrops insularis.

3.
R. bras. Zoo. ; 15(1/3): 15-25, 2013. mapas, ilus, tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-759640

RESUMO

This study aimed to investigate the population structure of Sinelobus stanfordi (Richardson, 1901) (Malacostraca, Tanaidae) in a coastal lagoon in the North coast in the Rio Grande do Sul state. The collections were performed weekly on banks of the aquatic hyacinth Eichhornia azurea (Sw.) Kunth during three months. Samples of water hyacinth were manually collected and washed on a sieve of 0.250μm mesh size. In the laboratory, the material was sorted and the tanaid lengths were measured and classified into following morphotype categories: Manca, Juveniles, Non- Reproductive Females (NRF), Preparatory Females (PREPF), Ovigerous Females (OVF) and Males. The distribution by frequency of body length classes presented a higher abundance of manca in the class of 0.75mm; juveniles in 2.19mm; non-reproductive females in 2.5mm; preparatory females in 2.7mm; ovigerous females in 2.85mm and males in 2.81mm. The average of sexual rate was 3.1:1 (females: males). It was observed the recruitment and predominance of juveniles in the eleven studied weeks, and the presence in lower proportion of PREPF, OVF and males. Based on the analyses of the population structure observed and data found in the literature, became evident the presence of juveniles, females and males during all the year, beyond a continuous reproduction activity of the species. The results have also suggested the species seems to have an opportunistic behavior, being able to colonize a high diversity of substrates.(AU)


Este trabalho buscou obter informações sobre a estrutura populacional de Sinelobus stanfordi (Richardson, 1901) (Malacostraca,Tanaidae), em intervalos semanais por um período de três meses, em uma laguna costeira do Litoral Norte do Rio Grande do Sul. As coletas foram realizadas em estande da macrófita aquática Eichhornia azurea (Sw.) Kunth. Exemplares do aguapé foram coletados manualmente e lavados sobre uma peneira de 0.250μm de abertura de malha. Em laboratório, o material foi triado e os indivíduos medidos e classificados por morfotipos: Mancas, Juvenis, Fêmeas Não-Reprodutivas (FNR), Fêmeas Preparatórias (FPREP), Fêmeas Ovadas (FOV) e Machos. A distribuição por frequências de classes de tamanho corporal demonstrou um maior número de indivíduos manca na classe de tamanho 0,75mm; juvenis, em 2,19mm; fêmeas não reprodutivas, em 2,5mm; fêmeas preparatórias, em 2,7mm; fêmeas ovadas, em 2,85mm e machos em 2,81mm. A média da proporção sexual foi de 3,1:1 (fêmeas:machos). Observou-se recrutamento e predomínio dos juvenis nas onze semanas de estudo e a presença, em menor proporção de FPREP, FOV e Machos. Com base na análise da estrutura populacional observada e dados encontrados na literatura, fica evidente a presença de juvenis, fêmeas e machos ao longo de todo ano, além de uma reprodução contínua da espécie. Estes resultados ainda sugerem que a espécie parece ter um comportamento oportunista, podendo, inclusive, colonizar uma diversidade de substratos.(AU)


Assuntos
Animais , Crustáceos , Raízes de Plantas , Eichhornia , Pontederiaceae , Distribuição Animal
4.
Revista Brasileira de Zoociências (Online) ; 15(1/3): 15-25, 2013. map, ilus, tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1494603

RESUMO

This study aimed to investigate the population structure of Sinelobus stanfordi (Richardson, 1901) (Malacostraca, Tanaidae) in a coastal lagoon in the North coast in the Rio Grande do Sul state. The collections were performed weekly on banks of the aquatic hyacinth Eichhornia azurea (Sw.) Kunth during three months. Samples of water hyacinth were manually collected and washed on a sieve of 0.250μm mesh size. In the laboratory, the material was sorted and the tanaid lengths were measured and classified into following morphotype categories: Manca, Juveniles, Non- Reproductive Females (NRF), Preparatory Females (PREPF), Ovigerous Females (OVF) and Males. The distribution by frequency of body length classes presented a higher abundance of manca in the class of 0.75mm; juveniles in 2.19mm; non-reproductive females in 2.5mm; preparatory females in 2.7mm; ovigerous females in 2.85mm and males in 2.81mm. The average of sexual rate was 3.1:1 (females: males). It was observed the recruitment and predominance of juveniles in the eleven studied weeks, and the presence in lower proportion of PREPF, OVF and males. Based on the analyses of the population structure observed and data found in the literature, became evident the presence of juveniles, females and males during all the year, beyond a continuous reproduction activity of the species. The results have also suggested the species seems to have an opportunistic behavior, being able to colonize a high diversity of substrates.


Este trabalho buscou obter informações sobre a estrutura populacional de Sinelobus stanfordi (Richardson, 1901) (Malacostraca,Tanaidae), em intervalos semanais por um período de três meses, em uma laguna costeira do Litoral Norte do Rio Grande do Sul. As coletas foram realizadas em estande da macrófita aquática Eichhornia azurea (Sw.) Kunth. Exemplares do aguapé foram coletados manualmente e lavados sobre uma peneira de 0.250μm de abertura de malha. Em laboratório, o material foi triado e os indivíduos medidos e classificados por morfotipos: Mancas, Juvenis, Fêmeas Não-Reprodutivas (FNR), Fêmeas Preparatórias (FPREP), Fêmeas Ovadas (FOV) e Machos. A distribuição por frequências de classes de tamanho corporal demonstrou um maior número de indivíduos manca na classe de tamanho 0,75mm; juvenis, em 2,19mm; fêmeas não reprodutivas, em 2,5mm; fêmeas preparatórias, em 2,7mm; fêmeas ovadas, em 2,85mm e machos em 2,81mm. A média da proporção sexual foi de 3,1:1 (fêmeas:machos). Observou-se recrutamento e predomínio dos juvenis nas onze semanas de estudo e a presença, em menor proporção de FPREP, FOV e Machos. Com base na análise da estrutura populacional observada e dados encontrados na literatura, fica evidente a presença de juvenis, fêmeas e machos ao longo de todo ano, além de uma reprodução contínua da espécie. Estes resultados ainda sugerem que a espécie parece ter um comportamento oportunista, podendo, inclusive, colonizar uma diversidade de substratos.


Assuntos
Animais , Crustáceos , Distribuição Animal , Eichhornia , Pontederiaceae , Raízes de Plantas
5.
An. acad. bras. ciênc ; 82(4): 983-996, Dec. 2010. ilus, graf, mapas, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-567808

RESUMO

The Quaternary fossil record of Águas de Araxá (Q AA) is represented mainly by an accumulation of skeletal elements of several sizes, which are assigned to a population of Stegomastodon waringi. We analyzed 97 molars according to the ear stages of Sipson and Paula-Couto (1957), and developed a orphoetric ear index. The population structure (proportion of immature, subadult, adult, mature adult and senile adult individuals) was identified, and these five age classes were compared to those of extant elephant populations and defined with social implications. The analysis made possible to establish that the population is largely composed of adults: 14.89 percent are immature individuals, 23.04 percent subadults, 27.65 percent adults, 17.21 percent mature adults and another 17.21 percent senile adults. Based on population structure, we do not discard the possibility that the fossil population was stable or in recovery, and/or was experiencing a high-predation period on younger individuals. The number of individuals composing the past population studied here could suggest that the occupied environment was open due to comparisons to populations of extant elephants. We consider this population as an aggregation of family units, which suggests a time of low environmental humidity. Based on literature and our findings, their extinction appears to be regional and probably related to a catastrophic event.


O registro fossilífero do Quaternário de Águas de Araxá (QAA) é representado principalmente pelo acúmulo de restos dentários e de esqueleto de diversos tamanhos, atribuídos a uma população pretérita do mastodonte Stegomastodon waringi. Foram analisados 97 molares de acordo com os estágios de desgaste propostos por Simpson e Paula-Couto 1957, e desenvolveu-se um índice morfométrico de desgaste. A estrutura populacional (proporção entre indivíduos imaturos, subadultos, adultos, adultos maduros e adultos senis) foi identificada e comparada com populações de elefantes atuais. Foi possível estabelecer que esta população era amplamente composta por adultos: 14,89 por cento eram indivíduos imaturos; 23,04 por cento eram subadultos; 27,65 por cento eram adultos; 17,21 por cento eram adultos maduros e outros 17,21 por cento eram adultos senis. Baseados na estrutura populacional observada, não se descartou a possibilidade desta população estar estável ou em recuperação e/ou de ter passado por um período de predação dos indivíduos mais jovens. O número de indivíduos encontrados nesta população sugere que esta ocupava um ambiente aberto, de acordo com comparações com populações de elefantes atuais. Considerou-se a assembléia de mastodontes do Quaternário de Águas de Araxá como uma agregação de unidades familiares, o que sugere um momento de baixa umidade ambiental. Baseados em literatura e nos resultados encontrados, a sua extinção parece ser regional e possivelmente relacionada a um evento catastrófico.


Assuntos
Animais , Elefantes/anatomia & histologia , Fósseis , Mastodontes/anatomia & histologia , Dente/anatomia & histologia , Brasil
6.
Rev. biol. trop ; Rev. biol. trop;56(1): 247-256, mar. 2008. graf, tab, ilus
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-496377

RESUMO

Population structure and environmental relationships of the tropical tree Nectandra rudis (Lauraceae), a rare species in western Mexico. The tree N. rudis is a rare species from western Mexico of which community and population features are unknown. We studied a population in an altitudinal gradient, from 550-1,850 m above sea level in the Sierra de Manantlan, Jalisco, Mexico. We established four 60x48 m sample sites at vertical distances of 100 m along this altitudinal gradient. Within each plot, ten 100 m2 circular sub-sampling units were randomly located. At each unit, we recorded diameter at breast height (dbh) and tree height for all woody vegetation > or =2.5 cm dbh. Basal area, tree density, frequency, species richness and importance values per species and plot. We estimated the vertical structure (total tree height) and diameter( as M=5log(10)N) for all N. rudis individuals. A direct ordination through Canonical Correspondence Analysis was done, involving amongst other species, edaphic and environmental data matrices. The record of 44 N. rudis individuals, in seven out the 56 plots sampled, represents the most septentrional record for the species and the first in Western Mexico. Its density and basal area represented 4.5 % and 8.7 % respectively of the total estimated for the community. The greatest importance values were observed at 1 650 m above sea level. The population structure of N. rudis is structured into five diameter categories in an inverse "J" shaped distribution. This is a typical behavior observed to occur in the Lauraceae, which produces big seeds of short viability that germinate when there is high soil moisture content. The species tend to form dense seedling banks although only a reduced number of them are able to survive. Species richness varies from 27 to 39 at plot level; the greatest importance values for the plots on which N. rudis was found, corresponds to Urera verrucosa (Liebm.) V.W. Steinm., N. rudis, Ficus sp...


Nectandra rudis es una especie rara en el occidente de México. Analizamos la población y la comunidad donde se desarrolla, en la Sierra de Manantlan, Jalisco, México. Establecimos cuatro parcelas de 60x48 m con diferencias altitudinales de 100 m entre sí. En cada una seleccionamos aleatoriamente diez círculos de 100 m2 cada uno, en los cuales medimos los diámetros normales y las alturas de las especies leñosas con diámetro ≥2.5 cm. Para cada especie y por parcela determinamos el área basal, la densidad, la frecuencia, la riqueza de especies y los valores de importancia. Establecimos la estructura vertical y diamétrica de N. rudis. Hicimos una ordenación directa con la matriz de especies y las variables edáficas y ambientales. El registro de N. rudis en la Sierra de Manantlán representa el primer registro para el occidente de México y el más septentrional del taxon. La población se estructura en cinco categorías diamétricas y genera una curva en forma de “J” invertida. La riqueza de especies en las parcelas donde se encuentra N. rudis, varía de 27 a 39, y los mayores valores de importancia son para Urera verrucosa, N. rudis y Ficus sp. La ordenación directa permite postular a la presencia de árboles caídos, la cobertura, la profundidad del horizonte superficial y el magnesio soluble, como los factores ambientales de mayor influencia en la distribución y abundancia de N. rudis.


Assuntos
Altitude , Ecologia , Lauraceae/fisiologia , Árvores , Clima Tropical , Densidade Demográfica , Dinâmica Populacional , Lauraceae/classificação , México
7.
Artigo em Português | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1483833

RESUMO

The aim of this work was to get some knowledge about the populational structure of the two sympatric freshwater shrimp species, Potimirim glabra (Kingsley, 1878) and Potimirim potimirim (Müller, 1881) in the Sahy River, Mangaratiba, Rio de Janeiro, Brazil. The specimens were sampled monthly from September 1997 to February 1999 by sieving the marginal vegetation, on rocky surface and among litter on river bottom, with 15-minute effort per sampling period. The animals were sorted sexed and their total and cephalothoracic length were measured. A total of 4,889 individuals were collected in Sahy river: 3,281 P. glabra and 1,608 P. potimirim. The sex ratio for all collected individuals was 1:1 for P. glabra and 1:2.3 for P. potimirim. In both populations, five sexual maturity stages were determined and the populations were constituted mainly of adult freshwater shrimps. This study shows the difference between the recruitment of juveniles along these species. The recruitment for P. glabra occurs throughout the year, except in Spring, while P. potimirim was recorded only in Autumn. The seasonal distribution of ovigerous females of P. glabra is similar to P. potimirim, with reproduction on Spring and Summer.


Este trabalho teve por objetivo obter conhecimento sobre a estrutura populacional de dois camarões de água doce simpátricos, Potimirim glabra (Kingsley, 1878) e Potimirim potimirim (Müller, 1881) no rio Sahy, Mangaratiba, Rio de Janeiro, Brasil. Os indivíduos foram coletados mensalmente durante o período de setembro de 1997 a fevereiro de 1999 utilizando-se peneiras, que foram passadas sob a vegetação marginal, superfície de rochas e pequenas poças d'água, num esforço de 15 minutos por coletor. Os animais foram separados quanto ao sexo e mensurados em relação ao comprimento total e do cefalotórax. Um total de 4.889 indivíduos foram coletados no rio Sahy: 3.281 P. glabra e 1.608 P. potimirim. A razão sexual observada foi de 1:1 para P. glabra e 1:2,3 para P. potimirim. Em ambas populações, cinco estágios de maturidade sexual foram determinados, sendo as populações constituídas principalmente por camarões adultos. O recrutamento de juvenis apresentou diferenças em ambas as espécies. O recrutamento de P. glabra ocorreu durante todo o período de estudo, exceto na primavera, enquanto que P. potimirim foi registrado somente no outono. A distribuição sazonal de fêmeas ovígeras de P. glabra é similar ao de P. potimirim, com reprodução na primavera e no verão.

8.
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-437453

RESUMO

The aim of this work was to get some knowledge about the populational structure of the two sympatric freshwater shrimp species, Potimirim glabra (Kingsley, 1878) and Potimirim potimirim (Müller, 1881) in the Sahy River, Mangaratiba, Rio de Janeiro, Brazil. The specimens were sampled monthly from September 1997 to February 1999 by sieving the marginal vegetation, on rocky surface and among litter on river bottom, with 15-minute effort per sampling period. The animals were sorted sexed and their total and cephalothoracic length were measured. A total of 4,889 individuals were collected in Sahy river: 3,281 P. glabra and 1,608 P. potimirim. The sex ratio for all collected individuals was 1:1 for P. glabra and 1:2.3 for P. potimirim. In both populations, five sexual maturity stages were determined and the populations were constituted mainly of adult freshwater shrimps. This study shows the difference between the recruitment of juveniles along these species. The recruitment for P. glabra occurs throughout the year, except in Spring, while P. potimirim was recorded only in Autumn. The seasonal distribution of ovigerous females of P. glabra is similar to P. potimirim, with reproduction on Spring and Summer.


Este trabalho teve por objetivo obter conhecimento sobre a estrutura populacional de dois camarões de água doce simpátricos, Potimirim glabra (Kingsley, 1878) e Potimirim potimirim (Müller, 1881) no rio Sahy, Mangaratiba, Rio de Janeiro, Brasil. Os indivíduos foram coletados mensalmente durante o período de setembro de 1997 a fevereiro de 1999 utilizando-se peneiras, que foram passadas sob a vegetação marginal, superfície de rochas e pequenas poças d'água, num esforço de 15 minutos por coletor. Os animais foram separados quanto ao sexo e mensurados em relação ao comprimento total e do cefalotórax. Um total de 4.889 indivíduos foram coletados no rio Sahy: 3.281 P. glabra e 1.608 P. potimirim. A razão sexual observada foi de 1:1 para P. glabra e 1:2,3 para P. potimirim. Em ambas populações, cinco estágios de maturidade sexual foram determinados, sendo as populações constituídas principalmente por camarões adultos. O recrutamento de juvenis apresentou diferenças em ambas as espécies. O recrutamento de P. glabra ocorreu durante todo o período de estudo, exceto na primavera, enquanto que P. potimirim foi registrado somente no outono. A distribuição sazonal de fêmeas ovígeras de P. glabra é similar ao de P. potimirim, com reprodução na primavera e no verão.

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