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1.
Hum Immunol ; 79(8): 632-637, 2018 Aug.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29879453

RESUMO

Glycoprotein-A repetitions predominant (GARP) is a transmembrane protein that is highly expressed in breast cancer. Its overexpression correlates with worse survival, and antibodies to GARP appear to play a protective role in a mouse model. No large-scale studies of immunity to GARP in humans have yet been undertaken. In this investigation, using a large multiethnic cohort (1738 subjects), we aimed to determine whether the magnitude of anti-GARP antibody responsiveness was significantly different in patients with breast cancer from that in matched healthy controls. We also investigated whether the allelic variation at the immunoglobulin GM (γ marker), KM (κ marker), and Fcγ receptor (FcγR) loci contributed to the interindividual variability in anti-GARP IgG antibody levels. A combined analysis of all subjects showed that levels of anti-GARP antibodies were significantly higher in patients with breast cancer than in healthy controls (mean ±â€¯SD: 7.4 ±â€¯3.5 vs. 6.9 ±â€¯3.5 absorbance units per mL (AU/µL), p < 0.0001). In the two populations with the largest sample size, the probability of breast cancer generally increases as anti-GARP antibody levels increase. Several significant individual and epistatic effects of GM, KM, and FcγR genotypes on anti-GARP antibody responsiveness were noted in both patients and controls. These results, if confirmed by independent investigations, will aid in devising personalized GARP-based immunotherapeutic strategies against breast cancer and other GARP-overexpressing malignancies.


Assuntos
Neoplasias da Mama/genética , Genótipo , Alótipos Gm de Imunoglobulina/genética , Alótipos Km de Imunoglobulina/genética , Imunoterapia/métodos , Proteínas de Membrana/imunologia , Receptores de IgG/genética , Formação de Anticorpos , Brasil , Neoplasias da Mama/imunologia , Estudos de Casos e Controles , Estudos de Coortes , Epistasia Genética , Etnicidade , Feminino , Humanos , Imunoglobulina G/sangue , Proteínas de Membrana/genética , Polimorfismo Genético , Medicina de Precisão
2.
Waste Manag ; 41: 20-7, 2015 Jul.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-25869842

RESUMO

Increasing generation of Urban Solid Waste (USW) has become a significant issue in developing countries due to unprecedented population growth and high rates of urbanisation. This issue has exceeded current plans and programs of local governments to manage and dispose of USW. In this study, a Genetic Algorithm for Rule-set Production (GARP) integrated into a Geographic Information System (GIS) was used to find areas with socio-economic conditions that are representative of the generation of USW constituents in such areas. Socio-economic data of selected variables categorised by Basic Geostatistical Areas (BGAs) were taken from the 2000 National Population Census (NPC). USW and additional socio-economic data were collected during two survey campaigns in 1998 and 2004. Areas for sampling of USW were stratified into lower, middle and upper economic strata according to income. Data on USW constituents were analysed using descriptive statistics and Multivariate Analysis. ARC View 3.2 was used to convert the USW data and socio-economic variables to spatial data. Desk-top GARP software was run to generate a spatial model to identify areas with similar socio-economic conditions to those sampled. Results showed that socio-economic variables such as monthly income and education are positively correlated with waste constituents generated. The GARP used in this study revealed BGAs with similar socio-economic conditions to those sampled, where a similar composition of waste constituents generated is expected. Our results may be useful to decrease USW management costs by improving the collection services.


Assuntos
Algoritmos , Países em Desenvolvimento , Sistemas de Informação Geográfica , Resíduos Sólidos/análise , Gerenciamento de Resíduos/métodos , Cidades , México , Análise Multivariada , Eliminação de Resíduos , Fatores Socioeconômicos
3.
Rev. biol. trop ; Rev. biol. trop;61(2): 897-925, Jun. 2013. ilus, mapas, tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-675476

RESUMO

The Sierra Madre Oriental region in the mexican state of San Luis Potosí is a relevant place for bird conservation at a country level. Therefore the main goal of this study was to analyze the geographic patterns of distribution and the conservation current state of the birds, to support the needs to expand the conservation areas in the future. Data was collected from various databases of zoological museums and collections, and field sampling methods conducted from January 2009 to May 2011. Potential distributions were modeled for 284 species using GARP software and then a map was developed to determine areas with favorable environmental characteristics for the distribution of species richness. Finally, the importance of conservation areas for the potential distribution of birds in the region was evaluated. A total of 359 species were recorded of which 71.4% are permanent residents, 19% are winter migrants and 4% are summer residents. From this total, 41 species were endemic, 47 were species at risk and 149 were neotropical migrants. The largest species richness correspond to oak forests, cloud forests, and tropical moist forests located at altitudes from 100m to 1 500m. Their potential distribution was concentrated towards the center and Southeast of the study area. Only 10% of areas with a high potential conservation was included in areas of priority for bird conservation (AICA) and just 3% of all potential areas were under some governmental category of protection. However, no conservation area has a management plan currently applied and monitored. The information generated is important for the development of management proposals for birds conservation in the region.


La región de la Sierra Madre Oriental (SMO) en el estado de San Luis Potosí en México es considerada un sitio de relevancia para la conservación de la avifauna a nivel nacional. Por lo anterior, el objetivo de este estudio fue analizar la distribución geográfica de las aves en la zona para identificar las áreas con mayor concentración de la riqueza y evaluar su estado actual de conservación para fundamentar la necesidad de incrementar la superficie dedicada a las áreas naturales protegidas en el futuro. Se recolectó información proveniente de diversas bases de datos de colecciones y museos, además de realizar trabajo de campo en el periodo de enero 2009 a Mayo 2011. Se modelaron las distribuciones potenciales para 284 especies con el programa GARP y se elaboró un mapa de consenso para determinar la ubicación espacial de las áreas con condiciones ambientales para soportar el mayor número de especies. Finalmente, se evaluó la representatividad de las zonas dedicadas a la conservación para las aves. Se registraron 357 especies, de las cuales el 71.4% son residentes permanentes, 19% son migratorias de invierno y 3.9% residentes de verano. Del total, 41 especies son endémicas y 48 se encuentran en alguna categoría de riesgo; la mayor concentración de especies se presentó en las coberturas de bosques de encino, bosques mesófilos y selvas medianas y bajas caducifolias, en un intervalo altitudinal entre 100-1 500m con una más alta cantidad de nichos en la parte centro y hacia el sur y este de la región. Sólo el 10% de las zonas con alto potencial de número de especies está incluido como área de importancia para la conservación de las aves y el 3% del total de áreas potenciales está bajo alguna categoría estatal de protección; sin embargo, ninguna de las áreas tiene un plan de manejo que esté siendo aplicado y monitoreado. La información generada es importante para el desarrollo de propuestas de conservación para las aves en la región.


Assuntos
Animais , Biodiversidade , Aves/classificação , Conservação dos Recursos Naturais , México , Densidade Demográfica , Dinâmica Populacional , Estações do Ano
4.
Rev. biol. trop ; Rev. biol. trop;61(2): 937-969, Jun. 2013. ilus, graf, mapas, tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-675478

RESUMO

Mesoamerica is a biologically complex zone that expands from Southern Mexico to extreme Northern Colombia. The biogeographical patterns and relationships of the mammalian fauna associated to the Mesoamerican Tropical Evergreen Forest (MTEF) are poorly understood, in spite of the wide distribution of this kind of habitat in the region. We compiled a complete georeferenced database of mammalian species distributed in the MTEF of specimens from museum collections and scientific literature. This database was used to create potential distribution maps through the use of environmental niche models (ENMs) by using the Genetic Algorithm for Rule-Set Production (GARP) using 22 climatic and topographic layers. Each map was used as a representation of the geographic distribution of the species and all available maps were summed to obtain general patterns of species richness in the region. Also, the maps were used to construct a presence-absence matrix in a grid of squares of 0.5 degrees of side, that was analyzed in a Parsimony Analysis of Endemicity (PAE), which resulted in a hypothesis of the biogeographic scheme in the region. We compiled a total of 41 527 records of 233 species of mammals associated to the MTEF. The maximum concentration of species richness (104-138 species) is located in the areas around the isthmus of Tehuantepec, Northeastern Chiapas-Western Guatemala, Western Honduras, Central Nicaragua to Northwestern Costa Rica and Western Panama. The proposed regionalization indicates that mammalian faunas associated to these forests are composed of two main groups that are divided by the isthmus of Tehuantepec in Oaxaca in: a) a Northern group that includes Sierra Madre of Chiapas-Guatemala and Yucatan Peninsula; and b) an austral group, that contains the Pacific slope of Chiapas towards the South including Central America. Some individual phylogenetic studies of mammal species in the region support the relationships between the areas of endemism proposed, which suggest a common biogeographical history. in spite that Mesoamerica is considered one of the most important hotspots for biological conservation, the poor knowledge of the biogeographic patterns, the scarcity of protected areas, and the high rate of habitat transformation due to human activities, make prioritary the development of conservation strategies that include patterns of species richness, endemism, and mammalian associations.


Este trabajo presenta una propuesta de regionalización biogeográfica de los bosques tropicales perennifolios de Mesoamérica, resultado de un análisis de parsimonia de endemismos (PAE), utilizando modelos de nicho ecológico (GARP) con mamíferos terrestres, usando 41 527 registros para las 233 especies de mamíferos reconocidas. La regionalización propuesta muestra que los bosques tropicales perennifolios de Mesoamérica se dividen por el istmo de Tehuantepec en Oaxaca en: a) un grupo septentrional que comprende la Sierra Madre de Chiapas-Guatemala y la Península de Yucatán, y b) un grupo austral, que contiene la vertiente pacífica hacia el sur incluyendo Centroamérica. Además se encontró congruencia con trabajos filogenéticos, lo que sugiere una historia biogeográfica común.


Assuntos
Animais , Biodiversidade , Mamíferos/classificação , Árvores , América Central , Geografia , México
5.
Braz. j. biol ; 70(3,supl.0): 697-708, Oct. 2010. mapas, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: lil-564105

RESUMO

After 500 years of exploitation and destruction, the Brazilian Atlantic Forest has been reduced to less the 8 percent of its original cover, and climate change may pose a new threat to the remnants of this biodiversity hotspot. In this study we used modelling techniques to determine present and future geographical distribution of 38 species of trees that are typical of the Brazilian Atlantic Forest (Mata Atlântica), considering two global warming scenarios. The optimistic scenario, based in a 0.5 percent increase in the concentration of CO2 in the atmosphere, predicts an increase of up to 2 °C in the Earth's average temperature; in the pessimistic scenario, based on a 1 percent increase in the concentration of CO2 in the atmosphere, temperature increase may reach 4 °C. Using these parameters, the occurrence points of the studied species registered in literature, the Genetic Algorithm for Rule-set Predictions/GARP and Maximum entropy modeling of species geographic distributions/MaxEnt we developed models of present and future possible occurrence of each species, considering Earth's mean temperature by 2050 with the optimistic and the pessimistic scenarios of CO2 emission. The results obtained show an alarming reduction in the area of possible occurrence of the species studied, as well as a shift towards southern areas of Brazil. Using GARP, on average, in the optimistic scenario this reduction is of 25 percent while in the pessimistic scenario it reaches 50 percent, and the species that will suffer the worst reduction in their possible area of occurrence are: Euterpe edulis, Mollinedia schottiana, Virola bicuhyba, Inga sessilis and Vochysia magnifica. Using MaxEnt, on average, in the optimistic scenario the reduction will be of 20 percent while in the pessimistic scenario it reaches 30 percent, and the species that will suffer the worst reduction are: Hyeronima alchorneoides, Schefflera angustissima, Andira fraxinifolia and the species of Myrtaceae studied.


Nos últimos 500 anos de ocupação da costa brasileira, de um total de 1.300.000 km², apenas cerca de 8 por cento da cobertura original da Mata Atlântica foi preservada. Os poucos fragmentos restantes dessa devastação apresentam diversos tamanhos, formas, estádios de sucessão e situação de conservação. Cerca de metade dos remanescentes florestais de grande extensão estão protegidos na forma de Unidades de Conservação. A maioria desses fragmentos se encontra hoje nas regiões serranas, principalmente a fachada da Serra do Mar, por serem impróprias para práticas agrícolas. Neste estudo, usamos técnicas de modelagem para determinar a distribuição geográfica presente e futura de 38 espécies arbóreas típicas da Mata Atlântica lato sensu, considerando dois cenários de aquecimento global. O cenário otimista prevê uma taxa anual de 0,5 por cento de aumento na concentração de CO2 na atmosfera e um aumento médio da temperatura inferior a 2 °C. O cenário pessimista prevê uma taxa anual de 1,0 por cento de aumento na concentração de CO2 na atmosfera e um aumento médio da temperatura superior a 3 °C. Usando estes parâmetros, os pontos de ocorrência atual das espécies e o algoritmo genético para previsões baseadas em regras pré-estabelecidas (GARP), desenvolvemos modelos da distribuição futura das espécies estudadas, considerando as temperaturas projetadas para 2050. Os resultados obtidos mostraram uma alarmante redução na área que as espécies estudadas poderão ocupar, bem como um deslocamento da ocorrência atual em direção ao sul do Brasil. Na média, com o cenário otimista, a redução da área potencial de ocorrência é de 25 por cento, enquanto que no cenário pessimista este patamar é da ordem de 50 por cento. As espécies que sofrerão a maior redução na área de ocorrência são: Euterpe edulis, Mollinedia schottiana, Virola bicuhyba, Inga sessilis e Vochysia magnifica.


Assuntos
Biodiversidade , Previsões , Aquecimento Global , Modelos Biológicos , Árvores , Brasil , Ecossistema , Árvores/classificação
6.
Braz. j. biol ; Braz. j. biol;70(3)Aug. 2010.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468030

RESUMO

After 500 years of exploitation and destruction, the Brazilian Atlantic Forest has been reduced to less the 8% of its original cover, and climate change may pose a new threat to the remnants of this biodiversity hotspot. In this study we used modelling techniques to determine present and future geographical distribution of 38 species of trees that are typical of the Brazilian Atlantic Forest (Mata Atlântica), considering two global warming scenarios. The optimistic scenario, based in a 0.5% increase in the concentration of CO2 in the atmosphere, predicts an increase of up to 2 °C in the Earth's average temperature; in the pessimistic scenario, based on a 1% increase in the concentration of CO2 in the atmosphere, temperature increase may reach 4 °C. Using these parameters, the occurrence points of the studied species registered in literature, the Genetic Algorithm for Rule-set Predictions/GARP and Maximum entropy modeling of species geographic distributions/MaxEnt we developed models of present and future possible occurrence of each species, considering Earth's mean temperature by 2050 with the optimistic and the pessimistic scenarios of CO2 emission. The results obtained show an alarming reduction in the area of possible occurrence of the species studied, as well as a shift towards southern areas of Brazil. Using GARP, on average, in the optimistic scenario this reduction is of 25% while in the pessimistic scenario it reaches 50%, and the species that will suffer the worst reduction in their possible area of occurrence are: Euterpe edulis, Mollinedia schottiana, Virola bicuhyba, Inga sessilis and Vochysia magnifica. Using MaxEnt, on average, in the optimistic scenario the reduction will be of 20% while in the pessimistic scenario it reaches 30%, and the species that will suffer the worst reduction are: Hyeronima alchorneoides, Schefflera angustissima, Andira fraxinifolia and the species of Myrtaceae studied.


Nos últimos 500 anos de ocupação da costa brasileira, de um total de 1.300.000 km², apenas cerca de 8% da cobertura original da Mata Atlântica foi preservada. Os poucos fragmentos restantes dessa devastação apresentam diversos tamanhos, formas, estádios de sucessão e situação de conservação. Cerca de metade dos remanescentes florestais de grande extensão estão protegidos na forma de Unidades de Conservação. A maioria desses fragmentos se encontra hoje nas regiões serranas, principalmente a fachada da Serra do Mar, por serem impróprias para práticas agrícolas. Neste estudo, usamos técnicas de modelagem para determinar a distribuição geográfica presente e futura de 38 espécies arbóreas típicas da Mata Atlântica lato sensu, considerando dois cenários de aquecimento global. O cenário otimista prevê uma taxa anual de 0,5% de aumento na concentração de CO2 na atmosfera e um aumento médio da temperatura inferior a 2 °C. O cenário pessimista prevê uma taxa anual de 1,0% de aumento na concentração de CO2 na atmosfera e um aumento médio da temperatura superior a 3 °C. Usando estes parâmetros, os pontos de ocorrência atual das espécies e o algoritmo genético para previsões baseadas em regras pré-estabelecidas (GARP), desenvolvemos modelos da distribuição futura das espécies estudadas, considerando as temperaturas projetadas para 2050. Os resultados obtidos mostraram uma alarmante redução na área que as espécies estudadas poderão ocupar, bem como um deslocamento da ocorrência atual em direção ao sul do Brasil. Na média, com o cenário otimista, a redução da área potencial de ocorrência é de 25%, enquanto que no cenário pessimista este patamar é da ordem de 50%. As espécies que sofrerão a maior redução na área de ocorrência são: Euterpe edulis, Mollinedia schottiana, Virola bicuhyba, Inga sessilis e Vochysia magnifica.

7.
Braz. J. Biol. ; 70(2): 263-269, May 2010. graf, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-2596

RESUMO

The use of ecological niche models (ENM) to generate potential geographic distributions of species has rapidly increased in ecology, conservation and evolutionary biology. Many methods are available and the most used are Maximum Entropy Method (MAXENT) and the Genetic Algorithm for Rule Set Production (GARP). Recent studies have shown that MAXENT perform better than GARP. Here we used the statistics methods of ROC - AUC (area under the Receiver Operating Characteristics curve) and bootstrap to evaluate the performance of GARP and MAXENT in generate potential distribution models for 39 species of New World coral snakes. We found that values of AUC for GARP ranged from 0.923 to 0.999, whereas those for MAXENT ranged from 0.877 to 0.999. On the whole, the differences in AUC were very small, but for 10 species GARP outperformed MAXENT. Means and standard deviations for 100 bootstrapped samples with sample sizes ranging from 3 to 30 species did not show any trends towards deviations from a zero difference in AUC values of GARP minus AUC values of MAXENT. Ours results suggest that further studies are still necessary to establish under which circumstances the statistical performance of the methods vary. However, it is also important to consider the possibility that this empirical inductive reasoning may fail in the end, because we almost certainly could not establish all potential scenarios generating variation in the relative performance of models.(AU)


A utilização de modelos de nicho ecológico (ENM) para gerar distribuições geográficas potenciais de espécies tem aumentado rapidamente nas áreas de ecologia, biologia da conservação e biologia evolutiva. O Método de Máxima Entropia (MAXENT) e o Algoritmo Genético para Produção de Conjunto de Regras (GARP) estão entre os métodos mais utilizados, e estudos recentes têm atribuído ao MAXENT um melhor desempenho no processo de modelagem com relação ao GARP. Neste trabalho, foram utilizados os métodos estatísticos ROC - AUC (area under the Receiver Operating Characteristics curve) e de reamostragem (bootstrap) para avaliar o desempenho do GARP e MAXENT em gerar modelos de distribuição potencial para 39 espécies de cobras corais do Novo Mundo. Os resultados mostraram que os valores de AUC para o GARP variaram de 0,923 a 0,999, enquanto que para o MAXENT variaram de 0,877 a 0,999. Em geral, as diferenças de AUC entre os dois métodos foram pequenas, embora o GARP tenha apresentado melhor desempenho que o MAXENT para 10 espécies. Valores de média e desvio padrão de 100 amostras variando de 3 a 30 espécies não revelaram qualquer tendência de desvio em relação à diferença zero entre valores de AUC do GARP menos valores de AUC do MAXENT. Estes resultados sugerem que mais estudos serão necessários para determinar sob quais circunstâncias o desempenho estatístico dos modelos varia, embora seja importante considerar também a possibilidade de que argumentações empírico-indutivas em favor de um ou outro método podem falhar, já que é quase impossível estabelecer todos os cenários potenciais causadores de variação no desempenho dos modelos.(AU)


Assuntos
Demografia/estatística & dados numéricos , Métodos , Empirismo
8.
Braz. j. biol ; Braz. j. biol;70(2): 263-269, May 2010. graf, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-548236

RESUMO

The use of ecological niche models (ENM) to generate potential geographic distributions of species has rapidly increased in ecology, conservation and evolutionary biology. Many methods are available and the most used are Maximum Entropy Method (MAXENT) and the Genetic Algorithm for Rule Set Production (GARP). Recent studies have shown that MAXENT perform better than GARP. Here we used the statistics methods of ROC - AUC (area under the Receiver Operating Characteristics curve) and bootstrap to evaluate the performance of GARP and MAXENT in generate potential distribution models for 39 species of New World coral snakes. We found that values of AUC for GARP ranged from 0.923 to 0.999, whereas those for MAXENT ranged from 0.877 to 0.999. On the whole, the differences in AUC were very small, but for 10 species GARP outperformed MAXENT. Means and standard deviations for 100 bootstrapped samples with sample sizes ranging from 3 to 30 species did not show any trends towards deviations from a zero difference in AUC values of GARP minus AUC values of MAXENT. Ours results suggest that further studies are still necessary to establish under which circumstances the statistical performance of the methods vary. However, it is also important to consider the possibility that this empirical inductive reasoning may fail in the end, because we almost certainly could not establish all potential scenarios generating variation in the relative performance of models.


A utilização de modelos de nicho ecológico (ENM) para gerar distribuições geográficas potenciais de espécies tem aumentado rapidamente nas áreas de ecologia, biologia da conservação e biologia evolutiva. O Método de Máxima Entropia (MAXENT) e o Algoritmo Genético para Produção de Conjunto de Regras (GARP) estão entre os métodos mais utilizados, e estudos recentes têm atribuído ao MAXENT um melhor desempenho no processo de modelagem com relação ao GARP. Neste trabalho, foram utilizados os métodos estatísticos ROC - AUC (area under the Receiver Operating Characteristics curve) e de reamostragem (bootstrap) para avaliar o desempenho do GARP e MAXENT em gerar modelos de distribuição potencial para 39 espécies de cobras corais do Novo Mundo. Os resultados mostraram que os valores de AUC para o GARP variaram de 0,923 a 0,999, enquanto que para o MAXENT variaram de 0,877 a 0,999. Em geral, as diferenças de AUC entre os dois métodos foram pequenas, embora o GARP tenha apresentado melhor desempenho que o MAXENT para 10 espécies. Valores de média e desvio padrão de 100 amostras variando de 3 a 30 espécies não revelaram qualquer tendência de desvio em relação à diferença zero entre valores de AUC do GARP menos valores de AUC do MAXENT. Estes resultados sugerem que mais estudos serão necessários para determinar sob quais circunstâncias o desempenho estatístico dos modelos varia, embora seja importante considerar também a possibilidade de que argumentações empírico-indutivas em favor de um ou outro método podem falhar, já que é quase impossível estabelecer todos os cenários potenciais causadores de variação no desempenho dos modelos.


Assuntos
Animais , Elapidae/classificação , Modelos Biológicos , Curva ROC , Algoritmos , Demografia , Geografia
9.
Braz. J. Biol. ; 70(3)2010.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-446649

RESUMO

After 500 years of exploitation and destruction, the Brazilian Atlantic Forest has been reduced to less the 8% of its original cover, and climate change may pose a new threat to the remnants of this biodiversity hotspot. In this study we used modelling techniques to determine present and future geographical distribution of 38 species of trees that are typical of the Brazilian Atlantic Forest (Mata Atlântica), considering two global warming scenarios. The optimistic scenario, based in a 0.5% increase in the concentration of CO2 in the atmosphere, predicts an increase of up to 2 °C in the Earth's average temperature; in the pessimistic scenario, based on a 1% increase in the concentration of CO2 in the atmosphere, temperature increase may reach 4 °C. Using these parameters, the occurrence points of the studied species registered in literature, the Genetic Algorithm for Rule-set Predictions/GARP and Maximum entropy modeling of species geographic distributions/MaxEnt we developed models of present and future possible occurrence of each species, considering Earth's mean temperature by 2050 with the optimistic and the pessimistic scenarios of CO2 emission. The results obtained show an alarming reduction in the area of possible occurrence of the species studied, as well as a shift towards southern areas of Brazil. Using GARP, on average, in the optimistic scenario this reduction is of 25% while in the pessimistic scenario it reaches 50%, and the species that will suffer the worst reduction in their possible area of occurrence are: Euterpe edulis, Mollinedia schottiana, Virola bicuhyba, Inga sessilis and Vochysia magnifica. Using MaxEnt, on average, in the optimistic scenario the reduction will be of 20% while in the pessimistic scenario it reaches 30%, and the species that will suffer the worst reduction are: Hyeronima alchorneoides, Schefflera angustissima, Andira fraxinifolia and the species of Myrtaceae studied.


Nos últimos 500 anos de ocupação da costa brasileira, de um total de 1.300.000 km², apenas cerca de 8% da cobertura original da Mata Atlântica foi preservada. Os poucos fragmentos restantes dessa devastação apresentam diversos tamanhos, formas, estádios de sucessão e situação de conservação. Cerca de metade dos remanescentes florestais de grande extensão estão protegidos na forma de Unidades de Conservação. A maioria desses fragmentos se encontra hoje nas regiões serranas, principalmente a fachada da Serra do Mar, por serem impróprias para práticas agrícolas. Neste estudo, usamos técnicas de modelagem para determinar a distribuição geográfica presente e futura de 38 espécies arbóreas típicas da Mata Atlântica lato sensu, considerando dois cenários de aquecimento global. O cenário otimista prevê uma taxa anual de 0,5% de aumento na concentração de CO2 na atmosfera e um aumento médio da temperatura inferior a 2 °C. O cenário pessimista prevê uma taxa anual de 1,0% de aumento na concentração de CO2 na atmosfera e um aumento médio da temperatura superior a 3 °C. Usando estes parâmetros, os pontos de ocorrência atual das espécies e o algoritmo genético para previsões baseadas em regras pré-estabelecidas (GARP), desenvolvemos modelos da distribuição futura das espécies estudadas, considerando as temperaturas projetadas para 2050. Os resultados obtidos mostraram uma alarmante redução na área que as espécies estudadas poderão ocupar, bem como um deslocamento da ocorrência atual em direção ao sul do Brasil. Na média, com o cenário otimista, a redução da área potencial de ocorrência é de 25%, enquanto que no cenário pessimista este patamar é da ordem de 50%. As espécies que sofrerão a maior redução na área de ocorrência são: Euterpe edulis, Mollinedia schottiana, Virola bicuhyba, Inga sessilis e Vochysia magnifica.

10.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 104(8): 1165-1170, Dec. 2009. tab, ilus
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-538177

RESUMO

Ecological niche modelling was used to predict the potential geographical distribution of Rhodnius nasutus Stål and Rhodnius neglectus Lent, in Brazil and to investigate the niche divergence between these morphologically similar triatomine species. The distribution of R. neglectus covered mainly the cerrado of Central Brazil, but the prediction maps also revealed its occurrence in transitional areas within the caatinga, Pantanal and Amazon biomes. The potential distribution of R. nasutus covered the Northeastern Region of Brazil in the semi-arid caatinga and the Maranhão babaçu forests. Clear ecological niche differences between these species were observed. R. nasutus occurred more in warmer and drier areas than R. neglectus. In the principal component analysis PC1 was correlated with altitude and temperature (mainly temperature in the coldest and driest months) and PC2 with vegetation index and precipitation. The prediction maps support potential areas of co-occurrence for these species in the Maranhão babaçu forests and in caatinga/cerrado transitional areas, mainly in state of Piaui. Entomologists engaged in Chagas disease vector surveillance should be aware that R. neglectus and R. nasutus can occur in the same localities of Northeastern Brazil. Thus, the identification of bugs in these areas should be improved by applying morphometrical and/or molecular methods.


Assuntos
Animais , Ecossistema , Insetos Vetores/fisiologia , Rhodnius/fisiologia , Brasil , Geografia , Insetos Vetores/classificação , Dinâmica Populacional , Rhodnius/classificação
11.
Artigo em Português | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1484057

RESUMO

The genus Uca Leach, 1814 (fiddler-crabs) is a well-know group characterized by a marked sexual dimorphism. Worldwide, there are 97 species of fiddler crabs described. Here, we predicted the potential geographical distribution of four species of this genus (Uca maracoani Latreille, 1802-1803, U. uruguayensis Nobili, 1901, U. panacea Novak & Salmon, 1974 e U. monilifera Rathbun, 1914), which occur in the American continent coast. Data used in the modeling were compiled from occurrence records available in the literature. We used Maxent and GARP programs for modelling, 10 climatic variables and three topographical variables. All variables were converted to a grid resolution of 0.0417 degrees. In both Maxent and GARP models the predicted geographical distribution of the species was larger than suggested by other observed data works, except for U. monilifera. According to the AUC criterion, the models generated by GARP were better than those obtained from Maxent. Evaluating the two models together, it is recommended conservation plans for species with restricted habitat (U. panaceae and U. monilifera) besides suggesting sampling of U. maracoani in the Brazilian northeast and U. uruguyaensis in the Brazilian southeast.


Caranguejos do gênero Uca Leach, 1814 (caranguejo "violinista") são um grupo bem conhecido e caracterizado por um acentuado dimorfismo sexual e assimetria da quela do macho. Atualmente, estão descritas 97 espécies no mundo. Objetivou-se estimar a distribuição geográfica potencial de 4 espécies do gênero Uca que ocorrem na costa do continente Americano: Uca maracoani Latreille, 1802-1803, U. uruguayensis Nobili, 1901, U. panacea Novak & Salmon, 1974 e U. monilifera Rathbun, 1914. Para modelar a distribuição dessas espécies nas Américas foram utilizados pontos de ocorrência compilados da literatura. Para a modelagem foram utilizados os programas Maxent e GARP a partir de 10 variáveis climáticas e três variáveis topográficas. Todas as variáveis foram convertidas para uma malha com resolução de 0,0417 graus. Nos dois modelos (Maxent e GARP) as espécies apresentaram distribuição geográfica maior do que sugerido por outros trabalhos de registro de ocorrência, com exceção de U. monilifera. Segundo o critério de área sob a curva (AUC), os modelos gerados pelo GARP apresentaram melhores resultados do que os modelos do Maxent. Entretanto, avaliando em conjunto os resultados dos dois modelos é possível melhor estabelecer planos de conservação para espécies com habitat restrito (U. panaceae e U. monilifera), além de recomendar um aumento na amostragem de U. maracoani no nordeste brasileiro e U. uruguyaensis no sudeste brasileiro, a fim de detectar possíveis aumentos na sua distribuição geográfica com base nas predições dos modelos de nicho.

12.
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-437663

RESUMO

The genus Uca Leach, 1814 (fiddler-crabs) is a well-know group characterized by a marked sexual dimorphism. Worldwide, there are 97 species of fiddler crabs described. Here, we predicted the potential geographical distribution of four species of this genus (Uca maracoani Latreille, 1802-1803, U. uruguayensis Nobili, 1901, U. panacea Novak & Salmon, 1974 e U. monilifera Rathbun, 1914), which occur in the American continent coast. Data used in the modeling were compiled from occurrence records available in the literature. We used Maxent and GARP programs for modelling, 10 climatic variables and three topographical variables. All variables were converted to a grid resolution of 0.0417 degrees. In both Maxent and GARP models the predicted geographical distribution of the species was larger than suggested by other observed data works, except for U. monilifera. According to the AUC criterion, the models generated by GARP were better than those obtained from Maxent. Evaluating the two models together, it is recommended conservation plans for species with restricted habitat (U. panaceae and U. monilifera) besides suggesting sampling of U. maracoani in the Brazilian northeast and U. uruguyaensis in the Brazilian southeast.


Caranguejos do gênero Uca Leach, 1814 (caranguejo "violinista") são um grupo bem conhecido e caracterizado por um acentuado dimorfismo sexual e assimetria da quela do macho. Atualmente, estão descritas 97 espécies no mundo. Objetivou-se estimar a distribuição geográfica potencial de 4 espécies do gênero Uca que ocorrem na costa do continente Americano: Uca maracoani Latreille, 1802-1803, U. uruguayensis Nobili, 1901, U. panacea Novak & Salmon, 1974 e U. monilifera Rathbun, 1914. Para modelar a distribuição dessas espécies nas Américas foram utilizados pontos de ocorrência compilados da literatura. Para a modelagem foram utilizados os programas Maxent e GARP a partir de 10 variáveis climáticas e três variáveis topográficas. Todas as variáveis foram convertidas para uma malha com resolução de 0,0417 graus. Nos dois modelos (Maxent e GARP) as espécies apresentaram distribuição geográfica maior do que sugerido por outros trabalhos de registro de ocorrência, com exceção de U. monilifera. Segundo o critério de área sob a curva (AUC), os modelos gerados pelo GARP apresentaram melhores resultados do que os modelos do Maxent. Entretanto, avaliando em conjunto os resultados dos dois modelos é possível melhor estabelecer planos de conservação para espécies com habitat restrito (U. panaceae e U. monilifera), além de recomendar um aumento na amostragem de U. maracoani no nordeste brasileiro e U. uruguyaensis no sudeste brasileiro, a fim de detectar possíveis aumentos na sua distribuição geográfica com base nas predições dos modelos de nicho.

13.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 102(3): 349-358, June 2007. mapas, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-452513

RESUMO

Understanding the different background landscapes in which malaria transmission occurs is fundamental to understanding malaria epidemiology and to designing effective local malaria control programs. Geology, geomorphology, vegetation, climate, land use, and anopheline distribution were used as a basis for an ecological classification of the state of Roraima, Brazil, in the northern Amazon Basin, focused on the natural history of malaria and transmission. We used unsupervised maximum likelihood classification, principal components analysis, and weighted overlay with equal contribution analyses to fine-scale thematic maps that resulted in clustered regions. We used ecological niche modeling techniques to develop a fine-scale picture of malaria vector distributions in the state. Eight ecoregions were identified and malaria-related aspects are discussed based on this classification, including 5 types of dense tropical rain forest and 3 types of savannah. Ecoregions formed by dense tropical rain forest were named as montane (ecoregion I), submontane (II), plateau (III), lowland (IV), and alluvial (V). Ecoregions formed by savannah were divided into steppe (VI, campos de Roraima), savannah (VII, cerrado), and wetland (VIII, campinarana). Such ecoregional mappings are important tools in integrated malaria control programs that aim to identify specific characteristics of malaria transmission, classify transmission risk, and define priority areas and appropriate interventions. For some areas, extension of these approaches to still-finer resolutions will provide an improved picture of malaria transmission patterns.


Assuntos
Humanos , Animais , Culicidae , Ecossistema , Insetos Vetores , Malária/prevenção & controle , Malária/transmissão , Algoritmos , Brasil , Análise por Conglomerados , Densidade Demográfica , Análise de Componente Principal , Estações do Ano , Clima Tropical
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