RESUMO
Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.(AU)
A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.(AU)
Assuntos
Animais , Peixes , Primers do DNA , GenéticaRESUMO
Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.
A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.
Assuntos
Animais , Genética , Peixes , Primers do DNARESUMO
ABSTRACT: Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.
RESUMO: A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.
RESUMO
Piaractus mesopotamicus is a tropical fish under threat because of declines in the number of wild populations. Restocking programs have been developed as a conservation method, and the genetic monitoring of populations and broodstocks is important to ensure the viability of such programs. The objective of the current, unprecedented experiment was to evaluate the genetic diversity of P. mesopotamicus wild populations (WPs) and broodstocks (BSs) using microsatellites markers for supplying the restocking programs in the Tietê and Grande rivers. Six microsatellite loci were amplified using the DNA obtained from the caudal fin of 279 adult fish. The observed intrapopulation genetic variability was high with mean heterozygosity ranging from 0.203 to 0.833. The number of alleles per locus ranged from three (loci Pme28 and Pme32) to thirteen (loci Pme4, Pme5 and Pme14), and there were allele differences between WPsxWPs and WPsxBSs. This differentiation was confirmed by the dendrogram analysis that showed three specific clusters. Four alleles were shared in the WPs2012xBSs. Positive FIS values indicated the presence of endogamy in seven out of ten samples obtained from the WPs. The AMOVA analysis and FST values indicated moderate and high genetic differences in WPsxWPs and high genetic differences in WPsxBSs. The genetic distance and genetic identity values and number of migrants...(AU)
Piaractus mesopotamicus é um peixe tropical que nos últimos anos tem apresentado uma diminuição no número de populações naturais. Programas de repovoamento vêm sendo utilizados como método de conservação, entretanto, o monitoramento genético das populações e dos estoques de reprodutores é importante para conferir a viabilidade desse tipo de programas. O objetivo do presente estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de populações selvagens (WPs) e estoques de reprodutores (BSs) de P. mesopotamicus utilizados em programas de repovoamento dos rios Tietê e Grande, através de marcadores microssatélite. Seis loci microssatélite foram amplificados usando DNA extraído de nadadeira caudal de 279 indivíduos adultos. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional, com medias de heterozigosidade observada entre 0.203 e 0.833. O número de alelos por locus foi de três (locus Pme28 e Pme32) a 13 (locus Pme4, Pme5 e Pme14) e houve diferenciação de alelos entre WPsxWPs e WPsxBSs. Essa diferenciação foi confirmada pela análise do dendrograma que mostrou a formação de três agrupamentos específicos. Observaram-se quatro alelos compartilhados entre WPs2012xBSs. Valores positivos de FIS mostraram a presença de endogamia em sete das 10 coletas realizadas nas WPs. A análise de AMOVA e do FST indicou moderada e muito alta diferenciação genética entre WPsxWPs...(AU)
Assuntos
Animais , Variação Genética , Peixes/genética , Rios , Biodiversidade , Repetições de MicrossatélitesRESUMO
Prochilodus lineatus is a tropical fish that in recent years as shown a decrease in the number of wild populations. Restocking programs have been developed as a conservation method, and the genetic monitoring of populations and broodstocks is important to ensure the viability of such programs. The objective of the current study was to evaluate the genetic diversity of wild samples (WSamp) and broodstocks of P. lineatus in restocking programs in the Tietê, Grande, Pardo and Mogi-Guaçu Rivers (São Paulo - Brazil) using microsatellite markers. High intra-population genetic variability was observed. The number of alleles per locus ranged from three to seven, and was detected the differentiation of alleles among WSamp and the broodstocks. This differentiation was confirmed using a dendrogram analysis. Positive values of the FIS indicated the presence of endogamy in seven of 10 WSamp. The AMOVA and FST indicated small and moderate genetic differentiation among these WSamp and high genetic differentiation in comparison to the broodstocks. This differentiation was confirmed by the values of the genetic distance, genetic identity and number of migratory individuals. The results indicated that there was high intra-population genetic variability, genetic similarity in WSamp and broodstocks and differentiation between WSamp and broodstocks. We intend that this work could be used to assist restocking programs in of P. lineatus in the studied region and serve as a model of monitoring for other programs conducted in Brazil.(AU)
Prochilodus lineatus é um peixe tropical que nos últimos anos tem apresentado uma redução no número de populações selvagens. Programas de repovoamento foram desenvolvidos como método de conservação, e o monitoramento genético das populações e reprodutores é importante para assegurar a viabilidade de tais programas. O objetivo do estudo foi avaliar a diversidade genética de amostras selvagens (WSamp) e reprodutores de P. lineatus do programa de repovoamento nos rios Tietê, Grande, Pardo e Mogi-Guaçu (São Paulo - Brasil), utilizando marcadores microssatélites. Alta variabilidade genética intra-populacional foi observada. O número de alelos por loco variou de três a sete e foi detectada a diferenciação dos alelos entre WSamp e os reprodutores. Essa diferenciação foi confirmada por meio da análise do dendrograma. Os valores positivos da FIS indicaram a presença de endogamia em sete das 10 WSamp. A AMOVA e o FST indicaram pequena e moderada diferenciação genética entre as WSamp e alta diferenciação genética em comparação com os reprodutores. Esta diferenciação foi confirmada pelos valores de distância e identidade genética e pelo número de indivíduos migrantes. Os resultados indicaram que houve alta variabilidade genética intra-populacional, similaridade genética em WSamp e reprodutores e diferenciação entre WSamp e reprodutores. Pretende-se que este trabalho possa ser usado para auxiliar os programas de repovoamento de P. lineatus na região estudada e sirva como modelo demonitoramento para outros programas realizados no Brasil.(AU)
Assuntos
Animais , Biodiversidade , Variação Genética , Caraciformes , Conservação dos Recursos Naturais , Repetições de MicrossatélitesRESUMO
Prochilodus lineatus is a tropical fish that in recent years as shown a decrease in the number of wild populations. Restocking programs have been developed as a conservation method, and the genetic monitoring of populations and broodstocks is important to ensure the viability of such programs. The objective of the current study was to evaluate the genetic diversity of wild samples (WSamp) and broodstocks of P. lineatus in restocking programs in the Tietê, Grande, Pardo and Mogi-Guaçu Rivers (São Paulo - Brazil) using microsatellite markers. High intra-population genetic variability was observed. The number of alleles per locus ranged from three to seven, and was detected the differentiation of alleles among WSamp and the broodstocks. This differentiation was confirmed using a dendrogram analysis. Positive values of the FIS indicated the presence of endogamy in seven of 10 WSamp. The AMOVA and FST indicated small and moderate genetic differentiation among these WSamp and high genetic differentiation in comparison to the broodstocks. This differentiation was confirmed by the values of the genetic distance, genetic identity and number of migratory individuals. The results indicated that there was high intra-population genetic variability, genetic similarity in WSamp and broodstocks and differentiation between WSamp and broodstocks. We intend that this work could be used to assist restocking programs in of P. lineatus in the studied region and serve as a model of monitoring for other programs conducted in Brazil.
Prochilodus lineatus é um peixe tropical que nos últimos anos tem apresentado uma redução no número de populações selvagens. Programas de repovoamento foram desenvolvidos como método de conservação, e o monitoramento genético das populações e reprodutores é importante para assegurar a viabilidade de tais programas. O objetivo do estudo foi avaliar a diversidade genética de amostras selvagens (WSamp) e reprodutores de P. lineatus do programa de repovoamento nos rios Tietê, Grande, Pardo e Mogi-Guaçu (São Paulo - Brasil), utilizando marcadores microssatélites. Alta variabilidade genética intra-populacional foi observada. O número de alelos por loco variou de três a sete e foi detectada a diferenciação dos alelos entre WSamp e os reprodutores. Essa diferenciação foi confirmada por meio da análise do dendrograma. Os valores positivos da FIS indicaram a presença de endogamia em sete das 10 WSamp. A AMOVA e o FST indicaram pequena e moderada diferenciação genética entre as WSamp e alta diferenciação genética em comparação com os reprodutores. Esta diferenciação foi confirmada pelos valores de distância e identidade genética e pelo número de indivíduos migrantes. Os resultados indicaram que houve alta variabilidade genética intra-populacional, similaridade genética em WSamp e reprodutores e diferenciação entre WSamp e reprodutores. Pretende-se que este trabalho possa ser usado para auxiliar os programas de repovoamento de P. lineatus na região estudada e sirva como modelo demonitoramento para outros programas realizados no Brasil.
Assuntos
Animais , Biodiversidade , Caraciformes , Conservação dos Recursos Naturais , Variação Genética , Repetições de MicrossatélitesRESUMO
Piaractus mesopotamicus is a tropical fish under threat because of declines in the number of wild populations. Restocking programs have been developed as a conservation method, and the genetic monitoring of populations and broodstocks is important to ensure the viability of such programs. The objective of the current, unprecedented experiment was to evaluate the genetic diversity of P. mesopotamicus wild populations (WPs) and broodstocks (BSs) using microsatellites markers for supplying the restocking programs in the Tietê and Grande rivers. Six microsatellite loci were amplified using the DNA obtained from the caudal fin of 279 adult fish. The observed intrapopulation genetic variability was high with mean heterozygosity ranging from 0.203 to 0.833. The number of alleles per locus ranged from three (loci Pme28 and Pme32) to thirteen (loci Pme4, Pme5 and Pme14), and there were allele differences between WPsxWPs and WPsxBSs. This differentiation was confirmed by the dendrogram analysis that showed three specific clusters. Four alleles were shared in the WPs2012xBSs. Positive FIS values indicated the presence of endogamy in seven out of ten samples obtained from the WPs. The AMOVA analysis and FST values indicated moderate and high genetic differences in WPsxWPs and high genetic differences in WPsxBSs. The genetic distance and genetic identity values and number of migrants...
Piaractus mesopotamicus é um peixe tropical que nos últimos anos tem apresentado uma diminuição no número de populações naturais. Programas de repovoamento vêm sendo utilizados como método de conservação, entretanto, o monitoramento genético das populações e dos estoques de reprodutores é importante para conferir a viabilidade desse tipo de programas. O objetivo do presente estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de populações selvagens (WPs) e estoques de reprodutores (BSs) de P. mesopotamicus utilizados em programas de repovoamento dos rios Tietê e Grande, através de marcadores microssatélite. Seis loci microssatélite foram amplificados usando DNA extraído de nadadeira caudal de 279 indivíduos adultos. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional, com medias de heterozigosidade observada entre 0.203 e 0.833. O número de alelos por locus foi de três (locus Pme28 e Pme32) a 13 (locus Pme4, Pme5 e Pme14) e houve diferenciação de alelos entre WPsxWPs e WPsxBSs. Essa diferenciação foi confirmada pela análise do dendrograma que mostrou a formação de três agrupamentos específicos. Observaram-se quatro alelos compartilhados entre WPs2012xBSs. Valores positivos de FIS mostraram a presença de endogamia em sete das 10 coletas realizadas nas WPs. A análise de AMOVA e do FST indicou moderada e muito alta diferenciação genética entre WPsxWPs...
Assuntos
Animais , Biodiversidade , Peixes/genética , Repetições de Microssatélites , Rios , Variação GenéticaRESUMO
The restocking programs are being used more frequently as methods of fish conservation. However, the reduction in the genetic diversity can affect survival of juveniles used in this programs and cause effects on the wild populations. The aim of this study was assess the genetic diversity in three broodstocks (BA, BB and BC) of pacu Piaractus mesopotamicus of a Hydropower plant in São Paulo - Brazil, using in restocking program of Tietê River. Nine RAPD primers were amplified used extracted DNA from 89 fin-clipping samples. Sixty-nine fragments were polymorphic, 15 had frequencies with significant differences (P<0.05), seven were excluded, and six were fixed fragments. High values for polymorphic fragments (47.83% to 71.01%) and Shannon index (0.270 to 0.424) were observed. Most of the genetic variation was found within the groups through the AMOVA analysis, which was confirmed by the results of the identity and genetic distance. Ancestry levels (FST) among the groups values indicated little and moderate genetic differentiation. The estimate of number of migrants by generation (Nm) indicated levels of gene flow. Moderate genetic divergence between groups (0.214 to 0.259) was observed. The results indicate high (BA and BB) and moderate (BC) variability within broodstocks and genetic differentiation among them. The fish stocks analyzed represent a genetic base that will allow the fish technicians to release juveniles without genetic risks to wild populations present in the river. These genetics procedures can be used as models for other migratory species.
Os programas de repovoamento estão sendo usados com mais frequência como métodos de conservação de peixes. No entanto, a redução na diversidade genética pode afetar a sobrevivência dos juvenis usados nesses programas e causar efeitos sobre as populações selvagens. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética de três estoques de reprodutores (BA, BB e BC) de pacu Piaractus mesopotamicus de uma hidrelétrica em São Paulo - Brasil, do programa de repovoamento do rio Tietê. Nove iniciadores RAPD amplificaram-se usando DNA extraído de 89 amostras de nadadeira. Sessenta e nove fragmentos foram polimórficos, 15 tiveram frequências com diferenças significativas (P<0.05), sete foram excluídos e seis foram fragmentos limitantes. Observaram-se altos valores de fragmentos polimórficos (47,83% a 71,01%) e de índice de Shannon. A maior variação genética observou-se dentro dos grupos através da análise de AMOVA, sendo confirmado com os resultados de identidade e distância genética. Os níveis de FST entre os grupos indicaram pequena e moderada diferenciação genética. O número de migrantes por geração (Nm) indicou níveis de fluxo gênico. Observou-se moderada divergência genética entre grupos (0,214 a 0,259). Os resultados indicaram alta (BA e BB) e moderada (BC) variabilidade dentro dos estoques e diferenciação genética entre eles. Os estoques de peixes analisados representam uma base genética que permitirá aos produtores liberar juvenis sem riscos genéticos para as populações naturais presentes no rio. Esses procedimentos genéticos podem ser utilizados como modelos para outras espécies migradoras.