RESUMO
Livestock rabies is endemic in Peru. Hence, its persistence and annual dissemination represent an important economic impact, especially for impoverished farming communities. The disease is mostly transmitted by the hematophagous bat Desmodus rotundus. The present study aimed to adapt an existing predictive model of the occurrence of livestock rabies to Peru, in which the risk of rabies transmission from bats to livestock was estimated using decision-tree models of receptivity and vulnerability. Official rabies surveillance data between 2010 and 2015 were used along with possible risk factors, such as livestock biomass, environmental changes, and geomorphological characteristics. Several scenarios were established to evaluate the prediction of the occurrence of livestock rabies cases by determining more than one cut-off point of the receptivity variables. During the study period, the precision of the model was estimated through the sensitivity (39.46%) and specificity (98.64%) by using confusion matrices. Targeting control efforts, especially in districts with a high estimated risk, could represent the prevention of a significant proportion of livestock rabies cases, which would optimize the human and economic resources of the Peruvian surveillance service. However, the quality of data produced by the surveillance should be improved not only to obtain higher model precision but also to allow the adequate planning of control actions.(AU)
Raiva de herbívoros é endêmica no Peru. Consequentemente, sua disseminação persistente e anual representa um importante impacto econômico, especialmente às comunidades rurais empobrecidas. A doença é principalmente transmitida pelo morcego hematófago Desmodus rotundus. Este estudo tem por objetivo adaptar um modelo preditivo pré-existente às ocorrências de raiva de herbívoros no Peru, no qual o risco de transmissão de morcegos para os herbívoros foi estimado por meio de árvores de cenários de receptividade e vulnerabilidade. Foram usados os dados oficiais de vigilância da raiva entre 2010 e 2015, assim como os possíveis fatores de risco, tais quais a biomassa de animais, alterações ambientais e características geomorfológicas. Diversos cenários foram criados para avaliar a predição da ocorrência da raiva por meio da determinação de diversos pontos de corte das variáveis de receptividade. Durante o período de estudo, a precisão do modelo foi estimada por meio da sensibilidade (39,46%) e especificidade (98,64%), utilizando matrizes de confusão. Focando em esforços de controle, especialmente em distritos com elevado risco estimado, seria possível prevenir uma proporção significativa dos focos, o que poderia otimizar os recursos humanos e econômicos do serviço oficial peruano. Entretanto, a qualidade dos dados produzidos pelo sistema de vigilância deveria ser melhorada não somente para obter maior precisão do modelo, mas também para possibilitar o melhor planejamento das ações de controle desta doença.(AU)
Assuntos
Animais , Vírus da Raiva , Modelos de Riscos Proporcionais , Quirópteros/virologia , Infecções/diagnósticoRESUMO
Livestock rabies is endemic in Peru. Hence, its persistence and annual dissemination represent an important economic impact, especially for impoverished farming communities. The disease is mostly transmitted by the hematophagous bat Desmodus rotundus. The present study aimed to adapt an existing predictive model of the occurrence of livestock rabies to Peru, in which the risk of rabies transmission from bats to livestock was estimated using decision-tree models of receptivity and vulnerability. Official rabies surveillance data between 2010 and 2015 were used along with possible risk factors, such as livestock biomass, environmental changes, and geomorphological characteristics. Several scenarios were established to evaluate the prediction of the occurrence of livestock rabies cases by determining more than one cut-off point of the receptivity variables. During the study period, the precision of the model was estimated through the sensitivity (39.46%) and specificity (98.64%) by using confusion matrices. Targeting control efforts, especially in districts with a high estimated risk, could represent the prevention of a significant proportion of livestock rabies cases, which would optimize the human and economic resources of the Peruvian surveillance service. However, the quality of data produced by the surveillance should be improved not only to obtain higher model precision but also to allow the adequate planning of control actions.(AU)
Raiva de herbívoros é endêmica no Peru. Consequentemente, sua disseminação persistente e anual representa um importante impacto econômico, especialmente às comunidades rurais empobrecidas. A doença é principalmente transmitida pelo morcego hematófago Desmodus rotundus. Este estudo tem por objetivo adaptar um modelo preditivo pré-existente às ocorrências de raiva de herbívoros no Peru, no qual o risco de transmissão de morcegos para os herbívoros foi estimado por meio de árvores de cenários de receptividade e vulnerabilidade. Foram usados os dados oficiais de vigilância da raiva entre 2010 e 2015, assim como os possíveis fatores de risco, tais quais a biomassa de animais, alterações ambientais e características geomorfológicas. Diversos cenários foram criados para avaliar a predição da ocorrência da raiva por meio da determinação de diversos pontos de corte das variáveis de receptividade. Durante o período de estudo, a precisão do modelo foi estimada por meio da sensibilidade (39,46%) e especificidade (98,64%), utilizando matrizes de confusão. Focando em esforços de controle, especialmente em distritos com elevado risco estimado, seria possível prevenir uma proporção significativa dos focos, o que poderia otimizar os recursos humanos e econômicos do serviço oficial peruano. Entretanto, a qualidade dos dados produzidos pelo sistema de vigilância deveria ser melhorada não somente para obter maior precisão do modelo, mas também para possibilitar o melhor planejamento das ações de controle desta doença.(AU)
Assuntos
Animais , Vírus da Raiva , Modelos de Riscos Proporcionais , Quirópteros/virologia , Infecções/diagnósticoRESUMO
Vampire bats became the main reservoir of rabies in Latin America, where the disease remains one of the most important viral zoonoses affecting humans and livestock. In Peru, the most affected livestock are cattle. The official data of 1,729 cases of bovine rabies were evaluated between 2003 and 2017 through a descriptive analysis, decomposition of the time-series and spatio-temporal analyses. Although the cases did not present a defined seasonality, the trend seemed to increase for several years. The bovine rabies cases are more frequent in the inter-Andean valleys than in other regions of the Amazon plains. The highest case density was observed in the regions of Ayacucho, Cuzco and Apurímac, all located in the Andes. It is necessary to review the current national program for the prevention and control of rabies in livestock, incorporating concepts of the ecology of vampire bats, as well as the prediction of the infection waves geographic and temporal spread. These approaches could improve the efficiency of other current prevention measures that have not shown the expected control effects, such as indiscriminate culling of vampire bats.
Assuntos
Doenças dos Bovinos/epidemiologia , Vírus da Raiva/isolamento & purificação , Raiva/veterinária , Animais , Bovinos , Doenças dos Bovinos/virologia , Quirópteros/virologia , Vetores de Doenças , Ecologia , América Latina , Gado , Peru/epidemiologia , Raiva/epidemiologia , Raiva/virologia , Análise Espaço-Temporal , ZoonosesRESUMO
The objectives of the study were to detect and genotype Cryptosporidium spp. and Giardia intestinalis in wastewater samples obtained from five cities with high transit of people in the State of São Paulo, Brazil, and at the entrance of a Wastewater Treatment Plant (WWTP) in Lima, Peru. Samples were collected and concentrated by centrifugation. The genomic DNA was extracted for molecular characterization by nested PCR for Cryptosporidium and double nested PCR for Giardia, followed by sequencing and phylogenetic analysis. G. intestinalis was found in 63.6 % of the samples, and the human assemblages A and B were identified. Cryptosporidium sp. was found in 36.4 % of the samples, and the species were corresponding to Cryptosporidium hominis, Cryptosporidium cuniculus, and Cryptosporidium muris. Results revealed the presence of human pathogenic Cryptosporidium species and G. intestinalis human pathogenic assemblages. Molecular tools highlight the importance to map the genetic diversity of these parasites, as well as to detect their epidemiological circulation pathway in the environment.
Assuntos
Cryptosporidium/isolamento & purificação , Giardia lamblia/isolamento & purificação , Águas Residuárias/parasitologia , Brasil , Cidades , Cryptosporidium/genética , Genótipo , Giardia lamblia/genética , Peru , Filogenia , Reação em Cadeia da Polimerase , RNA de Protozoário/genética , RNA Ribossômico 18S/genética , Análise de Sequência de DNARESUMO
A cross sectional study was carried out between May and November 2011 to investigate the epidemiological situation of bovine tuberculosis (bTB) in the state of São Paulo, Brazil. The state was divided into seven regions. Three hundred farms from each region, with reproductive activity, were randomly chosen and included as primary sample units. A fixed number of bovine females, older than 2 years of age, were randomly selected and tested, using the comparative cervical tuberculin test. An epidemiological questionnaire based survey was conducted in the selected farms. Our results show that in the state of São Paulo, the apparent prevalence of positive farms was 9% (95% confidence interval, 95% CI = 7.8 10.5%). The prevalence in the individual regions varied between 3.5% (95% CI = 1.7 ? 6.8%) and 13.9% (95% CI = 10.2 18.8%). The apparent prevalence of positive animals in the state was 1.3% (95% CI = 0.9 1.7%) and varied from 0.3% (95% CI = 0.2 0.6%) to 2.5% (95% CI = 1.4 4.5%) in the regions. The risk factors associated with tuberculosis in the state were (i) number of adult females in a herd is ? 24 (Odds ratio, OR = 1.91, 95% CI = 1.32 2.75), (ii) type of farm enterprise (dairy: OR = 2.70, 95% CI = 1.40 5.21; mixed: OR = 2.03, 95% CI = 1.08 3.82), (iii) milking process (milking parlor: OR = 4.12, 95% CI = 1.46 11.64; portable milking machine: OR = 2.94, 95% CI = 1.42 6.09), and (iv) pasture sharing (OR = 1.58, 95% CI = 1.07 2.33). The state of São Paulo should implement a structured surveillance system to detect and mitigate the disease. Further, an efficient animal health education program, which encourages the farmers to test replacement animals for bTB prior to introduction in their herds and to avoid pasture sharing with farms of unknown sanitary conditions should also be implemented.(AU)
Um estudo transversal foi realizado entre maio e novembro de 2011 para determinar a situação epidemiológica da tuberculose bovina (bTB) no estado de São Paulo, Brasil. O estado foi dividido em sete regiões. Trezentas propriedades com atividade reprodutiva de bovinos de cada região foram aleatoriamente selecionadas e consideradas unidades primárias de amostragem. Um número fixo de fêmeas bovinas com idade superior a dois anos foram aleatoriamente selecionadas e testadas usando o teste cervical comparativo. Um inquérito epidemiológico, utilizando um questionário específico, foi realizado em cada propriedade selecionada. Os nossos resultados indicam que no estado de São Paulo, a prevalência aparente de propriedades positiva foi de 9% (intervalo de confiança de 95%, IC95% = 7,8 10,5%). A prevalência nas diferentes regiões variou entre 3,5% (IC95% = 1,7 6,8%) e 13,9% (IC95% = 10,2 18,8%). A prevalência aparente de animais positivos no estado foi 1,3% (IC95% = 0,9 1,7%) e variou de 0,3% (IC95% = 0,2 0,6%) até 2,5% (IC95% = 1,4 4,5%) nas regiões. Os fatores de risco associados à tuberculose no estado foram (i) número de fêmeas adultas nos rebanhos ? 24 (Odds ratio, OR = 1,91, IC95% = 1,32 2,75), (ii) tipo de exploração (leite: OR = 2,70, IC95% = 1,4 5,21), misto: OR = 2,03, IC95% = 1,08 3,82), (iii) (sala de ordenha: OR = 4,12, IC95% = 1,46 11,64; ordenha mecânica: OR = 2,94, IC95% = 1,42 6,09) e (iv) compartilhamento de pastagens (OR = 1,58, IC95% = 1,07 2,33). O estado de São Paulo deve implementar um sistema de vigilância estruturado capaz de detectar e mitigar a doença. Além disso, um programa de educação em saúde animal eficiente, capaz de encorajar os proprietários a testar animais de reposição para bTB previamente à introdução no rebanho e evitar o compartilhamento de pastagens com propriedades cuja condição sanitária é desconhecida, deve ser implementado.(AU)
Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Tuberculose Bovina/epidemiologia , Doenças dos Bovinos/epidemiologia , Prevalência , Fatores de Risco , BovinosRESUMO
A cross sectional study was carried out between May and November 2011 to investigate the epidemiological situation of bovine tuberculosis (bTB) in the state of São Paulo, Brazil. The state was divided into seven regions. Three hundred farms from each region, with reproductive activity, were randomly chosen and included as primary sample units. A fixed number of bovine females, older than 2 years of age, were randomly selected and tested, using the comparative cervical tuberculin test. An epidemiological questionnaire based survey was conducted in the selected farms. Our results show that in the state of São Paulo, the apparent prevalence of positive farms was 9% (95% confidence interval, 95% CI = 7.8 10.5%). The prevalence in the individual regions varied between 3.5% (95% CI = 1.7 ? 6.8%) and 13.9% (95% CI = 10.2 18.8%). The apparent prevalence of positive animals in the state was 1.3% (95% CI = 0.9 1.7%) and varied from 0.3% (95% CI = 0.2 0.6%) to 2.5% (95% CI = 1.4 4.5%) in the regions. The risk factors associated with tuberculosis in the state were (i) number of adult females in a herd is ? 24 (Odds ratio, OR = 1.91, 95% CI = 1.32 2.75), (ii) type of farm enterprise (dairy: OR = 2.70, 95% CI = 1.40 5.21; mixed: OR = 2.03, 95% CI = 1.08 3.82), (iii) milking process (milking parlor: OR = 4.12, 95% CI = 1.46 11.64; portable milking machine: OR = 2.94, 95% CI = 1.42 6.09), and (iv) pasture sharing (OR = 1.58, 95% CI = 1.07 2.33). The state of São Paulo should implement a structured surveillance system to detect and mitigate the disease. Further, an efficient animal health education program, which encourages the farmers to test replacement animals for bTB prior to introduction in their herds and to avoid pasture sharing with farms of unknown sanitary conditions should also be implemented.
Um estudo transversal foi realizado entre maio e novembro de 2011 para determinar a situação epidemiológica da tuberculose bovina (bTB) no estado de São Paulo, Brasil. O estado foi dividido em sete regiões. Trezentas propriedades com atividade reprodutiva de bovinos de cada região foram aleatoriamente selecionadas e consideradas unidades primárias de amostragem. Um número fixo de fêmeas bovinas com idade superior a dois anos foram aleatoriamente selecionadas e testadas usando o teste cervical comparativo. Um inquérito epidemiológico, utilizando um questionário específico, foi realizado em cada propriedade selecionada. Os nossos resultados indicam que no estado de São Paulo, a prevalência aparente de propriedades positiva foi de 9% (intervalo de confiança de 95%, IC95% = 7,8 10,5%). A prevalência nas diferentes regiões variou entre 3,5% (IC95% = 1,7 6,8%) e 13,9% (IC95% = 10,2 18,8%). A prevalência aparente de animais positivos no estado foi 1,3% (IC95% = 0,9 1,7%) e variou de 0,3% (IC95% = 0,2 0,6%) até 2,5% (IC95% = 1,4 4,5%) nas regiões. Os fatores de risco associados à tuberculose no estado foram (i) número de fêmeas adultas nos rebanhos ? 24 (Odds ratio, OR = 1,91, IC95% = 1,32 2,75), (ii) tipo de exploração (leite: OR = 2,70, IC95% = 1,4 5,21), misto: OR = 2,03, IC95% = 1,08 3,82), (iii) (sala de ordenha: OR = 4,12, IC95% = 1,46 11,64; ordenha mecânica: OR = 2,94, IC95% = 1,42 6,09) e (iv) compartilhamento de pastagens (OR = 1,58, IC95% = 1,07 2,33). O estado de São Paulo deve implementar um sistema de vigilância estruturado capaz de detectar e mitigar a doença. Além disso, um programa de educação em saúde animal eficiente, capaz de encorajar os proprietários a testar animais de reposição para bTB previamente à introdução no rebanho e evitar o compartilhamento de pastagens com propriedades cuja condição sanitária é desconhecida, deve ser implementado.