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1.
Rev. bras. entomol ; Rev. bras. entomol;56(2): 249-256, Apr.-June 2012. graf, mapas, tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-640839

RESUMO

Genetic variability of a population of Aedes aegypti from Paraná, Brazil, using the mitochondrial ND4 gene. To analyze the genetic variability of populations of Aedes aegypti, 156 samples were collected from 10 municipalities in the state of Paraná, Brazil. A 311 base pairs (bp) region of the NADH dehydrogenase subunit 4 (ND4) mitochondrial gene was examined. An analysis of this fragment identified eight distinct haplotypes. The mean genetic diversity was high (h = 0.702; p = 0.01556). AMOVA analysis indicated that most of the variation (67%) occurred within populations and the F ST value (0.32996) was highly significant. F ST values were significant in most comparisons among cities. The isolation by distance was not significant (r = -0.1216 and p = 0, 7550), indicating that genetic distance is not related to geographic distance. Neighbor-joining analysis showed two genetically distinct groups within Paraná. The DNA polymorphism and AMOVA data indicate a decreased gene flow in populations from Paraná, which can result in increased vectorial competence.


Variabilidade genética de uma população de Aedes aegypti do Paraná, Brasil, usando o gene mitocondrial ND4. Para analisar a variabilidade genética de populações de Aedes aegypti, 156 amostras foram coletadas em dez cidades do estado do Paraná, Brasil. Foi examinada a distribuição dos 311 pares de base do gene que codifica a subunidade 4 da enzima NADH desidrogenase. Pela amplificação e o sequenciamento deste fragmento foram identificados 8 haplótipos distintos. Os valores de diversidade genética foram altos (h = 0.702; p = 0.01556). A análise de AMOVA indicou que a maior variação ocorreu dentro das populações com um valor de FST de 0.32996 altamente significativo. Valores de FST foram significativos na maior das comparações entre as cidades. O isolamento por distância não foi significativo (r = -0.1216 e p = 0.755), indicando que a distância genética não está relacionada a distância geográfica. A análise de Neighbor-joining mostrou dois grupos genéticos distintos dentro do estado do Paraná, grupo I e grupo II. O polimorfismo de DNA e os dados de AMOVA indicam decréscimo de fluxo gênico no estado do Paraná, o que pode resultar em aumento da competência vetorial da população.

2.
Protein Expr Purif ; 30(1): 117-23, 2003 Jul.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-12821329

RESUMO

NtrC is a bacterial enhancer-binding protein (EBP) that activates transcription by the sigma54 RNA polymerase holoenzyme. NtrC has a three domain structure typical of EBP family. In Herbaspirillum seropedicae, an endophytic diazotroph, NtrC regulates several operons involved in nitrogen assimilation, including glnAntrBC. In order to over-express and purify the NtrC protein, DNA fragments containing the complete structural gene for the whole protein, and for the N-terminal+Central and Central+C-terminal domains were cloned into expression vectors. The NtrC and NtrC(N-terminal+Central) proteins were over-expressed as His-tag fusion proteins upon IPTG addition, solubilized using N-lauryl-sarcosyl and purified by metal affinity chromatography. The over-expressed His-tag-NtrC(Central+C-terminal) fusion protein was partially soluble and was also purified by affinity chromatography. DNA band-shift assays showed that the NtrC protein and the Central+C-terminal domains bound specifically to the H. seropedicae glnA promoter region. The C-terminal domain is presumably necessary for DNA-protein interaction and DNA-binding does not require a phosphorylated protein.


Assuntos
Proteínas de Bactérias/isolamento & purificação , Proteínas de Bactérias/metabolismo , Proteínas de Ligação a DNA/isolamento & purificação , Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo , Herbaspirillum , Transativadores , Proteínas de Bactérias/química , DNA/metabolismo , Proteínas de Ligação a DNA/química , Ensaio de Desvio de Mobilidade Eletroforética , Expressão Gênica , Histidina , Proteínas PII Reguladoras de Nitrogênio , Estrutura Terciária de Proteína , Proteínas Recombinantes de Fusão/química , Proteínas Recombinantes de Fusão/isolamento & purificação , Proteínas Recombinantes de Fusão/metabolismo , Solubilidade , Fatores de Transcrição/química , Fatores de Transcrição/isolamento & purificação , Fatores de Transcrição/metabolismo
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