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1.
An Acad Bras Cienc ; 96(1): e20231006, 2024.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38451599

RESUMO

Among the potential feed additives, ß-glucans are known to positively affect the growth performance, blood parameters, and intestinal microbiota of fish, even the ornamental species. Therefore, the present study evaluated the effects of the dietary supplementation of different Saccharomyces cerevisiae ß-glucans concentrations (0, 0.05, 0.1, and 0.2%) in juvenile angelfish (Pterophyllum scalare) over a 42-day period. Regarding growth performance, no effects were observed on most parameters. However, 0.2% ß-glucans supplementation produced higher condition factor values, indicating a better nutritional status. Furthermore, ß-glucans supplementation did not affect blood parameters. Regarding intestinal microbiota, ß-glucans supplementation increased the abundance of the potentially beneficial bacterial genus Phascolarctobacterium. The high abundance of bacteria from the phylum Bacteroidetes, which can degrade ß-glucans, may be attributed to the increased abundance of Phascolarctobacterium spp. In addition, 0.2% ß-glucans supplementation produced more operational taxonomic units and higher Sobs (observed species richness), indicating effects on the overall bacterial community structure. These results demonstrate the potential application of ß-glucans as a dietary supplement to improve the performance and modulate the intestinal microbiota of angelfish.


Assuntos
Ciclídeos , Microbioma Gastrointestinal , beta-Glucanas , Animais , Dieta , Suplementos Nutricionais , Saccharomyces cerevisiae , beta-Glucanas/farmacologia
2.
Res Vet Sci ; 159: 214-224, 2023 Jun.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37167686

RESUMO

Organic acids (OAs) are a class of feed additives that have prophylactic and inhibitory properties against pathogenic bacteria. In this study, we investigated growth performance, innate immune response, gut microbiota, and disease resistance against Francisella orientalis F1 in Nile tilapia (Oreochromis niloticus) fed different doses of Bacti-nil®Aqua, a blend of short- and medium-chain OAs. For 21 days, 680 juvenile tilapias were fed a control diet or diets supplemented with a 0.3% (D3) or 0.5% (D5) OA blend. The feed conversion rate of fish fed the 0.5% enriched diet was considerably lower (p < 0.05) than that of the fish fed the basal diet. Lysozyme and serum bactericidal activities were significantly elevated following OA administration. After infection, no differences in the diversity and composition of gut microbiota were observed between the groups. After the bacterial challenge, the mortality was significantly lower in group D5 (p < 0.01). The diet supplemented with Bacti-nil®Aqua (Adisseo) improved the immune response and resistance of tilapia juveniles against F. orientalis infection. Thus, this OA blend could serve as a feed additive with good activity against F. orientalis.


Assuntos
Ciclídeos , Doenças dos Peixes , Microbioma Gastrointestinal , Infecções Estreptocócicas , Animais , Ração Animal/análise , Doenças dos Peixes/microbiologia , Infecções Estreptocócicas/prevenção & controle , Infecções Estreptocócicas/veterinária , Suplementos Nutricionais/análise , Imunidade Inata , Dieta/veterinária , Resistência à Doença
3.
Anim Biotechnol ; 33(4): 701-709, 2022 Aug.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33017262

RESUMO

Jewel tetra (Hyphessobrycon eques) is a freshwater fish found in several rivers and basins in South America. The present study is the first study to create a panel of microsatellite markers for detecting genetic diversity in H. eques and evaluating the application of these markers in Serrapinnus notomelas. In total, 44 individuals were genotyped from the natural (WIL, n = 20) and stock in captivity (CAP, n = 24) population. Moreover, 19 microsatellite markers were obtained, of which only 8 loci presented a high degree polymorphism. In total, 45 alleles were detected, ranging from 126 bp (Hype2G2) to 420 bp (Hype2E2). The Hardy-Weinberg equilibrium (p < 0.05) revealed significant difference in one locus in WIL (Hype1G4) and three loci in CAP (Hype1F4, Hype2C3, and Hype2G2). Null alleles (p < 0.05) were present in only one locus (Hype1G4). The WIL and CAP populations revealed high genetic diversity during FST analysis. The cross-amplification test for S. notomelas revealed that only two loci (Hype2C3 and Hype2G2B) presented satisfactory transferability results. The developed microsatellite primers will be useful in studying the genetic diversity and population structure of H. eques in wild populations and fish farms in the Brazilian and other South American basins.


Assuntos
Genética Populacional , Repetições de Microssatélites , Alelos , Animais , Variação Genética/genética , Genótipo , Repetições de Microssatélites/genética , Polimorfismo Genético
4.
Semina ciênc. agrar ; 43(4): 1605-1628, jul.-ago. 2022. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1369768

RESUMO

Hyphessobrycon eques has a great prominence in fishkeeping and scientific research. In this context, a systematic literature review was performed to assist in the improvement of captive breeding of this species and to identify knowledge gaps. Notably, of the 966 articles published between 1997 and 2020 found in an initial screening of the digital libraries of Google Scholar, PubMed, SciELO, Science Direct, and Scopus, only 56 represented research on the species according to the established criteria. Considering aspects pertinent to captive reproduction, 25 studies were selected. These studies addressed information regarding reproduction; embryonic, larval, and juvenile development of the species; parasitic fauna; limiting concentrations of prophylactic agents; food preferences; and dietary supplements already used for these fish. Only seven studies reported information on the physicochemical characteristics of water in natural habitats, with great variations in several parameters, mainly those related to temperature. In 5 of the 25 selected studies, information related to reproductive characteristics and/or embryonic, larval, and juvenile development was addressed. However, only two studies developed experimental studies with information relevant to the captive breeding of the species. Studies to identify parasitic fauna and to analyze the use of prophylactic agents were also found. As for the information gaps on the cultivation of the species, there are no studies related to nutrition seeking to determine the species nutritional needs, including feeding frequencies, feeding durations, and specific amounts of food. Therefore, this review offers a great support for the breeding of H. eques by highlighting opportunities for new scientific studies that could enrich and collaborate in the breeding of this ornamental fish.(AU)


Hyphessobrycon eques tem grande destaque na aquicultura e na pesquisa científica. Nesse contexto, foi realizada uma revisão sistemática da literatura para auxiliar no aprimoramento da reprodução em cativeiro desta espécie e verificar lacunas de conhecimento. Notadamente, dos 966 artigos publicados entre 1997 e 2020 que foram encontradas na triagem inicial das bibliotecas digitais do Google Scholar, PubMed, SciELO, Science Direct e Scopus, apenas 56 representaram pesquisas sobre a espécie de acordo com os critérios estabelecidos. Considerando os aspectos pertinentes à reprodução em cativeiro, foram selecionados 25 estudos. Esses estudos abordaram informações sobre reprodução; desenvolvimento embrionário, larval e juvenil da espécie; fauna parasitária; a concentração limitante de agentes profiláticos; preferências alimentares; e suplementos dietéticos já usados para esses peixes. Apenas sete estudos relataram informações sobre as características físico-químicas da água em habitats naturais, com grande variação nos parâmetros, principalmente relacionados à temperatura. Em 5 dos 25 estudos selecionados, foram abordadas informações relacionadas às características reprodutivas e/ou relacionadas ao desenvolvimento embrionário, larval e juvenil. No entanto, apenas dois estudos desenvolveram estudos experimentais com informações relevantes para a reprodução em cativeiro da espécie. Foram observados estudos de identificação da fauna parasitária e pesquisas utilizando agentes profiláticos. Quanto às lacunas de informação sobre o cultivo da espécie, não existem estudos relacionados à nutrição que busquem determinar suas necessidades nutricionais, incluindo frequências e tempos de alimentação e quantidades específicas de alimentos. Dessa forma, foi possível oferecer um maior suporte à criação de H. eques, destacando oportunidades para novos estudos científicos enriquecerem e colaborarem com a produção deste peixe ornamental.(AU)


Assuntos
Animais , Aquicultura , Caraciformes/anatomia & histologia , Pesqueiros
5.
Front Microbiol ; 12: 743957, 2021.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34659177

RESUMO

In the present study, we evaluated the effects of administering Enterococcus faecium in food and/or water on the hematological and immunological parameters, intestinal microbiota, resistance to bacterial diseases (streptococcosis and francisellosis) and growth of Nile tilapia. Before the in vivo experiment, probiotic bacteria isolated from Nile tilapia were selected via inhibition tests. Sequencing, annotation, and assembly of the complete genome of the selected bacteria as well as other tests were performed using bioinformatics tools. Three treatments were implemented: G1 (probiotic feeding), G2 (probiotic in water), and G3 (probiotic in food and water); and a negative control (NC) was also employed. Treatment lasted 38 days, and each group consisted of fish and two repetitions. The fish were divided and infected with Streptococcus agalactiae S13 (serotype Ib) and Francisella orientalis. The G1 group had a higher average final weight gain than the G2, G3, and NC groups. Further, a significant increase in the number of thrombocytes was observed in the groups administered probiotics in the diet (G1 and G3). A statistical difference was observed in the mortality of fish infected with S. agalactiae in the NC compared to the treated groups. Cetobacterium was the 43 most abundant genus in the intestinal microbiota of all groups, including the NC group. E. faecium increased the immunity of fish administered the treatment and decreased the mortality caused by S. agalactiae. As an autochtone probiotic, E. faecium does not interfere with the local ecosystem and thus has a great probiotic potential for Nile tilapia in Brazil.

6.
Rev. colomb. cienc. pecu ; 34(1): 29-39, Jan.-Mar. 2021. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1394926

RESUMO

Abstract Background: Preserving the genetic diversity of wild fish is an important consideration for restocking programs, as inbreeding can compromise progeny survival as well as impact the resilience of natural populations. Objective: To evaluate the influence of spawning method: semi-natural (SN) or strip-spawning (ST), and the number of breeders (1♀:3♂ and 2♀:6♂) on the reproductive efficiency and genetic diversity of B. orbignyanus progeny destined for restoration of wild stocks. Methods: Rates of fertilization, hatching and broodfish mortality were recorded. For genetic evaluations (allele frequency, observed and expected heterozygosity, Shannon index, inbreeding coefficient, molecular variance analysis, and genetic differentiation), breeders (n=24), and their progenies (90 larvae/treatment) were sampled and analyzed using eight microsatellite markers. Results: Higher fertilization and hatching rates, and lower broodfish mortality were observed for the SN method (p<0.05), whereas the number of breeders did not affect these parameters (p>0.05). Interaction between spawning method and number of breeders was not significant (p>0.05). The amplified microsatellite loci produced a total of 30 alleles, with sizes between 80 and 225 bp and their frequencies indicated an increase (p<0.05) of genetic diversity in the progenies, but low genetic differentiation between treatments (p>0.05). Conclusion: The spawning methods and number of breeders tested increased equally the genetic diversity of the progeny, with low genetic differentiation between treatments. In contrast, rates of fertilization, hatching and brood fish mortality revealed that the SN method resulted in the best reproductive efficiency due to the handling stress and injuries caused by ST. Thus, SN proves to be the most suitable spawning-method for B. orbignyanus in restocking programs.


Resumen Antecedentes: Mantener la diversidad genética de los peces salvajes es una consideración importante para los programas de repoblación, ya que la endogamia puede comprometer la supervivencia de la progenie y afectar la supervivencia de las poblaciones naturales. Objetivo: Evaluar la influencia del método de desove (seminatural - SN o en franjas - ST) y el número de reproductores (1♀:3♂ y 2♀:6♂) sobre la eficiencia reproductiva y la diversidad genética de progenies de B. orbignyanus destinados a la restauración de poblaciones silvestres. Métodos: Se monitorearon las tasas de fertilización, eclosión y mortalidad de reproductores. Para las evaluaciones genéticas (frecuencias alélicas, heterocigosidad observada y esperada, índice de Shannon, coeficiente de endogamia, análisis de varianza molecular y diferenciación genética) los reproductores (n=24) y su progenie (90 larvas/tratamiento) se muestrearon y analizaron utilizando ocho marcadores microsatélites. Resultados: La interacción entre el método de desove y el número de reproductores no fue significativa (p>0,05). Se obtuvieron mejores tasas de fecundación y eclosión (p<0,05), y una menor mortalidad de reproductores (p<0,05) con el método SN, mientras que el número de reproductores no tuvo efecto (p>0,05). Los loci de microsatélites amplificados produjeron un total de 30 alelos con tamaños entre 80 y 225 pb, y sus frecuencias indicaron un aumento (p<0,05) en la diversidad genética de las progenies, pero una baja diferenciación genética entre tratamientos (p>0,05). Conclusión: Los métodos de desove y el número de reproductores evaluados aumentaron de la misma manera la diversidad genética de las progenies, con baja diferenciación genética entre tratamientos. En contraste, las tasas de fecundación, eclosión y mortalidad de peces reproductores revelaron que el SN tuvo la mejor eficiencia reproductiva, un hecho relacionado con el estrés del manejo y las lesiones causadas por el ST. Por lo tanto, el SN demuestra ser el método de desove más adecuado para B. orbignyanus en los programas de repoblación.


Resumo Antecedentes: A manutenção da diversidade genética dos peixes selvagens é uma importante consideração para programas de repovoamento, já que a endogamia pode comprometer a sobrevivência da progênie, além de impactar na resiliência das populações naturais. Objetivo: Avaliar a influência do método de desova (semi-natural - SN ou por extrusão - ST) e número de reprodutores (1♀:3♂ e 2♀:6♂) na eficiência reprodutiva e na diversidade genética de progênie de B. orbignyanus destinados à recuperação de estoques selvagens. Métodos: Taxas de fertilização, eclosão e mortalidade de reprodutores foram monitorados. Para avaliações genéticas (frequências alélicas, heterozigosidade observada e esperada, índice de Shannon, coeficiente de endogamia, análise de variância molecular e diferenciação genética), reprodutores (n=24) e sua progênie (90 larvas/tratamento) foram amostrados e analisados utilizando oito marcadores microssatélites. Resultados: Interação entre método de desova e número de reprodutores não foi significante (p>0,05). Melhores taxas de fertilização e eclosão (p<0,05), e menor (p<0,05) mortalidade de reprodutores foram observados para o método SN, enquanto que o número de reprodutores não afetou esses parâmetros (p>0,05). Os loci microssatélites amplificados produziram um total de 30 alelos, com tamanhos entre 80 e 225 pb e suas frequências indicaram aumento (p<0,05) da diversidade genética nas progênies, mas baixa diferenciação genética entre os tratamentos (p>0,05). Conclusão: Os métodos de desova e números de reprodutores avaliados aumentaram igualmente a diversidade genética das progênies, com baixa diferenciação genética entre tratamentos. Em contraste, as taxas de fecundação, eclosão e mortalidade de reprodutores revelaram que SN obteve a melhor eficiência reprodutiva, fato relacionado com o estresse de manipulação e injurias causadas por ST. Por isso, SN se mostrou como o método de desova mais adequado para B. orbignyanus em programas de repovoamento.

7.
Semina ciênc. agrar ; 42(3): 1323-1334, mai.-jun. 2021. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1371305

RESUMO

Studies on genetic composition in fish populations contribute to conservationist practices and inbreeding control in fish stocks. To this end, molecular tools such as microsatellite markers (SSRs) are often used, but they are expensive and time-consuming to develop. A species-specific heterologous marker emerges as an alternative, which can be used in taxonomically related species in a fast way. Our goal was to test SSRs markers of Brachyplatystoma rousseauxi and Pseudoplatystoma punctifer in P. reticulatum in an unprecedented way. For this purpose, DNA was extracted from fragments of the caudal fin of 222 P. reticulatum adults, using a NaCl-based method. Then, DNA samples were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) using six markers, four from B. rousseauxi (BR38, 47, 51, and 61) and two from P. punctifer (PPU13 and PPU15). Two primers showed non-specific amplification and were disregarded (BR38 and PPU13). In the remaining four primers, the number of alleles per locus varied between two (BR47) to sixteen (BR51), and the average size of alleles was between 142 and 400 bp. Mean effective number of alleles per locus ranged from 10,650 (BR51) to 1,784 (BR47), with null or low-frequency alleles in all studied loci. Observed heterozygosity ranged from 0.299 (BR47) to 0.640 (BR51) and was always lower than the expected heterozygosity. Hardy-Weinberg balance was significant (p < 0.05) in all loci, and inbreeding coefficient (FIS) was always positive. Polymorphic Information Content (PIC) confirmed the efficiency of the markers since they had moderate (BR47) to high levels of information (BR51, BR61, and PPU15). Transferability test showed that the heterologous microsatellite molecular markers, originally for B. rousseauxi and P. punctifer, were efficient in P. reticulatum, producing three primers with high information content. Therefore, these markers can be safely used in future population studies of this species.(AU)


Estudos acerca da composição genética de populações de peixes contribuem para a elaboração de práticas conservacionista, bem como para controle da consanguinidade em estoques de piscicultura. Neste sentido, ferramentas moleculares como os marcadores microssatélites (SSR's) são comumente utilizados, contudo, seu desenvolvimento corresponde a um processo caro e demorado. Surge como alternativa a utilização dos marcadores heterólogos, originalmente desenvolvidos para uma espécie, mas que podem ser utilizados de maneira rápida em outras taxonomicamente relacionadas. O objetivo desta pesquisa foi testar de maneira inédita a utilização de marcadores SSR's de Brachyplatystoma rousseauxi e Pseudoplatystoma punctifer em P. reticulatum. Para tanto, foram extraídas amostras de DNA a partir de fragmentos de nadadeira caudal de 222 indivíduos adultos de P. reticulatum por metodologia a base de NaCl. As amostras foram então amplificadas por Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizandose seis marcadores, quatro de B. rousseauxi (BR38, 47, 51 e 61) e dois de P. punctifer (PPU13 e PPU15). Dois primers apresentaram amplificação inespecífica e foram desconsiderados (BR38 e PPU13). Entre os quatro restantes, o número de alelos por locus variou entre dois (BR47) a dezesseis (BR51), com tamanho médio de alelos entre 142 e 400 pb. O número efetivo médio de alelos por locus variou de 10,650 (BR51) à 1,784 (BR47), com alelos nulos ou de baixa frequência presentes em todos os loci estudados. Os valores de heterozigosidade observada variaram de 0,299 (BR47) à 0,640 (BR51), e foram sempre menores que os de heterozigosidade esperada. O Equilíbrio de Hardy-Weinberg foi significativo (P < 0,05) em todos os locus e o coeficiente de endogamia Fis sempre apresentou valores positivos. Os valores de Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) confirmaram a eficiência dos marcadores utilizados, já que possuíram de moderado (BR47) a alto nível de informação (BR51, BR61 e PPU15). O teste de transferibilidade de marcadores moleculares microssatélites heterólogos, originalmente desenvolvidos para B. rousseauxi e P. punctifer em P. reticulatum se mostrou eficiente, produzindo três primers com alto nível de informação, fato que garante sua utilização segura em estudos populacionais futuros voltados à esta espécie.(AU)


Assuntos
Reação em Cadeia da Polimerase , Repetições de Microssatélites , Genética , Peixes-Gato/genética , Endogamia
8.
Semina Ci. agr. ; 42(3,supl. 1): 1785-1796, 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-765839

RESUMO

The implementation of fish breeding programs in Brazil has brought significant results in the productivity of tilapia. However, the insertion of native species with great potential (such as Tambaqui Colossoma macropomum) in these programs is still recent, and thus requires genetic information for monitoring and enabling their consolidation into the programs. The objective of the present study was to evaluate the genetic diversity of the parental generation (G0) and two consecutive generations (G1 and G2) in the C. macropomum genetic improvement program, located in the municipality of Sorriso, Mato Grosso, Brazil. Ninety caudal fin samples were collected (30 samples per generation) for DNA extraction. The genetic study implemented seven microsatellite markers (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5, and Cm1H8). A total of 17 alleles were amplified, with variations in the mean number between four to two alleles per locus. The size per locus ranged from 170 to 360 bp. The average inbreeding coefficient was 0.126 (G0), -0.040 (G1), and 0.131 (G2). No null or exclusive alleles were found. The observed heterozygosity values for G1 and G2 demonstrated the preservation of genetic variability (0.453 and 0.409, respectively). In conclusion, the genetic diversity of the parental generation (G0) and the two progenies generations (G1 and G2) were adequate, which demonstrates that the genetic improvement program was conducted correctly; however, it is important to continue to evaluations the genetic diversity of the future progeny.(AU)


A implantação de programas de melhoramento genético de peixes do Brasil tem trazido resultados significativos na produtividade de peixes como na Tilápia. No entanto, a inserção desses programas em espécies nativas de grande potencial como o Tambaqui (Colossoma macropomum) ainda é recente, sendo necessárias informações genéticas que permitam seu monitoramento e viabilizem sua consolidação. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética da geração parental (G0) e duas gerações consecutivas (G1 e G2) do programa de melhoramento genético de Colossoma macropomum, localizado no município de Sorriso Mato Grosso, Brasil. Noventa amostras de nadadeira caudal foram coletadas (30 amostras por geração) para a extração do DNA. O estudo genético foi conduzido implementando-se um total de sete loci microssatélites (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5 e Cm1H8). Um total de 17 alelos foram amplificados, com variações no número médio entre quatro a dois alelos por locus. O tamanho por loci variou entre 170 a 360 pares de bases. O coeficiente de endogamia médio foi 0,126 (G0), -0,040 (G1) e 0,131 (G2). Não foram encontrados alelos nulos nem alelos exclusivos. Os valores de heterozigosidade observada para G1 e G2 demonstraram preservação da variabilidade genética (0,453 e 0,409, respectivamente). Em conclusão a diversidade genética tanto da geração parental (G0) como das duas gerações (G1 e G2) foi adequada, o que demostra que o programa de melhoramento genético está sendo conduzido de maneira correta sendo importante dar continuidade com avaliações de diversidade genética nas progênies futuras.(AU)


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Melhoramento Genético
9.
Semina ciênc. agrar ; 42(3,supl. 1): 1785-1796, 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1501959

RESUMO

The implementation of fish breeding programs in Brazil has brought significant results in the productivity of tilapia. However, the insertion of native species with great potential (such as Tambaqui Colossoma macropomum) in these programs is still recent, and thus requires genetic information for monitoring and enabling their consolidation into the programs. The objective of the present study was to evaluate the genetic diversity of the parental generation (G0) and two consecutive generations (G1 and G2) in the C. macropomum genetic improvement program, located in the municipality of Sorriso, Mato Grosso, Brazil. Ninety caudal fin samples were collected (30 samples per generation) for DNA extraction. The genetic study implemented seven microsatellite markers (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5, and Cm1H8). A total of 17 alleles were amplified, with variations in the mean number between four to two alleles per locus. The size per locus ranged from 170 to 360 bp. The average inbreeding coefficient was 0.126 (G0), -0.040 (G1), and 0.131 (G2). No null or exclusive alleles were found. The observed heterozygosity values for G1 and G2 demonstrated the preservation of genetic variability (0.453 and 0.409, respectively). In conclusion, the genetic diversity of the parental generation (G0) and the two progenies generations (G1 and G2) were adequate, which demonstrates that the genetic improvement program was conducted correctly; however, it is important to continue to evaluations the genetic diversity of the future progeny.


A implantação de programas de melhoramento genético de peixes do Brasil tem trazido resultados significativos na produtividade de peixes como na Tilápia. No entanto, a inserção desses programas em espécies nativas de grande potencial como o Tambaqui (Colossoma macropomum) ainda é recente, sendo necessárias informações genéticas que permitam seu monitoramento e viabilizem sua consolidação. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética da geração parental (G0) e duas gerações consecutivas (G1 e G2) do programa de melhoramento genético de Colossoma macropomum, localizado no município de Sorriso Mato Grosso, Brasil. Noventa amostras de nadadeira caudal foram coletadas (30 amostras por geração) para a extração do DNA. O estudo genético foi conduzido implementando-se um total de sete loci microssatélites (Cm1A8, Cm1A11, Cm1D1, Cm1E3, Cm1F4, Cm1F5 e Cm1H8). Um total de 17 alelos foram amplificados, com variações no número médio entre quatro a dois alelos por locus. O tamanho por loci variou entre 170 a 360 pares de bases. O coeficiente de endogamia médio foi 0,126 (G0), -0,040 (G1) e 0,131 (G2). Não foram encontrados alelos nulos nem alelos exclusivos. Os valores de heterozigosidade observada para G1 e G2 demonstraram preservação da variabilidade genética (0,453 e 0,409, respectivamente). Em conclusão a diversidade genética tanto da geração parental (G0) como das duas gerações (G1 e G2) foi adequada, o que demostra que o programa de melhoramento genético está sendo conduzido de maneira correta sendo importante dar continuidade com avaliações de diversidade genética nas progênies futuras.


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Melhoramento Genético
10.
Front Genet ; 11: 1024, 2020.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33005185

RESUMO

Streptococcus agalactiae is an invasive multi-host pathogen that causes invasive diseases mainly in newborns, elderly, and individuals with underlying health complications. In fish, S. agalactiae causes streptococcosis, which is characterized by septicemia and neurological signs, and leads to great economic losses to the fish farming industry worldwide. These bacteria can be classified into different serotypes based on capsular antigens, and into different sequence types (ST) based on multilocus sequence typing (MLST). In 2015, serotype III ST283 was identified to be associated with a foodborne invasive disease in non-pregnant immunocompetent humans in Singapore, and the infection was related to raw fish consumption. In addition, a serotype III strain isolated from tilapia in Brazil has been reported to be resistant to five antibiotic classes. This specific serotype can serve as a reservoir of resistance genes and pose a serious threat to public health. Thus, new approaches for the control and treatment of S. agalactiae infections are needed. In the present study, 24 S. agalactiae serotype III complete genomes, isolated from human and fish hosts, were compared. The core genome was identified, and, using bioinformatics tools and subtractive criteria, five proteins were identified as potential drug targets. Furthermore, 5,008 drug-like natural compounds were virtually screened against the identified targets. The ligands with the best binding properties are suggested for further in vitro and in vivo analysis.

11.
An Acad Bras Cienc ; 92(3): e20190099, 2020.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33111818

RESUMO

The aim of this study was to evaluate the growth curve of selectively bred and non-selectively bred tambaqui (Colossoma macropomum). The experiment involved 388 fish (weight: 65.38 ± 20.00 g; age: 217 days), consisting of 252 fish from seven selectively bred families (18 fish per family) and 18 non-selectively bred fish (control group). Groups were placed in two 800-m² tanks. Biometric measurements were taken on nine occasions at 30-day intervals, for a period of 254 days. Weight and morphometric traits were evaluated. To describe the tambaqui growth behavior, we adopted the Gompertz nonlinear regression model. Greater growth (p < 0.05) was observed in selectively bred families compared with control group. Four families stood out with higher (p < 0.05) asymptotic values for weight (F1: 2448.7 g; F7: 2284.7 g; F5 2180.1 g; F4: 2080.5 g; and control: 1808.4 g) and other morphometric traits. None of the selectively bred families (except F5) had a higher growth rate and age at inflection point than the fish from control group. In conclusion, selectively bred and non-selectively bred fish present distinct growth curves, but some families have greatly superior growth.


Assuntos
Caraciformes , Animais , Cruzamento , Caraciformes/crescimento & desenvolvimento
12.
Acta amaz ; Acta amaz;50(3): 232-238, jul. - set. 2020.
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1118836

RESUMO

The genus Bryconcomprises fish species of significant socioeconomic and biological importance in Brazil. Despite that, the genetic knowledge about these species is scarce, especially regardingBrycon falcatus. Thus, the objective of this study was to evaluate the transferability of heterologous microsatellite primers inB. falcatus for the first time. Heterologous primers obtained from B. opalinus, B. hilarii, B. insignis, B. orbignyanus, B. amazonicus, Prochilodus argenteus, Prochilodus lineatus, Piaractus mesopotamicus, and Colossoma macropomum were evaluated. The primers that showed the best amplification patterns were applied to a sample of 22 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers displayed satisfactory cross-amplification withB. falcatus: BoM5 (Brycon opalinus); Bh8, Bh13 and Bh16 (B. hilarii); Borg59 (B. orbignyanus); Bag22 (B. amazonicus); Par12 and Par80 (P. argenteus), and Cm1A8 (C. macropomum). The genetic parameters (number of alleles, effective alleles, allele richness, and expected and observed heterozygosity) and the polymorphic information content (PIC) confirmed the viability of these primers for population genetics analyses. Our study demonstrates the potential of transferability of microsatellite markers from related species and even different genera to B. falcatus, providing usefull tools for future population genetic studies in this species. (AU)


Assuntos
Variação Genética , Repetições de Microssatélites , /classificação , Genética Populacional
13.
PLoS One ; 15(1): e0226977, 2020.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31896132

RESUMO

Nutritional improvements in intensive aquaculture production systems is necessary for the reduction of stress, maximum utilization of nutritional components, and expression of the genetic potential of fish. The objective of this study was to evaluate the hemato-immunological, and histological parameters and gut microbiota of Nile tilapia fed with the microalga Schizochytrium sp. Males of Nile tilapia were distributed among eight net cages (6 m3), and fed for 105 days with two diets: control (CON), without Schizochytrium sp., and supplemented (SUP), with 1.2% Schizochytrium sp. in the diet. The final weight, mortality, hematocrit, total erythrocyte count (RBC), hemoglobin, hematimetric indices, white blood cell count (WBC), total protein, and serum lysozyme were measured. Alterations in intestinal morphology were evaluated. The gut microbiota was evaluated with next-generation sequencing. No significant differences (p>0.05) were found in the final weight and mortality between diets. Regarding the hematological parameters, a difference (p<0.05) was detected only in RBC, with there being lower values in the SUP, although this group also showed a tendency toward having an increased mean corpuscular hemoglobin level. There were no differences (p>0.05) in total protein and serum lysozyme concentrations or in WBCs between diets, except for lymphocytes, which presented lower values (p<0.05) in the SUP, suggesting immunomodulation by the polyunsaturated fatty acids present in the microalga. There was no difference (p>0.05) in the intestinal morphology between diets. Metagenomic data indicated greater richness (represented by the Chao index) and a higher abundance of the bacterial phylum Firmicutes in the gut microbiota of the tilapia fed with the SUP diet, demonstrating that the digestion and use of the components of the microalga could influence the microbial community. The results indicated that the microalga had modulatory effects on blood cells and the intestinal microbiota, without affecting the structure and integrity of the intestinal villi.


Assuntos
Ciclídeos/microbiologia , Suplementos Nutricionais , Microalgas , Animais , Células Sanguíneas/efeitos dos fármacos , Peso Corporal/efeitos dos fármacos , Ciclídeos/sangue , Ciclídeos/imunologia , Microbioma Gastrointestinal/efeitos dos fármacos , Intestinos/anatomia & histologia , Intestinos/efeitos dos fármacos , Intestinos/imunologia , Masculino , Microbiota/efeitos dos fármacos
14.
Semina Ci. agr. ; 41(05, supl. 01): 2297-2306, 2020. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-764803

RESUMO

The Amazonian Jundiá (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) is a species of catfish with social and economic importance in some South American countries such as Brazil and Colombia. Genetic evaluation of this species is limited due to the lack of specific molecular markers, hindering studies on genetic diversity and structure in animals under captive conditions or in natural populations. The objective of the present study was to evaluate the transferability of heterologous microsatellite markers in Leiarius marmoratus. Thirty-two heterologous primers were tested in L. marmoratus. The primers that presented the best standards were applied to 20 specimens, and the number of alleles (Na), number of effective alleles (Ne), gene diversity per Locus (GdL) and percentage of amplification failure (Md) were calculated. Eleven primers demonstrated satisfactory transferability patterns, all from the fish of the Pimelodidae family, of which, seven were monomorphic and four polymorphic. The eleven markers presented low percentage of Md (mean was 5.9% samples per locus). Na varied from one to two alleles per locus, revealing low polymorphism in the evaluated samples. The mean Ne and GdL numbers were 1.77 and 0.32, respectively. The transferability of the heterologous microsatellite loci in L. marmoratus was shown to be possible. However, further tests are needed to apply these markers inpopulation genetic studies.(AU)


O Jundiá da Amazônia (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) é uma espécie de catfish com importância social e econômica em alguns países Sul americanos como Brasil e Colômbia. A avaliação genética dessa espécie é limitada devido a ausência de marcadores moleculares específicos para L. marmoratus, dificultando estudos sobre a diversidade e estrutura genética em animais em condições de cativeiro ou em populações naturais. O objetivo do presente estudo foi avaliar a transferibilidade de 32 marcadores microssatélites heterólogos em Leiarius marmoratus. Os primers que apresentaram melhores padrões foram aplicados em 20 espécimes, sendo calculados o número de alelos (Na), número de alelos efetivos (Ne), diversidade gênica por Locus (GdL) e porcentagem de falha na amplificação (Md). Onze primers demonstraram padrões satisfatórios de transferibilidade, todos oriundos de peixes da família Pimelodidae, dos quais sete foram monomórficos e quatro polimórficos. Os onze marcadores apresentaram baixa porcentagem de Md (média 5,9% amostras por loco). O Na variou deum a dois alelos por loco, revelando baixo polimorfismo nas amostras avaliadas. O número médio de Ne e GdL foram 1,77 e 0,32, respectivamente. Estudos genéticos envolvendo indivíduos de diferentes regiões poderão apresentar novos alelos e maior número de loci polimórficos. A transferibilidade de loci microssatélites heterólogos em L. marmoratus se mostrou possível, no entanto, novos testes são necessários para aplicação desses marcadores em estudos genéticos populacionais.(AU)


Assuntos
Animais , Peixes/genética , Repetições de Microssatélites/genética , DNA
15.
Semina Ci. agr. ; 41(05, supl. 01): 2285-2296, 2020. graf, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-764802

RESUMO

The growth curve is a tool that can be used to determine the performance potential of fish at different ages. The aim of this study was to evaluate the growth curve of pacu (P. mesopotamicus) and the patinga hybrid (P. mesopotamicus × P. brachypomus) cultivated in a semi-intensive system. In the initial phase of the experiment, the pacu and patinga fish weighed 32.6 ± 7.5 g and 24.9 ± 7.1 g, respectively. The Gompertz model was adopted to describe the growth curve. At the end of the experiment, body weight, standard length, head length, body height and body width did not differ significantly between the pacu (625.9 g; 25.6 cm; 7.2 cm; 12.1 cm; 4.5 cm) and the patinga hybrid (727.1 g; 27.3 cm; 7.6 cm; 13.2 cm; 4.9 cm). The asymptotic value (parameter A), relative growth rate (parameter B), and age at the inflection point (parameter C) of the growth curve of the two species were similar for weight and for the evaluated morphometric traits. The asymptotic values obtained for weight in the pacu and the patinga hybrid were 1212.0 g and 1348.0 g, respectively. The growth curve of the patinga hybrid is similar to that of pacu, contrasting with the belief of many fish farmers.(AU)


A curva de crescimento possibilita determinar o potencial de desempenho dos peixes em diferentes idades. O objetivo do estudo foi avaliar a curva de crescimento do pacu (P. mesopotamicus) e do híbrido patinga (P. mesopotamicus x P. brachypomus) produzidos em sistema semi-intensivo. Foram utilizados no início do experimento pacu e patinga com peso de 32,6 ± 7,5 g e 24,9 ± 7,1 g, respectivamente. Foi utilizado o modelo Gompertz para descrever a curva de crescimento. No final do experimento, o peso corporal, comprimento padrão, comprimento da cabeça, altura do corpo e largura do corpo não diferiram significativamente entre o pacu (625,9 g; 25,6 cm; 7,2 cm; 12,1 cm; 4,5 cm) e o híbrido patinga (727,1g; 27,3 cm; 7,6 cm; 13,2 cm; 4,9 cm). O valor assintótico (parâmetro A), taxa de crescimento relativo (parâmetro B) e idade no ponto de inflexão (parâmetro C) da curva de crescimento do pacu e patinga foram semelhantes para peso e características morfométricas avaliadas. O valor assintótico obtido para peso no pacu e no híbrido patinga foi de 1212,0 g e 1348,0 g, respectivamente. O híbrido patinga apresenta curva de crescimento semelhante ao pacu, contrastando com a crença de muitos piscicultores.(AU)


Assuntos
Animais , Peixes/anatomia & histologia , Peixes/crescimento & desenvolvimento
16.
Acta amaz. ; 50(3): 232-238, jul.-set. 2020. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-760186

RESUMO

The genusBryconcomprises fish species of significant socioeconomic and biological importance in Brazil. Despite that, the genetic knowledge about these species is scarce, especially regardingBrycon falcatus. Thus, the objective of this study was to evaluate the transferability of heterologous microsatellite primers inB. falcatus for the first time. Heterologous primers obtained from B. opalinus, B. hilarii, B. insignis, B. orbignyanus, B. amazonicus, Prochilodus argenteus, Prochilodus lineatus, Piaractus mesopotamicus, and Colossoma macropomum were evaluated. The primers that showed the best amplification patterns were applied to a sample of 22 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers displayed satisfactory cross-amplification withB. falcatus: BoM5 (Brycon opalinus); Bh8, Bh13 and Bh16 (B. hilarii); Borg59 (B. orbignyanus); Bag22 (B. amazonicus); Par12 and Par80 (P. argenteus), and Cm1A8 (C. macropomum). The genetic parameters (number of alleles, effective alleles, allele richness, and expected and observed heterozygosity) and the polymorphic information content (PIC) confirmed the viability of these primers for population genetics analyses. Our study demonstrates the potential of transferability of microsatellite markers from related species and even different genera to B. falcatus, providing usefull tools for future population genetic studies in this species.(AU)


O gênero Brycon compreende um grupo de espécies de peixes de grande importância socioeconômica e biológica no Brasil. Entretanto, o conhecimento genético dessas espécies é escasso, principalmente no caso do Brycon falcatus. Diante disso, objetivou-se verificar a transferibilidade de primers heterólogos em B. falcatus. Foram avaliados primers heterólogos provenientes das espécies B. opalinus, B. hilarii, B. insignis, B. orbignyanus, B. amazonicus, Prochilodus argenteus, Prochilodus lineatus, Piaractus mesopotamicus e Colossoma macropomum. Os primers que demonstraram melhores padrões de amplificação foram aplicados a uma amostra de 22 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. falcatus: BoM5 (Brycon opalinus), Bh8, Bh13 e Bh16 (B. hilarii); Borg59 (Brycon orbignyanus); Bag22 (B. amazonicus); Par12 and Par80 (Prochilodus argenteus) e Cm1A8 (Colossoma macropomum). Os parâmetros genéticos (número de alelos, alelos efetivos, riqueza de alelos e heterozigosidade esperada e observada) e o conteúdo de informação polimórfica (PIC) demonstraram a viabilidade da utilização dos primers para análises genéticas populacionais. Nosso estudo demonstra o potencial de transferibilidade de marcadores microssatélites de espécies relacionadas e até de gêneros diferentes para B. falcatus, fornecendo ferramentas úteis para futuros estudos genéticos populacionais nessa espécie.(AU)


Assuntos
Animais , Caraciformes/anatomia & histologia , Caraciformes/genética , Variação Genética
17.
Semina Ci. agr. ; 41(06,supl. 2): 3249-3258, 2020. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-32589

RESUMO

The Amazonian fish Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most common native species in Brazil. This species has the highest production rate in the Northern region, especially in the State of Rondônia. The genetic evaluation of Tambaqui is an extremely important to increase productivity in fish farms or improve the adaptability in restocking natural populations. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity of three Tambaqui broodstocks in Rondônia, Brazil. Six microsatellite markers were used to analyze a total of 89 breeders collected from three fish farms located in Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) and Presidente Médici (PM). A total of 37 alleles between 140 and 310 bp were found, including the presence of exclusive and low frequency alleles in the three broodstocks. The average values of observed heterozygosity ranged from 0.404 (PM) to 0.499 (JP). The FIS coefficient values were positive for the three broodstocks, demonstrating a deficit of heterozygotes. The Molecular Variance Analysis (AMOVA) showed greater variation within the stocks than between them. The genetic differentiation was moderate and significant between the stocks, with higher differentiation between JP x PM and lower between OP x PM. The Bayesian analysis designated an optimal value of K=3 groupings. Although there is moderate genetic diversity between broodstocks, the high FIS indicates a possible decline of diversity in the next generations, and therefore, the incorporation of new breeders is suggested to increase the genetic diversity in the three stocks.(AU)


O peixe amazônico Tambaqui (Colossoma macropomum) é a espécie nativa mais produzida no Brasil. Esta espécie é a mais criada na região Norte, principalmente no Estado de Rondônia. A avaliação genética de Tambaqui é extremamente importante para aumentar a produtividade nas pisciculturas ou melhorar a adaptabilidade no repovoamento de populações naturais. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética de três estoques de Tambaqui em Rondônia, Brasil. Seis marcadores microssatélites foram utilizados para analisar um total de 89 reprodutores coletados em três pisciculturas localizadas em Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) e Presidente Médici (PM). Foram encontrados 37 alelos entre 140 e 310 pb, incluindo a presença de alelos exclusivos e de baixa frequência nas três ninhadas. Os valores médios de heterozigosidade observada variaram de 0,404 (PM) a 0,499 (JP). Os valores do coeficiente de FIS foram positivos para as três ninhadas, demonstrando déficit de heterozigotos. A Análise de Variância Molecular (AMOVA) mostrou maior variação dentro dos estoques do que entre eles. A diferenciação genética foi moderada e significativa entre os estoques, com maior diferenciação entre JPxPM e menor entre OP x PM. A análise bayesiana designou um valor ótimo de K = 3 agrupamentos. Embora exista uma diversidade genética moderada entre os filhotes, o alto SIF indica um possível declínio da diversidade nas próximas gerações e, portanto, sugere-se a incorporação de novos criadores para aumentar a diversidade genética nos três estoques.(AU)


Assuntos
Animais , Peixes/genética , Variação Genética
18.
Semina ciênc. agrar ; 41(05, supl. 01): 2285-2296, 2020. graf, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1501636

RESUMO

The growth curve is a tool that can be used to determine the performance potential of fish at different ages. The aim of this study was to evaluate the growth curve of pacu (P. mesopotamicus) and the patinga hybrid (P. mesopotamicus × P. brachypomus) cultivated in a semi-intensive system. In the initial phase of the experiment, the pacu and patinga fish weighed 32.6 ± 7.5 g and 24.9 ± 7.1 g, respectively. The Gompertz model was adopted to describe the growth curve. At the end of the experiment, body weight, standard length, head length, body height and body width did not differ significantly between the pacu (625.9 g; 25.6 cm; 7.2 cm; 12.1 cm; 4.5 cm) and the patinga hybrid (727.1 g; 27.3 cm; 7.6 cm; 13.2 cm; 4.9 cm). The asymptotic value (parameter A), relative growth rate (parameter B), and age at the inflection point (parameter C) of the growth curve of the two species were similar for weight and for the evaluated morphometric traits. The asymptotic values obtained for weight in the pacu and the patinga hybrid were 1212.0 g and 1348.0 g, respectively. The growth curve of the patinga hybrid is similar to that of pacu, contrasting with the belief of many fish farmers.


A curva de crescimento possibilita determinar o potencial de desempenho dos peixes em diferentes idades. O objetivo do estudo foi avaliar a curva de crescimento do pacu (P. mesopotamicus) e do híbrido patinga (P. mesopotamicus x P. brachypomus) produzidos em sistema semi-intensivo. Foram utilizados no início do experimento pacu e patinga com peso de 32,6 ± 7,5 g e 24,9 ± 7,1 g, respectivamente. Foi utilizado o modelo Gompertz para descrever a curva de crescimento. No final do experimento, o peso corporal, comprimento padrão, comprimento da cabeça, altura do corpo e largura do corpo não diferiram significativamente entre o pacu (625,9 g; 25,6 cm; 7,2 cm; 12,1 cm; 4,5 cm) e o híbrido patinga (727,1g; 27,3 cm; 7,6 cm; 13,2 cm; 4,9 cm). O valor assintótico (parâmetro A), taxa de crescimento relativo (parâmetro B) e idade no ponto de inflexão (parâmetro C) da curva de crescimento do pacu e patinga foram semelhantes para peso e características morfométricas avaliadas. O valor assintótico obtido para peso no pacu e no híbrido patinga foi de 1212,0 g e 1348,0 g, respectivamente. O híbrido patinga apresenta curva de crescimento semelhante ao pacu, contrastando com a crença de muitos piscicultores.


Assuntos
Animais , Peixes/anatomia & histologia , Peixes/crescimento & desenvolvimento
19.
Semina ciênc. agrar ; 41(05, supl. 01): 2297-2306, 2020. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1501637

RESUMO

The Amazonian Jundiá (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) is a species of catfish with social and economic importance in some South American countries such as Brazil and Colombia. Genetic evaluation of this species is limited due to the lack of specific molecular markers, hindering studies on genetic diversity and structure in animals under captive conditions or in natural populations. The objective of the present study was to evaluate the transferability of heterologous microsatellite markers in Leiarius marmoratus. Thirty-two heterologous primers were tested in L. marmoratus. The primers that presented the best standards were applied to 20 specimens, and the number of alleles (Na), number of effective alleles (Ne), gene diversity per Locus (GdL) and percentage of amplification failure (Md) were calculated. Eleven primers demonstrated satisfactory transferability patterns, all from the fish of the Pimelodidae family, of which, seven were monomorphic and four polymorphic. The eleven markers presented low percentage of Md (mean was 5.9% samples per locus). Na varied from one to two alleles per locus, revealing low polymorphism in the evaluated samples. The mean Ne and GdL numbers were 1.77 and 0.32, respectively. The transferability of the heterologous microsatellite loci in L. marmoratus was shown to be possible. However, further tests are needed to apply these markers inpopulation genetic studies.


O Jundiá da Amazônia (Leiarius marmoratus) (Siluliformes: Pimelodidae) é uma espécie de catfish com importância social e econômica em alguns países Sul americanos como Brasil e Colômbia. A avaliação genética dessa espécie é limitada devido a ausência de marcadores moleculares específicos para L. marmoratus, dificultando estudos sobre a diversidade e estrutura genética em animais em condições de cativeiro ou em populações naturais. O objetivo do presente estudo foi avaliar a transferibilidade de 32 marcadores microssatélites heterólogos em Leiarius marmoratus. Os primers que apresentaram melhores padrões foram aplicados em 20 espécimes, sendo calculados o número de alelos (Na), número de alelos efetivos (Ne), diversidade gênica por Locus (GdL) e porcentagem de falha na amplificação (Md). Onze primers demonstraram padrões satisfatórios de transferibilidade, todos oriundos de peixes da família Pimelodidae, dos quais sete foram monomórficos e quatro polimórficos. Os onze marcadores apresentaram baixa porcentagem de Md (média 5,9% amostras por loco). O Na variou deum a dois alelos por loco, revelando baixo polimorfismo nas amostras avaliadas. O número médio de Ne e GdL foram 1,77 e 0,32, respectivamente. Estudos genéticos envolvendo indivíduos de diferentes regiões poderão apresentar novos alelos e maior número de loci polimórficos. A transferibilidade de loci microssatélites heterólogos em L. marmoratus se mostrou possível, no entanto, novos testes são necessários para aplicação desses marcadores em estudos genéticos populacionais.


Assuntos
Animais , DNA , Peixes/genética , Repetições de Microssatélites/genética
20.
Semina ciênc. agrar ; 41(06,supl. 2): 3249-3258, 2020. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1501683

RESUMO

The Amazonian fish Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most common native species in Brazil. This species has the highest production rate in the Northern region, especially in the State of Rondônia. The genetic evaluation of Tambaqui is an extremely important to increase productivity in fish farms or improve the adaptability in restocking natural populations. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity of three Tambaqui broodstocks in Rondônia, Brazil. Six microsatellite markers were used to analyze a total of 89 breeders collected from three fish farms located in Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) and Presidente Médici (PM). A total of 37 alleles between 140 and 310 bp were found, including the presence of exclusive and low frequency alleles in the three broodstocks. The average values of observed heterozygosity ranged from 0.404 (PM) to 0.499 (JP). The FIS coefficient values were positive for the three broodstocks, demonstrating a deficit of heterozygotes. The Molecular Variance Analysis (AMOVA) showed greater variation within the stocks than between them. The genetic differentiation was moderate and significant between the stocks, with higher differentiation between JP x PM and lower between OP x PM. The Bayesian analysis designated an optimal value of K=3 groupings. Although there is moderate genetic diversity between broodstocks, the high FIS indicates a possible decline of diversity in the next generations, and therefore, the incorporation of new breeders is suggested to increase the genetic diversity in the three stocks.


O peixe amazônico Tambaqui (Colossoma macropomum) é a espécie nativa mais produzida no Brasil. Esta espécie é a mais criada na região Norte, principalmente no Estado de Rondônia. A avaliação genética de Tambaqui é extremamente importante para aumentar a produtividade nas pisciculturas ou melhorar a adaptabilidade no repovoamento de populações naturais. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética de três estoques de Tambaqui em Rondônia, Brasil. Seis marcadores microssatélites foram utilizados para analisar um total de 89 reprodutores coletados em três pisciculturas localizadas em Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) e Presidente Médici (PM). Foram encontrados 37 alelos entre 140 e 310 pb, incluindo a presença de alelos exclusivos e de baixa frequência nas três ninhadas. Os valores médios de heterozigosidade observada variaram de 0,404 (PM) a 0,499 (JP). Os valores do coeficiente de FIS foram positivos para as três ninhadas, demonstrando déficit de heterozigotos. A Análise de Variância Molecular (AMOVA) mostrou maior variação dentro dos estoques do que entre eles. A diferenciação genética foi moderada e significativa entre os estoques, com maior diferenciação entre JPxPM e menor entre OP x PM. A análise bayesiana designou um valor ótimo de K = 3 agrupamentos. Embora exista uma diversidade genética moderada entre os filhotes, o alto SIF indica um possível declínio da diversidade nas próximas gerações e, portanto, sugere-se a incorporação de novos criadores para aumentar a diversidade genética nos três estoques.


Assuntos
Animais , Peixes/genética , Variação Genética
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