RESUMO

This review presents a broader approach to the implementation and study of runs of homozygosity (ROH) in animal populations, focusing on identifying and characterizing ROH and their practical implications. ROH are continuous homozygous segments that are common in individuals and populations. The ability of these homozygous segments to give insight into a population's genetic events makes them a useful tool that can provide information about the demographic evolution of a population over time. Furthermore, ROH provide useful information about the genetic relatedness among individuals, helping to minimize the inbreeding rate and also helping to expose deleterious variants in the genome. The frequency, size and distribution of ROH in the genome are influenced by factors such as natural and artificial selection, recombination, linkage disequilibrium, population structure, mutation rate and inbreeding level. Calculating the inbreeding coefficient from molecular information from ROH (FROH ) is more accurate for estimating autozygosity and for detecting both past and more recent inbreeding effects than are estimates from pedigree data (FPED ). The better results of FROH suggest that FROH can be used to infer information about the history and inbreeding levels of a population in the absence of genealogical information. The selection of superior animals has produced large phenotypic changes and has reshaped the ROH patterns in various regions of the genome. Additionally, selection increases homozygosity around the target locus, and deleterious variants are seen to occur more frequently in ROH regions. Studies involving ROH are increasingly common and provide valuable information about how the genome's architecture can disclose a population's genetic background. By revealing the molecular changes in populations over time, genome-wide information is crucial to understanding antecedent genome architecture and, therefore, to maintaining diversity and fitness in endangered livestock breeds.

Assuntos

RESUMO

Estimaram-se fatores de correção para produção de leite aos 90, 240, 270 e 305 dias de lactação e parâmetros genéticos e de ambiente da produção de leite ajustada para esses períodos de lactação, utilizando-se 3888 lactações de 1630 búfalas, controladas entre 1987 e 2001, em 10 rebanhos do Estado de São Paulo. Os parâmetros genéticos foram estimados por meio do método da máxima verossimilhança restrita, livre de derivadas, aplicado a um modelo animal com medidas repetidas. As estimativas de herdabilidade para produção de leite corrigida para 90, 240, 270 e 305 dias de lactação foram 0,17; 0,15; 0,14 e 0,14, respectivamente. Nessa mesma ordem de apresentação, as estimativas de repetibilidade foram 0,40; 0,44; 0,41 e 0,41. As estimativas de correlação genética entre essas produções de leite corrigidas variaram de 0,96 a 1,00. Os fatores de correção multiplicativos para as diferentes classes de duração da lactação foram eficientes para ajustar a produção de leite aos 90, 240, 270 e 305 dias de lactação.

Assuntos

RESUMO

Estimaram-se fatores de correção para produção de leite aos 90, 240, 270 e 305 dias de lactação e parâmetros genéticos e de ambiente da produção de leite ajustada para esses períodos de lactação, utilizando-se 3888 lactações de 1630 búfalas, controladas entre 1987 e 2001, em 10 rebanhos do Estado de São Paulo. Os parâmetros genéticos foram estimados por meio do método da máxima verossimilhança restrita, livre de derivadas, aplicado a um modelo animal com medidas repetidas. As estimativas de herdabilidade para produção de leite corrigida para 90, 240, 270 e 305 dias de lactação foram 0,17; 0,15; 0,14 e 0,14, respectivamente. Nessa mesma ordem de apresentação, as estimativas de repetibilidade foram 0,40; 0,44; 0,41 e 0,41. As estimativas de correlação genética entre essas produções de leite corrigidas variaram de 0,96 a 1,00. Os fatores de correção multiplicativos para as diferentes classes de duração da lactação foram eficientes para ajustar a produção de leite aos 90, 240, 270 e 305 dias de lactação. (AU)

Correction factors for milk yield at 90, 240, 270 and 305 days of lactation of buffaloes and genetic and environmental parameters for milk yield of these lactation periods were estimated. The data used consisted of 3888 lactation records of 1630 buffaloes from 10 herds reared in the State of São Paulo. Genetic parameters were estimated by the derivative free restricted maximum likelihood method, fitting an animal repeatability model. Heritability estimates for milk yield corrected for 90, 240, 270 and 305 days of lactation were 0.17, 0.15, 0.14 and 0.14, respectively. In this same order, repeatability estimates were 0.40, 0.44, 0.41 and 0.41. The genetic correlation estimates between these corrected milk yields ranged from 0.96 to 1.00. The multiplicative correction factors for the different classes of lactation lengths were efficient for adjustment of milk yield at 90, 240, 270 and 305 days of lactation.(AU)

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