Your browser doesn't support javascript.
loading
Mostrar: 20 | 50 | 100
Resultados 1 - 20 de 780
Filtrar
1.
Geriatr Gerontol Aging ; 18: e0000158, Apr. 2024. tab, ilus
Artigo em Inglês, Português | LILACS | ID: biblio-1570290

RESUMO

Objective: To identify how antimicrobials are prescribed in long-term care facilities from the perspective of nurses. Methods: This descriptive study was conducted using an online survey. Participants were selected through conventional sampling methods and online recruitment. Data were collected through a 2-section self-administered questionnaire: the first section characterized the respondent and the institution, while the second investigated the antimicrobial prescription and usage in the institution. Results: Thirty-five responses were received, representing institutions from every state in Brazil. Sixty percent of the institutions had a part-time physician. More than 90% of the respondents said they contacted a prescriber to report signs and symptoms suggestive of infection, which led to subsequent antimicrobial use. Conclusions: The opinion of nurses has a significant impact on the prescriber's decision to begin antibiotic therapy in long-term care facilities, which indicates that nurses need training about the rational use of antimicrobials. (AU)


Objetivo: Identificar como ocorre a indicação de antimicrobianos nas instituições de longa permanência na perspectiva do profissional enfermeiro. Metodologia: Foi realizado um estudo descritivo por meio de um Survey online. Os participantes foram selecionados por meio de amostra convencional e o recrutamento foi realizado por meio de convite online. A coleta de dados foi feita a partir de um questionário autoaplicável constituído de dois blocos: o primeiro contemplando itens para a caracterização do respondente e da instituição; e o segundo, questões relacionadas ao uso e à indicação de antimicrobianos na instituição. Resultados: Foram recebidas 35 respostas, representando instituições de todos os estados brasileiros. A presença de médico em tempo parcial foi apontada em 60% das instituições. Mais de 90% dos participantes apontaram que acontecia o contato com prescritor para o relato de sinais e sintomas sugestivos de infecção apresentados pelo residente, implicando em uso subsequente de antimicrobianos. Conclusões: A opinião do profissional da Enfermagem tem grande impacto na decisão do prescritor em iniciar a antibioticoterapia nas instituições de longa permanência, demonstrando a necessidade de qualificação desse profissional direcionada ao uso racional de antimicrobianos. (AU)


Assuntos
Humanos , Idoso , Idoso de 80 Anos ou mais , Resistência Microbiana a Medicamentos , Instituição de Longa Permanência para Idosos , Enfermagem , Gestão de Antimicrobianos
2.
Vive (El Alto) ; 7(19): 85-92, abr. 2024.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1560632

RESUMO

Introducción: la resistencia antibiótica en bacterias patógenas como Escherichia coli y Klebsiella spp. productoras de betalactamasas, han surgido como un problema global de salud pública. Su presencia, se asocia con infecciones intrahospitalarias y comunitarias, aumentando la morbilidad y la mortalidad de los pacientes. Objetivo: determinar la frecuencia de E.coli y Klebsiella spp productoras de betalactamasas en cultivos procesados en un laboratorio clínico. Métodos: se realizó un estudio descriptivo de diseño documental. La muestra estuvo constituida por un total de 1465 resultados de cultivos positivos para Escherichia coli o Klebsiella spp. en el periodo 2022. Para la recolección de la información, se tuvo acceso a la base de datos anonimizada del laboratorio en una hoja de Excel para su posterior análisis. Los datos fueron tabulados en SPSS versión 25. Resultados: el análisis de bacterias productoras de BLEE mostró una positividad del 22,3% en E. coli y 46,1% en Klebsiella spp. E. coli presentó mayor frecuencia de negativos (77,7%) en comparación con Klebsiella spp. La presencia de E. coli fue más común en muestras de orina (90,6%) y en otras muestras como esputo y heridas cutáneas (21,3%). Se evaluaron 8 antibióticos, y se destacó la alta sensibilidad para amikacina (AK) (99,6% y 98,0%) y elevada resistencia ampicilina (AM) (91,5% y 100%) en ambas especies. Ciprofloxacino (CIP) y Trimetropin/Sulfametoxazol (STX) mostraron relativa frecuencia mayor de resistencia. Conclusión: los resultados muestran una alta frecuencia de bacterias productoras de BLEE en E. coli y Klebsiella spp., con una mayor prevalencia en Klebsiella spp. Además, la resistencia a AM, CIP y STX destaca la importancia de una gestión adecuada de la resistencia antimicrobiana.


Introduction: antibiotic resistance in pathogenic bacteria such as Escherichia coli and Klebsiella spp. producing beta-lactamases has emerged as a global public health problem. Their presence has been associated with both hospital-acquired and community-acquired infections, leading to increased morbidity and mortality in patients. Objective: to determine the frequency of betalactamase-producing E. coli and Klebsiella spp. in cultures processed in a clinical laboratory. Methods: a descriptive documentary design study was conducted. The sample consisted of a total of 1465 positive culture results for Escherichia coli or Klebsiella spp. in the year 2022. Data collection involved accessing the laboratory's anonymized database in an Excel sheet for subsequent analysis. The data were tabulated in SPSS version 25. Results: the analysis of ESBL-producing bacteria showed a positivity of 22.3% in E. coli and 46.1% in Klebsiella spp. E. coli showed a higher frequency of negatives (77.7%) compared to Klebsiella spp. The presence of E. coli was more common in urine samples (90.6%) and in other samples such as sputum and skin wounds (21.3%). Eight antibiotics were evaluated, with high sensitivity noted for amikacin (AK) (99.6% and 98.0%) and high resistance for ampicillin (AM) (91.5% and 100%) in both species. Ciprofloxacin (CIP) and Trimethoprim/Sulfamethoxazole (STX) showed a relatively higher frequency of resistance. Conclusion: the results show a high frequency of ESBL-producing bacteria in E. coli and Klebsiella spp., with a higher prevalence in Klebsiella spp. Furthermore, the resistance to AM, CIP, and STX highlights the importance of proper management of antimicrobial resistance.


Introdução: a resistência antibiótica em bactérias patogênicas como Escherichia coli e Klebsiella spp., produtoras de beta-lactamases, emergiu como um problema de saúde pública global. Sua presença tem sido associada a infecções hospitalares e comunitárias, aumentando a morbidade e a mortalidade dos pacientes. Objetivo: determinar a frequência de E. coli e Klebsiella spp. produtoras de betalactamase em culturas processadas em laboratório clínico. Métodos: foi realizado um estudo descritivo de design documental. A amostra consistiu em um total de 1465 resultados de cultura positiva para Escherichia coli ou Klebsiella spp. no ano de 2022. A coleta de dados envolveu o acesso ao banco de dados anonimizado do laboratório em uma planilha do Excel para análise subsequente. Os dados foram tabulados na versão 25 do SPSS. Resultados: a análise de bactérias produtoras de BLEE mostrou uma positividade de 22,3% em E. coli e 46,1% em Klebsiella spp. E. coli apresentou uma frequência maior de resultados negativos (77,7%) em comparação com Klebsiella spp. A presença de E. coli foi mais comum em amostras de urina (90,6%) e em outras amostras, como escarro e feridas na pele (21,3%). Foram avaliados oito antibióticos, com alta sensibilidade observada para amicacina (AK) (99,6% e 98,0%) e alta resistência para ampicilina (AM) (91,5% e 100%) em ambas as espécies. Ciprofloxacina (CIP) e Trimetoprima/Sulfametoxazol (STX) mostraram uma frequência relativamente maior de resistência. Conclusão: os resultados mostram uma alta frequência de bactérias produtoras de BLEE em E. coli e Klebsiella spp., com uma maior prevalência em Klebsiella spp. Além disso, a resistência a AM, CIP e STX destaca a importância da adequada gestão da resistência antimicrobiana.

3.
An. Fac. Med. (Perú) ; 85(1): 85-91, ene.-mar. 2024. tab
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1556807

RESUMO

RESUMEN La Resistencia a los Antimicrobianos (RAM) es un problema de salud pública de alcance global. De no lograrse contener su propagación, para el año 2050 se convertiría en la primera causa de muerte a nivel mundial, con un serio impacto en la economía mundial. Esta situación ha determinado la aplicación del enfoque «Una Salud¼ para su contención. Este enfoque reconoce que la salud de las personas, los animales, las plantas y el medio ambiente están estrechamente relacionados y son interdependientes. Desde el año 2015, la Organización Mundial de la Salud, en coordinación con otras organizaciones aprobaron el Plan de Acción Mundial para enfrentar la RAM, esto determinó que los estados miembros elaboraran e implementaran sus planes nacionales. El Perú inició el abordaje para la contención de la RAM aplicando el enfoque «Una Salud¼ desde el año 2017. Se registran algunos avances en la implementación de Plan nacional pero también los retos y acciones pendientes de alcanzar.


ABSTRACT Antimicrobial Resistance (AMR) is a public health problem of global scope, whose projections if its spread is not contained indicate that by the year 2050 it would become the leading cause of death worldwide with a serious impact on the world economy. This situation has determined the application of the "One Health" approach for its containment. The approach recognizes that the health of people, animals, plants and the environment are closely related and interdependent. Since 2015, the WHO, in coordination with other organizations, approved the Global Action Plan to face AMR, this determined that the Member States elaborate and implement their national plans. Peru began the approach to contain AMR applying the "One Health" approach since 2017. Some progress has been made in the implementation of the National Plan but also the challenges and actions pending to be achieved.

4.
Rev. epidemiol. controle infecç ; 14(1): 31-37, jan.-mar. 2024. ilus
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1567545

RESUMO

Background and Objectives: bacterial resistance is an important public health problem worldwide and is related to the indiscriminate use of antimicrobials, limiting the available therapeutic options. The COVID-19 pandemic aggravated this scenario, since the lack of a standardized therapy led to a considerable increase in the prescription of these drugs. Therefore, we proposed to investigate the prevalence of bacterial infections and the profile of antimicrobial resistance in patients diagnosed with COVID-19 as well as to point out possible risk factors. Methods: a retrospective study based on the analysis of medical records of patients hospitalized with COVID-19 over the age of 18. Information such as age, gender, length of stay, hospitalization unit, bacterial species and resistance profile and previous use of antimicrobials by patients diagnosed with COVID-19 were collected and analyzed using Excel® 2016. Results: of the 268 patients with COVID-19, 162 had suspected bacterial infections, and 26 patients (9.7%) were confirmed from positive cultures. Furthermore, around 80% of these patients underwent empirical treatment with antimicrobials, the majority of whom were male and admitted to the Intensive Care Unit. A total of 32 bacterial isolates were recovered, of which 59.4% were resistant to at least one class of antimicrobials, with 21.8% being multidrug resistant. Conclusion: despite the low percentage found of patients with COVID-19 who had bacterial infections and of these 21.8% were by multidrug-resistant bacteria, the reinforcement in infection prevention policies and the adequate management in the release of antimicrobials is necessary to reduce the hospital dissemination rates of such bacteria.(AU)


Justificativa e Objetivos: a resistência bacteriana é um importante problema de saúde pública mundial relacionado ao uso indiscriminado de antimicrobianos, limitando as opções terapêuticas disponíveis. A pandemia de COVID-19 agravou esse cenário, uma vez que a falta de uma terapia padronizada resultou no aumento considerável na prescrição desses fármacos. Diante disso, propôs-se investigar a prevalência de infecções bacterianas e o perfil de resistência aos antimicrobianos em pacientes diagnosticados com COVID-19, bem como apontar possíveis fatores de risco. Métodos: estudo retrospectivo baseado na análise de prontuários de pacientes internados com COVID-19 com idade superior a 18 anos. Informações como idade, gênero, tempo de internação, unidade de internação, espécie bacteriana e perfil de resistência e uso prévio de antimicrobianos pelos pacientes diagnosticados com COVID-19 foram coletadas e analisadas pelo software Excel® 2016. Resultados: dos 268 pacientes com COVID-19, 162 apresentaram suspeitas de infecções bacterianas, sendo 26 pacientes (9,7%) confirmados a partir de culturas positivas. Ainda, cerca de 80% desses pacientes realizaram tratamento empírico com antimicrobianos, sendo a maioria do sexo masculino e internados em Unidade de Terapia Intensiva. Foram recuperados um total de 32 isolados bacterianos, dos quais 59,4% apresentaram resistência a pelo menos uma classe de antimicrobianos, sendo 21,8% multidroga resistente. Conclusão: apesar do baixo percentual encontrado de pacientes com COVID-19 que apresentaram infecções bacterianas e, desses, 21,8% serem causados por bactérias multirresistentes, o reforço nas políticas de prevenção de infecções e o adequado gerenciamento na liberação de antimicrobianos se fazem necessários para a redução das taxas de disseminação hospitalar de tais bactérias.(AU)


Justificación y Objetivos: la resistencia bacteriana es un importante problema de salud pública en todo el mundo y está relacionada con el uso indiscriminado de antimicrobianos, lo que limita las opciones terapéuticas disponibles. La pandemia por COVID-19 agravó este escenario, ya que la falta de una terapia estandarizada llevó a un aumento considerable en la prescripción de estos fármacos. Por ello, nos propusimos investigar la prevalencia de infecciones bacterianas y el perfil de resistencia antimicrobiana en pacientes diagnosticados de COVID-19, así como señalar posibles factores de riesgo. Métodos: estudio retrospectivo basado en el análisis de historias clínicas de pacientes hospitalizados con COVID-19 mayores de 18 años. Información como edad, sexo, duración de la estadía, unidad de hospitalización, especies bacterianas y perfil de resistencia y uso previo de antimicrobianos por parte de pacientes diagnosticados con COVID-19 fueron recopiladas y analizadas mediante el software Excel® 2016. Resultados: de los 268 pacientes con COVID-19, 162 tenían sospecha de infección bacteriana, con 26 pacientes (9,7%) confirmada a partir de cultivos positivos. Además, alrededor del 80% de estos pacientes recibieron tratamiento empírico con antimicrobianos, la mayoría de los cuales eran hombres e ingresaron en la Unidad de Cuidados Intensivos. Se recuperaron un total de 32 aislados bacterianos, de los cuales el 59,4% eran resistentes a al menos una clase de antimicrobianos y el 21,8% eran resistentes a múltiples fármacos. Conclusión: a pesar del bajo porcentaje encontrado de pacientes con COVID-19 que presentaron infecciones bacterianas, y de éstas cerca del 21,8% fueron por bacterias multirresistentes, es necesario reforzar las políticas de prevención de infecciones y una gestión adecuada en la liberación de antimicrobianos para reducir las tasas de diseminación hospitalaria de dichas bacterias.(AU)


Assuntos
Humanos , Infecções Bacterianas , Resistência Microbiana a Medicamentos , Infecção Hospitalar , COVID-19/complicações , Pacientes Internados
5.
Rev. epidemiol. controle infecç ; 14(1): 81-87, jan.-mar. 2024. ilus
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1567543

RESUMO

Background and Objectives: antimicrobial resistance is one of the main public health concerns worldwide. Intensive Care Units have a high prevalence of resistant microorganisms and infections, and the rational use of antibiotics is one of the main strategies for tackling this problem. This work aimed to describe patterns associated with antimicrobial drugs as well as the resistance profile of microorganisms. Methods: an observational study was carried out using data from patients hospitalized in the Intensive Care Unit who used antimicrobial agents. Results: respiratory and cardiological causes were the most frequent reasons for admission, with cephalosporins (29.02%), with penicillin (25.84%) and macrolides (16.10%) being the most used classes of antibiotics. The predominant microorganisms were Klebsiella pneumoniae (13.98%), Staphylococcus aureus (13.44%) and Acinetobacter baumannii (11.83%). Urine cultures and tracheal aspirate were the culture tests with the highest growth of gram-negative microorganisms. Patients with bacteria isolated in tracheal aspirate had longer hospital stays; 20 patients had positive surveillance cultures; and the mortality rate found was 55.45%. Conclusion: the study combined the institution's epidemiological profile with patient characteristics, isolated microorganisms and outcomes.(AU)


Justificativa e Objetivos: a resistência antimicrobiana é uma das principais preocupações de saúde pública em todo o mundo. As Unidades de Terapia Intensiva têm uma alta prevalência de microorganismos resistentes e infecções, e o uso racional de antibióticos é uma das principais estratégias para lidar com esse problema. Este trabalho teve como objetivo descrever padrões associados a medicamentos antimicrobianos, bem como o perfil de resistência dos microorganismos. Métodos: foi realizado um estudo observacional utilizando dados de pacientes hospitalizados na Unidade de Terapia Intensiva que utilizaram agentes antimicrobianos. Resultados: causas respiratórias e cardiológicas foram os motivos mais frequentes de admissão, com cefalosporinas (29,02%), penicilina (25,84%) e macrolídeos (16,10%) sendo as classes de antibióticos mais utilizadas. Os microorganismos predominantes foram Klebsiella pneumoniae (13,98%), Staphylococcus aureus (13,44%) e Acinetobacter baumannii (11,83%). Culturas de urina e aspirado traqueal foram os testes de cultura com maior crescimento de microorganismos gram-negativos. Pacientes com bactérias isoladas no aspirado traqueal tiveram internações mais longas; 20 pacientes tiveram culturas de vigilância positivas; e a taxa de mortalidade encontrada foi de 55,45%. Conclusão: o estudo combinou o perfil epidemiológico da instituição com características dos pacientes, microorganismos isolados e resultados.(AU)


Antecedentes y Objetivos: la resistencia antimicrobiana es una de las principales preocupaciones de salud pública en todo el mundo. Las Unidades de Cuidados Intensivos tienen una alta prevalencia de microorganismos resistentes e infecciones, y el uso racional de antibióticos es una de las principales estrategias para abordar este problema. Este trabajo tuvo como objetivo describir patrones asociados con medicamentos antimicrobianos, así como el perfil de resistencia de los microorganismos. Métodos: se llevó a cabo un estudio observacional utilizando datos de pacientes hospitalizados en la Unidad de Cuidados Intensivos que utilizaron agentes antimicrobianos. Resultados: las causas respiratorias y cardiológicas fueron las razones más frecuentes de admisión, con cefalosporinas (29,02%), penicilina (25,84%) y macrólidos (16,10%) siendo las clases de antibióticos más utilizadas. Los microorganismos predominantes fueron Klebsiella pneumoniae (13,98%), Staphylococcus aureus (13,44%) y Acinetobacter baumannii (11,83%). Los cultivos de orina y el aspirado traqueal fueron las pruebas de cultivo con mayor crecimiento de microorganismos gramnegativos. Los pacientes con bacterias aisladas en el aspirado traqueal tuvieron estancias hospitalarias más largas; 20 pacientes tuvieron cultivos de vigilancia positivos; y la tasa de mortalidad encontrada fue del 55,45%. Conclusión: el estudio combinó el perfil epidemiológico de la institución con las características de los pacientes, los microorganismos aislados y los resultados.(AU)


Assuntos
Humanos , Prescrições de Medicamentos , Brasil , Resistência Microbiana a Medicamentos , Farmacorresistência Bacteriana , Testes Laboratoriais , Unidades de Terapia Intensiva , Antibacterianos , Uso de Medicamentos
6.
J. Health Biol. Sci. (Online) ; 12(1): 1-9, jan.-dez. 2024. tab
Artigo em Português | LILACS | ID: biblio-1554635

RESUMO

Objetivo: analisar o perfil de micro-organismos presentes e resistência destes aos antimicrobianos em uroculturas de pacientes transplantados renais no período de 2021-2022. Métodos: trata-se de um estudo transversal com análise quantitativa dos dados de uroculturas positivas de pacientes transplantados renais, acompanhados no Hospital Geral de Fortaleza entre janeiro de 2021 a dezembro de 2022. Foi empregado um instrumento de pesquisa elaborado, contendo variáveis classificatórias, e os dados foram obtidos por meio de registros das uroculturas existentes no sistema de prontuário eletrônico utilizado pelo hospital. Resultados: das 534 uroculturas solicitadas, 36,7% apresentaram resultado positivo, sendo 60,4% de mulheres com idades entre 20 e 59 anos. A maioria dos casos foram desenvolvidos por pacientes que receberam acompanhamento ambulatorial (56,2%). Os micro-organismos isolados foram, predominantemente, enterobactérias (81,34%), com prevalência de E.coli (69,30%). Os perfis de sensibilidade antimicrobiana variaram, com a resistência da E.coli a antibióticos como ampicilina, ácido nalidíxico, norfloxacino e ciprofloxacino. Conclusões: essas descobertas fornecem informações importantes sobre métodos clínicos específicos, métodos preventivos e melhorias na qualidade de vida dos transplantados renais.


Objective: to analyze the profile of microorganisms present and their resistance to antimicrobials in urocultures of renal transplant patients in 2021-2022. Methods: it is a cross-sectional study with quantitative data analysis from positive urocultures of renal transplant patients accompanied at the General Hospital of Fortaleza between January 2021 and December 2022. An elaborate research instrument containing classification variables was employed, and the data were obtained through records of the urocultures existing in the electronic checkbook system used by the hospital. Results: of the 534 urocultures requested, 36.7% showed a positive result, of which 60.4% were women aged between 20 and 59. Most cases were developed by patients who received outpatient follow-up (56.2%). The isolated microorganisms were predominantly enterobacteria (81.34%), with the prevalence of E.coli (69.30%). Antimicrobial sensitivity profiles varied, with E.coli resistance to antibiotics such as ampicillin, nalidixic acid, norfloxacin, and ciprofloxacin. Conclusion: these findings provide important information about specific clinical methods, preventive methods, and improvements in the quality of life of renal transplant patients.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Microbiota , Transplantados , Anti-Infecciosos , Pacientes , Rim
7.
Braz. j. biol ; 84: e256673, 2024. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1403861

RESUMO

The analysis of curated genomic, metagenomic and proteomic data is of paramount importance in the fields of biology, medicine, education, and bioinformatics. Although this type of data is usually hosted in raw format on free international repositories, the full access requires lots of computing power and large storage disk space for the domestic user. The purpose of the study is to offer a comprehensive set of microbial genomic and proteomic reference databases in an accessible and easy-to-use form to the scientific community and demonstrate its advantages and usefulness. Also, we present a case study on the applicability of the sketched data, for the determination of overall genomic coherence between two members of the Brucellacea family, which suggests they belong to the same genomospecies that remain as discrete ecotypes. A representative set of genomes, proteomes (from type material), and metagenomes were directly collected from the NCBI Assembly database and Genome Taxonomy Database (GTDB), associated with the major groups of Bacteria, Archaea, Virus, and Fungi. Sketched databases were subsequently created and stored on handy reduced representations by using the MinHash algorithm implemented in Mash software. The obtained dataset contains more than 133 GB of space disk reduced to 883.25 MB and represents 125,110 genomics/proteomic records from eight informative contexts, which have been prefiltered to make them accessible, usable, and user-friendly with limited computational resources. Potential uses of these sketched databases are discussed, including but not limited to microbial species delimitation, estimation of genomic distances and genomic novelties, paired comparisons between proteomes, genomes, and metagenomes; phylogenetic neighbor's exploration and selection, among others.


A análise de dados genômicos, metagenômicos e proteômicos com curadoria é de suma importância nos campos da biologia, medicina, educação e bioinformática. Embora esse tipo de dados geralmente seja hospedado em formato bruto em repositórios internacionais gratuitos, o acesso total requer muita capacidade de computação e grande espaço em disco de armazenamento para o usuário doméstico. Os objetivos do estudo são oferecer um conjunto abrangente de bancos de dados de referência genômica e proteômica microbiana de forma acessível e fácil de usar para a comunidade científica e demonstrar suas vantagens e utilidade. Além disso, apresentamos um estudo de caso sobre a aplicabilidade dos dados esboçados para a determinação da coerência genômica geral entre dois membros da família Brucellacea, o que sugere que eles pertencem às mesmas genomoespécies que permanecem como ecótipos discretos. Um conjunto representativo de genomas, proteomas (de material tipo) e metagenomas foi coletado diretamente do banco de dados NCBI Assembly e do banco de dados de taxonomia do genoma (GTDB), associada aos principais grupos de bactérias, Archaea, vírus e fungos. Bancos de dados esboçados foram subsequentemente criados e armazenados em representações reduzidas práticas usando o algoritmo MinHash implementado no software Mash. O conjunto de dados obtido contém mais de 133 GB de espaço em disco reduzido para 883,25 MB e representa 125,110 registros genômicos/proteômicos de oito contextos informativos, que foram pré-filtrados para torná-los acessíveis, utilizáveis ​​e amigáveis ​​com recursos computacionais limitados. Os usos potenciais desses bancos de dados esboçados são discutidos, incluindo, mas não se limitando, a delimitação de espécies microbianas, estimativa de distâncias genômicas e novidades genômicas, comparações emparelhadas entre proteomas, genomas e metagenomas, exploração e seleção filogenética de vizinhos, entre outros.


Assuntos
Classificação , Genoma , Genes Microbianos
8.
Odontoestomatol ; 26(43)2024.
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1558610

RESUMO

Objetivos. Explorar el efecto de las características de superficie sobre el volumen total y la viabilidad de la biopelícula formada sobre pilares de cicatrización de PEEK y titanio. Métodos. Los parámetros de rugosidad (S a y S k) y la energía superficial de pilares de cicatrización de PEEK y titanio (n=3) fueron determinados mediante microscopía confocal láser de barrido (CLSM) y ángulo de contacto, respectivamente. Se determinó luego el volumen total y la viabilidad de una biopelícula bacteriana multiespecie cultivada por 30 días, mediante CLSM y el reactivo LIVE/DEAD Kit BacLight. El tamaño del efecto se determinó mediante d de Cohen. Resultados. Los pilares de PEEK mostraron una mayor rugosidad que los de titanio (S a 0,41 µm vs 0,17 µm), pero no se observaron diferencias en la energía superficial. Si bien el volumen total de biopelícula fue mayor en titanio que en PEEK (696 µm3 vs 419 µm3), no hubo diferencias en la proporción de bacterias vivas entre ambos materiales. Conclusiones. La viabilidad de la biopelícula bacteriana formada no guarda relación directa con las características superficiales de pilares de cicatrización de PEEK y titanio.


Objetivo. Explorar o efeito das características da superfície no volume total e viabilidade do biofilme formado em PEEK e pilares de cicatrização de titânio. Métodos. Parâmetros de rugosidade (S a e S k) e energia de superfície de PEEK e pilares de titânio (n = 3) foram determinados por microscopia confocal de varredura a laser (CLSM) e ângulo de contato, respectivamente. O volume total e a viabilidade de um biofilme bacteriano multiespécie cultivado por 30 dias foram então determinados usando CLSM e o reagente LIVE/DEAD Kit BacLight. O tamanho do efeito foi determinado usando o d de Cohen. Resultados. Os pilares de PEEK mostraram maior rugosidade do que os de titânio (S a 0,41 µm vs 0,17 µm), mas não foram observadas diferenças na energia de superfície. Embora o volume total de biofilme tenha sido maior no titânio do que no PEEK (696 µm3 vs 419 µm3), não houve diferenças na proporção de bactérias vivas entre os dois materiais. Conclusões. A viabilidade do biofilme bacteriano formado não está diretamente relacionada às características da superfície dos pilares de cicatrização de PEEK e titânio.


Objectives . To explore the effect of surface characteristics on the total volume and viability of a bacterial biofilm developed on the surface of PEEK and titanium healing abutments. Methods. Surface parameters S a and S k, as well as the surface energy of PEEK and titanium healing abutments (n=3) were determined using confocal laser scanning microscopy (CLSM) and contact angle, respectively. The total volume and viability of a multispecies bacterial biofilm cultivated for 30 days were determined using CLSM and the LIVE/DEAD BacLight reactive kit. Effect size was determined using Cohen's d. Results. PEEK healing abutments displayed a higher surface roughness than titanium (S a 0.41 µm vs 0.17 µm), although no differences in surface energy were observed. Despite the higher total volume of the biofilm measured on titanium abutments compared to PEEK (696 µm3 vs 419 µm3), no differences in the live/dead bacterial ratio were observed. Conclusions. Bacterial viability of the biofilm did not show a direct relation to the surface characteristics of PEEK and titanium healing abutments.

9.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 41(2): 164-170, 2024. tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1567281

RESUMO

El objetivo fue determinar la presencia de genes de resistencia a carbapenémicos y resistencia plasmídica a colistina (mcr-1) en bacterias aisladas de Musca domestica en un basural cercano a un hospital de Lima, Perú. Las bacterias con resistencia fenotípica a los carbapénemicos se aislaron en medio CHROMagar mSu-perCARBATM y el perfil de resistencia a colistina se realizó mediante el método de elución de discos de co-listina. La detección de genes blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaOXA-48, blaVIM y mcr-1 se realizó mediante PCR convencional. El perfil de susceptibilidad antimicrobiana se determinó mediante el sistema automati-zado MicroScan. Las bacterias con resistencia fenotípica a carbapenémicos fueron 31/38 cepas y a colistina fueron 26/38 cepas con una concentración inhibitoria mínima ≥ 4 µg/ml. Finalmente, se identificaron siete cepas bacterianas con genes de resistencia a carbapenémicos (OXA-48 Y KPC) y una cepa bacteriana con resistencia plasmídica a colistina (mcr-1). Una cepa de Escherichia coli presentó tres genes de resistencia: KPC, OXA-48 y mcr-1.


Assuntos
Resistência Microbiana a Medicamentos , Testes de Sensibilidade Microbiana , Reação em Cadeia da Polimerase , Suscetibilidade a Doenças
10.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);43(4): 457-473, dic. 2023. tab, graf
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1533958

RESUMO

Introducción. El comportamiento de la resistencia antimicrobiana es fundamental en el mejoramiento y ajuste de los programas de optimización de uso de antimicrobianos, la implementación de las guías terapéuticas y las precauciones que limitan la transmisión cruzada de bacterias resistentes entre pacientes. Desde el inicio del 2020, la pandemia del SARS-CoV-2 desafió profundamente al sistema de salud y, según algunos reportes, aumentó las tasas de resistencia antimicrobiana. Objetivo. Describir el comportamiento de la resistencia antimicrobiana en los microrganismos más frecuentes en veinte hospitales colombianos durante el periodo 2018-2021. Materiales y métodos. Se trata de un estudio descriptivo basado en la información microbiológica reportada por veinte instituciones de salud de nivel III y IV, entre enero de 2018 y diciembre de 2021, en doce ciudades de Colombia, las cuales hacen parte del "Grupo para el estudio de la resistencia nosocomial en Colombia", liderado por la Universidad El Bosque. La identificación de género y especie de los microorganismos más frecuentes, junto con su perfil de resistencia frente a antibióticos marcadores, se determinaron mediante el análisis de los datos vía WHONET. Resultados. En general, los 10 microorganismos más frecuentes analizados a lo largo de los 4 años no presentaron cambios estadísticamente significativos en sus perfiles de resistencia durante los cuatro años del periodo evaluado, de 2018 a 2021. En contraste, Pseudomonas aeruginosa aumentó su resistencia frente a piperacilinatazobactam y carbapenémicos, lo cual fue estadísticamente significativo. Conclusiones. Los cambios en la resistencia antimicrobiana en estos años no han sido estadísticamente significativos, excepto para P. aeruginosa, bacteria que mostró un incremento en las tasas de resistencia a piperacilina-tazobactam y carbapenémicos.


Introduction. Antimicrobial resistance surveillance is a fundamental tool for the development, improvement, and adjustment of antimicrobial stewardship programs, therapeutic guidelines, and universal precautions to limit the cross-transmission of resistant bacteria between patients. Since the beginning of 2020, the SARS-CoV-2 pandemic profoundly challenged the health system and, according to some reports, increased the rates of antimicrobial resistance. Objective. To describe the behavior of antimicrobial resistance of the most frequent bacterial pathogens in twenty Colombian hospitals from January 2018 to December 2021. Materials and methods. We conducted a descriptive study based on the microbiological information recorded from January 2018 to December 2021 in twenty levels III and IV health institutions in twelve Colombian cities. We identified the species of the ten most frequent bacteria along with their resistance profile to the antibiotic markers after analyzing the data through WHONET. Results. We found no statistically significant changes in most pathogens' resistance profiles from January 2018 to December 2021. Only Pseudomonas aeruginosa had a statistically significant increase in its resistance profile, particularly to piperacillin/ tazobactam and carbapenems. Conclusions. The changes in antimicrobial resistance in these four years were not statistically significant except for P. aeruginosa to piperacillin/tazobactam and carbapenems.


Assuntos
Resistência Microbiana a Medicamentos , Colômbia , Monitoramento Epidemiológico
11.
Saúde Pesqui. (Online) ; 16(3): 11811, jul./set. 2023.
Artigo em Inglês, Português | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1518296

RESUMO

A humanidade foi impactada por uma Pandemia que expôs a população ao contato com um vírus de elevado contágio e com o índice de letalidade alarmante. Este estudo objetivou avaliar a possibilidade da persistência de material genético do SARS-CoV-2 na superfície dos equipamentos de estabelecimentos de prática de atividades físicas indoor e outdoor. Foram coleta das amostras de equipamentos utilizados para a prática de exercícios físicos em cinco academias, cinco praças e entre os frequentadores desses ambientes. Aplicou-se a técnica RT-PCR para a detecção doRNA do SARS-CoV-2 e posterior análise dos resultadose foi detectada a existência de partículas de RNA viral do SARS-CoV-2 em 48,57% das amostras coletadas dos equipamentos das academias e 12,85% das amostras coletadas nas praças, evidenciando uma incidência menor em equipamentos utilizados em locais abertos em todas as áreas comparadas.Além disso, constatou-se que 35,7% dos participantes do estudo testaram positivo para COVID-19.Os casos positivos para COVID-19 detectados apresentaram sintomas classificados como levesa moderados e uma recuperação rápida.A presença de material genético nos equipamentos,por sua vez, leva-nos a perceber a importância da higienização adequada das superfícies, como forma de prevenção.


Humanity was impacted by a Pandemic that exposed the population to contact with a highly contagious virus with an alarming lethality rate. The present study aimed to evaluate the possibility of the persistence of genetic material from SARS-CoV-2 on the surface of equipment used to practice indoor and outdoor physical activities. A sample of equipment used for the practice of physical activity was collected in five gyms and five squares and among the regulars of these environments. The RT-PCR technique was applied to detect the RNA of SARS-CoV-2 and subsequent analysis of the results. The existence of SARS-CoV-2 viral RNA particles was detected in 48.57% of the samples collected from gym equipment and 12.85% of the samples collected in squares, evidencing a lower incidence in equipment used in open spaces in all areas compared and it was found that 35.7% of the study participants tested positive for COVID-19. The positive cases for COVID-19 detected, had symptoms classified as mild to moderate and a quick recovery. The presence of genetic material in the equipment, in turn, leads us to realize the importance of proper cleaning of surfaces, as a form of prevention.

12.
Rev. méd. Chile ; 151(9): 1194-1200, sept. 2023. tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1565716

RESUMO

INTRODUCCIÓN: El uso de un esquema antibiótico inadecuado en sepsis aumenta significativamente la morbimortalidad. Este estudio presenta un reporte multicéntrico de susceptibilidad antibiótica en urosepsis asociada a ureterolitiasis, buscando proponer un esquema empírico óptimo para el medio nacional. MÉTODOS: Se realizó un estudio observacional prospectivo en 7 hospitales de 4 regiones del país. Se incluyeron pacientes con criterios de sepsis asociada a ureterolitiasis confirmada radiológicamente. Se registraron sus datos demográficos, signos vitales y laboratorio de ingreso, así como sus estudios microbiológicos y radiológicos, realizándose estadísticas descriptivas de los datos obtenidos. RESULTADOS: Se ingresaron 119 pacientes, de los cuales 52 cumplieron criterios de inclusión. 77% eran mujeres, con una edad promedio de 52 años. Se tomaron hemocultivos en el 48,7% de los casos y urocultivos en el 100%. El microorganismo más común fue Escherichia coli (73%), seguido por Proteus mirabilis (9,6%) y Klebsiella pneumoniae (3,9%). Hubo dos casos de bacterias gram positivas. El 100% de las bacterias gram negativas fueron sensibles a amikacina. CONCLUSIÓN: Los microorganismos encontrados en nuestra cohorte fueron similares a los de los estudios internacionales. Dado que el mayor nivel de susceptibilidad fue para amikacina, proponemos su uso como terapia empírica para la urosepsis asociada a ureterolitiasis en Chile. Siempre es necesario considerar los posibles efectos ne-frotóxicos de la amikacina. Se debe considerar una asociación de betalactámicos y glicopéptidos en pacientes con factores de riesgo de infecciones enterocócicas.


BACKGROUND: Inadequate antibiotic coverage in septic patients is associated with higher morbidity and mortality. This multicentric study reports antibiotic susceptibility in patients with ureterolithiasis-associated urosepsis, aiming to propose an optimal empirical therapy for this disease in the Chilean population. METHODS: The prospective cohort study included patients from 7 Chilean hospitals who presented with ureterolithiasis and met sepsis criteria. We analyzed demographic data, vital signs at admission, and microbiological and radiological exams. We used descriptive statistics for the analysis of collected data. Results: Initially, the study included 119 patients; 52 met the inclusion criteria. 77% were female, with a mean age of 52. 100% of the cohort had a urine culture taken at admission, whereas 48,7% had blood cultures. Escherichia Coli was the most common microorganism (73%), followed by Proteus Mirabilis (9.6%) and Klebsiella Pneumoniae (3.9%). Only two patients presented gram-positive pathogens. 100% of gram-negative bacteria were sensible to amikacin. CONCLUSION: The microorganisms found in our cohort were similar to those in international reports. Since the highest level of susceptibility was for amikacin, we propose its use as empirical therapy for urosepsis associated with ureterolithiasis in Chile. It is always necessary to consider the potential nephrotoxic effects of amikacin. An association of beta-lactams and glycopeptides should be considered in patients with risk factors for enterococcal infections.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Idoso , Infecções Urinárias/microbiologia , Infecções Urinárias/tratamento farmacológico , Testes de Sensibilidade Microbiana , Sepse/microbiologia , Sepse/tratamento farmacológico , Antibacterianos/efeitos adversos , Antibacterianos/uso terapêutico , Chile/epidemiologia , Estudos Prospectivos , Ureterolitíase/complicações , Ureterolitíase/tratamento farmacológico
13.
Rev. Inst. Med. Trop ; 18(1)jun. 2023.
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1449250

RESUMO

Introducción: La osteomielitis aguda es una infección del hueso que afecta principalmente a los niños y tiene generalmente diseminación hematógena, a veces asociada a un trauma. En la etiología influyen factores, como la edad, el estado inmunológico y las enfermedades concomitantes. En la mayoría de los casos, el principal agente etiológico es Staphylococcus aureus. Es importante el diagnóstico oportuno para evitar secuelas a mediano o largo plazo. Objetivo: Describir las características epidemiológicas de un grupo de pacientes con osteomielitis aguda. Métodos: Se realizó la revisión retrospectiva de los expedientes clínicos de pacientes egresados del servicio de pediatría del Instituto de Medicina Tropical, entre enero de 2016 y diciembre de 2020, con diagnóstico de osteomielitis aguda. Resultados: Los varones con osteomielitis corresponden al 67,8% del total de 59 casos registrados, en cuanto a los signos y síntomas, el dolor, la tumefacción y la impotencia funcional fueron predominantes, la fiebre se documentó en 49 (83,1%) pacientes, se registró antecedentes de cirugía en 37 (62,7%) de los pacientes y complicaciones en 42 (71,2%) de los pacientes, la complicación más frecuente fue osteomielitis crónica El sitio anatómico más frecuente fueron los miembros inferiores. El tratamiento empírico fue realizado con cefalosporinas de 3G en 72,9% de los pacientes, ya sea solo o combinado con clindamicina o vancomicina, un paciente con aislamiento de M. tuberculosis recibió tratamiento HRZE. Se aisló algún germen 44 pacientes (74,5%), el microorganismo predominante fue Staphylococcus aureus en 81,8 %, la mitad (52,3%) correspondieron a SAMR Se encontró una alta resistencia a oxacilina del 55,8% y un solo paciente resistente a clindamicina (2,2%). Conclusión Los hallazgos fueron similares a los reportados en la literatura en cuanto a etiología, sitio anatómico afectado y cobertura antibiótica.


Introduction: Acute osteomyelitis is a bone infection that mainly affects children and generally has hematogenous spread, sometimes associated with trauma. The etiology is influenced by factors such as age, immune status, and comorbidities. In most cases, the main etiologic agent is Staphylococcus aureus. Timely diagnosis is important to avoid sequelae in the medium or long term. Objective: To describe the epidemiological characteristics of a group of patients with acute osteomyelitis. Methods: A retrospective review of the clinical records of patients discharged from the pediatric service of the Institute of Tropical Medicine was carried out between January 2016 and December 2020, with a diagnosis of acute osteomyelitis. Results: Men with osteomyelitis correspond to 67.8% of the total of 59 registered cases, in terms of signs and symptoms, pain, swelling and functional impotence were predominant, fever was documented in 49 (83.1%) patients, a history of surgery was recorded in 37 (62.7%) of the patients and complications in 42 (71.2%) of the patients, the most frequent complication was chronic osteomyelitis The most frequent anatomical site was the lower limbs. Empirical treatment was performed with 3G cephalosporins in 72.9% of the patients, either alone or in combination with clindamycin or vancomycin. One patient with M. tuberculosis isolation received HRZE treatment. Some germ was isolated in 44 patients (74.5%), the predominant microorganism was Staphylococcus aureus in 81.8%, half (52.3%) corresponded to MRSA. A high resistance to oxacillin of 55.8% and a only patient resistant to clindamycin (2.2%). Conclusion The findings were similar to those reported in the literature in terms of etiology, affected anatomical site, and antibiotic coverage.

14.
Salud mil ; 42(1): e401, 05/05/2023.
Artigo em Espanhol | LILACS, UY-BNMED, BNUY | ID: biblio-1531497

RESUMO

Introducción: la resistencia a los antimicrobianos ha sido una problemática creciente a nivel global, la problemática afecta no solo la salud de personas, animales y el ambiente en general, sino que ha generado impactos de índole productivo y comercial. Una de las estrategias para abordar esta problemática es el enfoque de una salud. Este enfoque destaca la participación multidisciplinaria para combatir la resistencia antimicrobiana; y es así que cada profesión o actividad laboral genera unas responsabilidades innatas para la profesión veterinaria. Los veterinarios tienen un rol fundamental para este propósito, ya que son ellos quienes integran la aplicabilidad de estrategias de promoción y prevención a nivel agropecuario, y de consolidación e interlocución entre los diferentes componentes del enfoque (animal, humano, ambiente) desde el ámbito de la salud pública veterinaria. Materiales y Método: se realizó una búsqueda de la literatura en diferentes bases de datos, con el objetivo de realizar una revisión actualizada sobre la resistencia antimicrobiana. Resultados: dentro de las principales estrategias se debería fomentar un uso adecuado y bajo prescripción de antimicrobianos en la producción animal. Promover buenas prácticas de higiene, bioseguridad y vacunación, facilitando un correcto diagnóstico de enfermedades infecciosas en animales. Discusión: la adopción de normas internacionales para el uso responsable de los antibióticos y las directrices establecidas por la Organización Mundial de la Salud y Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura, a través del Codex Alimentarius y la Organización Mundial de Sanidad Animal, son fundamentales para hacer frente al desafío que representa el problema de la resistencia a los antimicrobianos.


Introduction: Antimicrobial resistance has been a growing problem at a global level, affecting not only the health of people, animals and the environment in general, but it has also generated impacts of a productive and commercial nature. One of the strategies to address this problem is the one-health approach. This approach emphasizes multidisciplinary participation to combat antimicrobial resistance; and thus, each profession or work activity generates innate responsibilities for the veterinary profession. Veterinarians have a fundamental role for this purpose, since they are the ones who integrate the applicability of promotion and prevention strategies at the agricultural level, and of consolidation and interlocution between the different components of the approach (animal, human, environment) from the field of veterinary public health. Materials and Method: a literature search was carried out in different databases, with the aim of carrying out an updated review on antimicrobial resistance. Results: one of the main strategies should be to promote an adequate use and under prescription of antimicrobials in animal production. Promote good hygiene, biosecurity and vaccination practices, facilitating a correct diagnosis of infectious diseases in animals. Discussion: the adoption of international standards for the responsible use of antibiotics and the guidelines established by the World Health Organization and the Food and Agriculture Organization of the United Nations, through Codex Alimentarius and the World Organization for Animal Health, are fundamental to face the challenge posed by the problem of antimicrobial resistance.


Introdução: A resistência antimicrobiana tem sido um problema crescente em todo o mundo, afetando não apenas a saúde dos seres humanos, dos animais e do meio ambiente em geral, mas também causando impactos na produção e no comércio. Uma das estratégias para lidar com esse problema é a abordagem One Health. Essa abordagem enfatiza o envolvimento multidisciplinar no combate à resistência antimicrobiana, com cada profissão ou atividade de trabalho gerando responsabilidades inatas à profissão veterinária. Os veterinários têm um papel fundamental nesse sentido, pois são eles que integram a aplicabilidade das estratégias de promoção e prevenção em nível agropecuário e de consolidação e interlocução entre os diferentes componentes da abordagem (animal, humano, ambiental) do campo da saúde pública veterinária. Materiais e Métodos: foi realizada uma pesquisa bibliográfica em diferentes bases de dados, com o objetivo de realizar uma revisão atualizada sobre a resistência antimicrobiana. Resultados: uma das principais estratégias deve ser a promoção do uso adequado e com baixa prescrição de antimicrobianos na produção animal. Promover boas práticas de higiene, biossegurança e vacinação, facilitando o diagnóstico correto de doenças infecciosas em animais. Discussão: A adoção de padrões internacionais para o uso responsável de antibióticos e as diretrizes estabelecidas pela Organização Mundial da Saúde e pela Organização das Nações Unidas para Agricultura e Alimentação, por meio do Codex Alimentarius e da Organização Mundial de Saúde Animal, são essenciais para enfrentar o desafio representado pelo problema da resistência antimicrobiana.


Assuntos
Humanos , Animais , Resistência Microbiana a Medicamentos/efeitos dos fármacos , Resistência a Múltiplos Medicamentos/efeitos dos fármacos
15.
Rev. argent. microbiol ; Rev. argent. microbiol;55(1): 91-100, mar. 2023.
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1441189

RESUMO

Resumen El abuso y mal uso de los antimicrobianos aceleró la propagación de bacterias resistentes. La asociación entre las infecciones que presentan resistencia a antimicrobianos (RAM) en humanos y el uso de antimicrobianos en la producción agropecuaria es compleja, pero está bien documentada. Proporcionamos una revisión sistemática y metaanálisis sobre la diseminación de la resistencia a antimicrobianos designados como críticamente importantes por la Organización Mundial de la Salud (OMS) en cerdos, aves y bovinos de producción intensiva y extensiva en Argentina. Se buscó información en bases de datos electrónicas (Medline-PubMed, Web of Science, SciELO, Sistema Nacional de Repositorios Digitales de Argentina) y en la literatura gris. Se incluyeron estudios epidemiológicos sobre la RAM en las principales bacterias transmitidas por los alimentos - Salmonella spp., Campylobacter spp., Escherichia coli y Enterococcus spp. - y bacterias causantes de mastitis aisladas de cerdos, pollos y bovinos. Los resultados de este estudio apoyan la hipótesis de que la RAM de las bacterias transmitidas por los alimentos alcanza niveles alarmantes. Los metaanálisis seguidos de análisis por subgrupos mostraron asociación entre la RAM y (a) el animal (p<0,01) para estreptomicina, ampicilina y tetraciclina o (b) el sistema productivo (p<0,05) para estreptomicina, cefotaxima, ampicilina, ácido nalidíxico y tetraciclina. La mayor prevalencia conjunta de multirresistencia se detectó en cerdos (0,47 [0,29; 0,66]) y producción intensiva (0,62 [0,34; 0,83]), mientras que la menor correspondió a bovinos de leche (0,056 [0,003; 0,524]) y producción extensiva (0,107 [0,043; 0,240]). Se observó un vacío de información respecto de los bovinos de feedlot. Es urgente adoptar medidas políticas para coordinar y armonizar la vigilancia de la RAM y regular el uso de antimicrobianos en animales.


Abstract Abuse and misuse of antimicrobial agents has accelerated the spread of antimicrobial-resistant bacteria. The association between antimicrobial-resistant infections in humans and antimicrobial use in agriculture is complex, but well-documented. This study provides a systematic review and meta-analysis of the dissemination of antimicrobial resistance (AMR) to antimicrobials defined as critically important by the WHO, in swine, chicken, and cattle from intensive and extensive production systems in Argentina. We conducted searches in electronic databases (MEDLINE-PubMed, Web of Science, SciELO, the National System of Digital Repositories from Argentina) as well as in the gray literature. Inclusion criteria were epidemiological studies on AMR in the main food-transmitted bacteria, Salmonella spp., Campylobacter spp., Escherichia coli and Enterococcus spp., and mastitis-causing bacteria, isolated from swine, chicken, dairy and beef cattle from Argentina. This study gives evidence for supporting the hypothesis that AMR of common food-transmitted bacteria in Argentina is reaching alarming levels. Meta-analyses followed by subgroup analyses confirmed the association between the prevalence of AMR and (a) animal species (p<0.01) for streptomycin, ampicillin and tetracycline or (b) the animal production system (p<0.05) for streptomycin, cefotaxime, nalidixic acid, ampicillin and tetracycline. Moreover, swine (0.47 [0.29; 0.66]) and intensive production (0.62 [0.34; 0.83]) showed the highest pooled prevalence of multidrug resistance while dairy (0.056 [0.003; 0.524]) and extensive production (0.107 [0.043; 0.240]) showed the lowest. A research gap regarding beef-cattle from feedlot was identified. Finally, there is an urgent need for political measures meant to coordinate and harmonize AMR surveillance and regulate antimicrobial use in animal production.

17.
Rev Argent Microbiol ; 55(1): 25-42, 2023.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36137889

RESUMO

Abuse and misuse of antimicrobial agents has accelerated the spread of antimicrobial-resistant bacteria. The association between antimicrobial-resistant infections in humans and antimicrobial use in agriculture is complex, but well-documented. This study provides a systematic review and meta-analysis of the dissemination of antimicrobial resistance (AMR) to antimicrobials defined as critically important by the WHO, in swine, chicken, and cattle from intensive and extensive production systems in Argentina. We conducted searches in electronic databases (MEDLINE-PubMed, Web of Science, SciELO, the National System of Digital Repositories from Argentina) as well as in the gray literature. Inclusion criteria were epidemiological studies on AMR in the main food-transmitted bacteria, Salmonella spp., Campylobacter spp., Escherichia coli and Enterococcus spp., and mastitis-causing bacteria, isolated from swine, chicken, dairy and beef cattle from Argentina. This study gives evidence for supporting the hypothesis that AMR of common food-transmitted bacteria in Argentina is reaching alarming levels. Meta-analyses followed by subgroup analyses confirmed the association between the prevalence of AMR and (a) animal species (p<0.01) for streptomycin, ampicillin and tetracycline or (b) the animal production system (p<0.05) for streptomycin, cefotaxime, nalidixic acid, ampicillin and tetracycline. Moreover, swine (0.47 [0.29; 0.66]) and intensive production (0.62 [0.34; 0.83]) showed the highest pooled prevalence of multidrug resistance while dairy (0.056 [0.003; 0.524]) and extensive production (0.107 [0.043; 0.240]) showed the lowest. A research gap regarding beef-cattle from feedlot was identified. Finally, there is an urgent need for political measures meant to coordinate and harmonize AMR surveillance and regulate antimicrobial use in animal production.


Assuntos
Antibacterianos , Anti-Infecciosos , Feminino , Animais , Suínos , Humanos , Bovinos , Antibacterianos/farmacologia , Antibacterianos/uso terapêutico , Farmacorresistência Bacteriana , Argentina , Anti-Infecciosos/farmacologia , Escherichia coli , Ampicilina , Estreptomicina , Tetraciclinas , Testes de Sensibilidade Microbiana
18.
Braz. j. biol ; 83: e248026, 2023. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1374638

RESUMO

Poultry industry is amongst highly developed industries of Pakistan, fulfilling the protein demand of rapidly increasing population. On the other hand, the untreated poultry waste is causing several health and environmental problems. The current study was designed to check the potential of keratinolytic fungal species for the conversion of chicken-feather waste into biofortified compost. For the purpose, three fungal species were isolated from soil samples. These strains were pure cultured and then characterized phenotypically and genotypically. BLAST searches of 18S rDNA nucleotide sequence of the fungal isolates revealed that the two fungal isolates belonged to genus Aspergillus and one belonged to genus Chrysosporium. Optimum temperature for Aspergillus flavus, Aspergillus niger and Chrysosporium queenslandicum was 29, 26 and 25 oC, respectively. A. flavus showed maximum (53%) feather degradation, A. niger degraded feather waste up to 37%, while C. queenslandicum showed 21% keratinolytic activity on chicken feathers at their respective temperature optima. The degradation potential of these fungal species showed their ability to form compost that has agro-industrial importance.


A indústria avícola está entre as indústrias altamente desenvolvidas do Paquistão, atendendo a demanda de proteína da população em rápido crescimento. Por outro lado, os resíduos de aves não tratados estão causando diversos problemas de saúde e ambientais. O presente estudo foi desenhado para verificar o potencial de espécies de fungos queratinolíticos para a conversão de resíduos de penas de frango em composto biofortificado. Para tanto, três espécies de fungos foram isoladas de amostras de solo. Essas cepas foram cultivadas puramente e, em seguida, caracterizadas fenotipicamente e genotipicamente. As pesquisas do BLAST da sequência de nucleotídeos do rDNA 18S dos isolados de fungos revelaram que os dois isolados de fungos pertenciam ao gênero Aspergillus e um pertencia ao gênero Chrysosporium. A temperatura ótima para Aspergillus flavus, Aspergillus niger e Chrysosporium queenslandicum foi de 29, 26 e 25 oC, respectivamente. A. flavus apresentou degradação máxima de penas (53%), A. niger degradou resíduos de penas em até 37%, enquanto C. queenslandicum apresentou 21% de atividade queratinolítica em penas de frango em suas respectivas temperaturas ótimas. O potencial de degradação dessas espécies de fungos mostrou sua capacidade de formar composto de importância agroindustrial.


Assuntos
Produtos Avícolas , Biodegradação Ambiental , Paquistão
19.
Colloq. Agrar ; 19(1): 28-42, jan.-dez. 2023. graf, tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1432781

RESUMO

Recent research suggests that soybean yield could be doubled in Brazilian conditions, implying that the base fertilization is pivotal, as it might influence chemical and microbiological soil indicators and, hence, the crop grain yield. The current study had the goal of assessing alterations in the chemical and microbiological soil indicators, in the short term, as well as the soybean biometric and grain yield performance as a function of different fertilizers for base fertilization, in two sowing periods. An experiment comprised of two sowing periods was carried out in the 2019/2020 season on a dystrophic Red Latosol, in north Parana state. Five treatments were assessed, comprising: 1) control; 2) mineral fertilizer; 3) organomineral fertilizer; 4) mineral fertilizer mixed with granulated gypsum; and 5) slow release mineral fertilizer. A randomized block design with four replicates was adopted. The following variables were assessed: chemical and microbiological soil indicators; final stand; first pod insertion height; plant height; stem diameter; number of pods per plant; number of grains per plant; number of grains per pod; grain mass per plant; and one thousand grain mass and grain yield. There is no base fertilization effect on the chemical soil indicators in the short term, however, there is an effect on the microbiological soil indicators. Soybean biometric and grain yield performance is decreased with the delayed sowing period, regardless of the type of fertilizer utilized for base fertilization. Analyzing a set of soil quality indicators enables precise and judicious results to be gathered on management practices in the soil environment.(AU)


Pesquisas recentes apontam que a produtividade da soja pode ser duplicada em condições brasileiras, para tanto, a adubação de base se mostra fundamental, pois pode interferir nos indicadoresquímicos e microbiológicos do solo e, consequentemente, no rendimento da cultura. Assim, objetivou-se avaliar as alterações nos indicadoresquímicos e microbiológicosdo solo, no curto prazo, e o desempenhofitométrico e produtivo da soja em função do uso de diferentes fertilizantes na adubação de base, em duas épocas de semeadura. Foi conduzido experimento em duas épocas de semeadura na safra 2019/2020, em um Latossolo Vermelho distroférrico, no norte do estado do Paraná. Foram avaliados cincotratamentos que consistiram de: 1) controle; 2) fertilizante mineral; 3) fertilizante organomineral; 4) fertilizante mineral emmistura com gesso granulado e 5) fertilizante mineral de liberação lenta. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso comquatro repetições. Foram avaliadososindicadoresquímicos e microbiológicos do solo; estande final; altura de inserção da primeira vagem; altura de planta; diâmetro do caule; número de vagens por planta; número de grãos por planta; número de grãos por vagem; massa de grãos por planta; massade mil grãos e produtividade. Não há efeito da adubação de base sobre os indicadoresquímicos do solo no curto prazo, porém, há efeito sobre os indicadoresmicrobiológicos. O desempenhofitométrico e produtivo da soja é reduzidoconforme o atraso da semeadura, independentemente do tipo de fertilizante utilizado na adubação de base.A análise conjunta de indicadores de qualidade do solo permite a obtenção de resultados precisos e criteriosos sobre as práticas de manejo no ambiente do solo.(AU)


Assuntos
Glycine max/química , Fertilizantes/análise , Microbiologia do Solo , Química do Solo , Técnicas Microbiológicas/métodos , Biomassa
20.
Braz. J. Biol. ; 83: 1-9, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-765394

RESUMO

Trees occurring on the margins of agricultural areas can mitigate damage from residual herbicides. Rhizospheric microbial activity associated with trees is one of the main remedial capacity indicators. The objective of this study was to evaluate the rhizospheric microbiological activity in tree species subjected to the herbicides atrazine and sulfentrazone via the rhizosphere. The experiment was designed in four blocks and a 6 × 3 factorial scheme. The first factor consisted of six tree species from Brazil and the second of atrazine, sulfentrazone, and water solutions. Four herbicide applications were performed via irrigation. The total dry mass of the plants, mycorrhizal colonization, number of spores, basal respiration of the rhizospheric soil, and survival rate of bioindicator plants after phytoremediation were determined. Trichilia hirta had higher biomass when treated with atrazine and sulfentrazone. Herbicides decreased the microbial activity in Triplaris americana and did not affect the microbiological indicators of Myrsine gardneriana, Schizolobium parahyba, and Toona ciliata. Fewer bioindicator plants survived in soil with Triplaris americana and sulfentrazone. Microbiological indicators were influenced in different ways between species by the presence of herbicides in the rhizosphere.(AU)


As árvores que ocorrem nas margens das áreas agrícolas podem mitigar os danos dos herbicidas residuais. A atividade microbiana rizosférica associada às árvores é um dos principais indicadores de capacidade corretiva. O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade microbiológica rizosférica em espécies arbóreas submetidas aos herbicidas atrazina e sulfentrazone via rizosfera. O experimento foi estruturado em quatro blocos e esquema fatorial 6 × 3. O primeiro fator consistiu em seis espécies de árvores do Brasil e o segundo em soluções de atrazine, sulfentrazone e água. Quatro aplicações de herbicidas foram realizadas via irrigação. Foram determinados a massa seca total das plantas, colonização micorrízica, número de esporos, respiração basal do solo rizosférico e taxa de sobrevivência de plantas bioindicadoras após fitorremediação. Trichilia hirta apresentou maior biomassa quando tratada com atrazina e sulfentrazone. Os herbicidas diminuíram a atividade microbiana em Triplaris americana e não afetaram os indicadores microbiológicos de Myrsine gardneriana, Schizolobium parahyba e Toona ciliata. Menos plantas bioindicadoras sobreviveram no solo com Triplaris americana e sulfentrazone. Os indicadores microbiológicos foram influenciados de formas distintas entre as espécies pela presença dos herbicidas na rizosfera.(AU)


Assuntos
Rizosfera , Meliaceae/efeitos dos fármacos , Meliaceae/microbiologia , Polygonaceae/efeitos dos fármacos , Polygonaceae/microbiologia , Myrsine/efeitos dos fármacos , Myrsine/microbiologia , Fabaceae/efeitos dos fármacos , Fabaceae/microbiologia , Herbicidas/administração & dosagem , Atrazina
SELEÇÃO DE REFERÊNCIAS
DETALHE DA PESQUISA