RESUMO
Allele frequencies for 15 short tandem repeats (STR) loci were obtained from a sample of 4076 unrelated individuals undergoing paternity testing. The population is from Paraná, Southern Brazil. The loci are the most commonly used in forensic and paternity testing, being analyzed by the AmpFlSTR((R)) Identifiler (Applied Biosystems) commercial kit. The most polymorphic loci were D2S1338 and D18S51. Excepting the D13S317, all loci were in Hardy-Weinberg equilibrium. Comparative analyses between our population data and other populations are presented.
Assuntos
Frequência do Gene , Genética Populacional , Sequências de Repetição em Tandem , Brasil , Impressões Digitais de DNA , Feminino , Humanos , Masculino , Paternidade , Reação em Cadeia da PolimeraseRESUMO
Infecções causadas por Chlamydia trachomatis são recentemente reconhecidas como as mais prevalentes e estão entre as mais prejudiciais doenças sexualmente transmissíveis (DST) no mundo. A ausência de sintomas dificulta o diagnóstico clínico das infecções clamidiais. Um dos desafios na prevenção das infecções causadas por C. trachomatis é a disponibilidade de diagnósticos laboratoriais com alta sensibilidade, especificidade e reprodutibilidade. No presente estudo, foi comparado o desempenho do testes de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) COBAS Amplicor® Chlamydia trachomatis (Roche) e PCR em tempo real (SYBR® Green), usados para detecção de Chlamydia trachomatis em espécimes de urina e secreções urogenitais. O COBAS Amplicor® (Roche) é umteste de PCR convencional e foi usado como ferramenta para controle e teste de padrão ouro para diagnóstico no presente trabalho. Um total de 136 amostras de secreção endocervical (61), secreção uretral (14) e urina (61), foram obtidas de pacientes submetidos a testes de detecção de Chlamydia trachomatis no Laboratório Alvaro S/A. Os métodos de PCR em tempo real e COBAS Amplicor® (Roche)foram igualmente sensíveis para o diagnóstico de C. trachomatis em amostras de secreção uretral. Entretanto, em análises de urinae secreção endocervical o teste COBAS Amplicor® (Roche) mostrou 57% e 33% de positividade, respectivamente, contra 47% e 24% de positividade obtidos para as mesmas amostras usando a PCR em tempo real. A maior sensibilidade (100%) obtida usando-seo ensaio de PCR em tempo real, foi em análises das amostras de secreção endocervical. A PCR em tempo real, comparada com o teste padrão ouro, mostrou uma alta especificidade (100%) e um valor preditivo positivo de 100% para as diferentes amostras clínicas estudadas. Em conclusão, os dados apresentados neste estudo indicam que a PCR em tempo real mostrou um alto desempenho para detecção de C. trachomatis em diferentes espécimes clínicos...
Infections caused by Chlamydia trachomatis are now recognized as the most prevalent and are among the most damaging of all sexually transmitted diseases (STD) worldwide. Lack of symptoms makes clinical diagnosis of chlamydial infection difficult. One of the challenge in the prevention of C. trachomatis infections is the availability of laboratory diagnostics with high sensitivity, specificity and reliable. In the present study, the performance of conventional polymerase chain reaction (PCR) and Real-time PCR (SYBRR Green) tests used for detection of Chlamydia trachomatis in urine and urogenital specimens were compared. The COBAS AmplicorR (Roche) is a conventional PCR and was used as a tool of control and gold standard test for diagnosis in this work. A total of 136 samples of endocervical secretion (61), uretral secretion (14) and urine (61), were obtained from patients submitted of Chlamydia trachomatis detection tests of Laboratório Alvaro S/A. Real-time PCR (SYBRR Green) and COBAS AmplicorR Chlamydia trachomatis Test (Roche) methods were equally sensitivity for diagnostic of C. trachomatis in uretral secretion samples. However, in analyses of the urine and endocervical secretion samples the COBAS AmplicorR test displayed 57% and 33% of positivity, recpectively, against 47% and 24% of positivity obtained for the same samples using Real-time PCR. The highest sensibility (100%) using Real-timePCR assay was obtained in analyses of endocervical secretion samples. Real-time PCR, comparing with our gold standard showed a high spedificity (100%) and a positive predictive value of 100% for different clinical samples studied. In conclusion, the data presented in this study indicate that PCR - Real time have shown a high performance for detection of C. trachomatis in different clinical specimens. Moreover, this method can be used as a powerful tool in diagnostic and epidemiological investigation of infection associated with C. trachomatis.