RESUMO
Abstract In soybean breeding program, continuous selection pressure on traits response to yield created a genetic bottleneck for improvements of soybean through hybridization breeding technique. Therefore an initiative was taken to developed high yielding soybean variety applying mutation breeding techniques at Plant Breeding Division, Bangladesh Institute of Nuclear Agriculture (BINA), Bangladesh. Locally available popular cultivar BARI Soybean-5 was used as a parent material and subjected to five different doses of Gamma ray using Co60. In respect to seed yield and yield attributing characters, twelve true breed mutants were selected from M4 generation. High values of heritability and genetic advance with high genotypic coefficient of variance (GCV) for plant height, branch number and pod number were considered as favorable attributes for soybean improvement that ensure expected yield. The mutant SBM-18 obtained from 250Gy provided stable yield performance at diversified environments. It provided maximum seed yield of 3056 kg ha-1 with highest number of pods plant-1 (56). The National Seed Board of Bangladesh (NSB) eventually approved SBM-18 and registered it as a new soybean variety named 'Binasoybean-5' for large-scale planting because of its superior stability in various agro-ecological zones and consistent yield performance.
Resumo No programa de melhoramento da soja, a pressão pela seleção contínua para a resposta das características de rendimento criou um gargalo genético para melhorias da soja por meio da técnica de melhoramento por hibridação. Portanto, foi desenvolvida uma variedade de soja de alto rendimento, aplicando técnicas de reprodução por mutação, na Divisão de Melhoramento de Plantas, no Instituto de Agricultura Nuclear de Bangladesh (BINA), em Bangladesh. A cultivar popular BARI Soybean-5, disponível localmente, foi usada como material original e submetida a cinco doses diferentes de raios gama usando Co60. Em relação ao rendimento de sementes e às características de atribuição de rendimento, 12 mutantes genuínos foram selecionados a partir da geração M4. Altos valores de herdabilidade e avanço genético com alto coeficiente de variância genotípico (GCV) para altura da planta, número de ramos e número de vagens foram considerados atributos favoráveis ao melhoramento da soja, garantindo, assim, a produtividade esperada. O mutante SBM-18, obtido a partir de 250Gy, proporcionou desempenho de rendimento estável em ambientes diversificados e produtividade máxima de sementes de 3.056 kg ha-1 com o maior número de vagens planta-1 (56). O Conselho Nacional de Sementes de Bangladesh (NSB) finalmente aprovou o SBM-18 e o registrou como uma nova variedade de soja, chamada 'Binasoybean-5', para plantio em larga escala por causa de sua estabilidade superior em várias zonas agroecológicas e desempenho de rendimento consistente.
Assuntos
Glycine max/crescimento & desenvolvimento , Glycine max/genética , Fenótipo , Bangladesh , Melhoramento Vegetal , Genótipo , MutaçãoRESUMO
Abstract In soybean breeding program, continuous selection pressure on traits response to yield created a genetic bottleneck for improvements of soybean through hybridization breeding technique. Therefore an initiative was taken to developed high yielding soybean variety applying mutation breeding techniques at Plant Breeding Division, Bangladesh Institute of Nuclear Agriculture (BINA), Bangladesh. Locally available popular cultivar BARI Soybean-5 was used as a parent material and subjected to five different doses of Gamma ray using Co60. In respect to seed yield and yield attributing characters, twelve true breed mutants were selected from M4 generation. High values of heritability and genetic advance with high genotypic coefficient of variance (GCV) for plant height, branch number and pod number were considered as favorable attributes for soybean improvement that ensure expected yield. The mutant SBM-18 obtained from 250Gy provided stable yield performance at diversified environments. It provided maximum seed yield of 3056 kg ha-1 with highest number of pods plant-1 (56). The National Seed Board of Bangladesh (NSB) eventually approved SBM-18 and registered it as a new soybean variety named Binasoybean-5 for large-scale planting because of its superior stability in various agro-ecological zones and consistent yield performance.
Resumo No programa de melhoramento da soja, a pressão pela seleção contínua para a resposta das características de rendimento criou um gargalo genético para melhorias da soja por meio da técnica de melhoramento por hibridação. Portanto, foi desenvolvida uma variedade de soja de alto rendimento, aplicando técnicas de reprodução por mutação, na Divisão de Melhoramento de Plantas, no Instituto de Agricultura Nuclear de Bangladesh (BINA), em Bangladesh. A cultivar popular BARI Soybean-5, disponível localmente, foi usada como material original e submetida a cinco doses diferentes de raios gama usando Co60. Em relação ao rendimento de sementes e às características de atribuição de rendimento, 12 mutantes genuínos foram selecionados a partir da geração M4. Altos valores de herdabilidade e avanço genético com alto coeficiente de variância genotípico (GCV) para altura da planta, número de ramos e número de vagens foram considerados atributos favoráveis ao melhoramento da soja, garantindo, assim, a produtividade esperada. O mutante SBM-18, obtido a partir de 250Gy, proporcionou desempenho de rendimento estável em ambientes diversificados e produtividade máxima de sementes de 3.056 kg ha-1 com o maior número de vagens planta-1 (56). O Conselho Nacional de Sementes de Bangladesh (NSB) finalmente aprovou o SBM-18 e o registrou como uma nova variedade de soja, chamada Binasoybean-5, para plantio em larga escala por causa de sua estabilidade superior em várias zonas agroecológicas e desempenho de rendimento consistente.
RESUMO
ABSTRACT Introduction: Some gene mutations in high grade glioma patients have many implications in prognosis and treatment response. Objectives: To describe the characteristics and associations of IDH, TP53 gene mutations and MGMT methylation status with some characteristics and treatment response in patients with high grade glioma. Methods: A descriptive, prospective, uncontrolled study was conducted, in 52 patients with high-grade glioma. Research variables include age, sex, Karnofsky score, the rate of IDH, P53 mutation, MGMT methylation; the relationship between genes mutation with some characteristics and response to treatment according to the RECIST classification. Results: For IDH gene mutation, grade III patients (23.1%) have a higher positive rate than grade IV (11.5 %); for P53 gene mutation, grade III patients (55.6 %) have a higher positive rate than grade IV (44.1 %); the rate of MGMT promoter methylation occurred in the study group of patients with the rate of 42.3 %. There is a relationship between IDH gene mutation with pathological results and malignancy in studied patients. Patients with the mutant expression of the IDH gene, p53, MGMT methylation status had better RECIST responses than patients without these expressions. Conclusion: High-grade glioma mainly occurs in men, over 40 years old. The presence of mutations in IDH, P53 genes, and MGMT methylation status was a beneficial factor for treatment response as assessed by RECIST.
RESUMEN Introducción: Algunas mutaciones genéticas en pacientes con glioma de alto grado tienen implicaciones en el pronóstico y respuesta al tratamiento. Objetivos: Describir las características y asociaciones de IDH, mutaciones del gen TP53 y estado de metilación de MGMT con algunas características y respuesta al tratamiento en pacientes con glioma de alto grado. Métodos: Se realizó un estudio descriptivo, prospectivo no controlado, en 52 pacientes con glioma de alto grado. Las variables investigadas fueron: edad, sexo, puntuación de Karnofsky, tasa de IDH, mutación P53, estado de metilación de MGMT, relación entre la mutación de genes con algunas características y la respuesta al tratamiento según la clasificación RECIST. Resultados: Mutación del gen IDH: los pacientes grado III (23,1 %) tienen una tasa positiva más alta que los grado IV (11,5 %). Mutación del gen P53: los grado III (55,6 %) tienen una tasa positiva más alta que los grado IV (44,1 %). La tasa de metilación del promotor de MGMT se produjo con una tasa del 42,3 %. Existe relación entre la mutación del gen IDH con los resultados patológicos y la malignidad. Los pacientes con la expresión mutante del gen IDH, p53, estado de metilación de MGMT tuvieron mejores respuestas RECIST. Conclusión: El glioma de alto grado se presenta principalmente en hombres, mayores de 40 años. La presencia de mutaciones en los genes IDH, P53 y el estado de metilación de MGMT fue un factor beneficioso para la respuesta al tratamiento según lo evaluado por RECIST.
RESUMO
CKB3 is a regulatory (beta) subunit of CK2. In this study Arabidopsis thaliana homozygous T-DNA mutant ckb3 was studied to understand the role of CKB3 in abscisic acid (ABA) signaling. The results shown: CKB3 was expressed in all organs and the highest expression in the seeds, followed by the root. During seed germination and root growth the ckb3 mutant showed reduced sensitivity to ABA. The ckb3 mutant had more stomatal opening and increased proline accumulation and leaf water loss. The expression levels of number of genes in the ABA regulatory network had changed. This study demonstrates that CKB3 is an ABA signaling-related gene and may play a positive role in ABA signaling.(AU)
CKB3 é uma subunidade reguladora (beta) de CK2. Neste estudo, o mutante homozigoto ckb3 de Arabidopsis thaliana foi estudado para entender o papel da CKB3 na sinalização de ácido abscísico (ABA). Os resultados apresentados: CKB3 foi expresso em todos os órgãos e a maior expressão nas sementes, seguida pela raiz. Durante a germinação das sementes e o crescimento radicular, o mutante ckb3 mostrou sensibilidade reduzida ao ABA. O mutante ckb3 teve mais abertura estomática e aumento do acúmulo de prolina e perda de água nas folhas. Os níveis de expressão do número de genes na rede reguladora da ABA haviam mudado. Este estudo demonstra que CKB3 é um gene relacionado à sinalização ABA e pode desempenhar um papel positivo na sinalização ABA.(AU)
Assuntos
Arabidopsis/genética , Ácido Abscísico/genética , Mutação , ProlinaRESUMO
CKB3 is a regulatory (beta) subunit of CK2. In this study Arabidopsis thaliana homozygous T-DNA mutant ckb3 was studied to understand the role of CKB3 in abscisic acid (ABA) signaling. The results shown: CKB3 was expressed in all organs and the highest expression in the seeds, followed by the root. During seed germination and root growth the ckb3 mutant showed reduced sensitivity to ABA. The ckb3 mutant had more stomatal opening and increased proline accumulation and leaf water loss. The expression levels of number of genes in the ABA regulatory network had changed. This study demonstrates that CKB3 is an ABA signaling-related gene and may play a positive role in ABA signaling.
CKB3 é uma subunidade reguladora (beta) de CK2. Neste estudo, o mutante homozigoto ckb3 de Arabidopsis thaliana foi estudado para entender o papel da CKB3 na sinalização de ácido abscísico (ABA). Os resultados apresentados: CKB3 foi expresso em todos os órgãos e a maior expressão nas sementes, seguida pela raiz. Durante a germinação das sementes e o crescimento radicular, o mutante ckb3 mostrou sensibilidade reduzida ao ABA. O mutante ckb3 teve mais abertura estomática e aumento do acúmulo de prolina e perda de água nas folhas. Os níveis de expressão do número de genes na rede reguladora da ABA haviam mudado. Este estudo demonstra que CKB3 é um gene relacionado à sinalização ABA e pode desempenhar um papel positivo na sinalização ABA.
Assuntos
Arabidopsis/genética , Arabidopsis/metabolismo , Ácido Abscísico , Proteínas de Arabidopsis/genética , Proteínas de Arabidopsis/metabolismo , Sementes , Germinação , Regulação da Expressão Gênica de Plantas/genética , Mutação/genéticaRESUMO
Brucella ovis causes economic and reproductive losses in sheep herds. The goal of this study was to characterize infection with B. ovis field isolates in a murine model, and to evaluate protection induced by the candidate vaccine strain B. ovis ΔabcBA in mice challenged with these field isolates. B. ovis field strains were able to colonize and cause lesions in the liver and spleen of infected mice. After an initial screening, two strains were selected for further characterization (B. ovis 94 AV and B. ovis 266 L). Both strains had in vitro growth kinetics that was similar to that of the reference strain B. ovis ATCC 25840. Vaccination with B. ovis ΔabcBA encapsulated with 1% alginate was protective against the challenge with field strains, with the following protection indexes: 0.751, 1.736, and 2.746, for mice challenged with B. ovis ATCC25840, B. ovis 94 AV, and B. ovis 266 L, respectively. In conclusion, these results demonstrated that B. ovis field strains were capable of infecting and inducing lesions in experimentally infected mice. The attenuated vaccine strain B. ovis ΔabcBA induced protection in mice challenged with different B. ovis field isolates, resulting in higher protection indexes against more pathogenic strains.(AU)
Brucella ovis é responsável por perdas econômicas e reprodutivas em rebanhos ovinos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a infecção com as cepas isoladas de campo de B. ovis em modelo murino e avaliar a eficiência vacinal da mutante B. ovis ΔabcAB para proteção contra desafio com as cepas isoladas de campo. Foram utilizadas sete cepas isoladas de campo foram capazes de colonizar e provocar lesões no fígado e no baço de camundongos após sete dias pós-infecção. Após triagem, duas cepas foram selecionadas para a melhor caracterização (B. ovis 94 AV and B. ovis 266L). Ambas apresentaram crescimento em placa de cultivo semelhante ao da cepa de referência B. ovis ATCC 25840. A vacinação com a cepa de Brucella ovis ΔabcBA encapsulada com alginato a 1% foi capaz de proteger camundongos desafiados com as cepas isoladas de campo, com os seguintes índices de proteção: 0,751, 1,736 e 2,746, para camundongos desafiados com B. ovis ATCC 25840, B. ovis 94 AV e B. ovis 266 L, respectivamente. Estes resultados demonstraram que as cepas isoladas de campo de B. ovis são capazes de infectar e induzir lesão em camundongos experimentalmente infectados. O uso da cepa mutante atenuada B. ovis ΔabcBA para vacinação de fêmeas C57BL/6 desafiados com diferentes cepas de B. ovis induziu proteção nos camundongos desafiados com diferentes cepas de B. ovis. Deste modo, mostrando-se eficiente na proteção das cepas de campo de B. ovis.(AU)
Assuntos
Animais , Camundongos , Brucelose/prevenção & controle , Ovinos/microbiologia , Vacinas Bacterianas/imunologia , Brucella ovis/isolamento & purificação , Brucella ovis/imunologia , Brucella ovis/patogenicidadeRESUMO
Brucella ovis causes economic and reproductive losses in sheep herds. The goal of this study was to characterize infection with B. ovis field isolates in a murine model, and to evaluate protection induced by the candidate vaccine strain B. ovis ΔabcBA in mice challenged with these field isolates. B. ovis field strains were able to colonize and cause lesions in the liver and spleen of infected mice. After an initial screening, two strains were selected for further characterization (B. ovis 94 AV and B. ovis 266 L). Both strains had in vitro growth kinetics that was similar to that of the reference strain B. ovis ATCC 25840. Vaccination with B. ovis ΔabcBA encapsulated with 1% alginate was protective against the challenge with field strains, with the following protection indexes: 0.751, 1.736, and 2.746, for mice challenged with B. ovis ATCC25840, B. ovis 94 AV, and B. ovis 266 L, respectively. In conclusion, these results demonstrated that B. ovis field strains were capable of infecting and inducing lesions in experimentally infected mice. The attenuated vaccine strain B. ovis ΔabcBA induced protection in mice challenged with different B. ovis field isolates, resulting in higher protection indexes against more pathogenic strains.(AU)
Brucella ovis é responsável por perdas econômicas e reprodutivas em rebanhos ovinos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a infecção com as cepas isoladas de campo de B. ovis em modelo murino e avaliar a eficiência vacinal da mutante B. ovis ΔabcAB para proteção contra desafio com as cepas isoladas de campo. Foram utilizadas sete cepas isoladas de campo foram capazes de colonizar e provocar lesões no fígado e no baço de camundongos após sete dias pós-infecção. Após triagem, duas cepas foram selecionadas para a melhor caracterização (B. ovis 94 AV and B. ovis 266L). Ambas apresentaram crescimento em placa de cultivo semelhante ao da cepa de referência B. ovis ATCC 25840. A vacinação com a cepa de Brucella ovis ΔabcBA encapsulada com alginato a 1% foi capaz de proteger camundongos desafiados com as cepas isoladas de campo, com os seguintes índices de proteção: 0,751, 1,736 e 2,746, para camundongos desafiados com B. ovis ATCC 25840, B. ovis 94 AV e B. ovis 266 L, respectivamente. Estes resultados demonstraram que as cepas isoladas de campo de B. ovis são capazes de infectar e induzir lesão em camundongos experimentalmente infectados. O uso da cepa mutante atenuada B. ovis ΔabcBA para vacinação de fêmeas C57BL/6 desafiados com diferentes cepas de B. ovis induziu proteção nos camundongos desafiados com diferentes cepas de B. ovis. Deste modo, mostrando-se eficiente na proteção das cepas de campo de B. ovis.(AU)
Assuntos
Animais , Camundongos , Brucelose/prevenção & controle , Ovinos/microbiologia , Vacinas Bacterianas/imunologia , Brucella ovis/isolamento & purificação , Brucella ovis/imunologia , Brucella ovis/patogenicidadeRESUMO
Abstract CKB3 is a regulatory (beta) subunit of CK2. In this study Arabidopsis thaliana homozygous T-DNA mutant ckb3 was studied to understand the role of CKB3 in abscisic acid (ABA) signaling. The results shown: CKB3 was expressed in all organs and the highest expression in the seeds, followed by the root. During seed germination and root growth the ckb3 mutant showed reduced sensitivity to ABA. The ckb3 mutant had more stomatal opening and increased proline accumulation and leaf water loss. The expression levels of number of genes in the ABA regulatory network had changed. This study demonstrates that CKB3 is an ABA signaling-related gene and may play a positive role in ABA signaling.
Resumo CKB3 é uma subunidade reguladora (beta) de CK2. Neste estudo, o mutante homozigoto ckb3 de Arabidopsis thaliana foi estudado para entender o papel da CKB3 na sinalização de ácido abscísico (ABA). Os resultados apresentados: CKB3 foi expresso em todos os órgãos e a maior expressão nas sementes, seguida pela raiz. Durante a germinação das sementes e o crescimento radicular, o mutante ckb3 mostrou sensibilidade reduzida ao ABA. O mutante ckb3 teve mais abertura estomática e aumento do acúmulo de prolina e perda de água nas folhas. Os níveis de expressão do número de genes na rede reguladora da ABA haviam mudado. Este estudo demonstra que CKB3 é um gene relacionado à sinalização ABA e pode desempenhar um papel positivo na sinalização ABA.
RESUMO
O camundongo mutante recessivo bate-palmas (bapa) originou-se de mutagênese química induzida por ENU (N-ethyl-N-nitrosourea) e apresenta alterações posturais com movimentos anormais dos membros posteriores quando levantado pela cauda. No sequenciamento do exoma identificou-se uma mutação no gene Kmt2d, localizado no cromossomo 15, que foi confirmada pelo sequenciamento do DNA pelo método de Sanger. A perda da função do gene KMT2D localizada no cromossomo 12 em humanos foi descrita como responsável pela síndrome de Kabuki, que é uma anomalia congênita rara, autossômica dominante. O fenótipo clínico da doença é variável, mas algumas características mais comuns são face dismórfica, anormalidades esqueléticas, alterações nas impressões digitais, leve a moderado retardo mental e retardo do crescimento pós-natal. O presente trabalho teve como objetivo a análise do comportamento e da morfologia craniofacial dos camundongos bapa comparando com modelos de mutação do gene Kmt2d descritos na literatura.
The recessive mutant mouse named bate-palmas (bapa) claps in Portuguese, originates from an ENU (N-ethyl-N-nitrosourea) mutagenesis program, presenting balance impairment and motor incoordination. Exome sequencing identified a mutation in the KMT2D gene, located on chromosome 15, which was confirmed by DNA sequence by the Sanger method. The loss of function of the gene KMT2D, located on chromosome 12 in humans, was described as being responsible for Kabuki syndrome, also known as Niikawa-Koruki syndrome, which is a rare congenital anomaly, autosomal dominant. The clinical phenotype of the disease is variable, but some common characteristics are dysmorphic facial features, skeletal abnormalities, fingerprint alterations, mild to moderate cognitive problems and postnatal growth retardation. The objective os this study was to analyze the behavior and craniofacial morphology of bapa mice comparing to KMT2D gene mutation models described on literature.
Assuntos
Masculino , Animais , Camundongos , Camundongos Mutantes/anatomia & histologia , Camundongos Mutantes/psicologia , Comportamento Animal , Etilnitrosoureia , Mutagênicos , Mutação PuntualRESUMO
O camundongo mutante recessivo bate-palmas (bapa) originou-se de mutagênese química induzida por ENU (N-ethyl-N-nitrosourea) e apresenta alterações posturais com movimentos anormais dos membros posteriores quando levantado pela cauda. No sequenciamento do exoma identificou-se uma mutação no gene Kmt2d, localizado no cromossomo 15, que foi confirmada pelo sequenciamento do DNA pelo método de Sanger. A perda da função do gene KMT2D localizada no cromossomo 12 em humanos foi descrita como responsável pela síndrome de Kabuki, que é uma anomalia congênita rara, autossômica dominante. O fenótipo clínico da doença é variável, mas algumas características mais comuns são face dismórfica, anormalidades esqueléticas, alterações nas impressões digitais, leve a moderado retardo mental e retardo do crescimento pós-natal. O presente trabalho teve como objetivo a análise do comportamento e da morfologia craniofacial dos camundongos bapa comparando com modelos de mutação do gene Kmt2d descritos na literatura.(AU)
The recessive mutant mouse named bate-palmas (bapa) claps in Portuguese, originates from an ENU (N-ethyl-N-nitrosourea) mutagenesis program, presenting balance impairment and motor incoordination. Exome sequencing identified a mutation in the KMT2D gene, located on chromosome 15, which was confirmed by DNA sequence by the Sanger method. The loss of function of the gene KMT2D, located on chromosome 12 in humans, was described as being responsible for Kabuki syndrome, also known as Niikawa-Koruki syndrome, which is a rare congenital anomaly, autosomal dominant. The clinical phenotype of the disease is variable, but some common characteristics are dysmorphic facial features, skeletal abnormalities, fingerprint alterations, mild to moderate cognitive problems and postnatal growth retardation. The objective os this study was to analyze the behavior and craniofacial morphology of bapa mice comparing to KMT2D gene mutation models described on literature.(AU)
Assuntos
Animais , Masculino , Camundongos , Camundongos Mutantes/anatomia & histologia , Camundongos Mutantes/psicologia , Comportamento Animal , Mutagênicos , Mutação Puntual , EtilnitrosoureiaRESUMO
Wheat (Triticum aestivum L.) stem development significantly affects grain yield. The dwarf plants (D) of wheat mutant dms was less than 30cm. Here, we were to explore the molecular basis for the restrained stem development of the dwarf plants. The results were reached by compare the young spikes and stems transcriptomes of the tall (T) and D plants of mutant dms. We identified 663 genes highly expressed in stem tips. We identified 997 differentially expressed genes (DEGs) in stem tips between T and D, 403 DEGs were significantly related with stem development. Most biological processes in stem tips on dwarf plants were significantly suppressed, such as phytohormone signaling etc. The sequencing analysis results were confirmed by quantitatively analysis the expression profiles of fourteen key DEGs via real-time QRT-PCR. We identified a group genes related to wheat stem development, identified a group DEGs related to the restrained stem development of D plants of dms. The suppressed phytohormone signaling, carbohydrate transport and metabolism were the major causal factors leading to dwarf plants of D. Our dataset provides a useful resource for investigating wheat stem development.
O desenvolvimento da haste do trigo (Triticum aestivum L.) afeta significativamente o rendimento dos grãos. A partir disso, empregou-se a base molecular para o desenvolvimento de uma haste de variedade de trigo. Os resultados foram alcançados ao conferir as hastes de um mutante de trigo DMS. Identificou-se 663 genes altamente expressos na haste; 997 genes (DEGs) diferentemente expressos em hastes entre T e D e; 403 DEGs foram significativamente diferentes. A maioria dos processos biológicos de caule tipo nمo plantas foram significativamente suprimidas, com o fito hormônio de sinalização. Os resultados da análise de sequencia foram confirmados pela expressão quantitativa de perfis de catorze chave DEGs através de qRT-PCR em tempo real. Nota-se um grupo de genes relacionados com a haste de trigo de desenvolvimento. Identificou-se um grupo DEGs relacionados com o desenvolvimento de um tronco D plantas de DMS. O fito hormônio de sinalização, transporte e metabolismo de hidratos de carbono foram os principais fatores suscetíveis das plantas anão de D. Nosso conjunto de dados fornece um recurso ْtil para investigar o desenvolvimento do caule de trigo.
Assuntos
Crescimento e Desenvolvimento , Transcriptoma , TriticumRESUMO
Wheat (Triticum aestivum L.) stem development significantly affects grain yield. The dwarf plants (D) of wheat mutant dms was less than 30cm. Here, we were to explore the molecular basis for the restrained stem development of the dwarf plants. The results were reached by compare the young spikes and stems transcriptomes of the tall (T) and D plants of mutant dms. We identified 663 genes highly expressed in stem tips. We identified 997 differentially expressed genes (DEGs) in stem tips between T and D, 403 DEGs were significantly related with stem development. Most biological processes in stem tips on dwarf plants were significantly suppressed, such as phytohormone signaling etc. The sequencing analysis results were confirmed by quantitatively analysis the expression profiles of fourteen key DEGs via real-time QRT-PCR. We identified a group genes related to wheat stem development, identified a group DEGs related to the restrained stem development of D plants of dms. The suppressed phytohormone signaling, carbohydrate transport and metabolism were the major causal factors leading to dwarf plants of D. Our dataset provides a useful resource for investigating wheat stem development.(AU)
O desenvolvimento da haste do trigo (Triticum aestivum L.) afeta significativamente o rendimento dos grãos. A partir disso, empregou-se a base molecular para o desenvolvimento de uma haste de variedade de trigo. Os resultados foram alcançados ao conferir as hastes de um mutante de trigo DMS. Identificou-se 663 genes altamente expressos na haste; 997 genes (DEGs) diferentemente expressos em hastes entre T e D e; 403 DEGs foram significativamente diferentes. A maioria dos processos biológicos de caule tipo nمo plantas foram significativamente suprimidas, com o fito hormônio de sinalização. Os resultados da análise de sequencia foram confirmados pela expressão quantitativa de perfis de catorze chave DEGs através de qRT-PCR em tempo real. Nota-se um grupo de genes relacionados com a haste de trigo de desenvolvimento. Identificou-se um grupo DEGs relacionados com o desenvolvimento de um tronco D plantas de DMS. O fito hormônio de sinalização, transporte e metabolismo de hidratos de carbono foram os principais fatores suscetíveis das plantas anão de D. Nosso conjunto de dados fornece um recurso ْtil para investigar o desenvolvimento do caule de trigo.(AU)
Assuntos
Transcriptoma , Triticum , Crescimento e DesenvolvimentoRESUMO
ABSTRACT: Wheat (Triticum aestivum L.) stem development significantly affects grain yield. The dwarf plants (D) of wheat mutant dms was less than 30cm. Here, we were to explore the molecular basis for the restrained stem development of the dwarf plants. The results were reached by compare the young spikes and stems transcriptomes of the tall (T) and D plants of mutant dms. We identified 663 genes highly expressed in stem tips. We identified 997 differentially expressed genes (DEGs) in stem tips between T and D, 403 DEGs were significantly related with stem development. Most biological processes in stem tips on dwarf plants were significantly suppressed, such as phytohormone signaling etc. The sequencing analysis results were confirmed by quantitatively analysis the expression profiles of fourteen key DEGs via real-time QRT-PCR. We identified a group genes related to wheat stem development, identified a group DEGs related to the restrained stem development of D plants of dms. The suppressed phytohormone signaling, carbohydrate transport and metabolism were the major causal factors leading to dwarf plants of D. Our dataset provides a useful resource for investigating wheat stem development.
RESUMO: O desenvolvimento da haste do trigo (Triticum aestivum L.) afeta significativamente o rendimento dos grãos. A partir disso, empregou-se a base molecular para o desenvolvimento de uma haste de variedade de trigo. Os resultados foram alcançados ao conferir as hastes de um mutante de trigo DMS. Identificou-se 663 genes altamente expressos na haste; 997 genes (DEGs) diferentemente expressos em hastes entre T e D e; 403 DEGs foram significativamente diferentes. A maioria dos processos biológicos de caule tipo não plantas foram significativamente suprimidas, com o fito hormônio de sinalização. Os resultados da análise de sequencia foram confirmados pela expressão quantitativa de perfis de catorze chave DEGs através de qRT-PCR em tempo real. Nota-se um grupo de genes relacionados com a haste de trigo de desenvolvimento. Identificou-se um grupo DEGs relacionados com o desenvolvimento de um tronco D plantas de DMS. O fito hormônio de sinalização, transporte e metabolismo de hidratos de carbono foram os principais fatores suscetíveis das plantas anão de D. Nosso conjunto de dados fornece um recurso útil para investigar o desenvolvimento do caule de trigo.
RESUMO
Abstract CKB3 is a regulatory (beta) subunit of CK2. In this study Arabidopsis thaliana homozygous T-DNA mutant ckb3 was studied to understand the role of CKB3 in abscisic acid (ABA) signaling. The results shown: CKB3 was expressed in all organs and the highest expression in the seeds, followed by the root. During seed germination and root growth the ckb3 mutant showed reduced sensitivity to ABA. The ckb3 mutant had more stomatal opening and increased proline accumulation and leaf water loss. The expression levels of number of genes in the ABA regulatory network had changed. This study demonstrates that CKB3 is an ABA signaling-related gene and may play a positive role in ABA signaling.
Resumo CKB3 é uma subunidade reguladora (beta) de CK2. Neste estudo, o mutante homozigoto ckb3 de Arabidopsis thaliana foi estudado para entender o papel da CKB3 na sinalização de ácido abscísico (ABA). Os resultados apresentados: CKB3 foi expresso em todos os órgãos e a maior expressão nas sementes, seguida pela raiz. Durante a germinação das sementes e o crescimento radicular, o mutante ckb3 mostrou sensibilidade reduzida ao ABA. O mutante ckb3 teve mais abertura estomática e aumento do acúmulo de prolina e perda de água nas folhas. Os níveis de expressão do número de genes na rede reguladora da ABA haviam mudado. Este estudo demonstra que CKB3 é um gene relacionado à sinalização ABA e pode desempenhar um papel positivo na sinalização ABA.
RESUMO
O objetivo do trabalho foi identificar a presença no Brasil do gene mutante L2HGDH em cães da raça Staffordshire Bull Terrier (SBT). Para tanto foi feito o teste genético em 76 cães provenientes de diferentes regiões do Brasil, no período de 2008 a 2015, sendo encontrados 55 animais (72,37%) livres do gene mutante L2-HGDH ou homozigotos dominantes, e 21(27,63%) portadores do gene mutante ou heterozigotos. Não foi encontrado nenhum animal homozigoto recessivo (afetado), porém pode-se observar que o gene circula no Brasil e que cães afetados podem aparecer.(AU)
The aim of this study was to identify the presence of a mutation in the L2-hydroxyglutarate dehydrogenase (L2-HGDH) gene in Staffordshire bull terriers in Brazil. Genetic testing was done in 76 dogs from different regions of the country, from 2008 to 2015. Fifty-five dogs (72.37%) were free of the mutant gene L2HGDH or homozygous-dominant, and 21 (27.63%) were carriers for the mutant gene or heterozygous. No homozygous recessive dogs (affected) were found, however, it is worth noting that the gene circulates in Brazil and that affected dogs can appear.(AU)
Assuntos
Animais , Cães , Sistema Nervoso Central/patologia , Anormalidades Congênitas/veterinária , Genes Recessivos , Triagem de Portadores Genéticos , Fenômenos Genéticos , Hereditariedade , Doenças do Sistema Nervoso/veterináriaRESUMO
The aim of this study was to identify the presence of a mutation in the L2-hydroxyglutarate dehydrogenase (L2-HGDH) gene in Staffordshire bull terriers in Brazil. Genetic testing was done in 76 dogs from different regions of the country, from 2008 to 2015. Fifty-five dogs (72.37%) were free of the mutant gene L2HGDH or homozygous-dominant, and 21 (27.63%) were carriers for the mutant gene or heterozygous. No homozygous recessive dogs (affected) were found, however, it is worth noting that the gene circulates in Brazil and that affected dogs can appear.(AU)
O objetivo do trabalho foi identificar a presença no Brasil do gene mutante L2HGDH em cães da raça Staffordshire Bull Terrier (SBT). Para tanto foi feito o teste genético em 76 cães provenientes de diferentes regiões do Brasil, no período de 2008 a 2015, sendo encontrados 55 animais (72,37%) livres do gene mutante L2-HGDH ou homozigotos dominantes, e 21(27,63%) portadores do gene mutante ou heterozigotos. Não foi encontrado nenhum animal homozigoto recessivo (afetado), porém pode-se observar que o gene circula no Brasil e que cães afetados podem aparecer.(AU)
Assuntos
Animais , Cães , Anormalidades Congênitas/veterinária , Sistema Nervoso Central/patologia , Genes Recessivos , Triagem de Portadores Genéticos , Fenômenos Genéticos , Doenças do Sistema Nervoso/veterinária , HereditariedadeRESUMO
The yeast Yarrowia lipolytica accumulates oils and is able to produce extracellular lipases when growing in different carbon sources including glycerol, the principal by-product of the biodiesel industry. In this study, biomass production of a novel mutant strain of Y. lipolytica was statistically optimized by Response Surface Methodology in media containing biodiesel-derived glycerol as main carbon source. This strain exhibited distinctive morphological and fatty acid profile characteristics, and showed an increased extracellular lipase activity. An organic source of nitrogen and the addition of 1.0 g/l olive oil were necessary for significant lipase production. Plackett-Burman and Central Composite Statistical Designs were employed for screening and optimization of fermentation in shaken flasks cultures, and the maximum values obtained were 16.1 g/l for biomass and 12.2 Units/ml for lipase, respectively. Optimized batch bioprocess was thereafter scaled in aerated bioreactors and the values reached for lipase specific activity after 95 % of the glycerol had been consumed, were three-fold higher than those obtained in shaken flasks cultures. A sustainable bioprocess to obtain biomass and extracellular lipase activity was attained by maximizing the use of the by-products of biodiesel industry.
Optimización de la producción de biomasa usando glicerol crudo, de una cepa mutante de Yarrowia lipolytica con actividad incrementada de lipasa. La levadura Yarrowia lipolytica acumula aceites y produce una lipasa extracelular al crecer en diferentes fuentes de carbono, entre ellas el glicerol, principal subproducto de la creciente industria del biodiésel. En el presente trabajo, se optimizó mediante la metodología de superficies de respuesta la producción de biomasa de una nueva cepa mutante de Y. lipolytica, empleando medios con glicerol derivado de la industria del biodiésel como principal fuente de carbono. Esta cepa presentó características morfológicas y perfil de ácidos grasos distintivos, y una mayor actividad de lipasa extracelular. Para obtener una producción significativa de lipasa extracelular, fue necesario el agregado de una fuente orgánica de nitrógeno y de 1 g/l de aceite de oliva. Se utilizaron los diseños estadísticos de Plackett-Burman y central compuesto para la selección y la optimización de las fermentaciones en frascos agitados; los máximos valores de biomasa y de lipasa obtenidos fueron de 16,1 g/l y 12,2 unidades/ml, respectivamente. Luego, el bioproceso en lote optimizado se escaló a biorreactores aireados, y los valores de actividad específica de lipasa alcanzados después de haberse consumido el 95 % del glicerol fueron tres veces más altos que los obtenidos en los cultivos en frascos agitados. En suma, se desarrolló un bioproceso sostenible para la obtención de biomasa y de una actividad de lipasa extracelular, que a la vez maximiza el uso de subproductos de la industria del biodiésel.
Assuntos
Biomassa , Meios de Cultura/farmacologia , Proteínas Fúngicas/genética , Glicerol/farmacologia , Microbiologia Industrial/métodos , Lipase/genética , Micologia/métodos , Yarrowia/crescimento & desenvolvimento , Reatores Biológicos , Biocombustíveis/análise , Meios de Cultivo Condicionados/química , DNA Fúngico/genética , DNA Intergênico/genética , Fermentação , Proteínas Fúngicas/biossíntese , Genes Fúngicos , Glicerol/isolamento & purificação , Hifas/ultraestrutura , Lipase/biossíntese , Yarrowia/enzimologia , Yarrowia/genética , Yarrowia/ultraestruturaRESUMO
Mutant viral strains deleted in non-essential genes represent useful tools to study the function of specific gene products in the biology of the virus. We herein describe an investigation on the phenotype of a bovine herpesvirus 5 (BoHV-5) recombinant deleted in the gene encoding the enzyme thymidine kinase (TK) in rabbits, with special emphasis to neuroinvasiveness and the ability to establish and reactivate latent infection. Rabbits inoculated with the parental virus (SV-507/99) (n=18) at a low titer (10(5.5)TCID50) shed virus in nasal secretions in titers up to 10(4.5)TCID50 for up to 12 days (average: 9.8 days [5-12]) and 5/ 16 developed neurological disease and were euthanized in extremis. Rabbits inoculated with the recombinant BoHV-5TKΔ at a high dose (10(7.1)TCID50) also shed virus in nasal secretions, yet to lower titers (maximum: 10(2.3)TCID50) and for a shorter period (average: 6.6 days [2-11]) and remained healthy. PCR examination of brain sections of inoculated rabbits at day 6 post-infection (pi) revealed a widespread distribution of the parental virus, whereas DNA of the recombinant BoHV-5TKΔ-was detected only in the trigeminal ganglia [TG] and olfactory bulbs [OB]. Nevertheless, during latent infection (52pi), DNA of the recombinant virus was detected in the TGs, OBs and also in other areas of the brain, demonstrating the ability of the virus to invade the brain. Dexamethasone (Dx) administration at day 65 pi was followed by virus reactivation and shedding by 5/8 rabbits inoculated with the parental strain (mean duration of 4.2 days [1 - 9]) and by none of seven rabbits inoculated with the recombinant virus. Again, PCR examination at day 30 post-Dx treatment revealed the presence of latent DNA in the TGs, OBs and in other areas of the brain of both groups. Taken together, these results confirm that the recombinant BoHV-5TKΔ is highly attenuated for rabbits. It shows a reduced ability to replicate in the nose but retains the ability [...](AU)
Cepas virais mutantes defectivas em genes não essenciais se constituem em ferramentas úteis para o estudo da função de proteínas virais na biologia dos vírus. Este estudo relata uma investigação do fenótipo, em coelhos, de uma cepa recombinante do herpesvírus bovino tipo 5 (BoHV-5) defectiva na enzima timidina quinase (TK), com ênfase para a neuroinvasividade e capacidade de estabelecer e reativar a infecção latente. Coelhos inoculados com o vírus parental (SV-507/99, n=18) em baixo título (10(5,5)TCID50) excretaram o vírus nas secreções nasais em títulos de até 10(4,5)TCID50/ mL por até 12 dias (média: 9,8 dias [5-12]) e 5/16 desenvolveram doença neurológica e morreram ou foram eutanasiados in extremis. Em contraste, coelhos inoculados com o recombinante BoHV-5TKΔ em alto título (10(7,1)TCID50) excretaram o vírus em títulos inferiores (máximo 10(2,3)TCID50/ mL), por um período menor (média: 6,6 days [2-11]) e permaneceram saudáveis. A realização de PCR em seções do encéfalo no dia 6 pós-infecção (pi) revelou uma ampla distribuição do DNA do vírus parental, enquanto o DNA do vírus recombinante foi detectado apenas nos gânglios trigêmeos [TGs] e nos bulbos olfatórios [OBs]. Não obstante, durante a infecção latente (52pi), o DNA do vírus recombinante foi detectado nos TGs, OBs e em outros locais do encéfalo, demonstrando que o vírus recombinante mantém a neuroinvasividade. Tratamento com dexamethasona (Dx) no dia 65 pi resultou em reativação e excreção viral por 5/8 dos coelhos inoculados com o vírus parental (duração média de 4,2 dias [1-9]) e por nenhum dos sete coelhos inoculados com o vírus recombinante. No entanto, PCR realizado no dia 30 pós-Dx revelou a presença de DNA latente do BoHV-5TKΔ nos TGs, OBs e em outras áreas do encéfalo. Esses resultados confirmam que o recombinante BoHV-5TKΔ é altamente atenuado para coelhos. A sua capacidade de replicação na mucosa nasal é reduzida, mas mantém a capacidade de invadir o encéfalo e estabelecer infecção [...](AU)
Assuntos
Animais , Coelhos , Coelhos/virologia , Herpesvirus Bovino 5 , Fenótipo , Mucosa Nasal/virologiaRESUMO
Mutant viral strains deleted in non-essential genes represent useful tools to study the function of specific gene products in the biology of the virus. We herein describe an investigation on the phenotype of a bovine herpesvirus 5 (BoHV-5) recombinant deleted in the gene encoding the enzyme thymidine kinase (TK) in rabbits, with special emphasis to neuroinvasiveness and the ability to establish and reactivate latent infection. Rabbits inoculated with the parental virus (SV-507/99) (n=18) at a low titer (10(5.5)TCID50) shed virus in nasal secretions in titers up to 10(4.5)TCID50 for up to 12 days (average: 9.8 days [5-12]) and 5/ 16 developed neurological disease and were euthanized in extremis. Rabbits inoculated with the recombinant BoHV-5TKΔ at a high dose (10(7.1)TCID50) also shed virus in nasal secretions, yet to lower titers (maximum: 10(2.3)TCID50) and for a shorter period (average: 6.6 days [2-11]) and remained healthy. PCR examination of brain sections of inoculated rabbits at day 6 post-infection (pi) revealed a widespread distribution of the parental virus, whereas DNA of the recombinant BoHV-5TKΔ-was detected only in the trigeminal ganglia [TG] and olfactory bulbs [OB]. Nevertheless, during latent infection (52pi), DNA of the recombinant virus was detected in the TGs, OBs and also in other areas of the brain, demonstrating the ability of the virus to invade the brain. Dexamethasone (Dx) administration at day 65 pi was followed by virus reactivation and shedding by 5/8 rabbits inoculated with the parental strain (mean duration of 4.2 days [1 - 9]) and by none of seven rabbits inoculated with the recombinant virus. Again, PCR examination at day 30 post-Dx treatment revealed the presence of latent DNA in the TGs, OBs and in other areas of the brain of both groups. Taken together, these results confirm that the recombinant BoHV-5TKΔ is highly attenuated for rabbits. It shows a reduced ability to replicate in the nose but retains the ability...
Cepas virais mutantes defectivas em genes não essenciais se constituem em ferramentas úteis para o estudo da função de proteínas virais na biologia dos vírus. Este estudo relata uma investigação do fenótipo, em coelhos, de uma cepa recombinante do herpesvírus bovino tipo 5 (BoHV-5) defectiva na enzima timidina quinase (TK), com ênfase para a neuroinvasividade e capacidade de estabelecer e reativar a infecção latente. Coelhos inoculados com o vírus parental (SV-507/99, n=18) em baixo título (10(5,5)TCID50) excretaram o vírus nas secreções nasais em títulos de até 10(4,5)TCID50/ mL por até 12 dias (média: 9,8 dias [5-12]) e 5/16 desenvolveram doença neurológica e morreram ou foram eutanasiados in extremis. Em contraste, coelhos inoculados com o recombinante BoHV-5TKΔ em alto título (10(7,1)TCID50) excretaram o vírus em títulos inferiores (máximo 10(2,3)TCID50/ mL), por um período menor (média: 6,6 days [2-11]) e permaneceram saudáveis. A realização de PCR em seções do encéfalo no dia 6 pós-infecção (pi) revelou uma ampla distribuição do DNA do vírus parental, enquanto o DNA do vírus recombinante foi detectado apenas nos gânglios trigêmeos [TGs] e nos bulbos olfatórios [OBs]. Não obstante, durante a infecção latente (52pi), o DNA do vírus recombinante foi detectado nos TGs, OBs e em outros locais do encéfalo, demonstrando que o vírus recombinante mantém a neuroinvasividade. Tratamento com dexamethasona (Dx) no dia 65 pi resultou em reativação e excreção viral por 5/8 dos coelhos inoculados com o vírus parental (duração média de 4,2 dias [1-9]) e por nenhum dos sete coelhos inoculados com o vírus recombinante. No entanto, PCR realizado no dia 30 pós-Dx revelou a presença de DNA latente do BoHV-5TKΔ nos TGs, OBs e em outras áreas do encéfalo. Esses resultados confirmam que o recombinante BoHV-5TKΔ é altamente atenuado para coelhos. A sua capacidade de replicação na mucosa nasal é reduzida, mas mantém a capacidade de invadir o encéfalo e estabelecer infecção...
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Animais , Coelhos , Coelhos/virologia , Fenótipo , Mucosa Nasal/virologiaRESUMO
An agent-based computer simulation of death by inheritable mutations in a changing environment shows a maximal population, or avoids extinction, at some intermediate mutation rate of the individuals. Our results indicate that death seems needed to allow for evolution of the fittest, as required by a changing environment.
Simulação computacional de agentes individuais que se reproduzem e morrem por acúmulo de mutações herdadas mostra um máximo da população ou evita extinção, para taxas de mutação intermediárias. Assim, as mortes parecem necessárias para a evolução dos mais adaptados a um ambiente mutante.