RESUMO
Mulinia lateralis is a native bivalve from the Western Atlantic Ocean, distributed from the Gulf of Saint Lawrence in Canada to Yucatan in Mexico. Based on morphological and genetic data of specimens collected in shrimp farms, in this work, we confirm the presence of M. lateralis in the Gulf of Guayaquil, Ecuador. Presence and its consequences of this invasive bivalve in the region is discussed.
Mulinia lateralis es un bivalvo nativo de las aguas del Océano Atlántico Occidental, distribuido desde el Golfo de Saint Lawrence en Canadá hasta Yucatán en México. En este trabajo, la presencia de M. lateralis es confirmada en el Golfo de Guayaquil, Ecuador, con base en datos morfológicos y genéticos de ejemplares colectados en camaroneras. Se presenta una discusión sobre la presencia y consecuencias de este bivalvo invasor en la región.
RESUMO
Methods and implementations of DNA-based identification are well established in several forensic contexts. However, assessing the statistical power of these methods has been largely overlooked, except in the simplest cases. In this paper we outline general methods for such power evaluation, and apply them to a large set of family reunification cases, where the objective is to decide whether a person of interest (POI) is identical to the missing person (MP) in a family, based on the DNA profile of the POI and available family members. As such, this application closely resembles database searching and disaster victim identification (DVI). If parents or children of the MP are available, they will typically provide sufficient statistical evidence to settle the case. However, if one must resort to more distant relatives, it is not a priori obvious that a reliable conclusion is likely to be reached. In these cases power evaluation can be highly valuable, for instance in the recruitment of additional family members. To assess the power in an identification case, we advocate the combined use of two statistics: the Probability of Exclusion, and the Probability of Exceedance. The former is the probability that the genotypes of a random, unrelated person are incompatible with the available family data. If this is close to 1, it is likely that a conclusion will be achieved regarding general relatedness, but not necessarily the specific relationship. To evaluate the ability to recognize a true match, we use simulations to estimate exceedance probabilities, i.e. the probability that the likelihood ratio will exceed a given threshold, assuming that the POI is indeed the MP. All simulations are done conditionally on available family data. Such conditional simulations have a long history in medical linkage analysis, but to our knowledge this is the first systematic forensic genetics application. Also, for forensic markers mutations cannot be ignored and therefore current models and implementations must be extended. All the tools are freely available in Familias (http://www.familias.no) empowered by the R library paramlink. The above approach is applied to a large and important data set: 'The missing grandchildren of Argentina'. We evaluate the power of 196 families from the DNA reference databank (Banco Nacional de Datos Genéticos, http://www.bndg.gob.ar. As a result we show that 58 of the families have poor statistical power and require additional genetic data to enable a positive identification.
Assuntos
Impressões Digitais de DNA , Bases de Dados de Ácidos Nucleicos , Funções Verossimilhança , Linhagem , Algoritmos , Argentina , Humanos , Probabilidade , SoftwareRESUMO
The increase in the populations acquisition power in emerging countries like Brazil has resulted in increased consumption of meat, milk and their derivatives, and a consequent growing surveillance regarding the responsibility of maintaining the quality of these food products. The total or partial replacement by other than the species declared on the product label in meat, milk or derived products compromises the nature and quality of these products, hurting consumer choice rights, which may be based on medical and nutritional recommendations, the economic value of the product or habits and/or dietary restrictions of each specific culture. Species identification in dairy and meat products is important in food traceability. Although food matrices are complex and variable, biomolecular techniques are gradually being applied for species identification, having proven increasingly reliable, fast, specific and highly sensitive, even in mixed samples. For these reasons, this review intends to show the main molecular methods applied to adulteration detection in dairy and meat derivatives, including an already established method, such as the polymerase chain reaction (PCR), as well as more advanced technologies, such as real-time PCR, next-generation DNA sequencing methods and DNA biochip or DNA microarray, which have been gradually applied to the detection and quantification of exogenous DNA in food samples, even if present in small amounts.
O aumento do poder de compra da população, especialmente em países emergentes como o Brasil, foi seguido pelo crescente consumo de carnes, leites e seus derivados, assim como pela maior exigência por padrões de qualidade destes produtos. Os diferentes tipos de fraude podem comprometer a qualidade e ferir os direitos do consumidor, sendo relevante a aplicação de métodos mais sensíveis e específicos para investigação da autenticidade de gêneros alimentícios de origem animal. A substituição total ou parcial de carne, leite ou derivados, de outra espécie animal que não a declarada no rótulo dos produtos, compromete a natureza e a qualidade destes produtos, prejudicando os direitos de escolha dos consumidores, que podem estar relacionados a recomendações médicas e nutricionais, ao valor econômico do produto ou sobre os hábitos e/ou restrições alimentares específicos de cada cultura. A identificação das espécies animais que deram origem aos produtos cárneos e lácteos e importante para a rastreabilidade dos alimentos. Embora matrizes alimentares tenham composição complexa e variável, técnicas biomoleculares têm sido cada vez mais utilizadas para a identificação de espécies animais, uma vez que tem sido demonstrada a confiabilidade, especificidade, rapidez e alta sensibilidade, mesmo quando utilizadas em amostras mistas. Esta revisão teve como objetivo apresentar os principais métodos moleculares que podem ser utilizados para a detecção da adulteração de espécies em derivados cárneos e lácteos, incluindo métodos já bem estabelecidos, tais como a reação em cadeia da polimerase (PCR), bem como as tecnologias mais avançadas, como a PCR em tempo real, os métodos de sequenciamento de DNA de ultima geração e o biochip de DNA ou DNA microarray. Esses métodos moleculares vêm sendo utilizados, com sucesso, na detecção e quantificação de DNA exógeno em amostras de alimentos, mesmo que este DNA esteja presente em pequenas quantidades.
Assuntos
Humanos , Animais , Alimentos de Origem Animal , Análise de Sequência de DNA , Contaminação de Alimentos/análise , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/veterinária , Reação em Cadeia da Polimerase/veterináriaRESUMO
The increase in the populations acquisition power in emerging countries like Brazil has resulted in increased consumption of meat, milk and their derivatives, and a consequent growing surveillance regarding the responsibility of maintaining the quality of these food products. The total or partial replacement by other than the species declared on the product label in meat, milk or derived products compromises the nature and quality of these products, hurting consumer choice rights, which may be based on medical and nutritional recommendations, the economic value of the product or habits and/or dietary restrictions of each specific culture. Species identification in dairy and meat products is important in food traceability. Although food matrices are complex and variable, biomolecular techniques are gradually being applied for species identification, having proven increasingly reliable, fast, specific and highly sensitive, even in mixed samples. For these reasons, this review intends to show the main molecular methods applied to adulteration detection in dairy and meat derivatives, including an already established method, such as the polymerase chain reaction (PCR), as well as more advanced technologies, such as real-time PCR, next-generation DNA sequencing methods and DNA biochip or DNA microarray, which have been gradually applied to the detection and quantification of exogenous DNA in food samples, even if present in small amounts.(AU)
O aumento do poder de compra da população, especialmente em países emergentes como o Brasil, foi seguido pelo crescente consumo de carnes, leites e seus derivados, assim como pela maior exigência por padrões de qualidade destes produtos. Os diferentes tipos de fraude podem comprometer a qualidade e ferir os direitos do consumidor, sendo relevante a aplicação de métodos mais sensíveis e específicos para investigação da autenticidade de gêneros alimentícios de origem animal. A substituição total ou parcial de carne, leite ou derivados, de outra espécie animal que não a declarada no rótulo dos produtos, compromete a natureza e a qualidade destes produtos, prejudicando os direitos de escolha dos consumidores, que podem estar relacionados a recomendações médicas e nutricionais, ao valor econômico do produto ou sobre os hábitos e/ou restrições alimentares específicos de cada cultura. A identificação das espécies animais que deram origem aos produtos cárneos e lácteos e importante para a rastreabilidade dos alimentos. Embora matrizes alimentares tenham composição complexa e variável, técnicas biomoleculares têm sido cada vez mais utilizadas para a identificação de espécies animais, uma vez que tem sido demonstrada a confiabilidade, especificidade, rapidez e alta sensibilidade, mesmo quando utilizadas em amostras mistas. Esta revisão teve como objetivo apresentar os principais métodos moleculares que podem ser utilizados para a detecção da adulteração de espécies em derivados cárneos e lácteos, incluindo métodos já bem estabelecidos, tais como a reação em cadeia da polimerase (PCR), bem como as tecnologias mais avançadas, como a PCR em tempo real, os métodos de sequenciamento de DNA de ultima geração e o biochip de DNA ou DNA microarray. Esses métodos moleculares vêm sendo utilizados, com sucesso, na detecção e quantificação de DNA exógeno em amostras de alimentos, mesmo que este DNA esteja presente em pequenas quantidades.(AU)