RESUMO

Analyses of 16S rDNA genes were used to identify the microbiota isolated from the mucus of the zoanthid Palythoa caribaeorum at Porto de Galinhas on the coast of Pernambuco State, Brazil. This study is important as the first report of this association, because of the potential biotechnological applications of the bacterium Alcanivorax dieselolei, and as evidence for the presence of a hydrocarbon degrading bacterium in a reef ecosystem such as Porto de Galinhas.

Análises dos genes 16S rDNA foram empregadas para identificar a microbiota isolada do muco do zoantídeo Palythoa caribaeorum de Porto de Galinhas, litoral do estado de Pernambuco, Brasil. Este estudo é importante pelo ineditismo dessa associação, pelas relevantes aplicações biotecnológicas da bactéria Alcanivorax dieselolei e pela indicação da presença de uma bactéria degradadora de hidrocarbonetos em um ecossistema recifal como o de Porto de Galinhas.

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The entomophatogenic bacterium Bacillus thuringiensis produces crystal proteins, named Cry proteins which are encoded by the cry genes. This bacterium is used on biological control of important economical pests, as well as in the control of disease´s vectors, such as Aedes aegypti, a mosquito that transmits the dengue viruses. Isolates of this bacterium can be characterized by the content of cry genes and this prediction helps target different insect orders. In this research, we isolated 76 colonies of B. thuringiensis from 30 soil samples that were taken from Ilha Bela (SP, Brazil), a place where simulids are already biologically controlled by B. thuringiensis, to find bacterial isolates that were capable of controlling A. aegypti. The 16S ribosomal subunit genes of the selected isolates were sequenced, and the isolates were molecularly characterized based on their Dipteran-specific cry gene contents. Eight of the 76 isolates (10.52%) contained the cry4Aa, cry4Ba or cry10Aa genes, these isolates were carried out against A. aegypti larvae on bioassay. The presence or absence of specific cry genes was associated with the observed average larval mortalities. From the 76 isolates, seven (9.2%) were potentially able to control A. aegypti larvae. Therefore these are promising isolates for the biological control of A. aegypti larvae.

Bacillus thuringiensis é entomopatogênica, por produzir proteínas cristais, denominadas proteínas Cry, as quais são codificadas pelos genes cry. Essa bactéria atua no controle biológico de insetos-praga de culturas economicamente importantes, bem como no controle de insetos vetores causadores de doenças, como o Aedes aegypti, mosquito transmissor do vírus da dengue. Os isolados dessa bactéria podem ser caracterizados pelo conteúdo de genes cry que possuem e, assim, predizer o alvo de controle dos mesmos às diferentes ordens de insetos. Com o objetivo de encontrar isolados eficientes no controle do vetor A. aegypti, o presente trabalho isolou 76 colônias de B. thuringiensis a partir de 30 amostras de solo oriundas de Ilhabela-SP, município que se caracteriza por realizar controle biológico de simulídeos com essa bactéria. Os 76 isolados foram sequenciados na região da subunidade ribossomal 16S e caracterizados molecularmente quanto ao conteúdo de genes cry díptero-específicos. No total, oito isolados (10,52% do total) apresentaram bandas para os genes cry4Aa, cry4Ba e cry10Aa, sendo os mesmos testados contra larvas de A. aegypti por meio de bioensaios. A presença e/ou ausência dos genes cry foi associada à mortalidade média de larvas. Dentre os isolados estudados, sete (9,2% do total) apresentaram elevado potencial de controle às larvas de A. aegypti, sendo assim considerados como promissores para o manejo do controle biológico de larvas de A. aegypti com a bactéria B. thuringiensis.

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The entomophatogenic bacterium Bacillus thuringiensis produces crystal proteins, named Cry proteins which are encoded by the cry genes. This bacterium is used on biological control of important economical pests, as well as in the control of disease´s vectors, such as Aedes aegypti, a mosquito that transmits the dengue viruses. Isolates of this bacterium can be characterized by the content of cry genes and this prediction helps target different insect orders. In this research, we isolated 76 colonies of B. thuringiensis from 30 soil samples that were taken from Ilha Bela (SP, Brazil), a place where simulids are already biologically controlled by B. thuringiensis, to find bacterial isolates that were capable of controlling A. aegypti. The 16S ribosomal subunit genes of the selected isolates were sequenced, and the isolates were molecularly characterized based on their Dipteran-specific cry gene contents. Eight of the 76 isolates (10.52%) contained the cry4Aa, cry4Ba or cry10Aa genes, these isolates were carried out against A. aegypti larvae on bioassay. The presence or absence of specific cry genes was associated with the observed average larval mortalities. From the 76 isolates, seven (9.2%) were potentially able to control A. aegypti larvae. Therefore these are promising isolates for the biological control of A. aegypti larvae.

Bacillus thuringiensis é entomopatogênica, por produzir proteínas cristais, denominadas proteínas Cry, as quais são codificadas pelos genes cry. Essa bactéria atua no controle biológico de insetos-praga de culturas economicamente importantes, bem como no controle de insetos vetores causadores de doenças, como o Aedes aegypti, mosquito transmissor do vírus da dengue. Os isolados dessa bactéria podem ser caracterizados pelo conteúdo de genes cry que possuem e, assim, predizer o alvo de controle dos mesmos às diferentes ordens de insetos. Com o objetivo de encontrar isolados eficientes no controle do vetor A. aegypti, o presente trabalho isolou 76 colônias de B. thuringiensis a partir de 30 amostras de solo oriundas de Ilhabela-SP, município que se caracteriza por realizar controle biológico de simulídeos com essa bactéria. Os 76 isolados foram sequenciados na região da subunidade ribossomal 16S e caracterizados molecularmente quanto ao conteúdo de genes cry díptero-específicos. No total, oito isolados (10,52% do total) apresentaram bandas para os genes cry4Aa, cry4Ba e cry10Aa, sendo os mesmos testados contra larvas de A. aegypti por meio de bioensaios. A presença e/ou ausência dos genes cry foi associada à mortalidade média de larvas. Dentre os isolados estudados, sete (9,2% do total) apresentaram elevado potencial de controle às larvas de A. aegypti, sendo assim considerados como promissores para o manejo do controle biológico de larvas de A. aegypti com a bactéria B. thuringiensis.

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ABSTRACT The aim of this study was to analyze in vitro antimicrobial susceptibility of Staphylococcus aureus strains isolated from teats of cow udders and milking workers hands as well as to verify polymorphism among them by using RAPD-PCR technique. Tests were conducted by disk diffusion technique and after the collection of the genetic material PCR and RAPD techniques were performed with the use of 40 different initiators. The analysis of polymorphism was conducted by using the NTSYS program of numerical taxonomy. The susceptibility of antimicrobials in the strains collected from teats of cow udders was 4% to penicillin, 88% to tetracycline, 92% to gentamicine, 96% to vancomycin and 100% to chloranfenicol. As for the strains collected from milking workers hands, susceptibility results were 0% to penicillin, 70% to tetracycline and 90% to vancomycin and 100% to gentamicine and chloranfenicol antimicrobials. E-test showed minimum inhibitory concentration (MIC) greater than 256 ?g/mL to strains resistant to the antimicrobial vancomycin. The studies made it possible to detect S. aureus resistance upon the use of the tested antimicrobials and to determine the genetic diversity found among strains of staphylococcus due to the presence of many polymorphic bands found in all initiators.

RESUMO O objetivo deste trabalho foi analisar a sensibilidade antimicrobiana in vitro de cepas de Staphylococcus aureusisoladas de tetos de vacas e mãos de retireiros, além de verificar o polimorfismo entre elas pela técnica de PCR-RAPD. Os testes foram realizados pela técnica de difusão em discos e, após a extração do material genético foram desenvolvidas as técnicas de PCR e RAPD, usando para isso 40 iniciadores diferentes. A análise do polimorfismo foi realizada empregando-se o programa de taxonomia numérica NTSYS. As sensibilidades dos antimicrobianos nas cepas obtidas de tetos de vacas foram 4% para a penicilina, 88% para a tetraciclina, 92% para a gentamicina, 96% para a vancomicina e 100% ao cloranfenicol. Para as cepas provenientes das mãos de retireiros, os resultados de sensibilidade foram zero para a penicilina, 70% para a tetraciclina e 90% para a vancomicina e 100% para os antimicrobianos gentamicina e cloranfenicol. A realização do E-teste indicou uma concentração inibitória mínima (CIM) maior que 256 mg/mL para as cepas resistentes ao antimicrobiano vancomicina. Os estudos permitiram detectar a resistência dos S. aureus mediante o uso dos antimicrobianos testados e determinar a diversidade genética entre as cepas de estafilococos devido à presença de muitas bandas polimórficas encontradas em todos os iniciadores.

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Salmonella enterica serovar Gallinarum (SG) is an intracellular pathogen of chickens. To survive, to invade and to multiply in the intestinal tract and intracellularly it depends on its ability to produce energy in anaerobic conditions. The fumarate reductase (frdABCD), dimethyl sulfoxide (DMSO)-trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase (dmsABC), and nitrate reductase (narGHIJ) operons in Salmonella Typhimurium (STM) encode enzymes involved in anaerobic respiration to the electron acceptors fumarate, DMSO, TMAO, and nitrate, respectively. They are regulated in response to nitrate and oxygen availability and changes in cell growth rate. In this study mortality rates of chickens challenged with mutants of Salmonella Gallinarum, which were defective in utilising anaerobic electron acceptors, were assessed in comparison to group of bird challenged with wild strain. The greatest degree of attenuation was observed with mutations affecting nitrate reductase (napA, narG) with additional attenuations induced by a mutation affecting fumarate reductase (frdA) and a double mutant (dmsA torC) affecting DMSO and TMAO reductase.

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ABSTRACT The aim of this work was to genetically characterize 1,073 isolates of B. thuringiensis, from three Brazilian collections UNESP/Jaboticabal, ESALQ/Piracicaba and EMBRAPA/Sete Lagoas with the main emphasis on the analysis of the cry1 gene types presented by these isolates. To achieve this purpose, oligonucleotide primers were designed based on 16 conserved and 4 unconserved regions of the corresponding sequences from each one of the 16 subclasses of the cry1 set of genes and used in PCR amplification assays. These sequences were amplified and the presence of amplicons for each subclass was evaluated in terms of percentage of gene type per bacterial collection. As a result, 55.7% of the isolates reacted to the primer Gral cry1, and the subclasses cry1Aa, cry1Ab, cry1Ac, cry1Ad, cry1Ae, cry1Af, cry1Ag, cry1Bf, cry1Ca and cry1Fa were detected in high percentages among the isolates ranging from 43.4 to 54.9%. A subclass distribution was observed among the set of isolates from these collections, with the greater percentage of isolates harboring the cry1Ab (42.12%) and the lowest percentage for thecry1Db subclass (0.6%). The genetic variability of the analyzed bacterial collections seems to indicate the ESALQ/Piracicaba and the UNESP/Jaboticabal subsets as sources of promising isolates for the control of Lepidoptera pest insects. For the EMBRAPA/Sete Lagoas subset of isolates, in which the evaluated subclasses frequencies were considered low (below 20%), the cry1B was the most frequently observed gene type present in 38.5% of the isolates.

RESUMO O presente trabalho teve como objetivo caracterizar geneticamente 1.073 isolados de Bacillus thuringiensis, de três coleções brasileiras, provenientes da UNESP, Jaboticabal, da ESALQ/ Piracicaba e da EMBRAPA. Sete Lagoas, analisando os tipos de genes cry1 apresentados pelos isolados. Para isso, foram elaborados oligonucleotídeos iniciadores a partir de 16 regiões conservadas e 4 regiões não conservadas das seqüências de cada uma das 16 subclasses do gene cry1. Essas seqüências foram amplificadas por PCR e a presença de amplicons para cada subclasse foi calculada em porcentagem por gene e por coleção. Nessa análise, 55,7% dos isolados apresentaram amplificação para o gene cry1, e as subclassescry1Aa, cry1Ab, cry1Ac, cry1Ad, cry1Ae, cry1Af, cry1Ag, e cry1Bf, cry1Ca e cry1Fa estão presentes em alta proporção de isolados, variando de 43,4% a 54,9%. Verificou-se que existe uma distribuição das subclasses dentro do banco de isolados de B. thuringiensis em estudo, com maior porcentagem de isolados portadores dos genes cry1Ab (42,12%) e com menor porcentagem de representantes da subclasse cry1Db (0,6%). A variabilidade gênica, nas coleções analisadas, destaca as coleções de Jaboticabal e Piracicaba como fontes de isolados promissores para uso em programas de Controle Biológico de pragas da ordem Lepidoptera. A coleção de Sete Lagoas, na qual as freqüências das subclasses estudadas foram relativamente baixas (abaixo de 20%), destaca somente o gene cry1Ab, presente em 38,5% dos isolados desta coleção.

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ABSTRACT The main of the present study was analyze the use of a french press device to obtain genetic material from staphylococci and to detect genes involved with chromosomal and plasmid resistance to the following antimicrobial drugs: oxacillin, gentamicin, kanamycin and vancomycin. The agar disc diffusion method was conducted initially for 50 strains and the bacterial susceptibility was confirmed by means of PCR reactions. The results from the antibiogram method revealed high sensibility to gentamicin and kanamycin (4%) and oxacillin (8%). All strains were susceptible to vancomycin. The DNA from the bacteria was obtained by means of physical lyses using a french press device. The genes mecA and aph3 IIIa were detected on the staphylococci chromosome and the gene aac(6)Ie + aph(2) was observed either in the chromosome and in the plasmid content of the staphylococci analyzed. Based on the obtained results one can conclude that the methodology used to extract the genomic genetic material using the french press device was efficient and allowed a simple method to detect by PCR and to locate by ultracentrifugation, the staphylococci antibiotic resistance genes.

RESUMO Este trabalho teve por objetivo analisar o uso da prensa francesa para se adquirir material genético de estafilococos e detectar possíveis genes de resistência cromossomais e plasmidiais aos antimicrobianos oxacilina, gentamicina, canamicina e vancomicina. O método da difusão de discos em ágar foi realizado, inicialmente, para 50 linhagens de estafilococos e a susceptibilidade antimicrobiana foi confirmada por meio de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os resultados obtidos pelo antibiograma constataram alta susceptibilidade para gentamicina e canamicina (4%) e oxacilina (8%). Todas as linhagens foram susceptíveis à vancomicina. O DNA bacteriano foi obtido por lise física a partir da prensa francesa. Os genes mecA e aph3IIIa foram detectados no cromossomo dos estafilococos e o gene aac(6) Ie + aph (2") foi observado tanto no cromossomo como no plasmidio destas bactérias. Pelos resultados pode-se concluir que a metodologia utilizada para a extração de DNA genômico, por meio da prensa francesa, foi barata e eficiente, pois possibilitou a detecção por PCR e a localização, por ultracentrifugação, de genes de resistência em estafilococos.

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ABSTRACT Aiming to observe the existence of genetic variability in plants of tropical spiderwort (Commelina benghalensis L.), plants were collected from 10 different regions of 4 Brazilian states (SP, MG, MT and MS). Theseaccessions were analyzed by RAPD molecular markers using 35 arbitrary primers which revealed 84 polymorphic bands. The establishment of 2 main groups with genetic identity above 59% was observed. Theaccessions from Arceburgo and Taiaçú were the ones with greater genetic similarity (95%). The accession from Campo Novo do Parecis was the one with less similarity in terms of the phylogram. The genetic variability observed analyzing the RAPD markers was small among the studied tropical spiderwort accessions, with no relation to the geographic region where the accessions were collected, since the two groups formed involve accessions from different states.

RESUMO Com o objetivo de determinar a existência de variabilidade genética em plantas de trapoeraba (Commelina benghalensis L.), foram coletadas plantas em 10 diferentes regiões de quatro Estados do Brasil (SP, MG, MT e MS). Esses acessos foram submetidos a um estudo de variabilidade genética por meio de RAPD com 35 iniciadores arbitrários, os quais geraram 84 bandas polimórficas. Observou-se a formação de 2 grupos principais e o índice de identidade genética entre os acessos estudados apresentou-se acima de 59%. Os acessos de Arceburgo e Taiaçú foram os que apresentaram a maior similaridade genética (95%). Campo Novo do Parecis foi o acesso que mais se distanciou dentro do filograma. Observou-se que a variabilidade genética pela análise de dados dos marcadores RAPD foi pequena entre os acessos de trapoeraba estudados, a qual não se mostrou relacionada à distribuição geográfica, pois nos 2 grupos existem acessos coletados em diferentes Estados.