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Abstract Introduction: The presence of secondary infections in critically ill patients and antibiotic resistance are often determining factors in the clinical evolution of these patients. Objective: To describe the pathogens isolated in blood cultures and tracheal secretion cultures in ICU patients with COVID-19 and to evaluate the association between the presence of secondary infections and 60-day mortality. Methods: Retrospective analytical cohort study conducted in 273 adults admitted to the ICU with COVID-19 at the Subred Integrada de Servicios de Salud del Sur - Hospital El Tunal, Bogotá, Colombia between April and December 2020. Data from records of blood or tracheal secretion cultures were collected. A bivariate analysis was performed using a Cox proportional-hazards regression model to assess the association between the development of secondary infections and 60-day mortality. Results: At least one positive blood culture was reported in 96/511 patients (18.8%). Of the 214 blood cultures performed within 48 hours after ICU admission, 7.7% were positive. A total of 127 germs were isolated from blood cultures - mostly gram-negative bacteria (61.4%) - followed by fungi (25.2%). Additionally, 39.5% were multidrug-resistant, and carbapenem resistance was the most common antibiotic resistance pattern (33.3% of all gram-negative bacteria isolates). Finally, in this cohort, the presence of secondary infections was not associated with 60-day mortality (HR: 1.012, 95%CI: 0.7211.420; p= 0.946). Conclusions: Although the prevalence of superinfection was moderately high, the prevalence of coinfection was low. Gram-negative bacteria were predominant, and almost one third of the germs were multidrug-resistant.

Resumen Introducción: La presencia de infecciones secundarias en pacientes críticos y la resistencia a los antibióticos suelen ser factores determinantes en la evolución clínica de estos pacientes. Objetivo: Describir los patógenos aislados en cultivos de sangre y de secreciones traqueales en pacientes de la UCI con COVID-19 y evaluar la relación entre la presencia de infecciones secundarias y la mortalidad a 60 días. Métodos: Estudio de cohorte analítico retrospectivo realizado en 273 adultos ingresados a la UCI con COVID-19 de la Subred Integrada de Servicios de Salud del Sur - Hospital El Tunal, Bogotá, Colombia entre abril y diciembre de 2020. Se obtuvieron los datos de los registros de cultivos en sangre y en secreciones de la tráquea. Se llevó a cabo un análisis bivariado mediante un modelo de riesgos proporcionales o regresión de Cox para evaluar la relación entre el desarrollo de infecciones secundarias y la mortalidad a 60 días. Resultados: Se reportó al menos un cultivo en sangre positivo en 96/511 (18.8%). De los 214 cultivos de sangre realizados dentro de las 48 horas siguientes al ingreso a la UCI, 7,7% resultaron positivos. Se aislaron en total 127 gérmenes en los cultivos en sangre, en su mayoría bacterias gramnegativas (61,4%) - seguido de hongos (25,2%). Adicionalmente, 39.5% fueron multirresistentes, siendo la resistencia los carbapenémicos el patrón de resistencia a los antibióticos más frecuente (33,3% de todos los aislados de bacterias gramnegativas). Finalmente, la presencia de infecciones secundarias en esta cohorte no se asoció con mortalidad a 60 días (HR: 1,012, IC 95%: 0,721-1,420; p= 0,946). Conclusiones: A pesar de que la prevalencia de super infecciones fue moderadamente alta, la prevalencia de coinfección fue baja. Las bacterias gramnegativas fueron las predominantes y casi un tercio de los gérmenes eran multirresistentes.

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Estudio cuasi-experimental desarrollado para disminuir el impacto de la resistencia a los antimicrobianos a través de un programa de prevención de infecciones y optimización del uso de antimicrobianos construido "a medida" según las posibilidades de la institución. Se implementó: vigilan-cia de colonización e infección por enterobacterias pro-ductoras de carbapenemasas (EPC); vigilancia y medidas preventivas para infecciones urinarias asociadas a sonda vesical (ITU); vigilancia e intervenciones para mejorar la higiene de manos; guías locales de tratamiento de enfer-medades infecciosas con evaluación de adherencia a las mismas y consumo de antibióticos (ATB). Resultados: Comparando periodo pre y postintervención: tasa de EPC en muestras clínicas: 1,1 a 0/días paciente; razón de tasas de incidencia (IRR: 0.00, p: 0.033); tasa de colonización: 3,3 a 0,61/días paciente (IRR: 0.18, p: 0.5). Tasa de ITU 8,9 a 7,2/1000 días catéter urinario (IRR: 0.81, p 0.5). Adherencia a higiene de manos: 77,5% a 70,38% (p 0.0067). Consumo de ATB: 376,24 a 176,82 DDD, (disminu-ción 53%). Adherencia a guías en elección de ATB: 57,1% a 95,4% (p 0.00031); duración de ATB: 92,8% a 98,4% (p 0.16); adecuación según rescate microbiológico: 57,1% a 100% (p <0.01). Conclusión: Un programa con medidas simples, a medida, con supervisión externa, redujo en un tiempo relativamente corto las infecciones por EPC, el consumo y uso apropiado de ATB en un hospital público de medianos/bajos recursos

This quasi-experimental study was developed in a public hospital with the goal of reducing the impact of antimicrobial resistance through an infection prevention and antimicrobial stewardship program. The following measures were implemented: surveillance of colonization and infection by carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE); surveillance and preventive measures for urinary catheter-associated infections (UTIs); surveillance and interventions for hand hygiene; local guidelines for treatment of infectious diseases with compliance and antibiotic (ATB) consumption metrics.Results: comparing the pre-intervention and post-intervention period, CPE rate in clinical samples 1.1 to 0/patient days, incidence rate ratio (IRR): 0.00, p: 0.033 and colonization of 3.3 to 0.61/days patient, IRR: 0.18, p-value: 0.5. UTI rate 8.9 to 7.2/1000 days urinary catheter IRR: 0.81, p 0.5. Hand Hygiene compliance: 77.5% to 70.38%, p 0.0067. ATB consumption: 376.24 to 176.82 DDD, 53% decrease. Compliance to guidelines in ATB selection: 57.1% to 95.4% p 0.00031, duration of ATB from 92.8% to 98.4% p 0.16, and adequacy to microbiological rescue of 57.1% at 100%, p <0.01. Conclusion: it is possible to reduce CPE infections, the consumption of antimicrobials and optimize their use in a public hospital in a country with medium/low resources through a program with basic and tailored measures

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Resumen Introducción: La problemática de las enterobacterias productoras de carbapenemasas (EPC) se exacerbó con la pandemia por COVID-19 en países con una incidencia previa elevada, como la Argentina. Este estudio describe el desarrollo y resultados de un programa de prevención de EPC, fundamental mente Klebsiellas productoras de carbapenemasas (KPC), en tres unidades críticas de dos hospitales públicos durante 6 meses de la pandemia. Métodos: El objetivo fue reducir la incidencia de KPC en muestras clínicas y de colonización. Este estudio, quasi experimental, se basó en un ciclo de mejora e implementación de tres me didas: higiene de manos, higiene ambiental y vigilancia periódica con hisopados rectales. Resultados: Respecto a las medidas, todas las unidades mejoraron la vigilancia activa y dos de estas tuvieron además mejoría en la higiene de manos e higiene ambiental. Comparando los períodos pre y post intervención en las tres unidades no se observaron cambios significativos en la tasa de muestras clínicas KPC positivas. Se logró disminuir en forma significativa la colonización por KPC en dos unidades (unidad 2: 51.6-18.5 p 0.0004, unidad 3: 62.5-5.2 p < 0.0000001). Todas las unidades mostraron hacia el final del estudio una tendencia al descenso en ambas tasas. Conclusión: Contener o reducir el avance de KPC en nuestra región es posible incluso en escenarios difíciles como el de la pandemia. Se necesitan más estudios en países de ingresos bajos y medianos, para demostrar el impacto de los programas de prevención de KPC en estas situaciones.

Abstract Introduction: The problem of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) was exacerbated by the COVID-19 pandemic in countries with a previous high incidence, such as Argentina. This study describes the development and results of a CPE prevention program, mainly carbapenemase-producing Klebsiellas (KPC), in three critical units of two public hospitals during 6 months of the pandemic. Methods: The objective was to reduce the incidence of KPC in clinical and colonization samples. This quasi-experimental study was based on a cycle of improvement and implementation of three measures: hand hygiene, environmental hygiene, and periodic surveillance with rectal swabs. Results: Regarding the measures, all the units optimized active surveillance, and two of these also improved hand and environmental hygiene. Comparing the pre- and post-intervention periods in the three units, no significant change was observed in the rate of KPC positive clinical samples. KPC coloni zation was significantly reduced in two units (unit 2: 51.6-18.5 p 0.0004, unit 3: 62.5-5.2 p < 0.0000001). All units showed a downtrend in both rates towards the end of the study. Conclusion: Containing or reducing the advance of the KPC in our region is possible even in difficult scenarios such as the pandemic. More studies are needed in low- and middle-income countries to demonstrate the impact of KPC prevention programs in these situations.

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Background: Commensal microflora such as Escherichia coli and Enterococcus spp. are representative indicators of antimicrobial resistance (AMR) as they are part of the normal intestinal microflora and can acquire and disseminate AMR to pathogenic or zoonotic bacteria like Salmonella spp. Objective: To investigate the state of AMR among E. coli and Salmonella spp., potential pathogens in humans, isolated from cecal contents of pigs submitted to a veterinary diagnostic laboratory in Colombia from 2016 to 2019. Methods: Susceptibility testing was conducted using the Kirby-Bauer disk diffusion method according to the Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines for antimicrobial zone diameter breakpoints. An E. coli strain (ATCC 25922) was used as the quality control organism. Isolates showing resistance to three or more antimicrobial classes were classified as multidrug-resistant (MDR) as defined by a joint group of the European Centre for Disease prevention and Control and the Center for Disease Control and Prevention of the USA. Results: A total of 112 E. coli and 192 Salmonella spp. colonies were isolated from 557 samples received between 2016 and 2019. In order of decreasing frequency, E. coli was resistant to tetracycline (100%), sulfamethoxazol-trimethoprim (97.5%), amoxicillin (86.4%), enrofloxacin (82.6%), tylosin (82.1%), doxycycline (59%), neomycin (50%), ciprofloxacin (45.5%), ceftiofur (35%), gentamicin (30%), tilmicosin (29%), and fosfomycin (12.5%). When compared with E. coli, Salmonella spp. was generally resistant to the same agents with slightly less resistance (between 10-30%) to eight of the antimicrobials tested. Salmonella spp. showed <20% resistance to three antimicrobials, as follows: neomycin (17%), gentamicin (16%), and fosfomycin (14%). Multi-resistance occurred in 68.7% (77/112) of E. coli and 70.3% (135/192) of Salmonella spp. isolates. Resistance of Salmonella spp. was alarming to all the critically important antimicrobials tested: fluoroquinolones (enrofloxacin, ciprofloxacin), ceftiofur (third- generation cephalosporin), and macrolides (tylosin). Conclusions: According to our results, there is a high level of multi- drug resistance (MDR) in E. coli and Salmonella spp. It is necessary to implement a nationwide antimicrobial resistance monitoring program in Colombia, together with proper antimicrobial prescribing guidelines for pigs. The indiscriminate use of antimicrobial growth promoters by the swine industry is generating widespread bacterial resistance and should be discontinued.

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Antecedentes: Flora comensal como espécies de Escherichia coli e Enterococcus são tipicamente escolhidas como indicadores representativos de la resistência antimicrobiana (AMR), pois fazem parte da flora intestinal normal e podem adquirir e disseminar AMR a bactérias patogênicas ou zoonóticas como Salmonella spp. Objetivo: Investigar o estado da AMR entre E. coli e Salmonella spp. isolados do conteúdo cecal de porcos colombianos submetidos ao Laboratório de Diagnóstico Veterinário de 2016 a 2019, ambos sendo patógenos potenciais em humanos. Métodos: O teste de suscetibilidade foi conduzido usando o método de difusão em disco Kirby-Bauer de acordo com as diretrizes do Instituto de Padrões Clínicos e Laboratoriais para pontos de quebra de diâmetro da zona antimicrobiana. A cepa de E. coli (ATCC 25922) foi usada como organismo de controle de qualidade. Os isolados que apresentam resistência a três ou mais classes de antimicrobianos foram classificados como multirresistentes (MDR), conforme definido por um grupo conjunto do Centro Europeu para Prevenção e Controle de Doenças e Centro para Controle e Prevenção de Doenças dos EUA. Resultados: Um total de 112 E. coli e 192 Salmonella spp. foram isolados de 557 amostras submetidas entre 2016 e 2019. Em ordem decrescente de frequência, a resistência a E. coli foi: tetraciclina (100%), sulfametoxazol-trimetoprim (97,5%), amoxicilina (86,4%), enrofloxacina (82,6%), tilosina (82,1%), doxiciclina (59%), neomicina (50%), ciprofloxacina (45,5%), ceftiofur (35%), gentamicina (30%), tilmicosina (29%) e fosfomicina (12,5%). Quando comparada com E. coli, Salmonella spp. foi geralmente resistente aos mesmos agentes com resistência ligeiramente menor (entre 10-30%) a oito dos antimicrobianos. Apenas três antimicrobianos apresentaram resistência a Salmonella spp. abaixo de 20% da seguinte forma: neomicina (17%), gentamicina (16%) e fosfomicina (14%). Multi-resistência ocorreu em 68,7% (77/112) de E. coli e 70,3% (135/192) de Salmonella spp. isolados. Resistência de Salmonella spp. foi alarmante para todos os antimicrobianos criticamente importantes testados: fluoroquinolonas (enrofloxacina, ciprofloxacina), ceftiofur (cefalosporina de terceira geração) e macrolídeos (tilosina). Conclusões: Esses resultados indicam um alto nível de resistência a múltiplos medicamentos (MDR) e que um Programa Nacional de Monitoramento da Resistência Antimicrobiana é necessário para a Colômbia, juntamente com a implementação de diretrizes de prescrição de antimicrobianos para suínos. O uso indiscriminado de antimicrobianos para promoção de crescimento na indústria suína está claramente promovendo resistência generalizada e deve ser interrompido.

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INTRODUCCIÓN: La prevalencia de microorganismos multirresistentes es un problema de salud pública que continúa creciendo a lo largo del mundo. Existe una población principalmente susceptible de ser colonizada y posteriormente infectarse, son los pacientes oncológicos. OBJETIVO: Identificar las características clínicas y patológicas de los pacientes oncológicos y su relación con la infección con microorganismos productores de BLEE y EPC. PACIENTES Y MÉTODOS: Se condujo un estudio retrospectivo y de carácter analítico entre el primero de enero de 2019 y el 30 de junio de 2020 en tres unidades hemato-oncológicas. RESULTADOS: Incluyó a 3.315 pacientes, de los cuales 217 (6,5%) se encontraban colonizados por microorganismos productores de BLEE y EPC; de éstos, 106/217 (48,8%) presentaron al menos un episodio de infección. El microorganismo más frecuentemente aislado fue Klebsiella pneumoniae, en 29/106 (27,4%). De los infectados, 18/106 (17%) presentaron infección por el mismo microorganismo colonizador. La mucositis (p = 0,002), edad mayor a 65 años (p = 0,041), hipoalbuminemia (p < 0,01), neutropenia (p < 0,01) y la presencia dispositivos invasivos (p < 0,01) demostraron una relación con el desarrollo de infección. CONCLUSIÓN: La presencia de hipoalbuminemia (OR 3,3, IC 1,5-7,1, p < 0,01), dispositivos invasivos (OR 5,8, IC 3.0-11,4, p < 0,01) y neutropenia (OR 4,1, IC 1,5-11,4, p < 0,01) predicen el desarrollo de infecciones.

BACKGROUND: The prevalence of multi-resistant microorganisms is a public health problem that continues to grow globally. There is a population that is mainly susceptible to being colonized and subsequently infected, and these are cancer patients. AIM: To identify the clinical and pathological characteristics of cancer patients and their relationship with infection with ESBL and CPE producing microorganisms. METHODS: A retrospective and analytical study was conducted between January 1, 2019 and June 30, 2020 in three hematooncological units. RESULTS: We included 3315 patients of which 217 (6.5%) were colonized by microorganisms producing ESBL and CPE. Of these, 106/217 (48.8%) had at least one episode of infection. The most frequently isolated microorganism was Klebsiella pneumoniae 29/106 (27.4%). Of those infected, 18/106 (17%) presented infection by the same colonizing microorganism. Mucositis (p = 0.002), age over 65 years (p = 0.041), hypoalbuminemia (p < 0.01), neutropenia (p < 0.01) and the presence of invasive devices (p < 0.01) demonstrated a relationship with development of infection. The presence of hypoalbuminemia (OR 3.3, CI 1.5-7.1, P < 0.01), invasive devices (OR 5.8, CI 3.0-11.4, p < 0.01) and neutropenia (OR 4.1, CI 1.5-11.4, p < 0.01) predict the development of infections.

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As atividades industriais e de agronegócio, embora necessárias para o desenvolvimento da sociedade, tem causado sérios problemas ambientais devido à eliminação inadequada de seus efluentes, sendo o tratamento destes um dos assuntos mais importantes em relação ao controle de poluição. Os microrganismos podem ser utilizados como biomarcadores de contaminação, portanto, o conhecimento de mecanismos associados à resistência e a capacidade de imobilização e biotransformação de poluentes é um fator importante para a identificação de linhagens adaptadas, que podem ser eficientes no tratamento e na recuperação de áreas contaminadas. O objetivo do presente projeto foi avaliar o perfil de tolerância de patógenos bacterianos de alto risco em saúde única, aos metais pesados (mercúrio, prata, telúrio e arsênio) e ao agrotóxico glifosato; identificando o resistoma associado. A correlação fenótipo-genótipo foi avaliada em isolados de Klebsiella pneumoniae (n= 35), Escherichia coli (n=46), e Salmonella spp. (n=19), determinando a CIM pelo método de microdiluição, e analisando as respectivas sequências genômicas. Entre os isolados de K. pneumoniae, 32 cepas apresentaram CIM elevadas (64- 512µg/mL) para o metal prata, dos quais 20 carregam o operon silPABCRSE responsável por conferir resistência. Uma cepa de K. pneumoniae carregando genes terABCE apresentou uma CIM de 64 µg/mL para telúrio. Seis cepas de E. coli apresentaram uma CIM >32 µg/mL para telúrio, sendo que 3 cepas carregam os genes tehA/B. Outras 6 cepas de E. coli apresentaram CIM para prata de 256-512 µg/mL, mas só duas carregaram genes silPFCE. Duas cepas de Salmonella apresentaram CIM 64-128 µg/mL para telúrio, e carregam genes tehA/B e terABCDEF. Em relação ao arsênio, 24 cepas de E. coli apresentaram uma CIM ≥ 512 µg/mL, e destas, 12 cepas carregam os genes arsRBC. Salmonella spp., que carregam o gene merR apresentaram CIMs de 8-16 µg/mL para mercúrio. Não foi possível correlacionar a presença do operon phnC-P (sugerido como responsável pela tolerância ao glifosato) com CIMs elevadas para este composto. Os resultados obtidos suportam a hipóteses que a exposição de bactérias de origem humana, animal e ambiental, aos metais pesados pode estar contribuindo para a seleção de linhagens tolerantes, sendo que a tolerância à prata mediada pelo operon silPABCRSE em K. pneumoniae foi predominante no grupo clonal CG258, característica com potencial de biomarcador que pode ser utilizado para monitorar o impacto do uso deste metal nas diferentes atividades humanas. Neste trabalho foi possível padronizar a técnica de PCR com os genes do operon sil de interesse

Industrial and agribusiness activities have caused serious environmental problems due to the inadequate disposal of their effluents, the treatment of which being one of the most important issues in relation to pollution control. Microorganisms can be used as biomarkers of contamination, therefore the knowledge of mechanisms associated with resistance and the immobilization and biotransformation capacity of pollutants can be an important factor for the identification of adapted strains, efficient in the treatment and recovery of contaminated areas. The aim of this study was to evaluate the tolerance profile of critical priority bacterial pathogens relevant in One Health, to heavy metals (mercury, silver, tellurium, and arsenic) and to the pesticide glyphosate, identifying the associated resistome. The phenotype-genotype correlation was evaluated in antibiotic-resistant isolates of Klebsiella pneumoniae (n= 35), Escherichia coli (n= 46), and Salmonella spp. (n= 19), by MIC determination using the microdilution method, and by analysis of their respective genomic sequences. Among the isolates of K. pneumoniae, 32 strains showed elevated MIC (64-512 µg/mL) for silver metal, of which 20 carried the silPABCRSE operon responsible for conferring resistance. A strain of K. pneumoniae carrying terrace genes showed a MIC of 64 µg/mL for tellurium. Six strains of E. coli showed an MIC> 32 µg/mL for tellurium, with 3 strains carrying the Thea/B genes. Other 6 strainsof E. coli showed MIC for silver of 256-512 µg/mL, but only two carried silPFCE genes. Two strains of Salmonella showed MIC 64-128 µg/mL for tellurium and carried the/B and terABCDEF genes. In relation to arsenic, 24 strains of E. coli had a MIC 512 µg/mL, and of these, 12 strains carried the arsRBC genes. Salmonella spp., which carriedthe mer gene, had MICs of 8-16 µg/mL for mercury. It was not possible to correlate thepresence of the phonic-P operon (suggested as responsible for glyphosate tolerance) with elevated MICs for this compound. The silver tolerance mediated by the operon sil was a predominant feature in K. pneumoniae strains belonging to the clonal group CG258, suggesting a intrinsic property that has contributed to the persistence and wide dissemination of CG258 within a One Health context, which could be as a biomarkerto monitor the impact of the use of silver compounds and silver-based biomaterial on different human activities. In this work it was possible to standardize the PCR technique with the genes of the sil operon of interest

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RESUMEN Introducción: la diseminación de microorganismos multirresistentes en el hospital, constituye un importante problema epidemiológico y terapéutico que afecta especialmente a pacientes de la Unidad de Cuidados Intensivos. Objetivo: escribir el comportamiento de las infecciones nosocomiales y la resistencia antimicrobiana en la Unidad de Cuidados Intensivos. Materiales y métodos: se realizó un estudio de tipo descriptivo, observacional y prospectivo en la Unidad de Cuidados Intensivos del Hospital Universitario Clínico Quirúrgico Comandante Faustino Pérez Hernández, durante el primer semestre de 2020. El universo estuvo constituido por 102 pacientes que ingresaron en la Unidad de Cuidados Intensivos en el período estudiado, a los que se les realizó estudios microbiológicos. Las variables analizas fueron: causas de ingreso, edad, infecciones nosocomiales, neumonía en ventilados, gérmenes, resistencia antimicrobiana y mortalidad. Se expresaron en tablas y gráficos porcentuales. Resultados: el sexo masculino presentó mayor número de infección nosocomial respecto al femenino, en edades diferentes de la vida. La causa más frecuente de ingreso fue el politrauma. El sitio más común de infección nosocomial fue la vía respiratoria. Predominaron gérmenes como los bacilos gramnegativos fermentadores y las enterobacterias. Antibióticos como los inhibidores de las betalactamasas, otras penicilinas, quinolonas, cefalosporinas, aminoglucósidos y meropenen han adquirido un mayor porciento de resistencia. Conclusiones: la infección nosocomial por bacterias multirresistentes a los antibióticos estratégicos, es un problema dentro de la Unidad de Cuidados Intensivos asociado a la ventilación mecánica, que provoca una elevada mortalidad (AU).

ABSTRACT Introduction: the spread of multi-resistant microorganisms in the hospital is a major epidemiological and therapeutic problem that particularly affects critical patients admitted to the Intensive Care Unit. Objective: to describe the behavior of nosocomial infections and antimicrobial resistance in the Intensive Care Unit. Materials and Methods: a descriptive, observational and prospective study was carried out in the Intensive Care Unit of the Teaching Clinic-Surgical Hospital Faustino Pérez Hernández, during the first half of 2020. The universe was formed by 102 patients who entered the Intensive Care Unit during the studied period, to whom microbiological studies were carried out. The analyzed variables were the following: causes of admission, age, nosocomial infections, ventilator-associated pneumonia, germs, antimicrobial resistance and mortality. The results were expressed in tables and percentage charts. Results: Male sex showed the highest number of nosocomial infection compared to the female, at different ages of life. The most common cause of admission was polytrauma. The most common site of nosocomial infection was the airway. Germs like fermentative Gram-negative bacilli and enterobacteria predominated. Antibiotics such as beta-lactamase inhibitors, other kinds of penicillin, quinolones, cephalosporin, aminoglycosides and meropenen have acquired a higher percent of resistance. Conclusions: nosocomial infection caused by bacteria that have developed multi-resistance to strategic antibiotics is a problem within the Intensive Care Unit, associated to mechanical ventilation, and leads to high mortality (AU).

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Contamination of the veterinary hospital environment with multiresistant pathogens endangers not only hospitalized animals, but also the workplace safety of veterinarians and nurses, animal guardians and, when in case of a teaching hospital, veterinary students. The objective of this study was to map the main points of bacterial contamination of a veterinary teaching hospital in Brazil to identify multiresistant microorganisms and their antimicrobial resistance genes. Samples were collected from 39 different locations of a veterinary school hospital which comprised a pool according to each hospital environment. In certain environments, more than one pool has been collected. All samples were collected in quadruplicates for the selective isolation of the main multiresistant microorganisms: methicillin-resistant Staphylococcus (MRS), vancomycin resistant Enterococcus (VRE), cephalosporinases and/or extended-spectrum beta-lactamase-producing Gram-negative bacteria (ESBL) and Carbapenemase-producing (CP). After isolation and identification of isolates, multiplex-PCR reactions were performed to detect the main genes for each microorganism and antimicrobial susceptibility tests with the main antibiotics used for each bacterial group according to CLSI. Of the 39 veterinary teaching hospital sites collected, all (100%) had at least one of the microorganisms surveyed, and 17.95% (n=7) of the sites were able to isolate the four pathogens. From the 94 pools collected, it was possible to isolate MRS in 81.91% (n=77), VRE in 12.77% (n=12), cephalosporinases and/or ESBL in 62.77% (n=59) and CP in 24.47%. (n=23). Regarding MRS, the mecA gene was detected in all isolates. All isolated VREs were identified as Enterococcus faecalis and presented the vanA gene. Regarding cephalosporinases and/or ESBL, 89.83% (n=53) of the isolates presented the blaTEM gene, 57.63% (n=34) the blaOXA-1 gene, 37.29% (n=22) blaCTX-M gene from some group (1, 2, 9 ou 8/25) and 20.34% (n=12) the blaSHV gene. It was possible to identify the main microorganisms responsible for causing nosocomial infections in humans (VRE, MRS, ESBL and CP) in the veterinary hospital environment, suggesting a source of infection for professionals and students of veterinary medicine, placing a high risk for public health.(AU)

A contaminação do ambiente hospitalar veterinário com patógenos multirresistentes coloca em perigo não apenas os animais hospitalizados, mas também a segurança no local de trabalho de veterinários e enfermeiros, responsáveis por animais e, quando se tratar de um hospital de ensino, estudantes de veterinária. O objetivo deste estudo foi mapear os principais pontos de contaminação bacteriana de um hospital veterinário de ensino no Brasil, identificando microorganismos multirresistentes e seus genes de resistência antimicrobiana. As amostras foram coletadas em 39 locais diferentes de um hospital de escola veterinária, que compreendia um pool de acordo com o ambiente de cada hospital. Em certos ambientes, mais de um pool foi coletado. Todas as amostras foram coletadas em quadruplicados para o isolamento seletivo dos principais microorganismos multirresistentes: Staphylococcus resistente à meticilina (MRS), Enterococcus resistente à vancomicina (VRE), bactérias Gram-negativas produtoras de cefalosporinases e/ou beta-lactamase de espectro estendido (ESBL) e produtoras de carbapenemase (PC). Após o isolamento e identificação dos isolados, foram realizadas reações de PCR multiplex para detectar os principais genes de cada microorganismo e testes de susceptibilidade a antimicrobianos com os principais antibióticos utilizados para cada grupo bacteriano de acordo com o CLSI. Dos 39 locais do VCH coletados, todos (100%) possuíam pelo menos um dos microrganismos pesquisados e 17,95% (n=7) dos locais foram capazes de isolar os quatro patógenos. Dos 94 pools coletados, foi possível isolar MRS em 81,91% (n=77), VRE em 12,77% (n=12), ESBL em 62,77% (n=59) e carbapenemases em 24,47% (n=23). Em relação ao MRS, o gene mecA foi detectado em todos os isolados. Todos os VREs isolados foram identificados como Enterococcus faecalis e apresentaram o gene vanA. Em relação às cefalosporinases e/ou ESBL, 89,83% (n=53) dos isolados apresentaram o gene blaTEM, 57,63% (n=34) o gene blaOXA-1, 37,29% (n=22) o gene blaCTX-M de algum grupo e 20,34% (n=12) o gene blaSHV. Foi possível identificar os principais microrganismos responsáveis por causar infecções nosocomiais em humanos (VRE, MRS, ESBL e CP) no ambiente hospitalar veterinário, sugerindo uma fonte de infecção para profissionais e estudantes de medicina veterinária, colocando alto risco para a saúde pública.(AU)

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ABSTRACT: Contamination of the veterinary hospital environment with multiresistant pathogens endangers not only hospitalized animals, but also the workplace safety of veterinarians and nurses, animal guardians and, when in case of a teaching hospital, veterinary students. The objective of this study was to map the main points of bacterial contamination of a veterinary teaching hospital in Brazil to identify multiresistant microorganisms and their antimicrobial resistance genes. Samples were collected from 39 different locations of a veterinary school hospital which comprised a pool according to each hospital environment. In certain environments, more than one pool has been collected. All samples were collected in quadruplicates for the selective isolation of the main multiresistant microorganisms: methicillin-resistant Staphylococcus (MRS), vancomycin resistant Enterococcus (VRE), cephalosporinases and/or extended-spectrum beta-lactamase-producing Gram-negative bacteria (ESBL) and Carbapenemase-producing (CP). After isolation and identification of isolates, multiplex-PCR reactions were performed to detect the main genes for each microorganism and antimicrobial susceptibility tests with the main antibiotics used for each bacterial group according to CLSI. Of the 39 veterinary teaching hospital sites collected, all (100%) had at least one of the microorganisms surveyed, and 17.95% (n=7) of the sites were able to isolate the four pathogens. From the 94 pools collected, it was possible to isolate MRS in 81.91% (n=77), VRE in 12.77% (n=12), cephalosporinases and/or ESBL in 62.77% (n=59) and CP in 24.47%. (n=23). Regarding MRS, the mecA gene was detected in all isolates. All isolated VREs were identified as Enterococcus faecalis and presented the vanA gene. Regarding cephalosporinases and/or ESBL, 89.83% (n=53) of the isolates presented the blaTEM gene, 57.63% (n=34) the blaOXA-1 gene, 37.29% (n=22) blaCTX-M gene from some group (1, 2, 9 ou 8/25) and 20.34% (n=12) the blaSHV gene. It was possible to identify the main microorganisms responsible for causing nosocomial infections in humans (VRE, MRS, ESBL and CP) in the veterinary hospital environment, suggesting a source of infection for professionals and students of veterinary medicine, placing a high risk for public health.

RESUMO: A contaminação do ambiente hospitalar veterinário com patógenos multirresistentes coloca em perigo não apenas os animais hospitalizados, mas também a segurança no local de trabalho de veterinários e enfermeiros, responsáveis por animais e, quando se tratar de um hospital de ensino, estudantes de veterinária. O objetivo deste estudo foi mapear os principais pontos de contaminação bacteriana de um hospital veterinário de ensino no Brasil, identificando microorganismos multirresistentes e seus genes de resistência antimicrobiana. As amostras foram coletadas em 39 locais diferentes de um hospital de escola veterinária, que compreendia um pool de acordo com o ambiente de cada hospital. Em certos ambientes, mais de um pool foi coletado. Todas as amostras foram coletadas em quadruplicados para o isolamento seletivo dos principais microorganismos multirresistentes: Staphylococcus resistente à meticilina (MRS), Enterococcus resistente à vancomicina (VRE), bactérias Gram-negativas produtoras de cefalosporinases e/ou beta-lactamase de espectro estendido (ESBL) e produtoras de carbapenemase (PC). Após o isolamento e identificação dos isolados, foram realizadas reações de PCR multiplex para detectar os principais genes de cada microorganismo e testes de susceptibilidade a antimicrobianos com os principais antibióticos utilizados para cada grupo bacteriano de acordo com o CLSI. Dos 39 locais do VCH coletados, todos (100%) possuíam pelo menos um dos microrganismos pesquisados e 17,95% (n=7) dos locais foram capazes de isolar os quatro patógenos. Dos 94 pools coletados, foi possível isolar MRS em 81,91% (n=77), VRE em 12,77% (n=12), ESBL em 62,77% (n=59) e carbapenemases em 24,47% (n=23). Em relação ao MRS, o gene mecA foi detectado em todos os isolados. Todos os VREs isolados foram identificados como Enterococcus faecalis e apresentaram o gene vanA. Em relação às cefalosporinases e/ou ESBL, 89,83% (n=53) dos isolados apresentaram o gene blaTEM, 57,63% (n=34) o gene blaOXA-1, 37,29% (n=22) o gene blaCTX-M de algum grupo e 20,34% (n=12) o gene blaSHV. Foi possível identificar os principais microrganismos responsáveis por causar infecções nosocomiais em humanos (VRE, MRS, ESBL e CP) no ambiente hospitalar veterinário, sugerindo uma fonte de infecção para profissionais e estudantes de medicina veterinária, colocando alto risco para a saúde pública.

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Contamination of the veterinary hospital environment with multiresistant pathogens endangers not only hospitalized animals, but also the workplace safety of veterinarians and nurses, animal guardians and, when in case of a teaching hospital, veterinary students. The objective of this study was to map the main points of bacterial contamination of a veterinary teaching hospital in Brazil to identify multiresistant microorganisms and their antimicrobial resistance genes. Samples were collected from 39 different locations of a veterinary school hospital which comprised a pool according to each hospital environment. In certain environments, more than one pool has been collected. All samples were collected in quadruplicates for the selective isolation of the main multiresistant microorganisms: methicillin-resistant Staphylococcus (MRS), vancomycin resistant Enterococcus (VRE), cephalosporinases and/or extended-spectrum beta-lactamase-producing Gram-negative bacteria (ESBL) and Carbapenemase-producing (CP). After isolation and identification of isolates, multiplex-PCR reactions were performed to detect the main genes for each microorganism and antimicrobial susceptibility tests with the main antibiotics used for each bacterial group according to CLSI. Of the 39 veterinary teaching hospital sites collected, all (100%) had at least one of the microorganisms surveyed, and 17.95% (n=7) of the sites were able to isolate the four pathogens. From the 94 pools collected, it was possible to isolate MRS in 81.91% (n=77), VRE in 12.77% (n=12), cephalosporinases and/or ESBL in 62.77% (n=59) and CP in 24.47%. (n=23). Regarding MRS, the mecA gene was detected in all isolates. All isolated VREs were identified as Enterococcus faecalis and presented the vanA gene. Regarding cephalosporinases and/or ESBL, 89.83% (n=53) of the isolates presented the blaTEM gene, 57.63% (n=34) the blaOXA-1 gene, 37.29% (n=22) blaCTX-M gene from some group (1, 2, 9 ou 8/25) and 20.34% (n=12) the blaSHV gene. It was possible to identify the main microorganisms responsible for causing nosocomial infections in humans (VRE, MRS, ESBL and CP) in the veterinary hospital environment, suggesting a source of infection for professionals and students of veterinary medicine, placing a high risk for public health.(AU)

A contaminação do ambiente hospitalar veterinário com patógenos multirresistentes coloca em perigo não apenas os animais hospitalizados, mas também a segurança no local de trabalho de veterinários e enfermeiros, responsáveis por animais e, quando se tratar de um hospital de ensino, estudantes de veterinária. O objetivo deste estudo foi mapear os principais pontos de contaminação bacteriana de um hospital veterinário de ensino no Brasil, identificando microorganismos multirresistentes e seus genes de resistência antimicrobiana. As amostras foram coletadas em 39 locais diferentes de um hospital de escola veterinária, que compreendia um pool de acordo com o ambiente de cada hospital. Em certos ambientes, mais de um pool foi coletado. Todas as amostras foram coletadas em quadruplicados para o isolamento seletivo dos principais microorganismos multirresistentes: Staphylococcus resistente à meticilina (MRS), Enterococcus resistente à vancomicina (VRE), bactérias Gram-negativas produtoras de cefalosporinases e/ou beta-lactamase de espectro estendido (ESBL) e produtoras de carbapenemase (PC). Após o isolamento e identificação dos isolados, foram realizadas reações de PCR multiplex para detectar os principais genes de cada microorganismo e testes de susceptibilidade a antimicrobianos com os principais antibióticos utilizados para cada grupo bacteriano de acordo com o CLSI. Dos 39 locais do VCH coletados, todos (100%) possuíam pelo menos um dos microrganismos pesquisados e 17,95% (n=7) dos locais foram capazes de isolar os quatro patógenos. Dos 94 pools coletados, foi possível isolar MRS em 81,91% (n=77), VRE em 12,77% (n=12), ESBL em 62,77% (n=59) e carbapenemases em 24,47% (n=23). Em relação ao MRS, o gene mecA foi detectado em todos os isolados. Todos os VREs isolados foram identificados como Enterococcus faecalis e apresentaram o gene vanA. Em relação às cefalosporinases e/ou ESBL, 89,83% (n=53) dos isolados apresentaram o gene blaTEM, 57,63% (n=34) o gene blaOXA-1, 37,29% (n=22) o gene blaCTX-M de algum grupo e 20,34% (n=12) o gene blaSHV. Foi possível identificar os principais microrganismos responsáveis por causar infecções nosocomiais em humanos (VRE, MRS, ESBL e CP) no ambiente hospitalar veterinário, sugerindo uma fonte de infecção para profissionais e estudantes de medicina veterinária, colocando alto risco para a saúde pública.(AU)

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Resumen La cinética de la procalcitonina es útil para reducir la duración de la antibioticoterapia en pacientes críticos, pero no se analizó su rol en infecciones por gérmenes multirresistentes. Se realizó un estudio observacional retrospectivo, analizando las curvas de procalcitonina de pacientes con neumonías asociadas a ventilación mecánica (NAVM) y bacteriemias asociadas a catéter (BAC) con rescate bacteriano durante el período 1/11/16 a 1/7/19. Se estudiaron 16 pacientes con infección por gérmenes sensibles (10 BAC y 6 NAVM) y 10 por gérmenes multirresistentes (10 BAC y 10 NAVM). Los pacientes con BAC generadas por gérmenes multirresistentes presentaron valores de procalcitonina mayores que los pacientes con BAC por gérmenes sensibles: (39 ± 30 μg/l vs. 10.7 ± 11 μg/l, p = 0.02). Los pacientes con NAVM generada por gérmenes sensibles y multirresistentes presentaron valores de procalcitonina similares. El descenso de procalcitonina a niveles 80% menores al valor máximo o menores a 0.5 μg/l (con tratamiento antibiótico efectivo) fue más veloz en pacientes con infección por gérmenes sensibles (5 ± 1.8 días vs. 7.2 ± 2.9 días, p = 0.03). En las infecciones por gérmenes multirresistentes, la respuesta inflamatoria medida por procalcitonina fue más intensa y prolongada, aun con un tratamiento antibiótico efectivo. Sin embargo, el descenso se produjo antes de que finalizaran los esquemas antibióticos convencionales. Por este motivo, se considera necesario estudiar la potencial utilidad de protocolos antibióticos guiados por procalcitonina en pacientes con infecciones por gérmenes multirresistentes para reducir la exposición a antibióticos.

Abstract Procalcitonin guidance stimulates a reduction in the duration of antibiotic treatment in critically ill patients with a presumed bacterial infection, but its role in infections caused by multidrug-resistant bacteria has not been sufficiently explored. In this retrospective observational study, we analyzed procalcitonin curves of 32 patients with culture-confirmed ventilation-associated pneumonia (VAP) and catheter-related bloodstream infections (CRBSI) occurred during the period 11/1/2016 to 7/1/2019. Sixteen infections were caused by multidrug-resistant bacteria (10 CRBSI and 6 VAP) and other 16 by sensitive bacteria (10 CRBSI and 6 VAP). CRBSI generated by multidrug-resistant bacteria elicited significantly higher procalcitonin levels than CRBSI infections caused by sensitive bacteria (39 ± 30 μg/l vs. 10.7 ± 11 μg/l, p = 0.02). Patients with VAP caused by sensitive and multidrug-resistant bacteria elicited similar procalcitonin levels. The time to a decrease in procalcitonin level to less than 80% of the peak value or less than 0.5 μg/l upon effective antibiotic treatment was 7.2 ± 2.9 days in multidrug-resistant bacteria vs. 5 ± 1.8 days in sensitive bacteria (p = 0.03). In multidrug-resistant bacteria, the inflammatory response measured by procalcitonin is stronger and longer, even with an effective antibiotic treatment. However, the decline occurs before the conventional antibiotic scheme is completed. The potential application of antibiotic protocols guided by procalcitonin to these groups of patients grants further studies aimed to reduce exposure to antibiotics in critical multidrug-resistant infections.

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Captive Psittaciformes may harbor Gram-negative bacteria in their digestive tract, mainly due to poor hygienic conditions and confinement. The present study was carried out with the objective of isolating and identifying Escherichia coli in samples collected from Psittaciformes cages in 50 commercial establishments in the metropolitan region of Goiania, with subsequent antimicrobial susceptibility testing and detection of virulence genes. A total of 141 samples of excreta and swab samples from feeders and water bowls were collected, totaling 423 samples. Escherichia coli was isolated from 9.7% (41/423) samples: 12% (17/141) in excreta, 8.5% (12/141) in feed, and 8.5% (12 /141) in waterers. To determine the susceptibility profile of E. coli isolates, resistance to ciprofloxacin 4.9% (2/41), gentamicin 17.0% (7/41), doxycycline 34.1% (14/41), florfenicol 34.1% (14/41), trimethoprim 39.0% (16/41), tetracycline 41.5% (17/41), enrofloxacin 43.9% (18/41), amoxicillin 48.8% (20/41), neomycin 61.0% (25/41), and sulfonamide 90.2% (37/41) was determined. In 20 isolates, resistance was determined at 4 or more antimicrobials, seven of excreta (7/17), five of feed (5/12), and eight of waterers (8/12). One of the isolates from the waterers showed resistance to all antimicrobials. The iss gene was detected in three isolates, the tsh gene in three, the papC gene in two, traT and eae genes were not detected. In this study, it can be concluded that Psittaciformes commercialized as pet are carry E. coli isolates resistant to most commonly used antimicrobials, mainly sulfonamides and neomycin, besides having virulence and serum resistance genes, which highlights the possibility of the to cause disease in humans.(AU)

Psittaciformes em cativeiro podem abrigar bactérias Gram-negativas em seu trato digestivo, principalmente devido a condições higiênicas inadequadas e ao confinamento. O presente estudo teve o objetivo de isolar e identificar Escherichia coli em amostras coletadas de gaiolas de Psittaciformes em 50 estabelecimentos comerciais da região metropolitana de Goiânia, com subsequentes testes de susceptibilidade antimicrobiana e detecção de genes de virulência. Foram coletadas 141 amostras de excrementos e suabes de alimentadores e bebedouros, totalizando 423 amostras. Escherichia coli foi isolada em 9,7% (41/423) amostras: 12% (17/141) em excrementos, 8,5% (12/141) em ração e 8,5% (12/141) em bebedouros. Os isolados de E. coli mostraram resistência à ciprofloxacina 4,9% (2/41), gentamicina 17,0% (7/41), doxiciclina 34,1% (14/41), florfenicol 34,1% (14/41), trimetoprim 39,0% (16/41), tetraciclina 41,5% (17/41), enrofloxacina 43,9% (18/41), amoxicilina 48,8% (20/41), neomicina 61,0% (25/41) e sulfonamida 90,2% (37 / 41) foi determinado. Multirresistência (resistência a quatro ou mais antimicrobianos) foi encontrada em 20 amostras, sete de excrementos (7/17), cinco de ração (5/12) e oito de bebedouros (8/12). Um dos isolados dos bebedouros apresentou resistência a todos os antimicrobianos. O gene iss foi detectado em três isolados, o gene tsh em três, o gene papC em dois, os genes traT e eae não foram detectados. Neste estudo, pode-se concluir que os Psittaciformes comercializados como animais de estimação são portadores de isolados de E. coli resistentes aos antimicrobianos mais utilizados, principalmente sulfonamidas e neomicina, além de possuir genes de virulência e resistência sérica, destacando a possibilidade de causar doenças em humanos.(AU)

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A proximidade dos primatas não humanos (PNH) com o ser humano pode ser considerada um fator de risco para transmissão de bactérias entre essas duas populações. Neste estudo, foi investigada a microbiota anfibiôntica aeróbica oral e retal de calitriquídeos em um fragmento de Mata Atlântica localizado no Rio de Janeiro, Brasil, e foram realizados testes fenotípicos para detecção de bactérias multirresistentes nos isolados encontrados. Foram capturados 14 calitriquídeos e coletadas 21 amostras (14 de cavidade oral e sete de cavidade retal) em dois pontos da mata próximos às habitações humanas. As espécies mais frequentes, na cavidade oral, foram Klebsiella oxytoca (50,0%), K. pneumoniae (28,6%), Kluyvera ascorbata (21,4%) e Stenotrophomonas maltophilia (21,4%) e, na cavidade retal, K. pneumoniae (85,7%), Escherichia coli (28,6%) e Enterobacter spp. (42,9%). Todos os 48 isolados da família Enterobacteriaceae foram negativos para ESBL (betalactamase de espectro ampliado), mostrando-se não produtores da enzima nos dois métodos utilizados: disco-aproximação e método de detecção automatizado. Na pesquisa de ERC (enterobactérias resistentes a carbapenêmicos), esses mesmos isolados não apresentaram resistência aos antibióticos imipenem, meropenem e ertapenem. Todas as bactérias isoladas apresentam um potencial zoonótico, o que representa um risco à saúde pública e à conservação das espécies.(AU)

Proximity of nonhuman primates (NHP) to humans can be considered a risk factor for transmission of pathogens between these two populations. This study investigated the oral and rectal aerobic bacterial microbiota of marmosets in an anthropized area of the Atlantic Forest located in Rio de Janeiro, Brazil, and performed phenotypic tests for detection of multidrug-resistant bacteria. Twenty-one samples (14 from the oral cavity and seven from the rectum) were collected from 14 Callithrix sp. captured in two sites of the forest near human dwellings. The most frequent species identified from the oral cavity swabs were Klebsiella oxytoca (50.0%), K. pneumoniae (28.6%), Kluyvera ascorbata (21.4%) and Stenotrophomonas maltophilia (21.4%), whereas the species most commonly identified from the rectum swabs were K. pneumoniae (85.7%), Enterobacter spp. (42.9%) and Escherichia coli (28.6%). All isolates of family Enterobacteriaceae showed no extended spectrum ß-lactamase production by disk-diffusion and automated detection tests. In the search for carbapenem-resistant enterobacteriaceae these isolates presented no resistance to the imipenem, meropenem and ertapenem antibiotics. The isolate of Staphylococcus aureus was susceptible to oxacillin and the isolate of Enterococcus was susceptible to vancomycin. All isolated bacteria showed zoonotic potential, thus posing a risk to species conservation and public health.(AU)

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A proximidade dos primatas não humanos (PNH) com o ser humano pode ser considerada um fator de risco para transmissão de bactérias entre essas duas populações. Neste estudo, foi investigada a microbiota anfibiôntica aeróbica oral e retal de calitriquídeos em um fragmento de Mata Atlântica localizado no Rio de Janeiro, Brasil, e foram realizados testes fenotípicos para detecção de bactérias multirresistentes nos isolados encontrados. Foram capturados 14 calitriquídeos e coletadas 21 amostras (14 de cavidade oral e sete de cavidade retal) em dois pontos da mata próximos às habitações humanas. As espécies mais frequentes, na cavidade oral, foram Klebsiella oxytoca (50,0%), K. pneumoniae (28,6%), Kluyvera ascorbata (21,4%) e Stenotrophomonas maltophilia (21,4%) e, na cavidade retal, K. pneumoniae (85,7%), Escherichia coli (28,6%) e Enterobacter spp. (42,9%). Todos os 48 isolados da família Enterobacteriaceae foram negativos para ESBL (betalactamase de espectro ampliado), mostrando-se não produtores da enzima nos dois métodos utilizados: disco-aproximação e método de detecção automatizado. Na pesquisa de ERC (enterobactérias resistentes a carbapenêmicos), esses mesmos isolados não apresentaram resistência aos antibióticos imipenem, meropenem e ertapenem. Todas as bactérias isoladas apresentam um potencial zoonótico, o que representa um risco à saúde pública e à conservação das espécies.(AU)

Proximity of nonhuman primates (NHP) to humans can be considered a risk factor for transmission of pathogens between these two populations. This study investigated the oral and rectal aerobic bacterial microbiota of marmosets in an anthropized area of the Atlantic Forest located in Rio de Janeiro, Brazil, and performed phenotypic tests for detection of multidrug-resistant bacteria. Twenty-one samples (14 from the oral cavity and seven from the rectum) were collected from 14 Callithrix sp. captured in two sites of the forest near human dwellings. The most frequent species identified from the oral cavity swabs were Klebsiella oxytoca (50.0%), K. pneumoniae (28.6%), Kluyvera ascorbata (21.4%) and Stenotrophomonas maltophilia (21.4%), whereas the species most commonly identified from the rectum swabs were K. pneumoniae (85.7%), Enterobacter spp. (42.9%) and Escherichia coli (28.6%). All isolates of family Enterobacteriaceae showed no extended spectrum ß-lactamase production by disk-diffusion and automated detection tests. In the search for carbapenem-resistant enterobacteriaceae these isolates presented no resistance to the imipenem, meropenem and ertapenem antibiotics. The isolate of Staphylococcus aureus was susceptible to oxacillin and the isolate of Enterococcus was susceptible to vancomycin. All isolated bacteria showed zoonotic potential, thus posing a risk to species conservation and public health.(AU)

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Conocer el rol del medio ambiente es fundamental para evitar las infecciones intra-hospitalarias. Con ese objetivo, se planteó evaluar la prevalencia de contaminación ambiental por microorganismos multirresistentes (MMR) antes y después de la limpieza terminal de habitaciones de pacientes colonizados y establecer si la aparatología de uso común actuaba como reservorio de estos en la unidad de cuidados intensivos (UTI). Se obtuvieron muestras ambientales de las habitaciones, 48 h posteriores a la detección de colonización y luego de las limpiezas. Los resultados mostraron que luego de ambos procedimientos de limpieza se logró reducir de 28,2% a 2,6% la contaminación por Acinetobacter spp. multirresistente (AMR). También, se tomaron muestras de aparatología de uso común encontrándose entre 1,8 y 5,4% de contaminación por MMR. La limpieza y desinfección reducen significativamente la contaminación ambiental. Sin embargo, la colonización de equipos por MMR y el incumplimiento de precauciones universales representan una posibilidad de transmisión cruzada.

It is essential to understand the role of the environment in order to avoid intrahospital infections. To achieve this objective, this research proposes to assess the prevalence of the environmental contamination caused by multi-resistant microorganisms (MRM) before and after terminal disinfection in rooms with colonized patients, but also to establish whether the commonly used device acts as a reservoir of those micro-organisms in an intensive care unit (ICU). Environmental samples were obtained from the rooms, 48 hours after detecting colonization and also after the first and second final cleaning. The results showed that after both procedures, there was a reduction from 28.2% to 2.6% of contamination caused by multi-resistant Acinetobacter spp. (AMR). Samples from appliances and supplies were taken as well, in which case, between 1.8 and 5.4% of contamination levels induced by MMR were found. Cleaning and disinfecting significantly reduce environmental contamination. However, both MMR bacterial colonization and the lack of universal precautions enforcement represent a possibility of cross-transmission.

É essencial conhecer o papel do meio ambiente para evitar as infecções intra-hospitalares. Com esse objetivo, planejou-se avaliar a prevalência de contaminação ambiental por microorganismos multirresistentes (MMR) antes e depois da limpeza final dos quartos de pacientes colonizados e estabelecer se os aparelhos de uso comum atuavam como um reservatório deles na unidade de terapia intensiva (UTI). Obtiveram-se amostras ambientais dos quartos 48 horas após a detecção da colonização e logo após as limpezas finais. Os resultados mostraram que depois dos dois procedimentos de limpeza se obteve uma redução de 28,2% para 2,6% da contaminação por Acinetobacter spp. multirresistente (AMR). Foram obtidas também amostras de aparelhos de uso comum onde se encontraram entre 1,8% e 5,4% de contaminação por MMR. A limpeza e a desinfecção reduzem significativamente a contaminação ambiental. Contudo, a colonização de equipamentos por MMR e o não cumprimento de providências universais representam uma possibilidade de transmissão cruzada.

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Staphylococcus spp. are bacteria involved in human and animal infections. They are resistant to antimicrobials and have become a major public health concern. In recent years, there has been a significant increase in methicillin-resistant Staphylococcus strains and vancomycin is the drug of choice for the treatment of such isolates. However, the minimum inhibitory concentration (MIC) of vancomycin necessary to combat this microorganism has been showing an increase. The aim of the present study was to determine the susceptibility profile of the Staphylococcus spp. of domestic and wild animals to vancomycin, using the microdilution in broth and E-test® techniques, as well as comparing the results of both tests. Of the 50 isolates tested, 47 (94 %) were sensitive to vancomycin in the microdilution and 43 (86 %) were sensitive to vancomycin in the E-test®. Seven (14 %) isolates had an intermediate result showing a risk to public health since the detection of these isolates may precede the occurrence of isolates resistant to vancomycin. In addition, the mecA gene was detected in 78 % of the tested samples. Six of the seven isolates with intermediate resistance to vancomycin were carriers of the mecA gene, showing that these isolates had a potential risk of becoming resistant. Thus, control measures must be taken to prevent the spread of these isolates with intermediate resistance and preserve the effectiveness of this antimicrobial for the treatment of infections caused by multiresistant Staphylococcus spp.(AU)

Staphylococcus spp. são bactérias envolvidas em infecções de humanos e animais, resistentes a antimicrobianos e tem se tornado uma grande preocupação em saúde pública. Nos últimos anos houve um aumento significativo de Staphylococcus resistentes à meticilina e a vancomicina é a droga de escolha para o tratamento desses isolados, porém vem apresentando elevação nos valores de Concentração Inibitória Mínima (CIM) necessários para combater este microrganismo. O objetivo do presente trabalho foi determinar o perfil de suscetibilidade à vancomicina para isolados de Staphylococcus spp. de animais domésticos e silvestres pelas técnicas de Microdiluição em caldo e E-test®, bem como comparar os resultados de ambos os testes. Dos 50 isolados testados 47 (94%) foram sensíveis à vancomicina na Microdiluição e 43 (86%) foram sensíveis à vancomicina no E-test®. Sete (14%) isolados tiveram resultado intermediário demonstrando um risco à saúde pública visto que a detecção destes isolados pode preceder a ocorrência de isolados resistentes à vancomicina. Ademais o gene mecA foi detectado em 78% das amostras testadas, sendo que dos sete isolados com resistência intermediária à vancomicina, seis eram portadores do gene mecA, evidenciando que esses isolados possuem potencial risco de se tornarem resistentes. Dessa forma medidas de controle devem ser tomadas para evitar a propagação destes isolados com resistência intermediária e preservar a eficácia deste antimicrobiano para o tratamento de infecções causadas por Staphylococcus multirresitentes.(AU)

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Captive Psittaciformes may harbor Gram-negative bacteria in their digestive tract, mainly due to poor hygienic conditions and confinement. The present study was carried out with the objective of isolating and identifying Escherichia coli in samples collected from Psittaciformes cages in 50 commercial establishments in the metropolitan region of Goiania, with subsequent antimicrobial susceptibility testing and detection of virulence genes. A total of 141 samples of excreta and swab samples from feeders and water bowls were collected, totaling 423 samples. Escherichia coli was isolated from 9.7% (41/423) samples: 12% (17/141) in excreta, 8.5% (12/141) in feed, and 8.5% (12 /141) in waterers. To determine the susceptibility profile of E. coli isolates, resistance to ciprofloxacin 4.9% (2/41), gentamicin 17.0% (7/41), doxycycline 34.1% (14/41), florfenicol 34.1% (14/41), trimethoprim 39.0% (16/41), tetracycline 41.5% (17/41), enrofloxacin 43.9% (18/41), amoxicillin 48.8% (20/41), neomycin 61.0% (25/41), and sulfonamide 90.2% (37/41) was determined. In 20 isolates, resistance was determined at 4 or more antimicrobials, seven of excreta (7/17), five of feed (5/12), and eight of waterers (8/12). One of the isolates from the waterers showed resistance to all antimicrobials. The iss gene was detected in three isolates, the tsh gene in three, the papC gene in two, traT and eae genes were not detected. In this study, it can be concluded that Psittaciformes commercialized as pet are carry E. coli isolates resistant to most commonly used antimicrobials, mainly sulfonamides and neomycin, besides having virulence and serum resistance genes, which highlights the possibility of the to cause disease in humans.

Psittaciformes em cativeiro podem abrigar bactérias Gram-negativas em seu trato digestivo, principalmente devido a condições higiênicas inadequadas e ao confinamento. O presente estudo teve o objetivo de isolar e identificar Escherichia coli em amostras coletadas de gaiolas de Psittaciformes em 50 estabelecimentos comerciais da região metropolitana de Goiânia, com subsequentes testes de susceptibilidade antimicrobiana e detecção de genes de virulência. Foram coletadas 141 amostras de excrementos e suabes de alimentadores e bebedouros, totalizando 423 amostras. Escherichia coli foi isolada em 9,7% (41/423) amostras: 12% (17/141) em excrementos, 8,5% (12/141) em ração e 8,5% (12/141) em bebedouros. Os isolados de E. coli mostraram resistência à ciprofloxacina 4,9% (2/41), gentamicina 17,0% (7/41), doxiciclina 34,1% (14/41), florfenicol 34,1% (14/41), trimetoprim 39,0% (16/41), tetraciclina 41,5% (17/41), enrofloxacina 43,9% (18/41), amoxicilina 48,8% (20/41), neomicina 61,0% (25/41) e sulfonamida 90,2% (37 / 41) foi determinado. Multirresistência (resistência a quatro ou mais antimicrobianos) foi encontrada em 20 amostras, sete de excrementos (7/17), cinco de ração (5/12) e oito de bebedouros (8/12). Um dos isolados dos bebedouros apresentou resistência a todos os antimicrobianos. O gene iss foi detectado em três isolados, o gene tsh em três, o gene papC em dois, os genes traT e eae não foram detectados. Neste estudo, pode-se concluir que os Psittaciformes comercializados como animais de estimação são portadores de isolados de E. coli resistentes aos antimicrobianos mais utilizados, principalmente sulfonamidas e neomicina, além de possuir genes de virulência e resistência sérica, destacando a possibilidade de causar doenças em humanos.

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ABSTRACT: Staphylococcus spp. are bacteria involved in human and animal infections. They are resistant to antimicrobials and have become a major public health concern. In recent years, there has been a significant increase in methicillin-resistant Staphylococcus strains and vancomycin is the drug of choice for the treatment of such isolates. However, the minimum inhibitory concentration (MIC) of vancomycin ​​necessary to combat this microorganism has been showing an increase. The aim of the present study was to determine the susceptibility profile of the Staphylococcus spp. of domestic and wild animals to vancomycin, using the microdilution in broth and E-test® techniques, as well as comparing the results of both tests. Of the 50 isolates tested, 47 (94 %) were sensitive to vancomycin in the microdilution and 43 (86 %) were sensitive to vancomycin in the E-test®. Seven (14 %) isolates had an intermediate result showing a risk to public health since the detection of these isolates may precede the occurrence of isolates resistant to vancomycin. In addition, the mecA gene was detected in 78 % of the tested samples. Six of the seven isolates with intermediate resistance to vancomycin were carriers of the mecA gene, showing that these isolates had a potential risk of becoming resistant. Thus, control measures must be taken to prevent the spread of these isolates with intermediate resistance and preserve the effectiveness of this antimicrobial for the treatment of infections caused by multiresistant Staphylococcus spp.

RESUMO: Staphylococcus spp. são bactérias envolvidas em infecções de humanos e animais, resistentes a antimicrobianos e tem se tornado uma grande preocupação em saúde pública. Nos últimos anos houve um aumento significativo de Staphylococcus resistentes à meticilina e a vancomicina é a droga de escolha para o tratamento desses isolados, porém vem apresentando elevação nos valores de Concentração Inibitória Mínima (CIM) necessários para combater este microrganismo. O objetivo do presente trabalho foi determinar o perfil de suscetibilidade à vancomicina para isolados de Staphylococcus spp. de animais domésticos e silvestres pelas técnicas de Microdiluição em caldo e E-test®, bem como comparar os resultados de ambos os testes. Dos 50 isolados testados 47 (94%) foram sensíveis à vancomicina na Microdiluição e 43 (86%) foram sensíveis à vancomicina no E-test®. Sete (14%) isolados tiveram resultado intermediário demonstrando um risco à saúde pública visto que a detecção destes isolados pode preceder a ocorrência de isolados resistentes à vancomicina. Ademais o gene mecA foi detectado em 78% das amostras testadas, sendo que dos sete isolados com resistência intermediária à vancomicina, seis eram portadores do gene mecA, evidenciando que esses isolados possuem potencial risco de se tornarem resistentes. Dessa forma medidas de controle devem ser tomadas para evitar a propagação destes isolados com resistência intermediária e preservar a eficácia deste antimicrobiano para o tratamento de infecções causadas por Staphylococcus multirresitentes.

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O presente trabalho teve como objetivos: a) avaliar a atividade antimicrobiana dos extratos naturais de alecrim, bardana, romã e cavalinha, sobre oito cepas de micro-organismos multirresistentes de Acinetobacter baumanii em cultura planctônica, verificando a concentração inibitória mínima e concentração microbicida mínima (CIM e CMM); b) avaliar a atividade antibiofilme dos extratos que apresentaram atividade antimicrobiana em cultura planctônica sobre cepas multirresistentes de A. baumanii no tempo de 5 minutos; c) avaliar a citotoxicidade das concentrações mais efetivas dos extratos que apresentaram atividade antimicrobiana nos testes em cultura planctônica sobre queratinócitos, em ensaio da atividade mitocondrial celular pelo método MTT, no tempo de 5 minutos. Para a determinação da CIM e CMM dos extratos utilizou-se o método de microdiluição em caldo, segundo Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), norma M27-A21 (CLSI, 2002) suplementada por M27-S4 (CLSI, 2012). Este teste foi realizado sobre 8 cepas clínicas de Acinetobacter baumanii e 4 extratos, perfazendo 32 grupos experimentais (n=8). Os extratos que apresentaram ação bacteriostática ou bactericida nos testes anteriores foram avaliados sobre biofilmes monomicrobianos (8 cepas clínicas de Acinetobacter baumanii), no tempo de contato de cinco minutos. As concentrações dos extratos, que apresentaram ação anti-biofilme sobre as cepas bacterianas analisadas, foram submetidas à análise de citotoxicidade em queratinócitos humanos. A avaliação foi realizada por meio do teste colorimétrico MTT, que analisou a atividade mitocondrial celular, após contato dos extratos por 5 min. Os resultados foram analisados estatisticamente por ANOVA e Tukey Test, sendo considerada diferença estatística significativa quando p ≤ 0,05. O extrato de romã apresentou CIM e CMM para todas as cepas analisadas, em quanto o extrato de alecrim apresentou CIM e CMM para 6 cepas das 8 analisadas, ambos apresentaram redução de biofilme, entretanto, romã foi o que apresentou as maiores reduções para a maioria das cepas. O extrato de romã apresentou viabilidade celular superior a 80% na maioria das concentrações e o alecrim apresentou viabilidade celular para 5 concentrações das 8 analisadas. Com isso pode-se concluir que o extrato de romã apresentou um melhor resultado comparado aos outros extratos, pois demonstrou uma significativa atividade antimicrobiana e antibiofilme e ausência de toxicidade conforme tempo de aplicação e concentração utilizada contra as cepas clínicas multirresistentes de Acinetobacter baumanni, podendo ser considerado potencial agente terapêutico para o combate destes patógenos(AU)

The objective of the present work was: a) to evaluate the antimicrobial activity of the natural extracts of rosemary, burdock, pomegranate and horsetail on eight strains of multidrug resistant Acinetobacter baumanii microorganisms in planktonic culture, verifying the minimum inhibitory concentration and minimum microbicidal concentration (MIC) and CMM); b) evaluate the antibiofilm activity of extracts that showed antimicrobial activity in planktonic culture on multi-resistant strains of A. baumanii within 5 minutes; c) to evaluate the cytotoxicity of the most effective concentrations of the extracts that showed antimicrobial activity in the tests in planktonic culture on keratinocytes, in an assay of cellular mitochondrial activity by the MTT method, in 5 minutes. For the determination of the minimum inhibitory (MIC) and minimum microbicidal (CMM) concentrations of the extracts, the broth microdilution method according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), standard M27-A21 (CLSI, 2002) supplemented by M27 was used. -S4 (CLSI, 2012). This test was performed on 8 clinical strains of Acinetobacter baumanii and 4 extracts, making 32 experimental groups (n = 8). The extracts that showed bacteriostatic or bactericidal action in the previous tests were evaluated on monomicrobial biofilms (8 clinical strains of Acinetobacter baumanii) at contact time of 5 minutes. The concentrations of the extracts, which showed anti-biofilm action on the bacterial strains analyzed, were submitted to cytotoxicity analysis in human kerotinocytes. The evaluation was performed by the MTT colorimetric test, which analyzed the mitochondrial cellular activity, after contact of the extracts for 5 min. The results were statistically analyzed by ANOVA and Tukey Test, being considered statistically significant difference when p ≤ 0.05. Pomegranate extract showed MIC and CMM for all strains analyzed, while rosemary extract showed MIC and CMM for 6 strains of the 8 analyzed, both showed reduced biofilm, however, pomegranate was the one that showed the greatest reductions for most of the strains. Pomegranate extract showed cell viability greater than 80% in most concentrations and rosemary showed cell viability for 5 concentrations of the 8 analyzed.Therefore it can be concluded that the pomegranate extract presented a better result compared to the other extracts, since it demonstrated a significant antimicrobial and antibiofilm activity and absence of toxicity according to the time of application and concentration used against the multidrug-resistant clinical strains of Acinetobacter baumanni, which can be considered a potential therapeutic agent to combat these pathogens(AU)

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Abstract Different methodologies have been developed throughout the years to identify environmental microorganisms to improve bioremediation techniques, determine susceptibility profiles of bacteria in contaminated environments, and reduce the impact of microorganisms in ecosystems. Two methods of bacterial biochemical identification are compared and the susceptibility profile of bacteria, isolated from residential and industrial wastewater, is determined. Twenty-four bacteria were retrieved from the bacteria bank of the Environmental Microbiology Laboratory at the Institute of Biology (IB) of the Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, Brazil. Bacteria were identified by conventional biochemical tests and by the VITEK ®2 automated system. Further, the susceptibility profile to antibiotics was also determined by the automated system. Six species of bacteria (Raoutella planticola, K. pneumoniae ssp. pneumoniae , Serratia marcescens, Raoutella sp., E. cloacae and Klebsiella oxytoca) were identified by conventional biochemical tests, while three species of bacteria (K. pneumoniae ssp. pneumoniae, S. marcescens and K. oxytoca ) were identified by VITEK®2 automated system. VITEK ®2 indicated agreement in 19 (79.17%) isolates and difference in five (20.83%) isolates when compared to results from conventional biochemical tests. Further, antibiotic susceptibility profile results showed that all isolates (100%) were resistant to at least one out of the 18 antibiotics tested by VITEK®2. Thus, no multi-resistant bacteria that may be used in effluent treatment systems or in bioremediation processes have been reported. Results indicate VITEK ® 2 automated system as a potential methodology in the determination of susceptibility profile and identification of environmental bacteria.

Resumo Diferentes metodologias foram desenvolvidas ao longo dos anos para identificar microrganismos ambientais para melhorar as técnicas de biorremediação, determinar perfis de suscetibilidade de bactérias em ambientes contaminados e reduzir o impacto de microrganismos nos ecossistemas. Dois métodos de identificação bioquímica bacteriana são comparados e o perfil de susceptibilidade de bactérias, isoladas de efluentes residenciais e industriais, é determinado. Vinte e quatro bactérias foram coletadas do banco de bactérias do Laboratório de Microbiologia Ambiental do Instituto de Biologia (IB) da Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, Brasil. As bactérias foram identificadas por testes bioquímicos convencionais e pelo sistema automatizado VITEK®2. Além disso, o perfil de suscetibilidade aos antibióticos também foi determinado pelo sistema automatizado. Seis espécies de bactérias (Raoutella planticola , K. pneumoniae ssp. pneumoniae, Serratia marcescens, Raoutella sp., E. cloacae e Klebsiella oxytoca) foram identificadas por testes bioquímicos convencionais, enquanto três espécies de bactérias (K. pneumoniae ssp. pneumoniae, S. marcescens e K. oxytoca) foram identificados pelo sistema automatizado VITEK®2. VITEK®2 indicou concordância em 19 (79,17%) isolados e diferença em cinco (20,83%) isolados quando comparados aos resultados de testes bioquímicos convencionais. Além disso, os resultados do perfil de suscetibilidade aos antibióticos mostraram que todos os isolados (100%) foram resistentes a pelo menos um dos 18 antibióticos testados pelo VITEK®2. Assim, não foram relatadas bactérias multirresistentes que possam ser usadas em sistemas de tratamento de efluentes ou em processos de biorremediação. Os resultados indicam que o sistema automatizado VITEK ® 2 é uma metodologia potencial na determinação do perfil de suscetibilidade e identificação de bactérias ambientais.

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