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1.
Arq. gastroenterol ; Arq. gastroenterol;61: e23104, 2024. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1533816

RESUMO

ABSTRACT Background: Lactose tolerant test (LTT) is the most broadly used diagnostic test for lactose intolerance in Brazil, is an indirect, minimally invasive and a low-cost test that is widely available in primary care and useful in clinical practice. The C/T-13910 polymorphism in lactase persistence has been well characterized in Caucasian populations, but there are no studies evaluating the concordance between C/T-13910 polymorphism genotyping results and LTT results in Brazil, where the population is highly mixed. Objective: We aimed to evaluate agreement between presence of C/T-13910 polymorphism genotyping and malabsorption in LTT results. Methods: This is a retrospective analysis of a Brazilian population whose data were collected from a single laboratory database present in several Brazilian states. Results of individuals who underwent both genetic testing for lactose intolerance (C/T-13910 polymorphism genotyping) and an LTT from April 2016 until February 2019 were analysed to evaluate agreement between tests. Groups were classified according to age (<10-year-old (yo), 10-17 yo, ≥18 yo groups) and state of residence (São Paulo or Rio Grande do Sul). Results: Among the 404 patients evaluated, there was agreement between the genotyping and LTT results in 325 (80.4%) patients and discordance in 79 (19.6%) patients (k=0.42 -moderate agreement). Regarding the genotype, 47 patients with genotype C/C (lactase nonpersistence) had normal LTT results, and 32 with genotype C/T or T/T (indicating lactase persistence) had abnormal LTT results. Neither age nor state of residence (Rio Grande do Sul or São Paulo) affected the agreement between test results. Conclusion: Considering the moderate agreement between C/T-13910 polymorphism genotyping and LTT results (κ=0.42) in the Brazilian population, we hypothesize that an analysis of other polymorphisms could be a strategy to improve the agreement between genotyping and established tests and suggest that additional studies should focus on exploring this approach.


RESUMO Contexto: O teste de tolerancia à lactose (TTL) é ampliamente utilizado por ser minimamente invasivo e de baixo custo, disponível na atenção primária e muito útil na prática clínica. Está bem estabelecido o polimorfismo C/T-13910 na persistência da lactase em populações caucasianas, mas não há estudos avaliando a concordância entre os resultados da genotipagem do polimorfismo C/T-13910 e do TTL no Brasil, onde a população é altamente miscigenada. Objetivo: Avaliar a concordância entre a presença do polimorfismo C/T-13910 e a má absorção nos resultados do TTL. Métodos: Análise retrospectiva de dados coletados de um laboratorio presente em vários estados brasileiros. Os resultados dos pacientes que realizaram um teste genético para intolerância à lactose (genotipagem do polimorfismo C/T-13910) e um TTL de abril de 2016 a fevereiro de 2019 foram analisados para avaliar a concordância entre os testes. Os grupos foram classificados de acordo com a idade (<10 anos; 10-17 anos, ≥18 anos) e estado de residência (São Paulo ou Rio Grande do Sul). Resultados: Entre os 404 pacientes avaliados, houve concordância entre os resultados de genotipagem e TTL em 325 (80,4%) pacientes e discordância em 79 (19,6%) pacientes (K=0,42 - concordância moderada). Em relação ao genótipo, 47 pacientes com genótipo C/C (não persistência de lactase) apresentaram TTL normal e 32 com genótipo C/T ou T/T (indicando persistência da lactase) apresentaram TTL anormal. A idade e o estado de residência (Rio Grande do Sul ou São Paulo) não afetaram a concordância entre os resultados dos exames. Conclusão: Considerando a concordância moderada entre a genotipagem do polimorfismo C/T-13910 e os resultados de TTL (κ=0,42) na população brasileira, sugerimos que a análise de outros polimorfismos poderia ser uma estratégia para melhorar a concordância entre os testes.

2.
BioSC. (Curitiba, Impresso) ; 80(2): 51-53, 20220000.
Artigo em Português | LILACS | ID: biblio-1438537

RESUMO

Introdução: A intolerância à lactose é síndrome decorrente da má digestão do dissacarídeo lactose por deficiência da enzima lactase, gerando sintomas principalmente gastrintestinais. Ela envolve 4 causas principais: deficiência congênita de lactase; deficiência de lactase de desenvolvimento; intolerância primária à lactose; e deficiência secundária à lactase. Objetivo: Revisão da apresentação clínica da intolerância à lactose e os principais métodos disponíveis para seu diagnóstico clínico. Método: Revisão narrativa da base de dados PubMed, por meio das palavras-chave "lactose intolerance" e "genetic test" utilizando o descritor boleano and. Foram incluídos somente artigos em língua inglesa e publicados entre os anos de 2017 e 2022, totalizando 8 artigos. Resultado: O diagnóstico de intolerância à lactose relaciona-se com o seu tipo e utiliza-se dos principais métodos: teste oral de tolerância à lactose, teste genético, teste do hidrogênio expirado. Conclusão: Quanto aos métodos de diagnóstico, o teste do hidrogênio expirado é o de escolha, por não ser invasivo, possuir execução fácil e baixo custo. Entretanto, ele não dispensa associação com outras técnicas diagnósticas. O teste genético também é muito útil e sua vantagem é que não há necessidade da realização do teste oral de tolerância.


Introduction: Lactose intolerance is a syndrome resulting from maldigestion of the disaccharide lactose due to lactase enzyme deficiency causing symptoms mainly gastrointestinal. It involves 4 main causes: congenital lactase deficiency; developmental lactase deficiency; primary lactose intolerance; and secondary lactase deficiency. Objective: Review of the clinical presentation of lactose intolerance and the main methods available for its clinical diagnosis. Methods: Literature review in the PubMed database, using the keywords "lactose intolerance" and "genetic test" and using the Boolean data type and. Only articles in English and published between the years 2017 and 2022 were included, totalizing 8 articles. Results: The diagnosis of lactose intolerance is related to its type and uses the main diagnostic tests: oral lactose tolerance, genetic, expired hydrogen. Conclusion: Regarding diagnostic methods, the expired hydrogen test is the one of choice, as it is not invasive, is easy to perform and has low cost. However, it does not dispense association with other diagnostic techniques. Genetic testing is also very usefull and its advantage is that there is no need to use the oral lactose tolerance test.

3.
São Paulo; s.n; 2022. 118 p. tab, ilus.
Tese em Português | LILACS, Inca | ID: biblio-1414118

RESUMO

Introdução: Pacientes com câncer colorretal (CCR) em idade jovem (< 50 anos) apresentam maior risco de apresentar variantes germinativas em genes de predisposição ao câncer, entre eles os genes da Síndrome de Lynch (SL) (genes MMR - MLH1, MSH2, MSH6 e PMS2). Detectar a perda de expressão de proteínas de reparo de incompatibilidade de DNA (MMR) é altamente relevante para identificar pacientes com síndrome de Lynch. No entanto, a inativação de MLH1 devido à hipermetilação do promotor ocorre em 15% dos cânceres colorretais (CCRs) esporádicos e está correlacionada com mutações somáticas BRAF. Ainda, apesar das principais síndromes hereditárias de CCR representarem 15-19% dos casos de CCR de início precoce, a etiologia da maior parte dos CCRs nestes pacientes é desconhecida, mesmo com até 25% destes casos apresentando história familiar importante para essa neoplasia. Objetivo: Caracterizar o fenótipo clínico e molecular (somático e germinativo) de pacientes com CCR desenvolvido antes dos 50 anos tratados no A.C.Camargo Cancer Center. Materiais e Métodos: Pacientes com câncer colorretal <50 anos foram selecionados a partir do banco de dados do Departamento de Cirurgia Pélvica ou pelo encaminhamento do Departamento de Oncogenética. A análise de metilação do promotor de MLH1 foi realizada por sequenciamento de nova geração (NGS) a partir de DNA convertido por bissulfito de sódio, em uma metodologia desenvolvida e validada nesse estudo. A análise de mutação de BRAF foi realizada por NGS de amplicon. Para um subgrupo de pacientes com critérios clínicos e moleculares específicos (tumores MMR deficientes, história familiar positiva para CCR, mutação KRAS: G12C e/ou idade <40 anos) foi realizado o sequenciamento germinativo de genes de predisposição ao CCR. Na avaliação das variantes germinativas foi utilizado um painel multigênico com 62 genes de associação conhecida, emergente ou desconhecida para predisposição ao CCR. As variantes identificadas foram classificadas segundo os critérios sugeridos pelo American College of Medical Genetics (ACMG). Resultados: Para análise de metilação de MLH1 utilizamos DNA de tumores FFPE e saliva foi tratado com bissulfito, amplificado por PCR e avaliado por NGS. Em tumores deficientes em MLH1/PMS2, o estado de metilação de MLH1 foi concordante com o estado de mutação BRAF em 90% (18/20) dos casos. Nosso teste NGS baseado em amplicon mostrou uma grande sensibilidade e especificidade para detectar a metilação de MLH1 em amostras de CCR, com alta concordância com a avaliação da mutação BRAF. A avaliação das variantes germinativas foi realizada em 89 pacientes, e identificamos 24 (27%) pacientes com variantes patogênicas ou provavelmente patogênicas (P/PP). A maioria dos pacientes 53% (47/89) apresentaram variantes de significado incerto (VUS) e 18 (20%) pacientes apresentaram apenas variantes sem significado clínico para os 62 genes avaliados. Dos 24 pacientes com variantes patogênicas, 16 (66,6%) apresentaram variantes P/PP em genes da síndrome de Lynch. Cinco pacientes (20%) apresentaram variantes P/PP em MUTYH (3 bialélicos e 2 monoalélicos). Dois (8,3%) pacientes tinham variantes PP em FAN1. Um paciente apresentou uma variante PP em NTHL1 (monoalélica), e para os genes XRCC4 e RAD51C tivemos um paciente cada com alteração. Dois pacientes apresentaram variantes P/PP em mais de 1 gene (1 MLH1 com FAN1, 1 MUTYH com XRCC4). Conclusão: Em nosso trabalho fomos capazes de desenvolver com sucesso uma metodologia baseada em NGS para avaliação de metilação no promotor do gene MLH1, para caracterizar molecularmente as amostras tumorais do grupo de pacientes com deficiência nos genes de reparo relacionados a causas esporádicas (metilação de MLH1 e mutação de BRAF). Além disso, identificamos variantes germinativas com evidência definitiva de predisposição ao CCR em 1 a cada 4 pacientes da nossa coorte, além de termos identificado variantes patogênicas em genes com evidência limitada ou ausente de predisposição hereditária ao câncer CCR, como é o caso dos genes RAD51C, XRCC4 e FAN1.


Introduction: Patients with colorectal cancer (CRC) at a young age (< 50 years) are at greater risk of having germline variants in cancer predisposition genes, including Lynch Syndrome (LS) genes (MMR genes - MLH1, MSH2, MSH6 and PMS2). Detecting the loss of expression of DNA mismatch repair (MMR) proteins is highly relevant to identify patients with Lynch syndrome. However, inactivation of MLH1 due to promoter hypermethylation occurs in 15% of sporadic colorectal cancers (CRCs) and is correlated with somatic BRAF mutations. Also, although the main hereditary syndromes of CRC represent 15-19% of cases of early-onset CRC, the etiology of most CRCs in these patients is unknown, even with up to 25% of these cases presenting an important family history of this neoplasm. Objective: To characterize the clinical and molecular phenotype (somatic and germline) of patients with CRC developed before the age of 50 years treated at the A.C.Camargo Cancer Center. Materials and Methods: Colorectal cancer patients <50 years were selected from the database of the Department of Pelvic Surgery or by referral from the Department of Oncogenetics. MLH1 promoter methylation analysis was performed by next-generation sequencing (NGS) from DNA converted by sodium bisulfite, in a methodology developed and validated in this study. BRAF mutation analysis was performed by amplicon NGS. For a subgroup of patients with specific clinical and molecular criteria (MMR deficient tumors, positive family history for CCR, KRAS:G12C mutation, and/or age <40 years) germline sequencing of CRC predisposing genes was performed. In the evaluation of germline variants, a multigene panel with 62 genes of known, emerging or unknown association for CRC predisposition was used. The identified variants were classified according to the criteria suggested by the American College of Medical Genetics (ACMG). Results: For MLH1 methylation analysis we used DNA from FFPE tumors and saliva was treated with bisulfite, amplified by PCR and evaluated by NGS. In MLH1/PMS2 deficient tumors, MLH1 methylation status was concordant with BRAF mutation status in 90% (18/20) of cases. Our amplicon-based NGS test showed great sensitivity and specificity for detecting MLH1 methylation in CRC samples, with high agreement with the BRAF mutation assessment. The evaluation of germline variants was performed in 89 patients, and we identified 24 (27%) patients with pathogenic or probably pathogenic (P/PP) variants. Most patients 53% (47/89) had variants of uncertain significance (VUS) and 18 (20%) patients had only variants without clinical significance for the 62 genes evaluated. Of the 24 patients with pathogenic variants, 16 (66.6%) had P/PP variants in Lynch syndrome genes. Five patients (20%) had P/PP variants in MUTYH (3 biallelic and 2 monoallelic). Two (8.3%) patients had PP variants in FAN1. One patient had a PP variant in NTHL1 (monoallelic), and for the XRCC4 and RAD51C genes we had one patient each with alteration. Two patients had P/PP variants in more than 1 gene (1 MLH1 with FAN1, 1 MUTYH with XRCC4). Conclusion: In our work, we were able to successfully develop a methodology based on NGS for the evaluation of methylation in the promoter of the MLH1 gene, to molecularly characterize the tumor samples from the group of patients with deficiency in the repair genes related to sporadic causes (MLH1 methylation and BRAF mutation). In addition, we identified germline variants with definitive evidence of predisposition to CRC in 1 out of 4 patients in our cohort, in addition to having identified pathogenic variants in genes with limited or no evidence of hereditary predisposition to CRC cancer, such as the RAD51C genes, XRCC4 and FAN1.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Neoplasias Colorretais Hereditárias sem Polipose , Neoplasias Colorretais
5.
Rev. bras. reprod. anim ; 45(4): 198-201, out.-dez. 2021.
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1492660

RESUMO

O gato doméstico foi o segundo carnívoro a passar pelo processo de domesticação. Este evento foi um marco muito importante para os gatos, mas também houve grande impacto para nossa sociedade, pois os gatos auxiliaram fortemente no controle de roedores. Após uma longa interação entre humanos e gatos, a seleção artificial para formação de raças e fenótipos de interesse gerou um aumento de acasalamentos entre indivíduos aparentados, e consequentemente, aumento de variantes deletérias nos gatos modernos. Atualmente, pesquisa e dados genômicos permitem a avaliação e detecção destas variantes, de modo a auxiliar a reprodução e saúde dos gatos domésticos.


The domestic cat was the second carnivore to go through the domestication process. This event was a very important milestone for cats, but it also had a great impact on our society, as cats strongly helped in rodent control. After a long interaction between humans and cats, artificial selection to form breeds and phenotypes of interest generated an increase in matings among related individuals, and consequently, an increase in deleterious variants in modern cats. Currently, research and genomic data allow the evaluation and detection of these variants, in order to help the reproduction and health of domestic felines.


Assuntos
Animais , Gatos , Comportamento Sexual Animal/fisiologia , Endogamia , Gatos/genética , Testes Genéticos
6.
Ciênc. Anim. (Impr.) ; 30(2,supl.1): 33-41, 2020. ilus, tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-29924

RESUMO

A raça Dálmata é uma das raças mais populares, e, de acordo com seu padrão racial, deve apresentar cor de pelagem branca, com pintas pretas ou fígado. Vários loci estão envolvidos na determinação da cor da pelagem dos cães. No Dálmata, os principais são o locus B e o locus E, pois esses lócus têm influência um sobre o outro, causando uma interação gênica chamada epistasia, onde o efeito de um gene modifica o efeito de outro, alterando o fenótipo do animal. Com o avanço da cinofilia, o melhoramento genético em cães se tornou mais importante, tornando o conhecimento desses genes uma ferramenta necessária para os criadores. O objetivo deste trabalho foi demonstrar a importância do teste genético para o gene E, e seu auxílio no planejamento de acasalamento nos canis de Dálmatas. Para isso, foi usada uma ninhada nascida em Fortaleza, na qual foram realizados testes genéticos para o gene E do padreador de pintas pretas e de dois filhotes escolhidos aleatoriamente, um preto e um limão. O teste foi realizado através da técnica de PCR, e como resultado foi visto que o pai é heterozigoto (Ee). Já em relação as crias, foi confirmado o homozigoto dominante (EE) para a cria dentro do padrão e o homozigoto recessivo (ee) para a cria limão. Nesta cria ocorreu a epistasia, fazendo com que apresentasse pintas alaranjadas. Assim, conclui-se que não se pode definir o genótipo apenas pelo fenótipo, tornando o teste genético uma importante ferramenta para escolha dos padreadores.(AU)


The Dalmatian breed is one of the most popular breeds, and, according to its racial pattern, should have a white coat color with black spots or liver. Several loci are involved in determining the coat color of dogs. In the Dalmatian, the major are the locus B and the locus E, because these locus have influence on each other, causing a genetic interaction called epistasis, where the effect of one gene modifies the effect of another, altering the phenotype of the animal. With the advancement of cynophilia, genetic improvement in dogs has become more important, making knowledge of these genes a necessary tool for breeders. The objective of this work was to demonstrate the importance of the genetic test for gene E, and its aid in the planning of mating in dalmatians kennels. For this, a litter born in Fortaleza was used, in which genetic tests were performed for the E gene of the black-spotted and two randomly selected puppies, one black and one lemon. The test was performed using the PCR technique, and as a result it was seen that the parent is heterozygous (Ee). In relation to the offspring, the dominant homozygous (EE) was created for the offspring and the recessive homozygote (ee) for the offspring. In this breed epistasis occurred, causing it to present orange spots. Thus, it can be concluded that the genotype can not be defined only by the phenotype, making the genetic test an important tool for the selection of stud holders.(AU)


Assuntos
Animais , Cães , Testes Genéticos/veterinária , Pelo Animal/fisiologia , Genótipo , Cães/fisiologia
7.
Ciênc. Anim. (Impr.) ; 30(2,supl.1): 33-41, 2020. ilus, tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1472636

RESUMO

A raça Dálmata é uma das raças mais populares, e, de acordo com seu padrão racial, deve apresentar cor de pelagem branca, com pintas pretas ou fígado. Vários loci estão envolvidos na determinação da cor da pelagem dos cães. No Dálmata, os principais são o locus B e o locus E, pois esses lócus têm influência um sobre o outro, causando uma interação gênica chamada epistasia, onde o efeito de um gene modifica o efeito de outro, alterando o fenótipo do animal. Com o avanço da cinofilia, o melhoramento genético em cães se tornou mais importante, tornando o conhecimento desses genes uma ferramenta necessária para os criadores. O objetivo deste trabalho foi demonstrar a importância do teste genético para o gene E, e seu auxílio no planejamento de acasalamento nos canis de Dálmatas. Para isso, foi usada uma ninhada nascida em Fortaleza, na qual foram realizados testes genéticos para o gene E do padreador de pintas pretas e de dois filhotes escolhidos aleatoriamente, um preto e um limão. O teste foi realizado através da técnica de PCR, e como resultado foi visto que o pai é heterozigoto (Ee). Já em relação as crias, foi confirmado o homozigoto dominante (EE) para a cria dentro do padrão e o homozigoto recessivo (ee) para a cria limão. Nesta cria ocorreu a epistasia, fazendo com que apresentasse pintas alaranjadas. Assim, conclui-se que não se pode definir o genótipo apenas pelo fenótipo, tornando o teste genético uma importante ferramenta para escolha dos padreadores.


The Dalmatian breed is one of the most popular breeds, and, according to its racial pattern, should have a white coat color with black spots or liver. Several loci are involved in determining the coat color of dogs. In the Dalmatian, the major are the locus B and the locus E, because these locus have influence on each other, causing a genetic interaction called epistasis, where the effect of one gene modifies the effect of another, altering the phenotype of the animal. With the advancement of cynophilia, genetic improvement in dogs has become more important, making knowledge of these genes a necessary tool for breeders. The objective of this work was to demonstrate the importance of the genetic test for gene E, and its aid in the planning of mating in dalmatians kennels. For this, a litter born in Fortaleza was used, in which genetic tests were performed for the E gene of the black-spotted and two randomly selected puppies, one black and one lemon. The test was performed using the PCR technique, and as a result it was seen that the parent is heterozygous (Ee). In relation to the offspring, the dominant homozygous (EE) was created for the offspring and the recessive homozygote (ee) for the offspring. In this breed epistasis occurred, causing it to present orange spots. Thus, it can be concluded that the genotype can not be defined only by the phenotype, making the genetic test an important tool for the selection of stud holders.


Assuntos
Animais , Cães , Cães/fisiologia , Genótipo , Pelo Animal/fisiologia , Testes Genéticos/veterinária
8.
J. epilepsy clin. neurophysiol ; 18(2): 60-62, 2012.
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-658980

RESUMO

OBJETIVOS: O propósito deste estudo foi ampliar o conhecimento acerca da aplicabilidade clínica do teste genético em SCN1A para fenótipos graves do espectro da epilepsia generalizada com crises febris plus por meio de triagem de mutações em pacientes com síndromes de Dravet e de Doose e estabelecimento de correlações genótipo-fenótipo. MÉTODOS: A triagem de mutações em SCN1A foi realizada em 15 pacientes com síndrome de Dravet e em 13 com síndrome de Doose. Oito algoritmos de predição foram utilizados para analisar o impacto das mutações na provável função proteica. Além disso, todas as mutações em SCN1A previamente publicadas foram compiladas e analisadas. A técnica de Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA) também foi usada para detectar variações no número de cópias em SCN1A. RESULTADOS: Doze mutações foram identificadas em pacientes com síndrome de Dravet, enquanto pacientes com síndrome de Doose não apresentaram mutações. Nossos resultados mostram que mutações missense são as mais comuns, e estão localizadas predominantemente nas regiões do poro e porções C- e N-terminal da proteína. Não foram identificadas alterações no número de cópias de SCN1A em nossa casuística. CONCLUSÕES: O teste genético em SCN1A é de utilidade clínica para pacientes com síndrome de Dravet, mas não para os com síndrome de Doose, pois ambas as síndromes parecem não compartilhar a mesma base genética. Nossos resultados indicam que mutações missense podem causar fenótipos graves dependendo da localização e do tipo da substituição do aminoácido. Além disso, a análise de predição utilizando múltiplos algoritmos computacionais foi eficaz para a maioria das mutações.


OBJECTIVES: The purpose of this study was to advance the knowledge on the clinical use of SCN1A testing for severe epilepsies within the spectrum of generalized epilepsy with febrile seizures plus by performing genetic screening in patients with Dravet and Doose syndromes and establishing genotype-phenotype correlations. METHODS: Mutation screening in SCN1A was performed in 15 patients with Dravet syndrome and 13 with Doose syndrome. Eight prediction algorithms were used to analyze the impact of the mutations in putative protein function. Furthermore, all SCN1A mutations previously published were compiled and analyzed. In addition, Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA) technique was used to detect possible copy number variations within SCN1A. RESULTS: Twelve mutations were identified in patients with Dravet syndrome, while patients with Doose syndrome showed no mutations. Our results show that the most common type of mutation found is missense, and that they are mostly located in the pore region and the N- and C-terminal of the protein. No copy number variants in SCN1A were identified in our cohort. CONCLUSIONS: SCN1A testing is clinically useful for patients with Dravet syndrome, but not for those with Doose syndrome, since both syndromes do not seem to share the same genetic basis. Our results indicate that indeed missense mutations can cause severe phenotypes depending on its location and the type of amino-acid substitution. Moreover, our strategy for predicting deleterious effect of mutations using multiple computation algorithms was efficient for most of the mutations identified.


Assuntos
Humanos , Testes Genéticos , Epilepsias Mioclônicas , Canal de Sódio Disparado por Voltagem NAV1.1 , Mutação
9.
Sci. agric ; 66(1)2009.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1496917

RESUMO

Breeding cycle in rubber extends to 20-30 years between pollination and yield assessment, distributed over three selection stages. Five hectares of small scale trial of rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell.-Arg.], was established in the Northwestern region of São Paulo State, Brazil. The population comprises 98 clones mostly derived from intensively selected plus tree in the natural forest of rubber tree in the Amazon. Three open pollinated progeny tests were established in three experimental stations. Seedlings from 98 progenies including a commercial check (CC) were planted in each one of the three locations. Assessments were made when the plants were one, two and three years old. The variation among progenies for girth was highly significant in all locations examined. In the combined analysis of variance over three locations, differences among progenies were also detected, while progeny × location interaction effect was not significant. Narrow sense heritability estimates on individual tree basis (h i²) were variable depending on the characteristic, age of assessment and experimental location. Realized genetic gains were calculated for the plant characteristics at the age of three years, by comparing the performance of improved (selected) materials to unimproved materials (CC). The total genetic gain from the genetically tested first generation clone population at Votuporanga is estimated as 25% for girth, 14% for rubber yield and 25% for bark thickness. Improvement of rubber tree by selection, establishment of clonal population (isolated garden) and progeny testing is a very promising and profitable operation.


Partindo-se da polinização à recomendação de clones para o plantio, o ciclo de melhoramento da seringueira, o qual compreende três ciclos de seleção leva em torno de 20-30 anos. Cinco hectares de uma população clonal de seringueira [Hevea brasiliensis Willd. ex Adr. de Juss.) Muell.-Arg.] foram instalados em Votuporanga, região Noroeste do Estado de São Paulo. A população inclui 98 clones, cuja maioria é derivada de árvores selecionadas na floresta nativa de seringueira na Amazônia. Três testes de progênies de polinização aberta foram conduzidos nas estações experimentais de Pindorama, Jaú e Votuporanga. Mudas de 98 progênies inclusive a testemunha (CC) foram plantadas em cada um dos três locais. Foram feitas avaliações quando as plantas apresentaram um, dois e três anos respectivamente. A variação entre progênies para crescimento de perímetro do caule foi altamente significantes em todos os locais testados. Nas análises de variâncias conjuntas com os três locais também foram observadas diferenças entre progênies, e que o efeito da interação progênie × local não foi significativo. Estimativas de herdabilidade no sentido restrito em nível de árvore individual (h i²) foram variáveis dependentes das características, idade de avaliação e local dos experimentos. Foram calculados ganhos genéticos para as características da planta na idade de três anos através da comparação de desempenho nos materiais selecionados para os não selecionados (CC). O ganho genético total da primeira população geneticamente testada da população clonal de Votuporanga foi calculado como 25% para perímetro caule, 14% para produção de borracha e 25% para espessura da casca. Melhoramento da seringueira por meio da seleção, implantação de uma população clonal e teste de progênie com os clones é uma operação lucrativa e muito promissora.

10.
Sci. agric. ; 66(1)2009.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-440327

RESUMO

Breeding cycle in rubber extends to 20-30 years between pollination and yield assessment, distributed over three selection stages. Five hectares of small scale trial of rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell.-Arg.], was established in the Northwestern region of São Paulo State, Brazil. The population comprises 98 clones mostly derived from intensively selected plus tree in the natural forest of rubber tree in the Amazon. Three open pollinated progeny tests were established in three experimental stations. Seedlings from 98 progenies including a commercial check (CC) were planted in each one of the three locations. Assessments were made when the plants were one, two and three years old. The variation among progenies for girth was highly significant in all locations examined. In the combined analysis of variance over three locations, differences among progenies were also detected, while progeny × location interaction effect was not significant. Narrow sense heritability estimates on individual tree basis (h i²) were variable depending on the characteristic, age of assessment and experimental location. Realized genetic gains were calculated for the plant characteristics at the age of three years, by comparing the performance of improved (selected) materials to unimproved materials (CC). The total genetic gain from the genetically tested first generation clone population at Votuporanga is estimated as 25% for girth, 14% for rubber yield and 25% for bark thickness. Improvement of rubber tree by selection, establishment of clonal population (isolated garden) and progeny testing is a very promising and profitable operation.


Partindo-se da polinização à recomendação de clones para o plantio, o ciclo de melhoramento da seringueira, o qual compreende três ciclos de seleção leva em torno de 20-30 anos. Cinco hectares de uma população clonal de seringueira [Hevea brasiliensis Willd. ex Adr. de Juss.) Muell.-Arg.] foram instalados em Votuporanga, região Noroeste do Estado de São Paulo. A população inclui 98 clones, cuja maioria é derivada de árvores selecionadas na floresta nativa de seringueira na Amazônia. Três testes de progênies de polinização aberta foram conduzidos nas estações experimentais de Pindorama, Jaú e Votuporanga. Mudas de 98 progênies inclusive a testemunha (CC) foram plantadas em cada um dos três locais. Foram feitas avaliações quando as plantas apresentaram um, dois e três anos respectivamente. A variação entre progênies para crescimento de perímetro do caule foi altamente significantes em todos os locais testados. Nas análises de variâncias conjuntas com os três locais também foram observadas diferenças entre progênies, e que o efeito da interação progênie × local não foi significativo. Estimativas de herdabilidade no sentido restrito em nível de árvore individual (h i²) foram variáveis dependentes das características, idade de avaliação e local dos experimentos. Foram calculados ganhos genéticos para as características da planta na idade de três anos através da comparação de desempenho nos materiais selecionados para os não selecionados (CC). O ganho genético total da primeira população geneticamente testada da população clonal de Votuporanga foi calculado como 25% para perímetro caule, 14% para produção de borracha e 25% para espessura da casca. Melhoramento da seringueira por meio da seleção, implantação de uma população clonal e teste de progênie com os clones é uma operação lucrativa e muito promissora.

11.
Arq. bras. endocrinol. metab ; Arq. bras. endocrinol. metab;51(9): 1463-1467, dez. 2007. ilus
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-471766

RESUMO

The two index patients of the family analyzed in this study had undergone bilateral adrenalectomy for pheochromocytomas. This prompted genetic analyses of the probands and seven first-degree relatives. The two pheochromocytoma patients and two additional asymptomatic family members were found to harbor a mutation c496G>T in exon 3 of the VHL gene. The family was then lost to systematic follow-up. Three years after performing the initial genetic evaluation, the sister of the probands, who was known to carry the same VHL germline mutation, was referred to our service after a pregnancy that was complicated by preeclampsia. She reported paroxysms suggestive for pheochromocytoma, but her urinary metanephrines were negative. However, computerized tomography of the abdomen showed an adrenal mass that was also positive on metaiodobenzylguanidine (MIBG) scintigraphy. This study illustrates that molecular analysis of the index patient(s) can lead to the identification of presymptomatic relatives carrying the mutation. Moreover, despite negative urinary metanephrines, the identification of a specific mutation has led to an increased suspicion and detection of a pheochromocytoma in the sister of the probands.


Dois pacientes índices da família analisada neste estudo foram submetidos a adrenalectomia bilateral devido a feocromocitoma. Foi, então, realizado o estudo genético dos pacientes e de sete parentes de primeiro grau. Os dois pacientes com feocromocitoma e dois outros membros assintomáticos da família apresentaram a mutação c496G>T no exon 3 do gene VHL. A família perdeu seguimento médico. Três anos após a realização da avaliação genética, a irmã dos pacientes, portadora da mutação, foi encaminhada para o nosso serviço após uma gestação complicada por pré-eclampsia. Ela referia paroxismos sugestivos de feocromocitoma, mas as metanefrinas urinárias eram negativas. Entretanto, a tomografia computadorizada de abdômen evidenciou uma massa adrenal que também se contrastou na cintilografia com metaiodobenzilguanidina (MIBG). Esse estudo mostra que a análise molecular do paciente índice pode levar à identificação de parentes assintomáticos portadores da mutação. Além disso, mesmo com as metanefrinas urinárias negativas, a identificação de uma mutação específica levou a um aumento da suspeita e detecção de feocromocitoma na irmã dos afetados pela doença.


Assuntos
Adolescente , Criança , Feminino , Humanos , Masculino , Gravidez , Neoplasias das Glândulas Suprarrenais/genética , Mutação em Linhagem Germinativa/genética , Mutação de Sentido Incorreto/genética , Feocromocitoma/genética , Proteína Supressora de Tumor Von Hippel-Lindau/genética , Doença de von Hippel-Lindau/genética , Sequência de Bases/genética , Linhagem , Reação em Cadeia da Polimerase , Pré-Eclâmpsia/genética
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