RESUMO
Salmonella Enteritidis (SE) is a dominant serotype among non-typhoidal Salmonella which renders poultry products unsafe for human consumption. Due to frequent reporting of egg associated outbreaks, broiler breeder flocks are understudied although farm environment present supporting conditions for the growth of SE. In this study, two rapid detection techniques for SE were compared in terms of analytical sensitivity and the extent of SE contamination in broiler breeder farm environment was determined. Analytical sensitivity as limit of detection (LOD) was evaluated quantitatively for serotype specific PCR based on amplification of Sdf I gene and a commercially available sandwich ELISA for antigen detection. In triplicate experiments, tenfold serial dilutions of SE were prepared and tested with each technique. Using pure cultures, analytical sensitivity of PCR and ELISA were found to be 18.6 CFU/ml and 2.77×105 CFU/ml respectively. PCR (LOD, log 1.2) was found to be more sensitive and rapid than ELISA (LOD, log 5.4). Environmental swab samples (n = 260) were collected from 22 hen houses representing 8 broiler breeder farms located in and around Lahore and Sheikhupura districts of Punjab province. From each hen house swab samples were collected from litter, nests, feeders, drinkers, fans, pads, ceiling, walls and walkways. Following selective enrichment, pooled swab samples were subjected to PCR. Results showed that 36.3 % (8/22) hen houses were detected positive for SE. These findings suggest improvement in farm biosecurity measures and advocate implementation of integrated Salmonellosis control programs in broiler breeder houses to minimize carcass contamination.(AU)
Assuntos
Salmonella enteritidis , Ensaio de Imunoadsorção Enzimática/instrumentação , Testes de Sensibilidade Microbiana , Reação em Cadeia da Polimerase/instrumentaçãoRESUMO
O Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) exibe uma enorme variabilidade genética. Tal característica é criticamente importante para que o vírus possa se adaptar às mudanças ambientais e escapar do sistema imune do hospedeiro, desenvolver resistência à drogas e impedir o sucesso de eventuais vacinas. Portanto, entender esta diversidade é fundamental para se desenvolver vacinas e drogas eficientes, extremamente necessárias para se conter a epidemia de HIV/AIDS. Neste estudo, nós investigamos a magnitude da diversidade das principais variantes de HIV- 1 circulantes no Brasil, através de seqüênciamento e análise de genoma completo. O DNA foi extraído de 22 amostras previamente classificadas em nosso laboratório como sendo 6 subtipos B, 8 subtipos C e 8 subtipos F, com base no seqüênciamento de pequenos amplicons. A reamplificação do DNA destas amostras foi realizada por PCR de fragmentos sobrepostos, seguido por seqüênciamento direto. Duas de seis amostras identificadas parcialmente como subtipo B e seis de oito amostras identificadas parcialmente como subtipo F foram então caracterizadas como BF recombinantes pela análise de seus genomas completos. Todas as 8 amostras previamente classificadas como subtipo C apresentaram-se como cepas não recombinantes através da análise de genoma completo. Dois recombinantes BF possuem estrutura de recombinação genômica idêntica, porém diferente da cepa Argentina CRF 12_BF, e provavelmente representam uma nova forma recombinante circulante no Brasil. As análises das seqüências dos subtipos C e F revelaram uma linhagem distinta altamente suportada pela filogenia, cada qual correspondendo a sua cepa de referência brasileira. Nossos dados indicam fortemente que a atual epidemia Brasileira de HIV-1 com as cepas dos subtipos C e F foi introduzida no país por um único evento, e não por fontes múltiplas. Além disso, a evidencia da recombinação BF obtida pela análise do genoma completo do HIV, indica uma disseminação dos recombinantes BF em nossa população de infectados pelo HIV-1 que pode representar força significativa na evolução do vírus