RESUMO
One of the most challenging aspects of RT-qPCR data analysis is the identification of reliable reference genes. Ideally, they should be neither induced nor repressed under different experimental conditions. To date, few reference genes have been adequately studied for sugarcane (Saccharum spp.) using statistical approaches. In this work, six candidate genes ( αTUB, GAPDH, H1, SAMDC, UBQ, and 25S rRNA) were tested for gene expression normalization of sugarcane root tissues from drought-tolerant and -sensitive accessions after continuous dehydration (24 h). By undergoing different approaches (GeNorm, NormFinder, and BestKeeper), it was shown that most of them could be used in combinations for normalization purposes, with the exception of SAMDC. Nevertheless three of them (H1, αTUB, and GAPDH) were considered the most reliable reference genes. Their suitability as reference genes validated the expression profiles of two targets (AS and PFP α1), related to SuperSAGE unitags, in agreement with results revealed by previous in silico analysis. The other two sugarcane unitags (ACC oxidase and PIP1-1), after salt stress (100 mM NaCl), presented their expressions validated in the same way. In conclusion, these reference genes will be useful for dissecting gene expression in sugarcane roots under abiotic stress, especially in transcriptomic studies using SuperSAGE or RNAseq approaches.
Assuntos
Secas , Regulação da Expressão Gênica de Plantas , Genes de Plantas , Saccharum/genética , Estresse Fisiológico/genética , Biologia Computacional , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real , Reprodutibilidade dos Testes , Saccharum/metabolismo , Sensibilidade e EspecificidadeRESUMO
Com o objetivo de avaliar a resposta dos dias efetivos de vernalização do lírio sobre o conteúdo de açúcares solúveis e nitrogênio total e a emergência de plantas, bulbos de Lilium longiflorum, cv æSnow QueenÆ foram submetidos a diferentes temperaturas de vernalização e períodos de exposição à temperaturas vernalizantes e cultivados em estufa plástica. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria (RS), em duas épocas de plantio dos bulbos: de 20/03/02 a 05/11/02 e 05/12/02 a 15/05/03. Os tratamentos foram 0, 9, 11, 14, 19, 23, 28, 29, 34, 38, 42, 45 e 56 dias efetivos de vernalização (DV), calculados a partir de uma função beta de resposta da vernalização à temperatura. Determinaram-se o conteúdo de açúcares solúveis e nitrogênio total e a duração do subperíodo de plantio dos bulbos-emergência das plantas (P-E). A vernalização promoveu a mobilização de reservas de açúcares e nitrogênio, o que é importante para nutrição da planta em emergência. O aumento do número de dias efetivos de vernalização reduziu a duração do subperíodo P-E. Bulbos tratados em temperaturas de 10ºC por 6 e 8 semanas de armazenamento (34 e 45DV), apresentaram uma menor duração do subperíodo P-E.
RESUMO
In order to evaluate the response of effective vernalization days on the soluble sugar and total nitrogen contents and the emergence of Lilium longiflorum plant shoots, cv Snow Queen bulbs were kept under different vernalization temperatures and periods of treatment under vernalizing temperatures, and cultivated in a plastic greenhouse after the vernalization. The experiment was carried out at the Universidade Federal de Santa Maria, RS, in two seasons: from 03/20/02 to 11/05/02 and from 12/05/02 to 05/15/03. The treatments were 0, 9, 11, 14, 19, 23, 28, 29, 34, 38, 42, 45 and 56 effective vernalization days, calculated with a beta response function to temperature. The soluble sugar and total nitrogen contents, and the duration of the planting-emergence (P-M) phase were determined. The vernalization promoted the mobilization of sugar and nitrogen reserves, which is important for the nutrition of the emergence of the shoot. The increasing number of the effective vernalization days reduced the duration of the P-E phase. Bulbs treated under temperatures of 10ºC for 6 to 8 weeks of storage (34 and 45DV), had the shortest duration of the P-E phase.
Com o objetivo de avaliar a resposta dos dias efetivos de vernalização do lírio sobre o conteúdo de açúcares solúveis e nitrogênio total e a emergência de plantas, bulbos de Lilium longiflorum, cv Snow Queen foram submetidos a diferentes temperaturas de vernalização e períodos de exposição à temperaturas vernalizantes e cultivados em estufa plástica. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria (RS), em duas épocas de plantio dos bulbos: de 20/03/02 a 05/11/02 e 05/12/02 a 15/05/03. Os tratamentos foram 0, 9, 11, 14, 19, 23, 28, 29, 34, 38, 42, 45 e 56 dias efetivos de vernalização (DV), calculados a partir de uma função beta de resposta da vernalização à temperatura. Determinaram-se o conteúdo de açúcares solúveis e nitrogênio total e a duração do subperíodo de plantio dos bulbos-emergência das plantas (P-E). A vernalização promoveu a mobilização de reservas de açúcares e nitrogênio, o que é importante para nutrição da planta em emergência. O aumento do número de dias efetivos de vernalização reduziu a duração do subperíodo P-E. Bulbos tratados em temperaturas de 10ºC por 6 e 8 semanas de armazenamento (34 e 45DV), apresentaram uma menor duração do subperíodo P-E.
RESUMO
In order to evaluate the response of effective vernalization days on the soluble sugar and total nitrogen contents and the emergence of Lilium longiflorum plant shoots, cv Snow Queen bulbs were kept under different vernalization temperatures and periods of treatment under vernalizing temperatures, and cultivated in a plastic greenhouse after the vernalization. The experiment was carried out at the Universidade Federal de Santa Maria, RS, in two seasons: from 03/20/02 to 11/05/02 and from 12/05/02 to 05/15/03. The treatments were 0, 9, 11, 14, 19, 23, 28, 29, 34, 38, 42, 45 and 56 effective vernalization days, calculated with a beta response function to temperature. The soluble sugar and total nitrogen contents, and the duration of the planting-emergence (P-M) phase were determined. The vernalization promoted the mobilization of sugar and nitrogen reserves, which is important for the nutrition of the emergence of the shoot. The increasing number of the effective vernalization days reduced the duration of the P-E phase. Bulbs treated under temperatures of 10ºC for 6 to 8 weeks of storage (34 and 45DV), had the shortest duration of the P-E phase.
Com o objetivo de avaliar a resposta dos dias efetivos de vernalização do lírio sobre o conteúdo de açúcares solúveis e nitrogênio total e a emergência de plantas, bulbos de Lilium longiflorum, cv Snow Queen foram submetidos a diferentes temperaturas de vernalização e períodos de exposição à temperaturas vernalizantes e cultivados em estufa plástica. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria (RS), em duas épocas de plantio dos bulbos: de 20/03/02 a 05/11/02 e 05/12/02 a 15/05/03. Os tratamentos foram 0, 9, 11, 14, 19, 23, 28, 29, 34, 38, 42, 45 e 56 dias efetivos de vernalização (DV), calculados a partir de uma função beta de resposta da vernalização à temperatura. Determinaram-se o conteúdo de açúcares solúveis e nitrogênio total e a duração do subperíodo de plantio dos bulbos-emergência das plantas (P-E). A vernalização promoveu a mobilização de reservas de açúcares e nitrogênio, o que é importante para nutrição da planta em emergência. O aumento do número de dias efetivos de vernalização reduziu a duração do subperíodo P-E. Bulbos tratados em temperaturas de 10ºC por 6 e 8 semanas de armazenamento (34 e 45DV), apresentaram uma menor duração do subperíodo P-E.
RESUMO
This research has the purpose to value the action of the gibberellic acid (GA3) in cut chrysanthemum 'Viking' as for fenometric parameters, the best time, the frequency and the concentration of the AG3 application to obtain brunches of the best quality in different time of thecultivation. In cultivation during the Summer/Fall, valued the effect of five times the application (2nd, 4th, 8th and 10th week after the plantation) and four concentrations (0, 100, 200 and 300 mg.L-1) in which it was observed that the tallest branches were obtained with applications done during the 2nd and 4th week 200 and 300 mg.L-1, the biggest brunch diameter of the floral peduncle are results of the GA3 of the 100 or 200 mg.L-1 application done on the 4th week. The AG3 200 mg.L-1 concentration independent of the application, the time caused the anticipation of the blossom in a period five days, all the concentration applied from the 8th week on result whiten floral disc.
Este trabalho tem como objetivo avaliar a ação do ácido giberélico (AG3) em plantas crisântemo de corte 'Viking' quanto a parâmetros fenométricos, melhor época e concentração da aplicação para obter-se hastes de melhor qualidade no cultivo de verão/outono. Avaliou-se o efeito de cinco épocas de aplicação (sem aplicação, aplicação na segunda, quarta, oitava e décima semana após o plantio) e quatro concentrações (0, 100, 200 e 300 mg.L-1 de GA3). Verificou-se que as maiores alturas foram obtidas com as aplicações na segunda e quarta semanas de cultivo e nas concentrações entre 200 a 300 mg.L-1. O maior diâmetro de haste e pedúnculo floral foram obtidos com a aplicação de 100 a 200 mg.L-1 GA3 na quarta semana. A concentração de 200 mg.L-1 de GA3, independente da época de aplicação proporcionou a antecipação do florescimento em cinco dias, todas as concentrações aplicadas a partir da oitava semana provocaram o clareamento do disco floral.
RESUMO
This research has the purpose to value the action of the gibberellic acid (GA3) in cut chrysanthemum 'Viking' as for fenometric parameters, the best time, the frequency and the concentration of the AG3 application to obtain brunches of the best quality in different time of thecultivation. In cultivation during the Summer/Fall, valued the effect of five times the application (2nd, 4th, 8th and 10th week after the plantation) and four concentrations (0, 100, 200 and 300 mg.L-1) in which it was observed that the tallest branches were obtained with applications done during the 2nd and 4th week 200 and 300 mg.L-1, the biggest brunch diameter of the floral peduncle are results of the GA3 of the 100 or 200 mg.L-1 application done on the 4th week. The AG3 200 mg.L-1 concentration independent of the application, the time caused the anticipation of the blossom in a period five days, all the concentration applied from the 8th week on result whiten floral disc.
Este trabalho tem como objetivo avaliar a ação do ácido giberélico (AG3) em plantas crisântemo de corte 'Viking' quanto a parâmetros fenométricos, melhor época e concentração da aplicação para obter-se hastes de melhor qualidade no cultivo de verão/outono. Avaliou-se o efeito de cinco épocas de aplicação (sem aplicação, aplicação na segunda, quarta, oitava e décima semana após o plantio) e quatro concentrações (0, 100, 200 e 300 mg.L-1 de GA3). Verificou-se que as maiores alturas foram obtidas com as aplicações na segunda e quarta semanas de cultivo e nas concentrações entre 200 a 300 mg.L-1. O maior diâmetro de haste e pedúnculo floral foram obtidos com a aplicação de 100 a 200 mg.L-1 GA3 na quarta semana. A concentração de 200 mg.L-1 de GA3, independente da época de aplicação proporcionou a antecipação do florescimento em cinco dias, todas as concentrações aplicadas a partir da oitava semana provocaram o clareamento do disco floral.
RESUMO
To evaluate the quality of the flowers of chrysanthemums, were cultivated the cv. Snowdon in greenhouse in eight plant densities and two planting dates. The experimental design was factorial, (2 planting dates x 8 plants densities). The two planting dates were: 05 March 1998 (Fall/Winter growing season) and 22 July 1998 (Winter/Spring growing season). Plant densities were: 48, 56, 64, 72, 80, 88 and 104plants/m². Plant height, diameter of the flower and stem, fresh weight were determinated. For obtaining of larger revenues of class stems A, the suitable plant density is between 40 and 56plants/m². There are not differences of qualitative revenue of class A (stem lenght > or = 90cm, flower diameter > or = 13,5cm, stem diameter > or = 0,73cm and fresh weight > or = 113g), among the dates planting. For attainmet best qualitative revenue the plant densities do not have upper the 72 plantas/m².
Para avaliar a qualidade das hastes florais, a cultivar de crisântemo Snowdon foi conduzida em estufa plástica em oito populações de plantas e duas épocas de plantio. O experimento bifatorial (2 x 8), com parcela subdividida, foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria (Santa Maria, RS) e teve época como parcela principal, sendo a primeira época outono/inverno no período de 05/03/98 à 29/06/98 e a segunda época inverno/primavera no período de 22/07/98 à 11/11/98 e as populações de 40, 48, 56, 64, 72, 80, 88 e 104pl/m², na subparcela para as duas épocas de plantio. As plantas foram conduzidas em haste unifloral. Determinaram-se a altura da planta, o diâmetro da inflorescência e da haste e a massa da matéria fresca. Para obtenção de maiores rendimentos de hastes de classe A (comprimento da haste > ou = 90 cm, diâmetro da inflorescência > ou = 13,5cm, diâmetro da haste > ou = 0,73cm e massa da matéria fresca > ou = 113g) a população indicada está entre 40 e 56plantas/m². Não há diferenças de rendimento qualitativo de classe A entre as épocas de plantio. Para obtenção de maiores rendimentos qualitativos, as populações de plantas não devem ser superiores a 72 plantas/m².
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To evaluate the quality of the flowers of chrysanthemums, were cultivated the cv. Snowdon in greenhouse in eight plant densities and two planting dates. The experimental design was factorial, (2 planting dates x 8 plants densities). The two planting dates were: 05 March 1998 (Fall/Winter growing season) and 22 July 1998 (Winter/Spring growing season). Plant densities were: 48, 56, 64, 72, 80, 88 and 104plants/m². Plant height, diameter of the flower and stem, fresh weight were determinated. For obtaining of larger revenues of class stems A, the suitable plant density is between 40 and 56plants/m². There are not differences of qualitative revenue of class A (stem lenght > or = 90cm, flower diameter > or = 13,5cm, stem diameter > or = 0,73cm and fresh weight > or = 113g), among the dates planting. For attainmet best qualitative revenue the plant densities do not have upper the 72 plantas/m².
Para avaliar a qualidade das hastes florais, a cultivar de crisântemo Snowdon foi conduzida em estufa plástica em oito populações de plantas e duas épocas de plantio. O experimento bifatorial (2 x 8), com parcela subdividida, foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria (Santa Maria, RS) e teve época como parcela principal, sendo a primeira época outono/inverno no período de 05/03/98 à 29/06/98 e a segunda época inverno/primavera no período de 22/07/98 à 11/11/98 e as populações de 40, 48, 56, 64, 72, 80, 88 e 104pl/m², na subparcela para as duas épocas de plantio. As plantas foram conduzidas em haste unifloral. Determinaram-se a altura da planta, o diâmetro da inflorescência e da haste e a massa da matéria fresca. Para obtenção de maiores rendimentos de hastes de classe A (comprimento da haste > ou = 90 cm, diâmetro da inflorescência > ou = 13,5cm, diâmetro da haste > ou = 0,73cm e massa da matéria fresca > ou = 113g) a população indicada está entre 40 e 56plantas/m². Não há diferenças de rendimento qualitativo de classe A entre as épocas de plantio. Para obtenção de maiores rendimentos qualitativos, as populações de plantas não devem ser superiores a 72 plantas/m².